MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 1352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008392	TGCGC	2	10	717	726	0 %	20 %	40 %	40 %	115360318
2	NC_008392	CATCG	2	10	2379	2388	20 %	20 %	20 %	40 %	115360320
3	NC_008392	GCGCG	2	10	3919	3928	0 %	0 %	60 %	40 %	115360322
4	NC_008392	ACAGC	2	10	5246	5255	40 %	0 %	20 %	40 %	115360323
5	NC_008392	GCTCG	2	10	7430	7439	0 %	20 %	40 %	40 %	115360324
6	NC_008392	GCCCG	2	10	7847	7856	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_008392	CGGAA	2	10	10168	10177	40 %	0 %	40 %	20 %	115360326
8	NC_008392	CCGGC	2	10	10577	10586	0 %	0 %	40 %	60 %	115360326
9	NC_008392	CGCGG	2	10	11395	11404	0 %	0 %	60 %	40 %	115360327
10	NC_008392	TCGGC	2	10	12098	12107	0 %	20 %	40 %	40 %	115360329
11	NC_008392	GCATC	2	10	13478	13487	20 %	20 %	20 %	40 %	115360331
12	NC_008392	GCGCC	2	10	13826	13835	0 %	0 %	40 %	60 %	115360331
13	NC_008392	CGACA	2	10	14329	14338	40 %	0 %	20 %	40 %	115360331
14	NC_008392	CGCGG	2	10	16253	16262	0 %	0 %	60 %	40 %	115360333
15	NC_008392	CCGCG	2	10	17760	17769	0 %	0 %	40 %	60 %	115360334
16	NC_008392	GCGCT	2	10	18715	18724	0 %	20 %	40 %	40 %	115360334
17	NC_008392	CGGCA	2	10	18841	18850	20 %	0 %	40 %	40 %	115360334
18	NC_008392	CGCGC	2	10	19632	19641	0 %	0 %	40 %	60 %	115360334
19	NC_008392	CGCGC	2	10	21694	21703	0 %	0 %	40 %	60 %	115360335
20	NC_008392	GAGCA	2	10	22521	22530	40 %	0 %	40 %	20 %	115360335
21	NC_008392	GATCC	2	10	25151	25160	20 %	20 %	20 %	40 %	115360336
22	NC_008392	CGACC	2	10	26003	26012	20 %	0 %	20 %	60 %	115360337
23	NC_008392	GCGCG	2	10	26390	26399	0 %	0 %	60 %	40 %	115360337
24	NC_008392	GCGCC	2	10	26405	26414	0 %	0 %	40 %	60 %	115360337
25	NC_008392	CGTGG	2	10	28333	28342	0 %	20 %	60 %	20 %	115360338
26	NC_008392	CGAGC	2	10	29114	29123	20 %	0 %	40 %	40 %	115360338
27	NC_008392	CGCGC	2	10	30118	30127	0 %	0 %	40 %	60 %	115360339
28	NC_008392	CGGCG	2	10	30592	30601	0 %	0 %	60 %	40 %	115360339
29	NC_008392	GCGTG	2	10	30692	30701	0 %	20 %	60 %	20 %	115360339
30	NC_008392	GCACG	2	10	31048	31057	20 %	0 %	40 %	40 %	115360339
31	NC_008392	GCCGC	2	10	31638	31647	0 %	0 %	40 %	60 %	115360339
32	NC_008392	CGCGC	2	10	32801	32810	0 %	0 %	40 %	60 %	115360340
33	NC_008392	GCATC	2	10	33363	33372	20 %	20 %	20 %	40 %	115360340
34	NC_008392	GACCG	2	10	35092	35101	20 %	0 %	40 %	40 %	115360341
35	NC_008392	GATTG	2	10	35380	35389	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008392	CTTGC	2	10	35720	35729	0 %	40 %	20 %	40 %	115360342
37	NC_008392	CACGG	2	10	36641	36650	20 %	0 %	40 %	40 %	115360343
38	NC_008392	CGGCG	2	10	36793	36802	0 %	0 %	60 %	40 %	115360343
39	NC_008392	GCTTC	2	10	39199	39208	0 %	40 %	20 %	40 %	115360346
40	NC_008392	CGCGC	2	10	40271	40280	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_008392	CGCGC	2	10	41974	41983	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_008392	GCCGC	2	10	42097	42106	0 %	0 %	40 %	60 %	115360351
43	NC_008392	ACGCG	2	10	43139	43148	20 %	0 %	40 %	40 %	115360353
44	NC_008392	CAGCG	2	10	44460	44469	20 %	0 %	40 %	40 %	115360354
45	NC_008392	TCCCA	2	10	44661	44670	20 %	20 %	0 %	60 %	115360354
46	NC_008392	GCCGC	2	10	46417	46426	0 %	0 %	40 %	60 %	115360354
47	NC_008392	GCATC	2	10	49087	49096	20 %	20 %	20 %	40 %	115360356
48	NC_008392	GGTCG	2	10	49361	49370	0 %	20 %	60 %	20 %	115360356
49	NC_008392	TGCGC	2	10	49504	49513	0 %	20 %	40 %	40 %	115360356
50	NC_008392	TCGGT	2	10	50320	50329	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008392	CGTGC	2	10	51563	51572	0 %	20 %	40 %	40 %	115360360
