MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 plasmid 1

Total Repeats: 3727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008545	CG	3	6	89248	89253	0 %	0 %	50 %	50 %	116687247
2002	NC_008545	CTG	2	6	89293	89298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687247
2003	NC_008545	CGGC	2	8	89394	89401	0 %	0 %	50 %	50 %	116687247
2004	NC_008545	AGC	2	6	89456	89461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687247
2005	NC_008545	CG	5	10	89487	89496	0 %	0 %	50 %	50 %	116687247
2006	NC_008545	CTG	2	6	89602	89607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687247
2007	NC_008545	AGG	2	6	89621	89626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116687247
2008	NC_008545	TCG	2	6	89705	89710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687247
2009	NC_008545	CGA	2	6	89765	89770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_008545	TCAA	2	8	89779	89786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2011	NC_008545	TGA	2	6	89942	89947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687248
2012	NC_008545	AGC	2	6	90005	90010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687248
2013	NC_008545	TGA	2	6	90025	90030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687248
2014	NC_008545	GA	3	6	90146	90151	50 %	0 %	50 %	0 %	116687248
2015	NC_008545	ACG	2	6	90171	90176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687248
2016	NC_008545	CGA	2	6	90214	90219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687248
2017	NC_008545	GAAC	2	8	90264	90271	50 %	0 %	25 %	25 %	116687248
2018	NC_008545	AGAT	2	8	90335	90342	50 %	25 %	25 %	0 %	116687248
2019	NC_008545	CG	3	6	90373	90378	0 %	0 %	50 %	50 %	116687248
2020	NC_008545	CGT	2	6	90393	90398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687248
2021	NC_008545	GCG	2	6	90426	90431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687248
2022	NC_008545	CGG	2	6	90481	90486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687248
2023	NC_008545	AC	3	6	90511	90516	50 %	0 %	0 %	50 %	116687248
2024	NC_008545	CATG	2	8	90544	90551	25 %	25 %	25 %	25 %	116687248
2025	NC_008545	ACC	2	6	90560	90565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687248
2026	NC_008545	A	6	6	90620	90625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_008545	A	6	6	90628	90633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_008545	GCAA	2	8	90642	90649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2029	NC_008545	CTT	2	6	90655	90660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_008545	CAG	2	6	90682	90687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_008545	ACC	2	6	90688	90693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_008545	TCG	2	6	90708	90713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_008545	ACA	2	6	90786	90791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687249
2034	NC_008545	AAG	2	6	90828	90833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687249
2035	NC_008545	CTT	2	6	90835	90840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116687249
2036	NC_008545	TCG	2	6	90849	90854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687249
2037	NC_008545	CTT	2	6	90860	90865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116687249
2038	NC_008545	CG	3	6	90872	90877	0 %	0 %	50 %	50 %	116687249
2039	NC_008545	AAC	2	6	90885	90890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687249
2040	NC_008545	ACGG	2	8	90926	90933	25 %	0 %	50 %	25 %	116687249
2041	NC_008545	GTA	2	6	90962	90967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687249
2042	NC_008545	GCT	2	6	91009	91014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687249
2043	NC_008545	GTC	3	9	91034	91042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687249
2044	NC_008545	CCTT	2	8	91116	91123	0 %	50 %	0 %	50 %	116687249
2045	NC_008545	CGT	2	6	91214	91219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687249
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2047	NC_008545	AAGA	2	8	91337	91344	75 %	0 %	25 %	0 %	116687249
2048	NC_008545	CGT	2	6	91351	91356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687249
2049	NC_008545	GC	3	6	91472	91477	0 %	0 %	50 %	50 %	116687249
2050	NC_008545	GCT	2	6	91556	91561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687249
2051	NC_008545	TGC	2	6	91568	91573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687249
2052	NC_008545	CGA	2	6	91591	91596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687249
2053	NC_008545	GTCTC	2	10	91651	91660	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2054	NC_008545	A	7	7	91678	91684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_008545	TCC	2	6	91751	91756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2056	NC_008545	TTC	2	6	91842	91847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_008545	AGCG	2	8	91849	91856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2058	NC_008545	A	6	6	91865	91870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_008545	CAAT	2	8	91879	91886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2060	NC_008545	TGT	2	6	91897	91902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_008545	TCT	2	6	91916	91921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_008545	AGC	2	6	91982	91987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_008545	ATC	2	6	92001	92006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_008545	GAA	2	6	92011	92016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_008545	AG	3	6	92031	92036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2067	NC_008545	GAA	2	6	92087	92092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_008545	CGACA	2	10	92093	92102	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2069	NC_008545	C	6	6	92114	92119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2070	NC_008545	AC	3	6	92133	92138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2071	NC_008545	GAA	2	6	92176	92181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_008545	GT	3	6	92259	92264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2089	NC_008545	CGA	2	6	93232	93237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_008545	TCC	2	6	93245	93250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2091	NC_008545	ACCGCT	2	12	93269	93280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2092	NC_008545	T	6	6	93280	93285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_008545	ATT	2	6	93299	93304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116687251
2094	NC_008545	ATCG	2	8	93360	93367	25 %	25 %	25 %	25 %	116687251
2095	NC_008545	CTT	2	6	93369	93374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116687251
2096	NC_008545	TC	3	6	93439	93444	0 %	50 %	0 %	50 %	116687251
2097	NC_008545	CAC	2	6	93546	93551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687251
