MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 3

Total Repeats: 20042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008544	CCG	2	6	63	68	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686246
2	NC_008544	GTC	2	6	76	81	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686246
3	NC_008544	GTG	2	6	89	94	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686246
4	NC_008544	ATG	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686246
5	NC_008544	GCG	2	6	158	163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686246
6	NC_008544	TTG	2	6	220	225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686246
7	NC_008544	ATG	2	6	239	244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686246
8	NC_008544	GAT	2	6	292	297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008544	GTT	2	6	321	326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008544	GTG	2	6	335	340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008544	CGA	2	6	342	347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008544	GCT	2	6	387	392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686247
13	NC_008544	TCG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686247
14	NC_008544	CGA	2	6	466	471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686247
15	NC_008544	GCG	2	6	489	494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686247
16	NC_008544	CGA	2	6	535	540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686247
17	NC_008544	GAT	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686247
18	NC_008544	TCG	2	6	607	612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008544	CAC	2	6	633	638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008544	ACT	2	6	643	648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008544	CGA	2	6	664	669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008544	ACC	2	6	691	696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008544	CGA	2	6	975	980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686248
24	NC_008544	GCG	2	6	1007	1012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686248
25	NC_008544	CTG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686248
26	NC_008544	GTC	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008544	CGT	2	6	1100	1105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008544	GCC	2	6	1189	1194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008544	CGC	2	6	1273	1278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008544	CGG	2	6	1351	1356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008544	CAA	2	6	1515	1520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008544	ACA	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008544	CAT	2	6	1617	1622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686249
34	NC_008544	CGG	2	6	1679	1684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686249
35	NC_008544	CAT	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686249
36	NC_008544	CGT	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
37	NC_008544	TCT	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116686249
38	NC_008544	ACG	2	6	1859	1864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686249
39	NC_008544	CCG	2	6	1939	1944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
40	NC_008544	TGC	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
41	NC_008544	TGG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686249
42	NC_008544	CGG	2	6	2114	2119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686249
43	NC_008544	CCG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
44	NC_008544	GCT	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
45	NC_008544	CGC	2	6	2334	2339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
46	NC_008544	AGC	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686249
47	NC_008544	CGT	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
48	NC_008544	CGC	3	9	2487	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
49	NC_008544	GCC	2	6	2500	2505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
50	NC_008544	GCT	2	6	2520	2525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
51	NC_008544	CGC	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686249
52	NC_008544	GAC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686249
53	NC_008544	TCT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116686249
54	NC_008544	CGA	2	6	2685	2690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686249
55	NC_008544	GCT	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
56	NC_008544	TGA	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686249
57	NC_008544	CGT	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
58	NC_008544	GCT	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
59	NC_008544	TCG	3	9	2813	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
60	NC_008544	CGT	2	6	2824	2829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686249
61	NC_008544	CGC	2	6	2931	2936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
62	NC_008544	GCC	2	6	2979	2984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
63	NC_008544	CTG	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
64	NC_008544	CGC	2	6	3104	3109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
65	NC_008544	CGG	2	6	3166	3171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686250
66	NC_008544	CGA	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686250
67	NC_008544	CCG	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
68	NC_008544	TGC	3	9	3226	3234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
69	NC_008544	TGC	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
70	NC_008544	TCG	2	6	3391	3396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
71	NC_008544	CGC	2	6	3425	3430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
72	NC_008544	CCG	2	6	3452	3457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
73	NC_008544	GCT	2	6	3530	3535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
74	NC_008544	CGA	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686250
75	NC_008544	TCG	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
76	NC_008544	CGA	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686250
77	NC_008544	TCG	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
78	NC_008544	ACT	2	6	3764	3769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686250
79	NC_008544	CGG	3	9	3772	3780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686250
80	NC_008544	GTC	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
81	NC_008544	TGC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
82	NC_008544	GCT	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686250
83	NC_008544	ACG	2	6	4097	4102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686250
84	NC_008544	CAC	2	6	4173	4178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686250
85	NC_008544	GCC	2	6	4207	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686250
86	NC_008544	GAC	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008544	ATC	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008544	CGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
89	NC_008544	CTT	2	6	4334	4339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116686251
90	NC_008544	CGT	2	6	4343	4348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
91	NC_008544	ACG	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
92	NC_008544	CGA	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
93	NC_008544	GCC	2	6	4449	4454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
94	NC_008544	GCG	2	6	4457	4462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686251
95	NC_008544	AGG	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686251
96	NC_008544	CGA	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
97	NC_008544	GCC	2	6	4530	4535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
98	NC_008544	CCG	2	6	4575	4580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
99	NC_008544	TGA	2	6	4594	4599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686251
100	NC_008544	GTC	2	6	4626	4631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
101	NC_008544	GCG	2	6	4632	4637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686251
102	NC_008544	GCA	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
103	NC_008544	CCG	3	9	4678	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
104	NC_008544	CTA	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686251
105	NC_008544	CTG	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
106	NC_008544	TCG	2	6	4852	4857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
107	NC_008544	TCA	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686251
108	NC_008544	GCT	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
109	NC_008544	CGG	2	6	5096	5101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686251
110	NC_008544	CGT	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686251
111	NC_008544	ACG	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686251
