MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 plasmid 1

Total Repeats: 3727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008545	TGG	2	6	22932	22937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687190
502	NC_008545	CCCCG	2	10	22951	22960	0 %	0 %	20 %	80 %	116687190
503	NC_008545	GGC	2	6	22970	22975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687190
504	NC_008545	TCG	2	6	23031	23036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687190
505	NC_008545	CAC	2	6	23062	23067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116687190
506	NC_008545	CGA	2	6	23086	23091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687190
507	NC_008545	GAC	2	6	23092	23097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687190
508	NC_008545	ATCGC	2	10	23186	23195	20 %	20 %	20 %	40 %	116687190
509	NC_008545	GACC	2	8	23242	23249	25 %	0 %	25 %	50 %	116687190
510	NC_008545	CTG	2	6	23373	23378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687190
511	NC_008545	CCG	2	6	23386	23391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687190
512	NC_008545	CG	3	6	23398	23403	0 %	0 %	50 %	50 %	116687190
513	NC_008545	GCT	2	6	23431	23436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687190
514	NC_008545	CGA	2	6	23437	23442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687190
515	NC_008545	CGT	2	6	23494	23499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687190
516	NC_008545	TCGA	2	8	23555	23562	25 %	25 %	25 %	25 %	116687190
517	NC_008545	CGTGC	2	10	23564	23573	0 %	20 %	40 %	40 %	116687190
518	NC_008545	GTC	2	6	23584	23589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687190
519	NC_008545	CGG	2	6	23629	23634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687190
520	NC_008545	TGT	2	6	23756	23761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116687191
521	NC_008545	GTG	2	6	23767	23772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687191
522	NC_008545	TCGG	2	8	23792	23799	0 %	25 %	50 %	25 %	116687191
523	NC_008545	CGC	3	9	23826	23834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687191
524	NC_008545	TGA	2	6	23840	23845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687191
525	NC_008545	GCT	2	6	23850	23855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
526	NC_008545	TGC	2	6	23858	23863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
527	NC_008545	TCA	2	6	23879	23884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687191
528	NC_008545	CAA	2	6	23892	23897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687191
529	NC_008545	CGC	2	6	23940	23945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687191
530	NC_008545	TC	3	6	23969	23974	0 %	50 %	0 %	50 %	116687191
531	NC_008545	TGC	2	6	24062	24067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
532	NC_008545	TTC	2	6	24124	24129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116687191
533	NC_008545	CGA	2	6	24221	24226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
534	NC_008545	GAC	2	6	24243	24248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
535	NC_008545	ACG	2	6	24271	24276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
536	NC_008545	TGC	3	9	24305	24313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
537	NC_008545	TCC	2	6	24437	24442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116687191
538	NC_008545	GTC	2	6	24444	24449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
539	NC_008545	CAA	2	6	24486	24491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687191
540	NC_008545	GGCG	2	8	24504	24511	0 %	0 %	75 %	25 %	116687191
541	NC_008545	GC	3	6	24541	24546	0 %	0 %	50 %	50 %	116687191
542	NC_008545	TGA	2	6	24566	24571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687191
543	NC_008545	CGA	2	6	24593	24598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
544	NC_008545	GCG	2	6	24716	24721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
545	NC_008545	TATC	2	8	24773	24780	25 %	50 %	0 %	25 %	116687191
546	NC_008545	TCA	2	6	24800	24805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687191
547	NC_008545	GGC	2	6	24879	24884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
548	NC_008545	CGA	2	6	24906	24911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
549	NC_008545	GCT	2	6	24918	24923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
550	NC_008545	ATT	2	6	24937	24942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116687191
551	NC_008545	CGGC	2	8	24980	24987	0 %	0 %	50 %	50 %	116687191
552	NC_008545	GCG	2	6	25013	25018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
553	NC_008545	CGG	2	6	25044	25049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
554	NC_008545	CAG	2	6	25051	25056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
555	NC_008545	CGA	2	6	25065	25070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
556	NC_008545	TCG	3	9	25096	25104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
557	NC_008545	ACA	2	6	25148	25153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687191
558	NC_008545	TCGC	2	8	25232	25239	0 %	25 %	25 %	50 %	116687191
559	NC_008545	CGAA	2	8	25336	25343	50 %	0 %	25 %	25 %	116687191
560	NC_008545	AGC	2	6	25364	25369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
561	NC_008545	AGC	2	6	25396	25401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
562	NC_008545	CGA	2	6	25431	25436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
563	NC_008545	GCG	2	6	25479	25484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
564	NC_008545	TGG	2	6	25572	25577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687191
565	NC_008545	CGG	2	6	25626	25631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