52	NC_008392	CGCGC	2	10	52057	52066	0 %	0 %	40 %	60 %	115360360
53	NC_008392	CGCAA	2	10	52209	52218	40 %	0 %	20 %	40 %	115360360
54	NC_008392	TCGAG	2	10	52624	52633	20 %	20 %	40 %	20 %	115360360
55	NC_008392	GTCAG	2	10	53169	53178	20 %	20 %	40 %	20 %	115360361
56	NC_008392	GCCTT	2	10	54727	54736	0 %	40 %	20 %	40 %	115360363
57	NC_008392	CCTCG	2	10	55805	55814	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_008392	CCCGG	2	10	55949	55958	0 %	0 %	40 %	60 %	115360366
59	NC_008392	GGGCC	2	10	56250	56259	0 %	0 %	60 %	40 %	115360366
60	NC_008392	CGGCG	2	10	58335	58344	0 %	0 %	60 %	40 %	115360368
61	NC_008392	GCGAC	2	10	61550	61559	20 %	0 %	40 %	40 %	115360371
62	NC_008392	GCGCG	2	10	61842	61851	0 %	0 %	60 %	40 %	115360371
63	NC_008392	GCCGA	2	10	61977	61986	20 %	0 %	40 %	40 %	115360371
64	NC_008392	CACGC	2	10	63191	63200	20 %	0 %	20 %	60 %	115360373
65	NC_008392	GCGAC	2	10	65864	65873	20 %	0 %	40 %	40 %	115360376
66	NC_008392	CGGCG	2	10	66312	66321	0 %	0 %	60 %	40 %	115360376
67	NC_008392	GCTGA	3	15	66798	66812	20 %	20 %	40 %	20 %	115360376
68	NC_008392	CGCGC	2	10	69629	69638	0 %	0 %	40 %	60 %	115360380
69	NC_008392	CGCGA	2	10	70494	70503	20 %	0 %	40 %	40 %	115360382
70	NC_008392	GTCGC	2	10	71515	71524	0 %	20 %	40 %	40 %	115360383
71	NC_008392	CGTGC	2	10	72535	72544	0 %	20 %	40 %	40 %	115360384
72	NC_008392	TGCGC	2	10	74724	74733	0 %	20 %	40 %	40 %	115360386
73	NC_008392	CCGCG	2	10	74924	74933	0 %	0 %	40 %	60 %	115360386
74	NC_008392	TGCCC	2	10	75000	75009	0 %	20 %	20 %	60 %	115360386
75	NC_008392	GCCGG	2	10	76951	76960	0 %	0 %	60 %	40 %	115360387
76	NC_008392	GCACC	2	10	78113	78122	20 %	0 %	20 %	60 %	115360388
77	NC_008392	AGCGC	2	10	78406	78415	20 %	0 %	40 %	40 %	115360388
78	NC_008392	CGAGC	2	10	78991	79000	20 %	0 %	40 %	40 %	115360389
79	NC_008392	CGCGC	2	10	79507	79516	0 %	0 %	40 %	60 %	115360389
80	NC_008392	ATGCG	2	10	79845	79854	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008392	TCGAA	2	10	80520	80529	40 %	20 %	20 %	20 %	115360390
82	NC_008392	CGGAT	2	10	81541	81550	20 %	20 %	40 %	20 %	115360391
83	NC_008392	CGCGC	2	10	81701	81710	0 %	0 %	40 %	60 %	115360391
84	NC_008392	CCCGA	2	10	82077	82086	20 %	0 %	20 %	60 %	115360391
85	NC_008392	GCACA	2	10	82726	82735	40 %	0 %	20 %	40 %	115360392
86	NC_008392	GCGAC	2	10	82926	82935	20 %	0 %	40 %	40 %	115360392
87	NC_008392	TCGCG	2	10	84343	84352	0 %	20 %	40 %	40 %	115360394
88	NC_008392	CGGCG	2	10	85511	85520	0 %	0 %	60 %	40 %	115360394
89	NC_008392	GGCGC	2	10	85639	85648	0 %	0 %	60 %	40 %	115360394
90	NC_008392	TGCCG	2	10	85750	85759	0 %	20 %	40 %	40 %	115360394
91	NC_008392	GCGCG	2	10	86656	86665	0 %	0 %	60 %	40 %	115360395
92	NC_008392	CCGTG	2	10	88681	88690	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_008392	TCGGG	2	10	89037	89046	0 %	20 %	60 %	20 %	115360398
94	NC_008392	GCGTC	2	10	90589	90598	0 %	20 %	40 %	40 %	115360399
95	NC_008392	CGGCT	2	10	90858	90867	0 %	20 %	40 %	40 %	115360399
96	NC_008392	CGCGC	2	10	91103	91112	0 %	0 %	40 %	60 %	115360399
97	NC_008392	ACCGA	2	10	91473	91482	40 %	0 %	20 %	40 %	115360399
98	NC_008392	GGTCG	2	10	92057	92066	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008392	GCGCG	2	10	92997	93006	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_008392	GCCGG	2	10	94884	94893	0 %	0 %	60 %	40 %	115360402
101	NC_008392	ACGGT	2	10	95005	95014	20 %	20 %	40 %	20 %	115360402
102	NC_008392	CGCGC	2	10	95058	95067	0 %	0 %	40 %	60 %	115360402
103	NC_008392	TCGCC	2	10	96106	96115	0 %	20 %	20 %	60 %	115360404
104	NC_008392	CGGGT	2	10	97052	97061	0 %	20 %	60 %	20 %	115360404