2098	NC_008545	CTT	2	6	93629	93634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116687251
2099	NC_008545	GC	3	6	93707	93712	0 %	0 %	50 %	50 %	116687251
2100	NC_008545	ACG	2	6	93724	93729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687251
2101	NC_008545	TTG	2	6	93739	93744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116687251
2102	NC_008545	GAGC	2	8	93782	93789	25 %	0 %	50 %	25 %	116687251
2103	NC_008545	CTC	2	6	93813	93818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116687251
2104	NC_008545	AGA	2	6	93868	93873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687251
2105	NC_008545	CCT	2	6	93940	93945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116687251
2106	NC_008545	TGA	2	6	93962	93967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687251
2107	NC_008545	TCC	2	6	93976	93981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2108	NC_008545	GTTT	2	8	93992	93999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_008545	TTC	2	6	94017	94022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2110	NC_008545	TCAA	2	8	94035	94042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2111	NC_008545	T	7	7	94052	94058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_008545	AAC	2	6	94085	94090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_008545	GAT	2	6	94149	94154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_008545	GGT	2	6	94280	94285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_008545	GGCCT	2	10	94355	94364	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2116	NC_008545	GAG	2	6	94417	94422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_008545	TGCT	2	8	94522	94529	0 %	50 %	25 %	25 %	116687252
2118	NC_008545	CG	3	6	94592	94597	0 %	0 %	50 %	50 %	116687252
2119	NC_008545	GTCC	2	8	94670	94677	0 %	25 %	25 %	50 %	116687252
2120	NC_008545	GTC	2	6	94806	94811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687252
2121	NC_008545	AAC	2	6	94830	94835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687252
2122	NC_008545	CGC	2	6	94866	94871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687252
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2124	NC_008545	GT	3	6	95137	95142	0 %	50 %	50 %	0 %	116687252
2125	NC_008545	GAG	2	6	95145	95150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116687252
2126	NC_008545	CGCGC	2	10	95180	95189	0 %	0 %	40 %	60 %	116687252
2127	NC_008545	GCC	2	6	95239	95244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687252
2128	NC_008545	CG	3	6	95262	95267	0 %	0 %	50 %	50 %	116687252
2129	NC_008545	CGT	2	6	95368	95373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687252
2130	NC_008545	GC	3	6	95384	95389	0 %	0 %	50 %	50 %	116687252
2131	NC_008545	CAGA	2	8	95471	95478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2132	NC_008545	CGAT	3	12	95480	95491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2133	NC_008545	CGACAT	2	12	95496	95507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2151	NC_008545	GCCG	2	8	96455	96462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2260	NC_008545	TGA	2	6	101060	101065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687263
2261	NC_008545	CGC	2	6	101069	101074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687263
2262	NC_008545	ACG	2	6	101090	101095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687263
2263	NC_008545	GCC	2	6	101224	101229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687264
2264	NC_008545	GTG	2	6	101261	101266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687264
2265	NC_008545	GC	3	6	101281	101286	0 %	0 %	50 %	50 %	116687264
2266	NC_008545	CGATGT	2	12	101290	101301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116687264
2267	NC_008545	CGGA	2	8	101326	101333	25 %	0 %	50 %	25 %	116687264
2268	NC_008545	GAT	2	6	101363	101368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687264
2269	NC_008545	GCAT	2	8	101403	101410	25 %	25 %	25 %	25 %	116687264
2270	NC_008545	CG	4	8	101445	101452	0 %	0 %	50 %	50 %	116687264
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2273	NC_008545	ACT	2	6	101670	101675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687265
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2277	NC_008545	TGC	2	6	101855	101860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687265
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2280	NC_008545	TGGC	2	8	101936	101943	0 %	25 %	50 %	25 %	116687265
2281	NC_008545	GGC	2	6	101992	101997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687265
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2284	NC_008545	GCT	2	6	102163	102168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687265
2285	NC_008545	GCCG	2	8	102170	102177	0 %	0 %	50 %	50 %	116687265
2286	NC_008545	CTGCG	2	10	102255	102264	0 %	20 %	40 %	40 %	116687265
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2289	NC_008545	CGC	2	6	102409	102414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687265
2290	NC_008545	GCA	2	6	102422	102427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687265
2291	NC_008545	ATCG	2	8	102450	102457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2292	NC_008545	ATG	2	6	102482	102487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687266
2293	NC_008545	CG	3	6	102586	102591	0 %	0 %	50 %	50 %	116687266
2294	NC_008545	GCG	2	6	102647	102652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687266
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2297	NC_008545	CCG	2	6	102756	102761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687267
2298	NC_008545	GCT	2	6	102780	102785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687267
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2302	NC_008545	CGA	2	6	102861	102866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687267
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2369	NC_008545	CGAG	2	8	105641	105648	25 %	0 %	50 %	25 %	116687269
2370	NC_008545	ACG	2	6	105661	105666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687269
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2372	NC_008545	TTGA	2	8	105707	105714	25 %	50 %	25 %	0 %	116687269
2373	NC_008545	CTA	2	6	105733	105738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2374	NC_008545	CG	3	6	105758	105763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2375	NC_008545	AC	3	6	105805	105810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2376	NC_008545	AGCA	2	8	105909	105916	50 %	0 %	25 %	25 %	116687270
2377	NC_008545	TGC	2	6	105963	105968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687270
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2380	NC_008545	GCCG	2	8	106216	106223	0 %	0 %	50 %	50 %	116687270
2381	NC_008545	GTC	2	6	106310	106315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687270
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