566	NC_008545	GGC	3	9	25636	25644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
567	NC_008545	GGT	2	6	25651	25656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687191
568	NC_008545	AGA	3	9	25734	25742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687191
569	NC_008545	CTCG	2	8	25747	25754	0 %	25 %	25 %	50 %	116687191
570	NC_008545	CGAA	2	8	25781	25788	50 %	0 %	25 %	25 %	116687191
571	NC_008545	ATCG	2	8	25811	25818	25 %	25 %	25 %	25 %	116687191
572	NC_008545	GGC	3	9	25846	25854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
573	NC_008545	TCG	2	6	25949	25954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
574	NC_008545	AGT	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687191
575	NC_008545	GCC	2	6	25972	25977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687191
576	NC_008545	TC	3	6	25997	26002	0 %	50 %	0 %	50 %	116687191
577	NC_008545	GCA	2	6	26049	26054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
578	NC_008545	CGCAG	2	10	26128	26137	20 %	0 %	40 %	40 %	116687191
579	NC_008545	CG	3	6	26171	26176	0 %	0 %	50 %	50 %	116687191
580	NC_008545	TGA	2	6	26195	26200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687191
581	NC_008545	GC	3	6	26227	26232	0 %	0 %	50 %	50 %	116687191
582	NC_008545	CAGC	2	8	26247	26254	25 %	0 %	25 %	50 %	116687191
583	NC_008545	TGA	2	6	26255	26260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687191
584	NC_008545	CGT	2	6	26388	26393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
585	NC_008545	CGT	2	6	26441	26446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
586	NC_008545	CCG	2	6	26525	26530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687191
587	NC_008545	GCA	2	6	26553	26558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
588	NC_008545	CCG	2	6	26576	26581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687191
589	NC_008545	ACA	2	6	26624	26629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687191
590	NC_008545	CGCT	2	8	26662	26669	0 %	25 %	25 %	50 %	116687191
591	NC_008545	AAC	2	6	26760	26765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116687191
592	NC_008545	GCG	2	6	26842	26847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
593	NC_008545	GCCG	2	8	26916	26923	0 %	0 %	50 %	50 %	116687191
594	NC_008545	ATC	2	6	26954	26959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687191
595	NC_008545	GCCG	2	8	26990	26997	0 %	0 %	50 %	50 %	116687191
596	NC_008545	AAG	2	6	27023	27028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116687191
597	NC_008545	GCC	2	6	27036	27041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687191
598	NC_008545	GGT	2	6	27066	27071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116687191
599	NC_008545	GCG	2	6	27122	27127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
600	NC_008545	ACG	2	6	27151	27156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
601	NC_008545	GATC	2	8	27330	27337	25 %	25 %	25 %	25 %	116687191
602	NC_008545	CTG	2	6	27356	27361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687191
603	NC_008545	ACG	2	6	27437	27442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687191
604	NC_008545	CGG	2	6	27446	27451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
605	NC_008545	GCG	2	6	27455	27460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116687191
606	NC_008545	GAT	2	6	27565	27570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687191
607	NC_008545	CAAT	2	8	27620	27627	50 %	25 %	0 %	25 %	116687192
608	NC_008545	TC	3	6	27663	27668	0 %	50 %	0 %	50 %	116687192
609	NC_008545	GCT	2	6	27692	27697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687192
610	NC_008545	TTG	2	6	27702	27707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116687192
611	NC_008545	TCA	2	6	27732	27737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687192
612	NC_008545	GC	3	6	27742	27747	0 %	0 %	50 %	50 %	116687192
613	NC_008545	ATG	2	6	27753	27758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687192
614	NC_008545	AG	3	6	27817	27822	50 %	0 %	50 %	0 %	116687192
615	NC_008545	AATC	2	8	27920	27927	50 %	25 %	0 %	25 %	116687192
616	NC_008545	ACG	2	6	27949	27954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116687192
617	NC_008545	CTG	2	6	27973	27978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687192
618	NC_008545	ATG	2	6	28014	28019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116687192
619	NC_008545	TGA	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008545	TCG	2	6	28096	28101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_008545	CCTGC	2	10	28178	28187	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
622	NC_008545	TGC	2	6	28192	28197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_008545	CGA	2	6	28216	28221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008545	CTA	2	6	28320	28325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116687193
625	NC_008545	TGC	2	6	28328	28333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687193
626	NC_008545	GTC	3	9	28365	28373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687193
627	NC_008545	CT	3	6	28392	28397	0 %	50 %	0 %	50 %	116687193
628	NC_008545	CTC	2	6	28416	28421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116687193
629	NC_008545	GC	3	6	28520	28525	0 %	0 %	50 %	50 %	116687193
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631	NC_008545	CGC	2	6	28564	28569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116687193
632	NC_008545	GC	3	6	28590	28595	0 %	0 %	50 %	50 %	116687193
633	NC_008545	GTC	2	6	28618	28623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116687193
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