MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)

Total Repeats: 1769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008513	ATTA	2	8	99	106	50 %	50 %	0 %	0 %	116514951
2	NC_008513	CAAT	2	8	976	983	50 %	25 %	0 %	25 %	116514951
3	NC_008513	TTAT	2	8	1093	1100	25 %	75 %	0 %	0 %	116514951
4	NC_008513	TAAA	2	8	1778	1785	75 %	25 %	0 %	0 %	116514951
5	NC_008513	GTTT	2	8	2203	2210	0 %	75 %	25 %	0 %	116514952
6	NC_008513	TAAT	2	8	2214	2221	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
7	NC_008513	ATTA	2	8	2989	2996	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
8	NC_008513	TTCC	2	8	3068	3075	0 %	50 %	0 %	50 %	116514952
9	NC_008513	TTTA	2	8	3721	3728	25 %	75 %	0 %	0 %	116514952
10	NC_008513	TATC	2	8	4131	4138	25 %	50 %	0 %	25 %	116514952
11	NC_008513	TTTA	2	8	4418	4425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008513	ATTT	2	8	4491	4498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008513	ATTT	2	8	4768	4775	25 %	75 %	0 %	0 %	116514953
14	NC_008513	AAAC	2	8	4788	4795	75 %	0 %	0 %	25 %	116514953
15	NC_008513	ATTT	2	8	4952	4959	25 %	75 %	0 %	0 %	116514953
16	NC_008513	TTTG	2	8	5000	5007	0 %	75 %	25 %	0 %	116514953
17	NC_008513	TAAT	2	8	5010	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	116514953
18	NC_008513	ATTT	2	8	5716	5723	25 %	75 %	0 %	0 %	116514954
19	NC_008513	ATTG	2	8	5843	5850	25 %	50 %	25 %	0 %	116514954
20	NC_008513	ATAA	2	8	7049	7056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008513	TATT	2	8	7101	7108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008513	AATA	2	8	7361	7368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008513	GTTT	2	8	7597	7604	0 %	75 %	25 %	0 %	116514956
24	NC_008513	TAAA	2	8	7729	7736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008513	TAAA	2	8	7998	8005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008513	TAAA	2	8	8009	8016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008513	AAAT	2	8	8307	8314	75 %	25 %	0 %	0 %	116514957
28	NC_008513	GAAA	2	8	9183	9190	75 %	0 %	25 %	0 %	116514958
29	NC_008513	ATTA	2	8	9336	9343	50 %	50 %	0 %	0 %	116514958
30	NC_008513	TAAA	2	8	9527	9534	75 %	25 %	0 %	0 %	116514958
31	NC_008513	TAAT	2	8	10073	10080	50 %	50 %	0 %	0 %	116514958
32	NC_008513	TATT	2	8	10122	10129	25 %	75 %	0 %	0 %	116514958
33	NC_008513	TAAT	2	8	10268	10275	50 %	50 %	0 %	0 %	116514958
34	NC_008513	TTCT	2	8	10641	10648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008513	ATTT	2	8	11060	11067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008513	GAAT	2	8	11430	11437	50 %	25 %	25 %	0 %	116514960
37	NC_008513	GGTT	2	8	11572	11579	0 %	50 %	50 %	0 %	116514960
38	NC_008513	TTAT	2	8	11695	11702	25 %	75 %	0 %	0 %	116514960
39	NC_008513	AAAT	2	8	12156	12163	75 %	25 %	0 %	0 %	116514960
40	NC_008513	GAAA	2	8	12268	12275	75 %	0 %	25 %	0 %	116514960
41	NC_008513	TTTA	2	8	12803	12810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008513	TAAT	2	8	12885	12892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008513	TTAT	2	8	13114	13121	25 %	75 %	0 %	0 %	116514961
44	NC_008513	TTTA	2	8	13390	13397	25 %	75 %	0 %	0 %	116514961
