MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 3

Total Repeats: 30860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008544	GAA	2	6	17035	17040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116686263
502	NC_008544	CG	3	6	17053	17058	0 %	0 %	50 %	50 %	116686263
503	NC_008544	GCGTT	2	10	17059	17068	0 %	40 %	40 %	20 %	116686263
504	NC_008544	GCC	2	6	17082	17087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686263
505	NC_008544	CGC	2	6	17103	17108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686263
506	NC_008544	GC	3	6	17177	17182	0 %	0 %	50 %	50 %	116686263
507	NC_008544	GAG	2	6	17199	17204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686263
508	NC_008544	TCAT	2	8	17207	17214	25 %	50 %	0 %	25 %	116686263
509	NC_008544	CGA	2	6	17220	17225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686263
510	NC_008544	GC	3	6	17239	17244	0 %	0 %	50 %	50 %	116686263
511	NC_008544	GGTC	2	8	17262	17269	0 %	25 %	50 %	25 %	116686263
512	NC_008544	CGT	2	6	17271	17276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686263
513	NC_008544	CAT	2	6	17322	17327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686263
514	NC_008544	GCA	2	6	17342	17347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686263
515	NC_008544	CAG	2	6	17398	17403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686263
516	NC_008544	TCG	2	6	17474	17479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686263
517	NC_008544	TCG	2	6	17495	17500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686263
518	NC_008544	CCCG	2	8	17509	17516	0 %	0 %	25 %	75 %	116686263
519	NC_008544	CGA	2	6	17537	17542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686263
520	NC_008544	CGC	2	6	17610	17615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686263
521	NC_008544	GC	3	6	17630	17635	0 %	0 %	50 %	50 %	116686263
522	NC_008544	CGC	2	6	17648	17653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686263
523	NC_008544	ACG	2	6	17680	17685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686263
524	NC_008544	TGG	2	6	17696	17701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686263
525	NC_008544	TCG	2	6	17827	17832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686263
526	NC_008544	CG	3	6	17873	17878	0 %	0 %	50 %	50 %	116686263
527	NC_008544	TCG	2	6	17985	17990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686264
528	NC_008544	CCG	2	6	18017	18022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686264
529	NC_008544	TTC	2	6	18073	18078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116686264
530	NC_008544	GCG	2	6	18111	18116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686264
531	NC_008544	CG	3	6	18178	18183	0 %	0 %	50 %	50 %	116686264
532	NC_008544	CCG	2	6	18212	18217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686264
533	NC_008544	GCG	2	6	18232	18237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686264
534	NC_008544	GCC	2	6	18260	18265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686264
535	NC_008544	GC	3	6	18353	18358	0 %	0 %	50 %	50 %	116686264
536	NC_008544	TGC	2	6	18377	18382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686264
537	NC_008544	CATC	2	8	18387	18394	25 %	25 %	0 %	50 %	116686264
538	NC_008544	GCA	2	6	18408	18413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686264
539	NC_008544	CGA	2	6	18414	18419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686264
540	NC_008544	AGC	2	6	18458	18463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686264
541	NC_008544	CGG	2	6	18503	18508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686264
542	NC_008544	CAG	2	6	18526	18531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686264
543	NC_008544	CGT	2	6	18544	18549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686264
544	NC_008544	CGC	2	6	18624	18629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_008544	CGG	2	6	18719	18724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686265
546	NC_008544	TAC	2	6	18853	18858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686265
547	NC_008544	CGA	2	6	18888	18893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686265
548	NC_008544	GCTC	2	8	18909	18916	0 %	25 %	25 %	50 %	116686265
549	NC_008544	AGC	2	6	18923	18928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686265
550	NC_008544	ACGA	2	8	18967	18974	50 %	0 %	25 %	25 %	116686265
551	NC_008544	TCG	2	6	19034	19039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686265
552	NC_008544	TCGC	2	8	19048	19055	0 %	25 %	25 %	50 %	116686265
553	NC_008544	CGA	2	6	19065	19070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686265
554	NC_008544	GGC	2	6	19080	19085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686265
555	NC_008544	TGG	2	6	19118	19123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686265
556	NC_008544	TG	3	6	19154	19159	0 %	50 %	50 %	0 %	116686265
557	NC_008544	GC	3	6	19187	19192	0 %	0 %	50 %	50 %	116686265
558	NC_008544	CGC	2	6	19199	19204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686265
559	NC_008544	CAT	2	6	19219	19224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686265
560	NC_008544	GCG	2	6	19363	19368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686265
561	NC_008544	CTTC	2	8	19393	19400	0 %	50 %	0 %	50 %	116686265
562	NC_008544	CGA	2	6	19413	19418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686265
563	NC_008544	GA	3	6	19424	19429	50 %	0 %	50 %	0 %	116686265
564	NC_008544	GCA	2	6	19503	19508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686265
565	NC_008544	GCC	2	6	19589	19594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_008544	CGT	2	6	19607	19612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008544	CCG	2	6	19663	19668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_008544	CGA	2	6	19712	19717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008544	CCG	2	6	19742	19747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_008544	CG	3	6	19770	19775	0 %	0 %	50 %	50 %	116686266
571	NC_008544	CTCG	2	8	19825	19832	0 %	25 %	25 %	50 %	116686266
572	NC_008544	TCG	2	6	19868	19873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686266
573	NC_008544	AGG	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686266
574	NC_008544	TGT	2	6	19980	19985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686266
