MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008542	CCG	2	6	21702	21707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688042
502	NC_008542	ACG	2	6	21723	21728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688042
503	NC_008542	CGC	2	6	21733	21738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688042
504	NC_008542	CGC	2	6	21754	21759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688042
505	NC_008542	CGAA	2	8	21766	21773	50 %	0 %	25 %	25 %	116688042
506	NC_008542	GGC	2	6	21874	21879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688042
507	NC_008542	CGATCG	2	12	21969	21980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116688042
508	NC_008542	GCT	2	6	22084	22089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688042
509	NC_008542	GGC	2	6	22100	22105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688042
510	NC_008542	CTGG	2	8	22111	22118	0 %	25 %	50 %	25 %	116688042
511	NC_008542	CGG	2	6	22119	22124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688042
512	NC_008542	CGC	2	6	22143	22148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688042
513	NC_008542	CTG	2	6	22160	22165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688042
514	NC_008542	ATG	2	6	22169	22174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688042
515	NC_008542	AGAA	2	8	22234	22241	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_008542	CG	3	6	22294	22299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_008542	CGA	2	6	22351	22356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688043
518	NC_008542	CGT	2	6	22363	22368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
519	NC_008542	GTC	2	6	22383	22388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
520	NC_008542	TGA	2	6	22414	22419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688043
521	NC_008542	TGA	2	6	22435	22440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688043
522	NC_008542	GCCG	2	8	22535	22542	0 %	0 %	50 %	50 %	116688043
523	NC_008542	GCC	3	9	22553	22561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688043
524	NC_008542	GC	3	6	22605	22610	0 %	0 %	50 %	50 %	116688043
525	NC_008542	CGC	2	6	22615	22620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688043
526	NC_008542	CGC	2	6	22628	22633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688043
527	NC_008542	GCT	2	6	22663	22668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
528	NC_008542	CG	3	6	22689	22694	0 %	0 %	50 %	50 %	116688043
529	NC_008542	CGTG	2	8	22702	22709	0 %	25 %	50 %	25 %	116688043
530	NC_008542	GCG	2	6	22719	22724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688043
531	NC_008542	TCG	2	6	22756	22761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
532	NC_008542	TCG	2	6	22770	22775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
533	NC_008542	CGT	2	6	22792	22797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
534	NC_008542	GCA	2	6	22798	22803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688043
535	NC_008542	CGC	2	6	22808	22813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688043
536	NC_008542	GCG	2	6	22822	22827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688043
537	NC_008542	AGC	3	9	22845	22853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688043
538	NC_008542	CGT	2	6	22864	22869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
539	NC_008542	CGA	2	6	22885	22890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688043
540	NC_008542	CG	3	6	22935	22940	0 %	0 %	50 %	50 %	116688043
541	NC_008542	GCG	2	6	22976	22981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688043
542	NC_008542	TCCA	2	8	23022	23029	25 %	25 %	0 %	50 %	116688043
543	NC_008542	CCT	2	6	23041	23046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116688043
544	NC_008542	ACGCG	2	10	23089	23098	20 %	0 %	40 %	40 %	116688043
545	NC_008542	CGC	3	9	23129	23137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688043
546	NC_008542	TTC	2	6	23147	23152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688043
547	NC_008542	GCG	2	6	23156	23161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688043
548	NC_008542	CCA	2	6	23190	23195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688044
549	NC_008542	CGG	3	9	23202	23210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688044
550	NC_008542	TTC	2	6	23305	23310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688044
551	NC_008542	CG	3	6	23404	23409	0 %	0 %	50 %	50 %	116688044
552	NC_008542	CGGT	2	8	23414	23421	0 %	25 %	50 %	25 %	116688044
553	NC_008542	CAG	2	6	23449	23454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688044
554	NC_008542	GCT	2	6	23463	23468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688044
