MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008542	GCG	2	6	195672	195677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688200
5502	NC_008542	GCT	3	9	195779	195787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688200
5503	NC_008542	GCG	2	6	195813	195818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688200
5504	NC_008542	GCA	2	6	195875	195880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688200
5505	NC_008542	TC	3	6	195890	195895	0 %	50 %	0 %	50 %	116688200
5506	NC_008542	GC	3	6	195907	195912	0 %	0 %	50 %	50 %	116688200
5507	NC_008542	TC	3	6	195928	195933	0 %	50 %	0 %	50 %	116688201
5508	NC_008542	GC	5	10	195952	195961	0 %	0 %	50 %	50 %	116688201
5509	NC_008542	TGA	2	6	195993	195998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688201
5510	NC_008542	CGA	2	6	196042	196047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688201
5511	NC_008542	GCG	2	6	196092	196097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688201
5512	NC_008542	CG	3	6	196135	196140	0 %	0 %	50 %	50 %	116688201
5513	NC_008542	GAA	2	6	196160	196165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688201
5514	NC_008542	TTC	2	6	196223	196228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688201
5515	NC_008542	GC	3	6	196241	196246	0 %	0 %	50 %	50 %	116688201
5516	NC_008542	GCG	2	6	196266	196271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688201
5517	NC_008542	ATT	2	6	196417	196422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116688201
5518	NC_008542	CGC	2	6	196453	196458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688201
5519	NC_008542	CGC	2	6	196489	196494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688201
5520	NC_008542	CGC	2	6	196545	196550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688201
5521	NC_008542	AAG	2	6	196605	196610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688201
5522	NC_008542	TGACA	2	10	196718	196727	40 %	20 %	20 %	20 %	116688201
5523	NC_008542	TCT	2	6	196763	196768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688202
5524	NC_008542	GC	3	6	196797	196802	0 %	0 %	50 %	50 %	116688202
5525	NC_008542	GTT	2	6	196805	196810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688202
5526	NC_008542	GCC	2	6	196891	196896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688202
5527	NC_008542	TGT	2	6	196930	196935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688202
5528	NC_008542	CAGC	2	8	196947	196954	25 %	0 %	25 %	50 %	116688202
5529	NC_008542	GC	3	6	196953	196958	0 %	0 %	50 %	50 %	116688202
5530	NC_008542	CG	3	6	197043	197048	0 %	0 %	50 %	50 %	116688202
5531	NC_008542	GC	3	6	197064	197069	0 %	0 %	50 %	50 %	116688202
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5533	NC_008542	GGCGC	2	10	197119	197128	0 %	0 %	60 %	40 %	116688202
5534	NC_008542	CGG	2	6	197145	197150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688202
5535	NC_008542	CGA	2	6	197168	197173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688202
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5537	NC_008542	GTG	2	6	197263	197268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688202
5538	NC_008542	CG	4	8	197297	197304	0 %	0 %	50 %	50 %	116688202
5539	NC_008542	GCG	2	6	197422	197427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688202
5540	NC_008542	CGG	2	6	197435	197440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688202
5541	NC_008542	CTT	2	6	197463	197468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688202
5542	NC_008542	CAC	2	6	197794	197799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688203
5543	NC_008542	CGC	2	6	197811	197816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688203
5544	NC_008542	CG	3	6	197906	197911	0 %	0 %	50 %	50 %	116688203
5545	NC_008542	CGA	2	6	197917	197922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688203
5546	NC_008542	GC	3	6	197924	197929	0 %	0 %	50 %	50 %	116688203
5547	NC_008542	TGCG	2	8	197933	197940	0 %	25 %	50 %	25 %	116688203
5548	NC_008542	CCATC	2	10	197968	197977	20 %	20 %	0 %	60 %	116688203
5549	NC_008542	GCA	2	6	197980	197985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688203
5550	NC_008542	GAG	2	6	198023	198028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688203
5551	NC_008542	GGC	2	6	198095	198100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688203
5552	NC_008542	CGAT	2	8	198135	198142	25 %	25 %	25 %	25 %	116688203
5553	NC_008542	CGA	2	6	198205	198210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688203
5554	NC_008542	GGT	2	6	198217	198222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688203
5555	NC_008542	GCC	2	6	198309	198314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688203
5556	NC_008542	GAT	2	6	198325	198330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688203
5557	NC_008542	CTT	2	6	198418	198423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688203
5558	NC_008542	CA	3	6	198457	198462	50 %	0 %	0 %	50 %	116688203
5559	NC_008542	CTCG	2	8	198478	198485	0 %	25 %	25 %	50 %	116688203
5560	NC_008542	ATG	2	6	198496	198501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688203
5561	NC_008542	GCA	2	6	198625	198630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5562	NC_008542	AGC	2	6	198631	198636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5563	NC_008542	TGG	2	6	198648	198653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688204
5564	NC_008542	TCT	2	6	198725	198730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688204
5565	NC_008542	CG	3	6	198739	198744	0 %	0 %	50 %	50 %	116688204
5566	NC_008542	GCC	2	6	198795	198800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688204
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5569	NC_008542	CGC	2	6	198922	198927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688204
5570	NC_008542	GCT	2	6	198938	198943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5571	NC_008542	GCC	3	9	198960	198968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688204
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5573	NC_008542	CG	3	6	199024	199029	0 %	0 %	50 %	50 %	116688204
5574	NC_008542	CGT	2	6	199076	199081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5575	NC_008542	GGC	2	6	199143	199148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688204
5576	NC_008542	GATGG	2	10	199175	199184	20 %	20 %	60 %	0 %	116688204
5577	NC_008542	CG	3	6	199211	199216	0 %	0 %	50 %	50 %	116688204
5578	NC_008542	ATCG	2	8	199221	199228	25 %	25 %	25 %	25 %	116688204
5579	NC_008542	CGC	2	6	199270	199275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688204
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5581	NC_008542	CGT	2	6	199304	199309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5582	NC_008542	CGC	2	6	199310	199315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688204
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5586	NC_008542	GGCT	2	8	199440	199447	0 %	25 %	50 %	25 %	116688204