45	NC_008513	TAGT	2	8	14306	14313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008513	TTAT	2	8	14336	14343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008513	TAAA	2	8	14347	14354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008513	TAAT	2	8	14502	14509	50 %	50 %	0 %	0 %	116514963
49	NC_008513	ATTG	2	8	14580	14587	25 %	50 %	25 %	0 %	116514963
50	NC_008513	TAGA	2	8	14621	14628	50 %	25 %	25 %	0 %	116514963
51	NC_008513	ATTT	2	8	14906	14913	25 %	75 %	0 %	0 %	116514963
52	NC_008513	TCTT	2	8	14968	14975	0 %	75 %	0 %	25 %	116514963
53	NC_008513	TAAA	2	8	15129	15136	75 %	25 %	0 %	0 %	116514964
54	NC_008513	ATTT	2	8	15363	15370	25 %	75 %	0 %	0 %	116514964
55	NC_008513	ATTA	2	8	15496	15503	50 %	50 %	0 %	0 %	116514964
56	NC_008513	TTCT	2	8	15591	15598	0 %	75 %	0 %	25 %	116514964
57	NC_008513	AAAT	2	8	15927	15934	75 %	25 %	0 %	0 %	116514964
58	NC_008513	GGTT	2	8	16628	16635	0 %	50 %	50 %	0 %	116514965
59	NC_008513	AGTA	2	8	16675	16682	50 %	25 %	25 %	0 %	116514965
60	NC_008513	TAAA	2	8	17127	17134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008513	TAAT	2	8	17288	17295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008513	ATAA	2	8	17556	17563	75 %	25 %	0 %	0 %	116514966
63	NC_008513	TTTA	2	8	17612	17619	25 %	75 %	0 %	0 %	116514966
64	NC_008513	ATAA	2	8	17862	17869	75 %	25 %	0 %	0 %	116514966
65	NC_008513	TAAT	2	8	18199	18206	50 %	50 %	0 %	0 %	116514966
66	NC_008513	GGAA	2	8	18207	18214	50 %	0 %	50 %	0 %	116514966
67	NC_008513	ATAA	2	8	18270	18277	75 %	25 %	0 %	0 %	116514966
68	NC_008513	GTTC	2	8	18570	18577	0 %	50 %	25 %	25 %	116514966
69	NC_008513	ATGG	2	8	18853	18860	25 %	25 %	50 %	0 %	116514966
70	NC_008513	ATTC	2	8	19413	19420	25 %	50 %	0 %	25 %	116514966
71	NC_008513	TTAA	2	8	19795	19802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008513	AAAT	2	8	20096	20103	75 %	25 %	0 %	0 %	116514967
73	NC_008513	ATTT	2	8	20577	20584	25 %	75 %	0 %	0 %	116514967
74	NC_008513	CTTT	2	8	21544	21551	0 %	75 %	0 %	25 %	116514967
75	NC_008513	AGTT	2	8	21617	21624	25 %	50 %	25 %	0 %	116514967
76	NC_008513	CCCA	2	8	24384	24391	25 %	0 %	0 %	75 %	116514968
77	NC_008513	GCAT	2	8	24433	24440	25 %	25 %	25 %	25 %	116514968
78	NC_008513	TTTC	2	8	24496	24503	0 %	75 %	0 %	25 %	116514968
79	NC_008513	ATTA	2	8	24780	24787	50 %	50 %	0 %	0 %	116514968
80	NC_008513	ATTT	2	8	24927	24934	25 %	75 %	0 %	0 %	116514968
81	NC_008513	GTAA	2	8	25228	25235	50 %	25 %	25 %	0 %	116514968
82	NC_008513	TAAA	2	8	26234	26241	75 %	25 %	0 %	0 %	116514968
83	NC_008513	AATT	2	8	26450	26457	50 %	50 %	0 %	0 %	116514968
84	NC_008513	CTAA	2	8	26761	26768	50 %	25 %	0 %	25 %	116514968
85	NC_008513	ATTA	2	8	26868	26875	50 %	50 %	0 %	0 %	116514968
86	NC_008513	AAAT	2	8	27015	27022	75 %	25 %	0 %	0 %	116514968
87	NC_008513	TTCT	2	8	27365	27372	0 %	75 %	0 %	25 %	116514968
88	NC_008513	TAAA	2	8	27584	27591	75 %	25 %	0 %	0 %	116514968
89	NC_008513	ATAA	2	8	27855	27862	75 %	25 %	0 %	0 %	116514968
90	NC_008513	CATA	2	8	27920	27927	50 %	25 %	0 %	25 %	116514968
91	NC_008513	ATTG	2	8	28003	28010	25 %	50 %	25 %	0 %	116514968
92	NC_008513	ATTA	2	8	28293	28300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008513	GATA	2	8	29227	29234	50 %	25 %	25 %	0 %	116514970
94	NC_008513	ATTT	2	8	29238	29245	25 %	75 %	0 %	0 %	116514970
95	NC_008513	ATTT	2	8	29524	29531	25 %	75 %	0 %	0 %	116514971
96	NC_008513	ATTG	2	8	29553	29560	25 %	50 %	25 %	0 %	116514971
