MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)

Total Repeats: 17523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_008513	GAAT	2	8	11430	11437	50 %	25 %	25 %	0 %	116514960
503	NC_008513	A	7	7	11494	11500	100 %	0 %	0 %	0 %	116514960
504	NC_008513	GGTT	2	8	11572	11579	0 %	50 %	50 %	0 %	116514960
505	NC_008513	ATG	2	6	11613	11618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514960
506	NC_008513	GAA	2	6	11633	11638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514960
507	NC_008513	AGT	2	6	11665	11670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514960
508	NC_008513	TTAT	2	8	11695	11702	25 %	75 %	0 %	0 %	116514960
509	NC_008513	TTA	2	6	11712	11717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514960
510	NC_008513	TAG	2	6	11736	11741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514960
511	NC_008513	A	7	7	11774	11780	100 %	0 %	0 %	0 %	116514960
512	NC_008513	ATT	2	6	11797	11802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514960
513	NC_008513	ATT	2	6	11839	11844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514960
514	NC_008513	ATT	2	6	11846	11851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514960
515	NC_008513	AGA	2	6	11854	11859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514960
516	NC_008513	TAG	2	6	11886	11891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514960
517	NC_008513	TGG	2	6	11989	11994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514960
518	NC_008513	GAA	2	6	12008	12013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514960
519	NC_008513	TCT	2	6	12035	12040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514960
520	NC_008513	AGA	2	6	12043	12048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514960
521	NC_008513	TAA	2	6	12076	12081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514960
522	NC_008513	ACA	3	9	12086	12094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116514960
523	NC_008513	ATT	2	6	12095	12100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514960
524	NC_008513	AAG	2	6	12117	12122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514960
525	NC_008513	AAAT	2	8	12156	12163	75 %	25 %	0 %	0 %	116514960
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527	NC_008513	GCA	2	6	12248	12253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116514960
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529	NC_008513	A	8	8	12273	12280	100 %	0 %	0 %	0 %	116514960
530	NC_008513	CTA	2	6	12306	12311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514960
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532	NC_008513	GTT	2	6	12332	12337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116514960
533	NC_008513	TGG	3	9	12340	12348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514960
534	NC_008513	A	6	6	12372	12377	100 %	0 %	0 %	0 %	116514960
535	NC_008513	GAA	2	6	12479	12484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514960
536	NC_008513	AGT	2	6	12490	12495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514960
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538	NC_008513	TGATA	2	10	12559	12568	40 %	40 %	20 %	0 %	116514960
539	NC_008513	TGC	2	6	12619	12624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514960
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541	NC_008513	AATGG	2	10	12719	12728	40 %	20 %	40 %	0 %	116514960
542	NC_008513	ATG	2	6	12746	12751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514960
543	NC_008513	T	6	6	12755	12760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008513	AT	3	6	12780	12785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008513	TTA	2	6	12794	12799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008513	TTTA	2	8	12803	12810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008513	GA	3	6	12879	12884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008513	TAAT	2	8	12885	12892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008513	ATT	2	6	13030	13035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514961
550	NC_008513	TCA	2	6	13051	13056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514961
551	NC_008513	T	6	6	13077	13082	0 %	100 %	0 %	0 %	116514961
552	NC_008513	CTG	2	6	13086	13091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514961
553	NC_008513	TTAT	2	8	13114	13121	25 %	75 %	0 %	0 %	116514961
554	NC_008513	ATA	2	6	13122	13127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514961
555	NC_008513	A	8	8	13154	13161	100 %	0 %	0 %	0 %	116514961
556	NC_008513	A	7	7	13183	13189	100 %	0 %	0 %	0 %	116514961
557	NC_008513	TTATG	2	10	13239	13248	20 %	60 %	20 %	0 %	116514961
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559	NC_008513	TTTA	2	8	13390	13397	25 %	75 %	0 %	0 %	116514961
560	NC_008513	A	6	6	13400	13405	100 %	0 %	0 %	0 %	116514961
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601	NC_008513	TA	4	8	14355	14362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008513	TAT	2	6	14389	14394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008513	T	6	6	14399	14404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008513	ATT	2	6	14422	14427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514963
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632	NC_008513	TAT	2	6	15020	15025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008513	ATA	2	6	15030	15035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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