MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008542	CTT	2	6	38028	38033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688057
1002	NC_008542	GC	3	6	38074	38079	0 %	0 %	50 %	50 %	116688057
1003	NC_008542	CG	3	6	38103	38108	0 %	0 %	50 %	50 %	116688057
1004	NC_008542	CGA	2	6	38127	38132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688057
1005	NC_008542	GCGG	2	8	38152	38159	0 %	0 %	75 %	25 %	116688057
1006	NC_008542	CGTG	2	8	38205	38212	0 %	25 %	50 %	25 %	116688057
1007	NC_008542	GCA	2	6	38250	38255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688057
1008	NC_008542	CAG	2	6	38314	38319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688057
1009	NC_008542	TGA	2	6	38334	38339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688057
1010	NC_008542	GCGCGA	2	12	38346	38357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116688057
1011	NC_008542	CCG	2	6	38372	38377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688057
1012	NC_008542	GCCG	2	8	38485	38492	0 %	0 %	50 %	50 %	116688057
1013	NC_008542	GGC	2	6	38577	38582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688057
1014	NC_008542	AGC	2	6	38615	38620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688057
1015	NC_008542	CGA	2	6	38667	38672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688057
1016	NC_008542	CGC	2	6	38685	38690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688057
1017	NC_008542	GC	3	6	38689	38694	0 %	0 %	50 %	50 %	116688057
1018	NC_008542	GCCTT	2	10	38729	38738	0 %	40 %	20 %	40 %	116688057
1019	NC_008542	GCG	2	6	38850	38855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008542	GC	3	6	38884	38889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_008542	CGG	3	9	38891	38899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_008542	CGC	3	9	38903	38911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_008542	TCGT	2	8	38952	38959	0 %	50 %	25 %	25 %	116688058
1024	NC_008542	GC	3	6	38966	38971	0 %	0 %	50 %	50 %	116688058
1025	NC_008542	CGGC	2	8	39043	39050	0 %	0 %	50 %	50 %	116688058
1026	NC_008542	CGGC	2	8	39127	39134	0 %	0 %	50 %	50 %	116688058
1027	NC_008542	GCC	2	6	39275	39280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688058
1028	NC_008542	GCGCG	2	10	39283	39292	0 %	0 %	60 %	40 %	116688058
1029	NC_008542	TCT	2	6	39340	39345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688058
1030	NC_008542	GTC	2	6	39369	39374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688058
1031	NC_008542	GCA	2	6	39436	39441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688058
1032	NC_008542	TGC	2	6	39468	39473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688058
1033	NC_008542	TCG	2	6	39499	39504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688058
1034	NC_008542	CCTTGC	2	12	39637	39648	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116688058
1035	NC_008542	CGA	2	6	39679	39684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688058
1036	NC_008542	AGC	2	6	39705	39710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688058
1037	NC_008542	GCCG	2	8	39728	39735	0 %	0 %	50 %	50 %	116688058
1038	NC_008542	CAG	2	6	39743	39748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688058
1039	NC_008542	CG	3	6	39798	39803	0 %	0 %	50 %	50 %	116688058
1040	NC_008542	CCG	2	6	39828	39833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688058
1041	NC_008542	GCC	2	6	39851	39856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688058
1042	NC_008542	GTC	2	6	39857	39862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688058
1043	NC_008542	GCG	2	6	39879	39884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688058
1044	NC_008542	GC	3	6	39886	39891	0 %	0 %	50 %	50 %	116688058
1045	NC_008542	GGCT	2	8	39898	39905	0 %	25 %	50 %	25 %	116688058
1046	NC_008542	GTC	2	6	39942	39947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_008542	TGC	2	6	39978	39983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_008542	CGGC	2	8	40108	40115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_008542	CATCG	2	10	40150	40159	20 %	20 %	20 %	40 %	116688059
1050	NC_008542	ATC	2	6	40205	40210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688059
1051	NC_008542	CGA	2	6	40230	40235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688059
1052	NC_008542	GCG	2	6	40275	40280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688059
1053	NC_008542	CG	3	6	40282	40287	0 %	0 %	50 %	50 %	116688059
1054	NC_008542	CAG	2	6	40318	40323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688059
1055	NC_008542	ACC	2	6	40331	40336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688059
1056	NC_008542	CAG	3	9	40345	40353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688059
1057	NC_008542	GCA	2	6	40410	40415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688059
1058	NC_008542	ACG	2	6	40443	40448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688059
1059	NC_008542	CGC	2	6	40542	40547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688059
1060	NC_008542	GAA	2	6	40561	40566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688059
1061	NC_008542	GCCG	2	8	40606	40613	0 %	0 %	50 %	50 %	116688059
1062	NC_008542	ATTG	2	8	40671	40678	25 %	50 %	25 %	0 %	116688059
1063	NC_008542	CGA	3	9	40743	40751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688059
1064	NC_008542	AGCC	2	8	40868	40875	25 %	0 %	25 %	50 %	116688059
1065	NC_008542	GCA	2	6	40956	40961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688060