575	NC_008544	ATTTTA	2	12	19988	19999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116686266
576	NC_008544	ATG	2	6	20000	20005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008544	GC	3	6	20013	20018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_008544	CGTC	2	8	20233	20240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_008544	CGC	2	6	20283	20288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686267
580	NC_008544	CAGC	2	8	20339	20346	25 %	0 %	25 %	50 %	116686267
581	NC_008544	GTC	2	6	20391	20396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686267
582	NC_008544	GCC	2	6	20397	20402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686267
583	NC_008544	A	7	7	20483	20489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008544	AGG	2	6	20528	20533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008544	GAG	2	6	20558	20563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008544	TGA	2	6	20572	20577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008544	CTT	2	6	20590	20595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008544	GCCG	2	8	20625	20632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_008544	TG	3	6	20654	20659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008544	GTC	2	6	20745	20750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_008544	AGC	3	9	20795	20803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686268
592	NC_008544	CTG	2	6	20827	20832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686268
593	NC_008544	TCG	2	6	20877	20882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686268
594	NC_008544	TCA	2	6	20895	20900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686268
595	NC_008544	GC	3	6	20907	20912	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
596	NC_008544	GCC	2	6	20944	20949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
597	NC_008544	GC	3	6	21042	21047	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
598	NC_008544	CCG	2	6	21072	21077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
599	NC_008544	CGG	3	9	21126	21134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686268
600	NC_008544	GTA	2	6	21187	21192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686268
601	NC_008544	TTG	2	6	21245	21250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686268
602	NC_008544	CGG	2	6	21373	21378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686268
603	NC_008544	GCC	3	9	21395	21403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
604	NC_008544	CGA	2	6	21433	21438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686268
605	NC_008544	CGG	2	6	21472	21477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686268
606	NC_008544	TCA	2	6	21495	21500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686268
607	NC_008544	CAC	2	6	21502	21507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686268
608	NC_008544	GC	3	6	21534	21539	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
609	NC_008544	CGC	2	6	21544	21549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
610	NC_008544	CG	3	6	21627	21632	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
611	NC_008544	AGG	2	6	21641	21646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686268
612	NC_008544	GAGCG	2	10	21658	21667	20 %	0 %	60 %	20 %	116686268
613	NC_008544	ACG	2	6	21722	21727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686268
614	NC_008544	GCC	2	6	21762	21767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
615	NC_008544	CGGC	3	12	21811	21822	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
616	NC_008544	CT	3	6	21938	21943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_008544	GCA	2	6	21977	21982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008544	GGCC	2	8	21987	21994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_008544	TCG	2	6	22015	22020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008544	TCG	2	6	22053	22058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_008544	CG	4	8	22152	22159	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
622	NC_008544	CG	3	6	22162	22167	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
623	NC_008544	GCG	2	6	22241	22246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686269
624	NC_008544	ACTTTC	2	12	22265	22276	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116686269
625	NC_008544	GCG	2	6	22543	22548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686269
626	NC_008544	CG	4	8	22575	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
627	NC_008544	CGGCCG	2	12	22589	22600	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
628	NC_008544	CGC	2	6	22608	22613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686269
629	NC_008544	CG	3	6	22635	22640	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
630	NC_008544	GCCG	2	8	22653	22660	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
631	NC_008544	CAG	2	6	22683	22688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686269
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633	NC_008544	ACG	2	6	22814	22819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_008544	AATTC	2	10	22827	22836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
635	NC_008544	TC	3	6	22835	22840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_008544	GGC	2	6	22903	22908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_008544	CGC	2	6	22961	22966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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752	NC_008544	CGG	2	6	27378	27383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686275
753	NC_008544	GCGG	2	8	27484	27491	0 %	0 %	75 %	25 %	116686275
754	NC_008544	GC	3	6	27496	27501	0 %	0 %	50 %	50 %	116686275
755	NC_008544	GC	3	6	27503	27508	0 %	0 %	50 %	50 %	116686275
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757	NC_008544	CCGGC	2	10	27527	27536	0 %	0 %	40 %	60 %	116686275
758	NC_008544	GC	3	6	27571	27576	0 %	0 %	50 %	50 %	116686275
759	NC_008544	CG	3	6	27636	27641	0 %	0 %	50 %	50 %	116686275
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765	NC_008544	ATCG	2	8	27974	27981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
766	NC_008544	CGG	2	6	27991	27996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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