MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 plasmid 1

Total Repeats: 2437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008545	CCT	2	6	62	67	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008545	TTC	2	6	117	122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008545	TTC	2	6	127	132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008545	CGT	2	6	207	212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008545	GGA	2	6	246	251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008545	CTG	2	6	267	272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008545	TGT	2	6	287	292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008545	TCC	2	6	388	393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008545	GAA	2	6	455	460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008545	TCG	3	9	511	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008545	ATG	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008545	GTC	2	6	702	707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008545	CCG	2	6	826	831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008545	GCG	2	6	861	866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008545	CGC	2	6	882	887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008545	CCT	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008545	AGC	2	6	1258	1263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008545	TCT	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008545	TGC	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687165
20	NC_008545	GCT	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687165
21	NC_008545	GCC	2	6	1488	1493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687165
22	NC_008545	CCT	2	6	1664	1669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116687165
23	NC_008545	GCC	2	6	1743	1748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687165
24	NC_008545	ACA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687165
25	NC_008545	CGC	2	6	1787	1792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687165
26	NC_008545	AGG	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116687165
27	NC_008545	ATG	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687165
28	NC_008545	CTT	2	6	1901	1906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116687166
29	NC_008545	ACG	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687166
30	NC_008545	CGA	2	6	2037	2042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687166
31	NC_008545	CGT	2	6	2068	2073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687166
32	NC_008545	CAC	2	6	2292	2297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008545	AGG	2	6	2305	2310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008545	TAA	2	6	2333	2338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008545	ACT	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008545	TGC	2	6	2384	2389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008545	GCG	2	6	2395	2400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008545	GCT	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008545	TGA	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687167
40	NC_008545	ACC	2	6	2665	2670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687167
41	NC_008545	TCG	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687167
42	NC_008545	CAT	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687167
43	NC_008545	CGA	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687167
44	NC_008545	GCG	2	6	2857	2862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008545	GAT	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008545	GAC	2	6	2902	2907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008545	AGC	2	6	2940	2945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008545	CGG	2	6	2967	2972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008545	GAA	2	6	3108	3113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008545	CCG	2	6	3118	3123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008545	GCC	2	6	3170	3175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687168
52	NC_008545	GAA	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687168
53	NC_008545	TGC	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687168
54	NC_008545	CAC	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687168
55	NC_008545	TCA	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687168
56	NC_008545	TCA	3	9	3294	3302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687168
57	NC_008545	GCC	2	6	3304	3309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687168
58	NC_008545	ACC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687168
59	NC_008545	ACA	2	6	3423	3428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687168
60	NC_008545	ACG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687168
61	NC_008545	CAA	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687168
62	NC_008545	ACC	2	6	3602	3607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687168
63	NC_008545	TCC	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116687168
64	NC_008545	CAT	2	6	3759	3764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687168
65	NC_008545	GCC	2	6	3829	3834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008545	TTA	2	6	3845	3850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008545	GTC	2	6	3874	3879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008545	GCA	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008545	CGG	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008545	CGG	2	6	4011	4016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008545	CAC	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687169
72	NC_008545	TTG	2	6	4105	4110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116687169
73	NC_008545	ACG	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687169
74	NC_008545	ATG	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687169
75	NC_008545	GGT	2	6	4234	4239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687169
76	NC_008545	AGG	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116687169
77	NC_008545	CGA	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687169
78	NC_008545	GCC	2	6	4530	4535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687170
79	NC_008545	TTC	2	6	4595	4600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116687170
80	NC_008545	CAC	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687170
81	NC_008545	CGA	2	6	4750	4755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687170
82	NC_008545	GCT	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687170
83	NC_008545	CAT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687170
84	NC_008545	TCG	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687170
85	NC_008545	CAG	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687170
86	NC_008545	AAG	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687170
87	NC_008545	CTC	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116687170
88	NC_008545	ATG	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687170
89	NC_008545	GCA	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687170
90	NC_008545	TCC	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116687170
91	NC_008545	GCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687170
92	NC_008545	GAA	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687170
93	NC_008545	AGG	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116687170
94	NC_008545	TGC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687170
95	NC_008545	TAC	2	6	5645	5650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687170
96	NC_008545	ACG	2	6	5736	5741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687170
97	NC_008545	GAT	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687170
98	NC_008545	TGA	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687170
99	NC_008545	CGT	2	6	5899	5904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687171
100	NC_008545	CTG	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687171
101	NC_008545	CGA	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687171
102	NC_008545	TGG	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687171
103	NC_008545	CGA	2	6	6283	6288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687171
104	NC_008545	ATG	2	6	6342	6347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687171
105	NC_008545	CGA	2	6	6392	6397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687171
106	NC_008545	GCC	2	6	6405	6410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687171
107	NC_008545	GGC	2	6	6447	6452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687171
108	NC_008545	TGC	2	6	6605	6610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687171
109	NC_008545	ACG	2	6	6681	6686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687172
110	NC_008545	GTC	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687172
111	NC_008545	ATC	2	6	7076	7081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687173
112	NC_008545	TGC	2	6	7187	7192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687173
113	NC_008545	ACG	2	6	7199	7204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687173
114	NC_008545	GCC	2	6	7219	7224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687173
115	NC_008545	AAG	2	6	7306	7311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687173
116	NC_008545	AAG	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687173
117	NC_008545	GTC	2	6	7387	7392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687173
118	NC_008545	GAT	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687173
119	NC_008545	CGC	2	6	7495	7500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687173
120	NC_008545	GGA	2	6	7509	7514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116687173
121	NC_008545	TGC	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008545	GCT	2	6	7643	7648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008545	TGT	2	6	7793	7798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008545	ATG	2	6	7857	7862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687174
125	NC_008545	GCG	2	6	7865	7870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687174
126	NC_008545	GTG	2	6	7894	7899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687174
127	NC_008545	CCA	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687174
128	NC_008545	CAG	2	6	7962	7967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687174
129	NC_008545	CGA	3	9	7969	7977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687174
130	NC_008545	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687174
131	NC_008545	AAG	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687174
132	NC_008545	CGC	2	6	8104	8109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687174
133	NC_008545	TGA	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008545	CAC	2	6	8202	8207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008545	CTG	2	6	8219	8224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687175
136	NC_008545	GGC	2	6	8358	8363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687175
137	NC_008545	CGC	2	6	8403	8408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687175
138	NC_008545	CAA	2	6	8445	8450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687175
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142	NC_008545	GGC	2	6	8857	8862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687175
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156	NC_008545	GCG	2	6	9871	9876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687177
157	NC_008545	CTG	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687177
158	NC_008545	CTA	2	6	9940	9945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687177
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258	NC_008545	CTG	2	6	16103	16108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687182
259	NC_008545	GCC	2	6	16166	16171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687183
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382	NC_008545	TCA	2	6	23879	23884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687191
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387	NC_008545	CGA	2	6	24221	24226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
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494	NC_008545	GCC	2	6	31196	31201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
495	NC_008545	CTG	2	6	31310	31315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687196
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500	NC_008545	GTG	2	6	31513	31518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687196

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