1066	NC_008542	AGT	2	6	40974	40979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688060
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1069	NC_008542	ACG	2	6	41099	41104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688060
1070	NC_008542	CAG	3	9	41125	41133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688060
1071	NC_008542	AGC	2	6	41144	41149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688060
1072	NC_008542	CAT	2	6	41158	41163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688060
1073	NC_008542	TCA	2	6	41181	41186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688060
1074	NC_008542	CG	3	6	41203	41208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_008542	TCC	2	6	41212	41217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_008542	GCGA	2	8	41236	41243	25 %	0 %	50 %	25 %	116688061
1077	NC_008542	CAG	2	6	41250	41255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688061
1078	NC_008542	CAT	3	9	41322	41330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688061
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1086	NC_008542	GAA	2	6	41658	41663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688061
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1089	NC_008542	CGT	2	6	41706	41711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688061
1090	NC_008542	GCA	2	6	41732	41737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688061
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1092	NC_008542	TCA	3	9	41771	41779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688061
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1097	NC_008542	CG	3	6	41948	41953	0 %	0 %	50 %	50 %	116688061
1098	NC_008542	GCG	2	6	42007	42012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_008542	GCC	2	6	42120	42125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688062
1100	NC_008542	GACG	2	8	42126	42133	25 %	0 %	50 %	25 %	116688062
1101	NC_008542	GCC	3	9	42172	42180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688062
1102	NC_008542	CCGG	2	8	42184	42191	0 %	0 %	50 %	50 %	116688062
1103	NC_008542	GCA	2	6	42200	42205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688062
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1106	NC_008542	GCC	2	6	42315	42320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688062
1107	NC_008542	CG	3	6	42325	42330	0 %	0 %	50 %	50 %	116688062
1108	NC_008542	GCG	2	6	42345	42350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688062
1109	NC_008542	CACGCG	2	12	42358	42369	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116688062
1110	NC_008542	CGA	2	6	42398	42403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688062
1111	NC_008542	GCA	2	6	42410	42415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688062
1112	NC_008542	ACCG	2	8	42447	42454	25 %	0 %	25 %	50 %	116688062
1113	NC_008542	GGT	2	6	42479	42484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688062
1114	NC_008542	CGG	2	6	42500	42505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688062
1115	NC_008542	GCCG	2	8	42507	42514	0 %	0 %	50 %	50 %	116688062
1116	NC_008542	CGG	3	9	42533	42541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688062
1117	NC_008542	GCC	3	9	42547	42555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688062
1118	NC_008542	CG	3	6	42561	42566	0 %	0 %	50 %	50 %	116688062
1119	NC_008542	CG	3	6	42570	42575	0 %	0 %	50 %	50 %	116688062
1120	NC_008542	CCGG	2	8	42576	42583	0 %	0 %	50 %	50 %	116688062
1121	NC_008542	ACG	2	6	42589	42594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688062
1122	NC_008542	CGGC	2	8	42622	42629	0 %	0 %	50 %	50 %	116688063
1123	NC_008542	TGA	2	6	42631	42636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688063
1124	NC_008542	ACC	2	6	42669	42674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688063
1125	NC_008542	CGA	2	6	42748	42753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688063
1126	NC_008542	GCA	2	6	42772	42777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688063
1127	NC_008542	ATC	2	6	42840	42845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688063
1128	NC_008542	CGC	2	6	42869	42874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688063
1129	NC_008542	CGCC	2	8	42913	42920	0 %	0 %	25 %	75 %	116688063
1130	NC_008542	GCC	2	6	42954	42959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688063
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1132	NC_008542	CGGCCG	2	12	42985	42996	0 %	0 %	50 %	50 %	116688063
1133	NC_008542	CGC	2	6	43019	43024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688063
1134	NC_008542	GTC	3	9	43052	43060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688063
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1138	NC_008542	ATC	2	6	43117	43122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688064
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1142	NC_008542	CGA	2	6	43269	43274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688064
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1154	NC_008542	CGA	3	9	43694	43702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688064
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1185	NC_008542	CGG	2	6	44734	44739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1187	NC_008542	GCC	2	6	44790	44795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1188	NC_008542	GCG	2	6	44822	44827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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