112	NC_008544	CCG	3	9	5186	5194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686251
113	NC_008544	GCG	2	6	5430	5435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686252
114	NC_008544	TCG	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
115	NC_008544	TCG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
116	NC_008544	CCG	2	6	5596	5601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686252
117	NC_008544	CGT	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
118	NC_008544	GCT	2	6	5645	5650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
119	NC_008544	CGA	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686252
120	NC_008544	TGC	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686252
121	NC_008544	CTT	2	6	5706	5711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008544	CAT	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008544	GCA	2	6	5920	5925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008544	GCC	2	6	5936	5941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008544	CGG	2	6	6074	6079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686253
126	NC_008544	GGT	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686253
127	NC_008544	ACT	3	9	6368	6376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686253
128	NC_008544	GTC	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686253
129	NC_008544	ATC	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686253
130	NC_008544	CGC	2	6	6534	6539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008544	TTG	2	6	6544	6549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008544	GGA	2	6	6551	6556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008544	TCG	2	6	6595	6600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686254
134	NC_008544	GCT	2	6	6611	6616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686254
135	NC_008544	CGC	2	6	6850	6855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686254
136	NC_008544	CGC	2	6	6875	6880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686254
137	NC_008544	CTG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686254
138	NC_008544	CGT	2	6	6916	6921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686254
139	NC_008544	CAC	3	9	6971	6979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686254
140	NC_008544	ACG	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686254
141	NC_008544	CCG	2	6	7115	7120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_008544	CGT	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686255
143	NC_008544	CGG	2	6	7194	7199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686255
144	NC_008544	GCC	2	6	7362	7367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686255
145	NC_008544	CGC	2	6	7394	7399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686255
146	NC_008544	ACG	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686255
147	NC_008544	TGC	2	6	7637	7642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686255
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149	NC_008544	ACC	2	6	7855	7860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686255
150	NC_008544	GCG	2	6	7889	7894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686255
151	NC_008544	GCG	2	6	8038	8043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686255
152	NC_008544	GCG	2	6	8065	8070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686255
153	NC_008544	GCA	2	6	8166	8171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008544	GCG	2	6	8245	8250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686256
155	NC_008544	ACG	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686256
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157	NC_008544	TCG	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686256
158	NC_008544	TTG	2	6	8460	8465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686256
159	NC_008544	GAT	2	6	8693	8698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686256
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163	NC_008544	AGC	4	12	8811	8822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686256
164	NC_008544	GCG	2	6	8862	8867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686256
165	NC_008544	GCG	2	6	8935	8940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686256
166	NC_008544	GTT	2	6	8945	8950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686256
167	NC_008544	CGT	3	9	9085	9093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686256
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171	NC_008544	CCG	2	6	9370	9375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_008544	CCG	2	6	9380	9385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_008544	GCT	2	6	9550	9555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_008544	TAT	2	6	9556	9561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008544	CGA	2	6	9603	9608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_008544	GCC	2	6	9684	9689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_008544	CCG	3	9	9775	9783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686257
178	NC_008544	CGC	2	6	9792	9797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686257
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253	NC_008544	CAT	2	6	13424	13429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_008544	CTG	2	6	13472	13477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_008544	CGC	2	6	13501	13506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_008544	CGC	2	6	13538	13543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686260
257	NC_008544	GCG	2	6	13550	13555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686260
258	NC_008544	GCG	2	6	13576	13581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686260
259	NC_008544	GCT	2	6	13592	13597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686260
260	NC_008544	GCC	2	6	13601	13606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686260
261	NC_008544	GCT	2	6	13667	13672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686260
262	NC_008544	GCT	3	9	13724	13732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686260
263	NC_008544	CGC	2	6	13775	13780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686260
264	NC_008544	CGA	2	6	13858	13863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686260
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269	NC_008544	GCT	2	6	14018	14023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686260
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278	NC_008544	TCG	2	6	14296	14301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686260
279	NC_008544	CTG	2	6	14421	14426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686260
280	NC_008544	GCA	2	6	14543	14548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686261
281	NC_008544	TCA	2	6	14597	14602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686261
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284	NC_008544	TCG	2	6	14885	14890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686261
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287	NC_008544	GTC	3	9	14950	14958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686261
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293	NC_008544	CGA	2	6	15549	15554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686261
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317	NC_008544	ACG	2	6	16644	16649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686262
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320	NC_008544	GAC	2	6	16939	16944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
321	NC_008544	CGC	2	6	17005	17010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686263
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332	NC_008544	TCG	2	6	17495	17500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686263
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352	NC_008544	CGT	2	6	18544	18549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686264
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354	NC_008544	CGG	2	6	18719	18724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686265
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368	NC_008544	CGT	2	6	19607	19612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
369	NC_008544	CCG	2	6	19663	19668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
370	NC_008544	CGA	2	6	19712	19717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
371	NC_008544	CCG	2	6	19742	19747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
372	NC_008544	TCG	2	6	19868	19873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686266
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375	NC_008544	ATG	2	6	20000	20005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
376	NC_008544	CGC	2	6	20283	20288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686267
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