MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 2

Total Repeats: 56366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008543	CGG	2	6	46	51	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008543	GGC	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691274
3	NC_008543	GAC	2	6	265	270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691274
4	NC_008543	TCG	2	6	278	283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691274
5	NC_008543	CAG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691274
6	NC_008543	TGA	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691274
7	NC_008543	CGG	2	6	470	475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008543	GCG	2	6	476	481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008543	CGG	2	6	509	514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008543	GCG	2	6	550	555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008543	GCC	2	6	624	629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008543	GGC	2	6	636	641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008543	GGC	2	6	649	654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008543	GCG	2	6	701	706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008543	CGG	3	9	801	809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
16	NC_008543	GCA	2	6	818	823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
17	NC_008543	CGA	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
18	NC_008543	TCT	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
19	NC_008543	GCG	2	6	979	984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
20	NC_008543	TGC	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
21	NC_008543	CGC	2	6	1067	1072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
22	NC_008543	TGA	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
23	NC_008543	GTC	3	9	1179	1187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
24	NC_008543	TCG	2	6	1231	1236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
25	NC_008543	CAT	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162228942
26	NC_008543	TTC	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
27	NC_008543	GAT	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
28	NC_008543	CTT	2	6	1356	1361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
29	NC_008543	CGG	2	6	1401	1406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
30	NC_008543	TGC	2	6	1444	1449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
31	NC_008543	GCC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
32	NC_008543	GCA	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
33	NC_008543	CCG	2	6	1555	1560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
34	NC_008543	GCG	2	6	1598	1603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
35	NC_008543	TCG	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
36	NC_008543	CGA	2	6	1721	1726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
37	NC_008543	CAT	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162228942
38	NC_008543	CTT	2	6	1905	1910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
39	NC_008543	GTC	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
40	NC_008543	GCG	2	6	1952	1957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
41	NC_008543	TGA	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
42	NC_008543	TTC	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
43	NC_008543	ATG	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
44	NC_008543	CCG	2	6	2251	2256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
45	NC_008543	CAG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
46	NC_008543	TTC	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
47	NC_008543	CGG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
48	NC_008543	CGA	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
49	NC_008543	CAG	2	6	2360	2365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
50	NC_008543	GCC	2	6	2401	2406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008543	GGC	2	6	2715	2720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008543	CGG	2	6	2803	2808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008543	CAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008543	CCG	2	6	2908	2913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691276
55	NC_008543	CTG	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691276
56	NC_008543	CAC	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691276
57	NC_008543	CGC	2	6	3053	3058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691276
58	NC_008543	GCG	2	6	3065	3070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691276
59	NC_008543	AGC	3	9	3105	3113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691276
60	NC_008543	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691276
61	NC_008543	ACG	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691276
62	NC_008543	CGA	2	6	3230	3235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008543	CGA	2	6	3340	3345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008543	CGC	2	6	3450	3455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008543	TGC	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008543	CGT	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
67	NC_008543	GTC	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
68	NC_008543	GCA	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
69	NC_008543	TCG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
70	NC_008543	GGC	2	6	3899	3904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691277
71	NC_008543	GCC	2	6	4041	4046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691277
72	NC_008543	GCA	3	9	4076	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
73	NC_008543	ATG	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691277
74	NC_008543	CGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
75	NC_008543	CGA	2	6	4208	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
76	NC_008543	CGA	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
77	NC_008543	GTC	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
78	NC_008543	AGC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
79	NC_008543	CCA	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691277
80	NC_008543	CGA	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
81	NC_008543	GCG	2	6	4360	4365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691277
82	NC_008543	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008543	CGA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008543	GAC	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008543	TCG	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
86	NC_008543	CGG	2	6	4829	4834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
87	NC_008543	ACG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
88	NC_008543	CGG	2	6	4904	4909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
89	NC_008543	ACC	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691278