105	NC_008392	TCGGC	2	10	98124	98133	0 %	20 %	40 %	40 %	115360405
106	NC_008392	GCCGC	2	10	98423	98432	0 %	0 %	40 %	60 %	115360405
107	NC_008392	CATGG	2	10	98833	98842	20 %	20 %	40 %	20 %	115360405
108	NC_008392	CGTGT	2	10	100827	100836	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008392	CCGCG	2	10	103969	103978	0 %	0 %	40 %	60 %	115360410
110	NC_008392	CGCGA	2	10	104049	104058	20 %	0 %	40 %	40 %	115360410
111	NC_008392	GCGCG	2	10	104072	104081	0 %	0 %	60 %	40 %	115360410
112	NC_008392	GCTCG	2	10	104309	104318	0 %	20 %	40 %	40 %	115360410
113	NC_008392	GGCCG	2	10	105306	105315	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_008392	TGCCG	2	10	105405	105414	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_008392	GCCCG	2	10	105497	105506	0 %	0 %	40 %	60 %	115360412
116	NC_008392	CGACC	2	10	105703	105712	20 %	0 %	20 %	60 %	115360412
117	NC_008392	GGCCA	2	10	109785	109794	20 %	0 %	40 %	40 %	115360413
118	NC_008392	CGACG	2	10	110436	110445	20 %	0 %	40 %	40 %	115360413
119	NC_008392	CTCTC	2	10	110771	110780	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_008392	CGACG	2	10	111556	111565	20 %	0 %	40 %	40 %	115360414
121	NC_008392	TCCTG	2	10	112276	112285	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008392	TTCGC	2	10	113286	113295	0 %	40 %	20 %	40 %	115360415
123	NC_008392	CGGCG	2	10	114785	114794	0 %	0 %	60 %	40 %	115360417
124	NC_008392	GATCG	2	10	114869	114878	20 %	20 %	40 %	20 %	115360417
125	NC_008392	TAAGG	2	10	118243	118252	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008392	CCCGT	2	10	119058	119067	0 %	20 %	20 %	60 %	115360422
127	NC_008392	GCACG	2	10	119137	119146	20 %	0 %	40 %	40 %	115360422
128	NC_008392	CCGAA	2	10	119645	119654	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_008392	GCGTC	2	10	119758	119767	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008392	ACCCG	2	10	120311	120320	20 %	0 %	20 %	60 %	115360424
131	NC_008392	CAACG	2	10	120813	120822	40 %	0 %	20 %	40 %	115360424
132	NC_008392	GCTCG	2	10	120933	120942	0 %	20 %	40 %	40 %	115360424
133	NC_008392	TTCGC	2	10	121637	121646	0 %	40 %	20 %	40 %	115360425
134	NC_008392	CCGGC	2	10	126608	126617	0 %	0 %	40 %	60 %	115360430
135	NC_008392	GCGCC	2	10	126962	126971	0 %	0 %	40 %	60 %	115360430
136	NC_008392	CGGCG	2	10	128014	128023	0 %	0 %	60 %	40 %	115360431
137	NC_008392	ACGCG	2	10	130553	130562	20 %	0 %	40 %	40 %	115360434
138	NC_008392	CGCGC	2	10	132049	132058	0 %	0 %	40 %	60 %	115360436
139	NC_008392	AAGGC	2	10	132953	132962	40 %	0 %	40 %	20 %	115360436
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142	NC_008392	CGAGC	2	10	138732	138741	20 %	0 %	40 %	40 %	115360440
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151	NC_008392	TTCGG	2	10	145234	145243	0 %	40 %	40 %	20 %	115360444
152	NC_008392	ACGGG	2	10	146599	146608	20 %	0 %	60 %	20 %	115360444
153	NC_008392	CGCCT	2	10	147151	147160	0 %	20 %	20 %	60 %	115360444
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155	NC_008392	GCATC	2	10	147735	147744	20 %	20 %	20 %	40 %	115360444
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175	NC_008392	GCCGC	2	10	167895	167904	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
176	NC_008392	GCGCG	2	10	168358	168367	0 %	0 %	60 %	40 %	115360459
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186	NC_008392	TGCGC	2	10	175540	175549	0 %	20 %	40 %	40 %	115360465
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190	NC_008392	CGCGG	2	10	177842	177851	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
