MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 2

Total Repeats: 86869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008543	GCCGT	2	10	197532	197541	0 %	20 %	40 %	40 %	116691464
5002	NC_008543	ACG	2	6	197565	197570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691464
5003	NC_008543	GTTCG	2	10	197591	197600	0 %	40 %	40 %	20 %	116691464
5004	NC_008543	GCG	2	6	197611	197616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691464
5005	NC_008543	GCG	2	6	197677	197682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_008543	GC	3	6	197714	197719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_008543	GC	3	6	197734	197739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_008543	CG	3	6	197873	197878	0 %	0 %	50 %	50 %	116691465
5009	NC_008543	GCG	2	6	197895	197900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691465
5010	NC_008543	GC	3	6	197946	197951	0 %	0 %	50 %	50 %	116691465
5011	NC_008543	CGT	2	6	197967	197972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691465
5012	NC_008543	CG	4	8	198094	198101	0 %	0 %	50 %	50 %	116691465
5013	NC_008543	CCG	2	6	198111	198116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691465
5014	NC_008543	CGC	2	6	198145	198150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691465
5015	NC_008543	TCG	2	6	198220	198225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691466
5016	NC_008543	CGC	2	6	198232	198237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691466
5017	NC_008543	GC	3	6	198242	198247	0 %	0 %	50 %	50 %	116691466
5018	NC_008543	TCG	2	6	198250	198255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691466
5019	NC_008543	CAG	2	6	198258	198263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691466
5020	NC_008543	GCC	2	6	198295	198300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691466
5021	NC_008543	GCT	2	6	198314	198319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691466
5022	NC_008543	CGA	2	6	198425	198430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691466
5023	NC_008543	CGC	2	6	198540	198545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691466
5024	NC_008543	GCG	2	6	198546	198551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691466
5025	NC_008543	TGC	2	6	198568	198573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691466
5026	NC_008543	AGCG	2	8	198590	198597	25 %	0 %	50 %	25 %	116691466
5027	NC_008543	CGC	2	6	198621	198626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_008543	AGC	2	6	198636	198641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5029	NC_008543	CGA	2	6	198646	198651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5030	NC_008543	GC	3	6	198652	198657	0 %	0 %	50 %	50 %	116691467
5031	NC_008543	GCCATT	2	12	198773	198784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116691467
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5033	NC_008543	GCGCC	2	10	198812	198821	0 %	0 %	40 %	60 %	116691467
5034	NC_008543	ACG	2	6	198861	198866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5035	NC_008543	GC	3	6	198890	198895	0 %	0 %	50 %	50 %	116691467
5036	NC_008543	CG	4	8	198967	198974	0 %	0 %	50 %	50 %	116691467
5037	NC_008543	TTGTCG	2	12	198975	198986	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116691467
5038	NC_008543	GC	4	8	198997	199004	0 %	0 %	50 %	50 %	116691467
5039	NC_008543	GGC	2	6	199026	199031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691467
5040	NC_008543	GCCG	2	8	199058	199065	0 %	0 %	50 %	50 %	116691467
5041	NC_008543	ACG	2	6	199098	199103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5042	NC_008543	CGT	2	6	199154	199159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5043	NC_008543	CGT	2	6	199219	199224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5044	NC_008543	CG	3	6	199226	199231	0 %	0 %	50 %	50 %	116691467
5045	NC_008543	CTG	2	6	199307	199312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691467
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5050	NC_008543	TGC	2	6	199455	199460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5051	NC_008543	TCG	2	6	199477	199482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5052	NC_008543	AGC	2	6	199518	199523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5053	NC_008543	TCG	2	6	199561	199566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5054	NC_008543	GCC	2	6	199633	199638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691467
5055	NC_008543	GC	3	6	199670	199675	0 %	0 %	50 %	50 %	116691467
5056	NC_008543	TCGA	2	8	199686	199693	25 %	25 %	25 %	25 %	116691467
5057	NC_008543	GCG	2	6	199711	199716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691467
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5059	NC_008543	ATC	2	6	199764	199769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116691467
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5061	NC_008543	CAG	2	6	199826	199831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5062	NC_008543	GTC	2	6	199832	199837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5063	NC_008543	CAG	3	9	199859	199867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691467
5064	NC_008543	GC	3	6	199873	199878	0 %	0 %	50 %	50 %	116691467
5065	NC_008543	AGGATC	2	12	199905	199916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116691467
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5068	NC_008543	AGT	2	6	199981	199986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691467
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5093	NC_008543	TGG	2	6	200982	200987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_008543	CAG	2	6	201194	201199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691469