5587	NC_008542	TTC	2	6	199482	199487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688204
5588	NC_008542	CTG	2	6	199491	199496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5589	NC_008542	GTG	2	6	199557	199562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688204
5590	NC_008542	CTG	2	6	199608	199613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5591	NC_008542	GT	3	6	199708	199713	0 %	50 %	50 %	0 %	116688204
5592	NC_008542	GCT	2	6	199781	199786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5593	NC_008542	CAG	2	6	199855	199860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688204
5594	NC_008542	ATGG	2	8	199919	199926	25 %	25 %	50 %	0 %	116688205
5595	NC_008542	GCGTC	2	10	199951	199960	0 %	20 %	40 %	40 %	116688205
5596	NC_008542	CGGC	2	8	200053	200060	0 %	0 %	50 %	50 %	116688205
5597	NC_008542	GCG	2	6	200137	200142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688205
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5599	NC_008542	GGA	2	6	200205	200210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688205
5600	NC_008542	GCATC	2	10	200239	200248	20 %	20 %	20 %	40 %	116688205
5601	NC_008542	ACA	2	6	200380	200385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688205
5602	NC_008542	CGG	2	6	200452	200457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688205
5603	NC_008542	ACG	2	6	200581	200586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688205
5604	NC_008542	GCA	2	6	200610	200615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688205
5605	NC_008542	TTC	2	6	200619	200624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688205
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5607	NC_008542	CCG	2	6	200656	200661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688205
5608	NC_008542	GGC	3	9	200718	200726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688205
5609	NC_008542	CGT	2	6	200741	200746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688205
5610	NC_008542	TCT	2	6	200785	200790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688205
5611	NC_008542	CG	3	6	200872	200877	0 %	0 %	50 %	50 %	116688205
5612	NC_008542	GCA	2	6	200896	200901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688205
5613	NC_008542	GCC	2	6	200940	200945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688205
5614	NC_008542	GC	3	6	200967	200972	0 %	0 %	50 %	50 %	116688205
5615	NC_008542	GCGG	2	8	200985	200992	0 %	0 %	75 %	25 %	116688205
5616	NC_008542	CGG	3	9	200990	200998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688205
5617	NC_008542	CGC	2	6	201008	201013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688205
5618	NC_008542	T	6	6	201055	201060	0 %	100 %	0 %	0 %	116688205
5619	NC_008542	CGT	2	6	201091	201096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_008542	ATT	2	6	201184	201189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116688206
5621	NC_008542	CGG	2	6	201203	201208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688206
5622	NC_008542	AGC	2	6	201307	201312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688206
5623	NC_008542	CG	3	6	201316	201321	0 %	0 %	50 %	50 %	116688206
5624	NC_008542	GCC	2	6	201462	201467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688206
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5627	NC_008542	CTGT	2	8	201597	201604	0 %	50 %	25 %	25 %	116688206
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5652	NC_008542	CGGG	2	8	203014	203021	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5653	NC_008542	GC	3	6	203055	203060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5654	NC_008542	CG	3	6	203154	203159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5655	NC_008542	TCG	2	6	203170	203175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5851	NC_008542	TG	3	6	212200	212205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5852	NC_008542	GAGC	2	8	212210	212217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5853	NC_008542	GAAGC	2	10	212218	212227	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5854	NC_008542	TAG	2	6	212246	212251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5857	NC_008542	CAG	2	6	212459	212464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5862	NC_008542	CGGC	2	8	212861	212868	0 %	0 %	50 %	50 %	116688213
5863	NC_008542	CAG	2	6	212923	212928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688213
5864	NC_008542	CG	4	8	212955	212962	0 %	0 %	50 %	50 %	116688213
5865	NC_008542	GCC	2	6	212965	212970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688213
5866	NC_008542	CGTGA	2	10	213027	213036	20 %	20 %	40 %	20 %	116688213
5867	NC_008542	CTGTA	2	10	213044	213053	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5868	NC_008542	GGT	2	6	213070	213075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5869	NC_008542	AGT	2	6	213136	213141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5870	NC_008542	GCA	2	6	213157	213162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5871	NC_008542	ACG	2	6	213189	213194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5872	NC_008542	CTTG	2	8	213208	213215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5873	NC_008542	ATGGCT	2	12	213275	213286	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116688214
5874	NC_008542	AAC	2	6	213323	213328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688214
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5876	NC_008542	AAC	2	6	213370	213375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688214
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5879	NC_008542	TCC	2	6	213566	213571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5880	NC_008542	GTC	2	6	213601	213606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688215
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5912	NC_008542	CGATT	2	10	215119	215128	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5933	NC_008542	TCG	2	6	216472	216477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688217
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5993	NC_008542	TGC	2	6	218916	218921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5994	NC_008542	GC	3	6	219020	219025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5995	NC_008542	A	9	9	219033	219041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_008542	GCT	2	6	219164	219169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688220
5997	NC_008542	TGA	2	6	219171	219176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688220
5998	NC_008542	GGC	2	6	219215	219220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688220
5999	NC_008542	ATC	2	6	219225	219230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688220
6000	NC_008542	TCA	2	6	219240	219245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688220

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