90	NC_008543	TTC	2	6	4936	4941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116691278
91	NC_008543	ACG	2	6	4954	4959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
92	NC_008543	GGC	2	6	4963	4968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
93	NC_008543	CCG	2	6	4982	4987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
94	NC_008543	CGC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
95	NC_008543	CGA	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
96	NC_008543	GGT	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116691278
97	NC_008543	GCG	2	6	5131	5136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
98	NC_008543	CCG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
99	NC_008543	TCG	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
100	NC_008543	CGC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
101	NC_008543	CGC	2	6	5502	5507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
102	NC_008543	CGC	2	6	5583	5588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
103	NC_008543	CGG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
104	NC_008543	GCG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
105	NC_008543	GTG	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116691278
106	NC_008543	CGG	2	6	5772	5777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
107	NC_008543	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
108	NC_008543	GCA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
109	NC_008543	TCG	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
110	NC_008543	GCG	2	6	5965	5970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
111	NC_008543	CTC	2	6	6114	6119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008543	CCG	2	6	6166	6171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008543	ACG	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008543	CGG	2	6	6362	6367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008543	GAC	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008543	GAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691279
117	NC_008543	GGC	2	6	6509	6514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691279
118	NC_008543	CGC	2	6	6617	6622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691279
119	NC_008543	TCG	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691279
120	NC_008543	GTC	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691279
121	NC_008543	GAC	2	6	6729	6734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691279
122	NC_008543	ACG	3	9	6776	6784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691279
123	NC_008543	CTG	3	9	6797	6805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691279
124	NC_008543	AGC	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691279
125	NC_008543	AAC	2	6	6842	6847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116691279
126	NC_008543	GCA	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691279
127	NC_008543	GCG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691279
128	NC_008543	GCC	2	6	7067	7072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691279
129	NC_008543	GAT	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691279
130	NC_008543	CGA	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691279
131	NC_008543	TCG	2	6	7296	7301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691279
132	NC_008543	GTC	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691279
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156	NC_008543	GCA	2	6	8552	8557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_008543	TGA	2	6	13791	13796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_008543	GAA	2	6	21168	21173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116691289
385	NC_008543	GTC	2	6	21282	21287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691289
386	NC_008543	GCG	2	6	21295	21300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691289
387	NC_008543	CGT	2	6	21342	21347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691289
388	NC_008543	GGC	2	6	21474	21479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691289
389	NC_008543	GCG	2	6	21497	21502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691289
390	NC_008543	CGT	2	6	21536	21541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691289
391	NC_008543	GGC	2	6	21786	21791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_008543	TGC	2	6	21827	21832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_008543	AGC	2	6	21971	21976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691290
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396	NC_008543	GCA	2	6	22095	22100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691290
397	NC_008543	GAC	2	6	22107	22112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691290
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399	NC_008543	TCG	2	6	22361	22366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691290
400	NC_008543	CGA	2	6	22370	22375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691290
401	NC_008543	CTT	2	6	22419	22424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116691290
402	NC_008543	GCT	2	6	22464	22469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691290
403	NC_008543	CGA	2	6	22470	22475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691290
404	NC_008543	TCG	2	6	22492	22497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691290
405	NC_008543	GCT	2	6	22503	22508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691290
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409	NC_008543	GCT	2	6	22671	22676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691290
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411	NC_008543	TCG	2	6	22741	22746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691291
412	NC_008543	CGG	2	6	22774	22779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691291
413	NC_008543	CGA	2	6	22784	22789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691291
414	NC_008543	TCG	2	6	22810	22815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691291
415	NC_008543	CGC	2	6	23020	23025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691291
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421	NC_008543	GAC	2	6	23186	23191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691292
422	NC_008543	CTA	2	6	23200	23205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116691292
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497	NC_008543	CGG	2	6	26570	26575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691293
498	NC_008543	CGA	2	6	26578	26583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691293
499	NC_008543	GCG	2	6	26585	26590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691293
500	NC_008543	TGC	2	6	26637	26642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691293

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