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5105	NC_008543	CGA	2	6	201544	201549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691469
5106	NC_008543	CTGG	2	8	201563	201570	0 %	25 %	50 %	25 %	116691469
5107	NC_008543	TCG	2	6	201577	201582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691469
5108	NC_008543	CGCGG	2	10	201587	201596	0 %	0 %	60 %	40 %	116691469
5109	NC_008543	ATC	2	6	201636	201641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116691469
5110	NC_008543	CGGCCG	2	12	201643	201654	0 %	0 %	50 %	50 %	116691469
5111	NC_008543	GTC	2	6	201668	201673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691469
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5120	NC_008543	ATT	3	9	202005	202013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_008543	CAC	2	6	202017	202022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_008543	TTGT	2	8	202030	202037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_008543	GCA	2	6	202088	202093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_008543	AG	3	6	202119	202124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_008543	GA	3	6	202130	202135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_008543	CG	3	6	202185	202190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_008543	GAA	2	6	202225	202230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_008543	GCG	2	6	202233	202238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_008543	GCT	2	6	202290	202295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691470
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5131	NC_008543	CGA	2	6	202356	202361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691470
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5147	NC_008543	G	6	6	202906	202911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_008543	AAC	2	6	202943	202948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5149	NC_008543	ATCG	2	8	202956	202963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5152	NC_008543	GCG	3	9	203045	203053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691471
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5165	NC_008543	CG	3	6	203356	203361	0 %	0 %	50 %	50 %	116691471
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5246	NC_008543	GC	3	6	206078	206083	0 %	0 %	50 %	50 %	116691473
5247	NC_008543	CGG	2	6	206157	206162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5360	NC_008543	CGCTG	2	10	209897	209906	0 %	20 %	40 %	40 %	116691476
5361	NC_008543	CCG	2	6	209907	209912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691476
5362	NC_008543	CGC	2	6	209929	209934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5363	NC_008543	GC	3	6	209933	209938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5364	NC_008543	GTG	2	6	210059	210064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_008543	AGC	2	6	210065	210070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5366	NC_008543	GTTGAC	2	12	210123	210134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5367	NC_008543	CGC	3	9	210148	210156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5368	NC_008543	CG	4	8	210172	210179	0 %	0 %	50 %	50 %	116691477
5369	NC_008543	CGC	2	6	210194	210199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691477
5370	NC_008543	CGATG	2	10	210206	210215	20 %	20 %	40 %	20 %	116691477
5371	NC_008543	TGA	2	6	210220	210225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691477
5372	NC_008543	GCG	2	6	210235	210240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691477
5373	NC_008543	CG	4	8	210250	210257	0 %	0 %	50 %	50 %	116691477
5374	NC_008543	TGC	2	6	210272	210277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691477
5375	NC_008543	CGA	2	6	210295	210300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691477
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5379	NC_008543	CAGCG	2	10	210411	210420	20 %	0 %	40 %	40 %	116691477
5380	NC_008543	CAG	2	6	210470	210475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691477
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5402	NC_008543	CGC	2	6	211261	211266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691477
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5484	NC_008543	CG	4	8	213812	213819	0 %	0 %	50 %	50 %	116691481
5485	NC_008543	TCC	2	6	213859	213864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116691481
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5489	NC_008543	TTC	2	6	214051	214056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116691481
5490	NC_008543	GCA	2	6	214067	214072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691481
5491	NC_008543	CGA	2	6	214074	214079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691481
5492	NC_008543	GTC	2	6	214086	214091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691481
5493	NC_008543	CAC	2	6	214131	214136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691481
5494	NC_008543	CAG	2	6	214185	214190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691481
5495	NC_008543	CG	3	6	214202	214207	0 %	0 %	50 %	50 %	116691481
5496	NC_008543	TGC	2	6	214217	214222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691481
5497	NC_008543	CGGC	2	8	214242	214249	0 %	0 %	50 %	50 %	116691481
5498	NC_008543	TCC	2	6	214258	214263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116691481
5499	NC_008543	CG	3	6	214317	214322	0 %	0 %	50 %	50 %	116691481
5500	NC_008543	CGA	2	6	214349	214354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691481

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