191	NC_008392	CGGAT	2	10	178679	178688	20 %	20 %	40 %	20 %	115360469
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198	NC_008392	CCGAT	2	10	183116	183125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
199	NC_008392	ACGCG	2	10	183147	183156	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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233	NC_008392	CCGCA	2	10	217680	217689	20 %	0 %	20 %	60 %	115360500
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238	NC_008392	TAAAA	2	10	226540	226549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_008392	GGCCC	2	10	227154	227163	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
240	NC_008392	GTGGC	2	10	227544	227553	0 %	20 %	60 %	20 %	115360507
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248	NC_008392	CGCGG	2	10	237963	237972	0 %	0 %	60 %	40 %	115360513
249	NC_008392	GGTGC	2	10	238915	238924	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
250	NC_008392	TTCGG	2	10	240895	240904	0 %	40 %	40 %	20 %	115360515
251	NC_008392	TGCGT	2	10	241131	241140	0 %	40 %	40 %	20 %	115360516
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253	NC_008392	GACCA	2	10	245102	245111	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
254	NC_008392	CGGCG	2	10	247303	247312	0 %	0 %	60 %	40 %	115360520
255	NC_008392	GCGAC	2	10	247633	247642	20 %	0 %	40 %	40 %	115360520
256	NC_008392	GTCGC	2	10	248232	248241	0 %	20 %	40 %	40 %	115360521
257	NC_008392	ATGCG	2	10	248501	248510	20 %	20 %	40 %	20 %	115360521
258	NC_008392	CGACG	2	10	248566	248575	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
259	NC_008392	CAATG	2	10	249074	249083	40 %	20 %	20 %	20 %	115360522
260	NC_008392	GGTCA	2	10	249583	249592	20 %	20 %	40 %	20 %	115360522
261	NC_008392	CGGCA	2	10	249663	249672	20 %	0 %	40 %	40 %	115360522
262	NC_008392	TCGCG	2	10	250061	250070	0 %	20 %	40 %	40 %	115360522
263	NC_008392	CGGCA	2	10	251199	251208	20 %	0 %	40 %	40 %	115360523
264	NC_008392	GCGAA	2	10	251649	251658	40 %	0 %	40 %	20 %	115360523
265	NC_008392	CGAAG	2	10	251818	251827	40 %	0 %	40 %	20 %	115360523
266	NC_008392	CCGCG	2	10	252171	252180	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
267	NC_008392	CGGGC	2	10	252836	252845	0 %	0 %	60 %	40 %	115360524
268	NC_008392	TGCGA	2	10	255620	255629	20 %	20 %	40 %	20 %	115360526
269	NC_008392	CATCG	2	10	256176	256185	20 %	20 %	20 %	40 %	115360526
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272	NC_008392	CGCGC	2	10	257914	257923	0 %	0 %	40 %	60 %	115360528
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282	NC_008392	CGATG	2	10	272745	272754	20 %	20 %	40 %	20 %	115360545
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284	NC_008392	CGCGT	2	10	275594	275603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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383	NC_008392	CGGCG	2	10	362082	362091	0 %	0 %	60 %	40 %	115360625
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386	NC_008392	AACCG	2	10	369037	369046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
387	NC_008392	GCCTT	2	10	372513	372522	0 %	40 %	20 %	40 %	115360635
388	NC_008392	CGTTG	2	10	372710	372719	0 %	40 %	40 %	20 %	115360635
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392	NC_008392	ATTTA	2	10	377414	377423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_008392	CGTAC	2	10	378007	378016	20 %	20 %	20 %	40 %	115360639
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397	NC_008392	TCGCG	2	10	380906	380915	0 %	20 %	40 %	40 %	115360641
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