555	NC_008542	CG	3	6	23484	23489	0 %	0 %	50 %	50 %	116688044
556	NC_008542	CG	3	6	23539	23544	0 %	0 %	50 %	50 %	116688044
557	NC_008542	CGAC	2	8	23592	23599	25 %	0 %	25 %	50 %	116688044
558	NC_008542	TCA	2	6	23616	23621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688044
559	NC_008542	GCG	2	6	23630	23635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688044
560	NC_008542	CG	3	6	23712	23717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_008542	GC	3	6	23756	23761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_008542	GCC	2	6	23782	23787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_008542	AGGA	2	8	23800	23807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008542	CGA	2	6	23850	23855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_008542	CG	3	6	23857	23862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_008542	GGC	2	6	23886	23891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008542	ACG	2	6	23957	23962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008542	CG	3	6	23983	23988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_008542	CACAC	2	10	23994	24003	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
570	NC_008542	TTTC	2	8	24015	24022	0 %	75 %	0 %	25 %	116688045
571	NC_008542	CGC	2	6	24101	24106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688045
572	NC_008542	GC	5	10	24119	24128	0 %	0 %	50 %	50 %	116688045
573	NC_008542	ACG	2	6	24139	24144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688045
574	NC_008542	CAG	2	6	24145	24150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688045
575	NC_008542	CG	3	6	24167	24172	0 %	0 %	50 %	50 %	116688045
576	NC_008542	GCAAC	2	10	24202	24211	40 %	0 %	20 %	40 %	116688045
577	NC_008542	CCT	2	6	24247	24252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116688046
578	NC_008542	GC	3	6	24286	24291	0 %	0 %	50 %	50 %	116688046
579	NC_008542	CCG	2	6	24321	24326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688046
580	NC_008542	TTC	2	6	24395	24400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688046
581	NC_008542	CGT	2	6	24406	24411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688046
582	NC_008542	CGC	2	6	24448	24453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688046
583	NC_008542	GCT	2	6	24520	24525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688046
584	NC_008542	CGTC	2	8	24530	24537	0 %	25 %	25 %	50 %	116688046
585	NC_008542	CGA	2	6	24541	24546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688046
586	NC_008542	CGA	2	6	24571	24576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688046
587	NC_008542	TGC	2	6	24582	24587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688046
588	NC_008542	GC	4	8	24586	24593	0 %	0 %	50 %	50 %	116688046
589	NC_008542	AGC	3	9	24660	24668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688046
590	NC_008542	TGC	2	6	24693	24698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688046
591	NC_008542	CGGC	2	8	24722	24729	0 %	0 %	50 %	50 %	116688046
592	NC_008542	CGA	2	6	24748	24753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688046
593	NC_008542	GC	3	6	24762	24767	0 %	0 %	50 %	50 %	116688046
594	NC_008542	CGC	2	6	24769	24774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688046
595	NC_008542	GCTG	2	8	24795	24802	0 %	25 %	50 %	25 %	116688046
596	NC_008542	CGGG	2	8	24810	24817	0 %	0 %	75 %	25 %	116688046
597	NC_008542	TCG	2	6	24819	24824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688046
598	NC_008542	AACG	2	8	24860	24867	50 %	0 %	25 %	25 %	116688046
599	NC_008542	CGG	2	6	24952	24957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688046
600	NC_008542	GAC	3	9	25043	25051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688046
601	NC_008542	GCC	2	6	25058	25063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688046
602	NC_008542	CG	3	6	25065	25070	0 %	0 %	50 %	50 %	116688046
603	NC_008542	GC	3	6	25173	25178	0 %	0 %	50 %	50 %	116688046
604	NC_008542	CCGA	2	8	25184	25191	25 %	0 %	25 %	50 %	116688046
605	NC_008542	CAG	2	6	25343	25348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688046
606	NC_008542	GCA	3	9	25359	25367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688046
607	NC_008542	CGC	2	6	25374	25379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688046
608	NC_008542	TTTC	2	8	25408	25415	0 %	75 %	0 %	25 %	116688046
609	NC_008542	CGG	2	6	25419	25424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688046
610	NC_008542	CTGAC	2	10	25465	25474	20 %	20 %	20 %	40 %	116688046
611	NC_008542	CCCG	2	8	25497	25504	0 %	0 %	25 %	75 %	116688047
612	NC_008542	CGC	2	6	25558	25563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688047