97	NC_008513	ATTT	2	8	29626	29633	25 %	75 %	0 %	0 %	116514971
98	NC_008513	ATTT	2	8	29677	29684	25 %	75 %	0 %	0 %	116514971
99	NC_008513	ATCA	2	8	30240	30247	50 %	25 %	0 %	25 %	116514972
100	NC_008513	TAGA	2	8	30631	30638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008513	GTTG	2	8	30885	30892	0 %	50 %	50 %	0 %	116514973
102	NC_008513	TTTC	2	8	31075	31082	0 %	75 %	0 %	25 %	116514973
103	NC_008513	ATTG	2	8	31110	31117	25 %	50 %	25 %	0 %	116514973
104	NC_008513	AGTA	2	8	31198	31205	50 %	25 %	25 %	0 %	116514974
105	NC_008513	TAGT	2	8	31266	31273	25 %	50 %	25 %	0 %	116514974
106	NC_008513	ACTA	2	8	31399	31406	50 %	25 %	0 %	25 %	116514974
107	NC_008513	ATGT	2	8	31715	31722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008513	CTAA	2	8	31825	31832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008513	CTAC	2	8	32124	32131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008513	ATAA	2	8	32269	32276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008513	TAAA	2	8	32288	32295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008513	AAAT	2	8	32330	32337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008513	ATTA	2	8	32512	32519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008513	AATT	2	8	32774	32781	50 %	50 %	0 %	0 %	116514975
115	NC_008513	AATA	2	8	32961	32968	75 %	25 %	0 %	0 %	116514975
116	NC_008513	AAAT	2	8	33048	33055	75 %	25 %	0 %	0 %	116514975
117	NC_008513	TAAA	2	8	33530	33537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008513	TTTA	2	8	34346	34353	25 %	75 %	0 %	0 %	116514976
119	NC_008513	ATTT	2	8	34354	34361	25 %	75 %	0 %	0 %	116514976
120	NC_008513	TCAA	2	8	34539	34546	50 %	25 %	0 %	25 %	116514977
121	NC_008513	TAAA	2	8	35159	35166	75 %	25 %	0 %	0 %	116514977
122	NC_008513	ATGT	2	8	35313	35320	25 %	50 %	25 %	0 %	116514977
123	NC_008513	GTTT	2	8	35576	35583	0 %	75 %	25 %	0 %	116514977
124	NC_008513	TAAT	2	8	35932	35939	50 %	50 %	0 %	0 %	116514978
125	NC_008513	ATTT	2	8	36637	36644	25 %	75 %	0 %	0 %	116514978
126	NC_008513	TAAA	2	8	36949	36956	75 %	25 %	0 %	0 %	116514978
127	NC_008513	TAAA	3	12	37034	37045	75 %	25 %	0 %	0 %	116514978
128	NC_008513	TAAA	2	8	37077	37084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008513	TTCT	2	8	37542	37549	0 %	75 %	0 %	25 %	116514979
130	NC_008513	CTAC	2	8	37568	37575	25 %	25 %	0 %	50 %	116514979
131	NC_008513	CCCG	2	8	37872	37879	0 %	0 %	25 %	75 %	116514979
132	NC_008513	TTTA	2	8	38212	38219	25 %	75 %	0 %	0 %	116514979
133	NC_008513	ATTA	2	8	39094	39101	50 %	50 %	0 %	0 %	116514979
134	NC_008513	ATTT	2	8	39348	39355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008513	ATAA	3	12	39404	39415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008513	AATT	2	8	39750	39757	50 %	50 %	0 %	0 %	116514980
137	NC_008513	AATT	2	8	39759	39766	50 %	50 %	0 %	0 %	116514980
138	NC_008513	TAAT	2	8	39860	39867	50 %	50 %	0 %	0 %	116514980
139	NC_008513	TAAA	2	8	39990	39997	75 %	25 %	0 %	0 %	116514980
140	NC_008513	ATTT	2	8	40080	40087	25 %	75 %	0 %	0 %	116514980
141	NC_008513	ATTG	2	8	40550	40557	25 %	50 %	25 %	0 %	116514980
142	NC_008513	ATTT	2	8	40592	40599	25 %	75 %	0 %	0 %	116514980
143	NC_008513	CTTT	2	8	40618	40625	0 %	75 %	0 %	25 %	116514980
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