613	NC_008542	GCA	2	6	25564	25569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688047
614	NC_008542	CCG	2	6	25572	25577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688047
615	NC_008542	CGGC	2	8	25594	25601	0 %	0 %	50 %	50 %	116688047
616	NC_008542	TAC	2	6	25638	25643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688047
617	NC_008542	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	116688047
618	NC_008542	GCG	2	6	25694	25699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688047
619	NC_008542	TCG	2	6	25720	25725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688047
620	NC_008542	GCTC	2	8	25738	25745	0 %	25 %	25 %	50 %	116688047
621	NC_008542	TGC	2	6	25759	25764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688047
622	NC_008542	GC	3	6	25800	25805	0 %	0 %	50 %	50 %	116688047
623	NC_008542	CCG	2	6	25825	25830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688047
624	NC_008542	CG	3	6	25850	25855	0 %	0 %	50 %	50 %	116688047
625	NC_008542	GCGG	2	8	25859	25866	0 %	0 %	75 %	25 %	116688047
626	NC_008542	CGC	2	6	25888	25893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688047
627	NC_008542	CGC	2	6	25942	25947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688047
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629	NC_008542	T	6	6	25962	25967	0 %	100 %	0 %	0 %	116688047
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761	NC_008542	CG	4	8	30229	30236	0 %	0 %	50 %	50 %	116688051
762	NC_008542	CGCGC	2	10	30242	30251	0 %	0 %	40 %	60 %	116688051
763	NC_008542	CGA	2	6	30265	30270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688051
764	NC_008542	TTG	2	6	30285	30290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688051
765	NC_008542	CGA	2	6	30301	30306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688051
766	NC_008542	CGATCT	2	12	30316	30327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116688051
767	NC_008542	CGTG	2	8	30394	30401	0 %	25 %	50 %	25 %	116688051
768	NC_008542	GCG	2	6	30424	30429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688051
769	NC_008542	CGCGCC	2	12	30448	30459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688051
770	NC_008542	GCC	2	6	30467	30472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688051
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776	NC_008542	GTT	2	6	30572	30577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688051
777	NC_008542	TCTT	2	8	30582	30589	0 %	75 %	0 %	25 %	116688051
778	NC_008542	TCA	2	6	30607	30612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688051
779	NC_008542	CGC	2	6	30635	30640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688051
780	NC_008542	AGT	2	6	30682	30687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688051
781	NC_008542	GC	3	6	30709	30714	0 %	0 %	50 %	50 %	116688051
782	NC_008542	CCTT	2	8	30753	30760	0 %	50 %	0 %	50 %	116688051
783	NC_008542	ACG	2	6	30777	30782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688051
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787	NC_008542	CGG	2	6	30905	30910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688051
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792	NC_008542	GCG	2	6	31023	31028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688051
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794	NC_008542	GCG	2	6	31044	31049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688051
795	NC_008542	CGC	2	6	31069	31074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688051
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832	NC_008542	GCG	2	6	32145	32150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688052
833	NC_008542	CTT	3	9	32170	32178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688052
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835	NC_008542	CG	3	6	32281	32286	0 %	0 %	50 %	50 %	116688052
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842	NC_008542	GC	3	6	32455	32460	0 %	0 %	50 %	50 %	116688052
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864	NC_008542	CGG	2	6	33227	33232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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871	NC_008542	GC	3	6	33385	33390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
872	NC_008542	A	7	7	33434	33440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
873	NC_008542	CGT	2	6	33453	33458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
874	NC_008542	GGAG	2	8	33487	33494	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
875	NC_008542	GGC	2	6	33497	33502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1000	NC_008542	GCG	2	6	38002	38007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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