MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 35965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008392	GCGCG	2	10	168358	168367	0 %	0 %	60 %	40 %	115360459
5002	NC_008392	CG	5	10	168421	168430	0 %	0 %	50 %	50 %	115360459
5003	NC_008392	GCC	2	6	168567	168572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360459
5004	NC_008392	TCGCG	2	10	168621	168630	0 %	20 %	40 %	40 %	115360459
5005	NC_008392	GAC	2	6	168661	168666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360459
5006	NC_008392	TGA	2	6	168826	168831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115360460
5007	NC_008392	GCA	2	6	168836	168841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360460
5008	NC_008392	ACG	2	6	168850	168855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360460
5009	NC_008392	ACG	2	6	168885	168890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360460
5010	NC_008392	GGC	2	6	168898	168903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360460
5011	NC_008392	CCG	2	6	168910	168915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360460
5012	NC_008392	CCG	2	6	168947	168952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360460
5013	NC_008392	GTCCG	2	10	168962	168971	0 %	20 %	40 %	40 %	115360460
5014	NC_008392	TCG	2	6	168990	168995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360460
5015	NC_008392	GCCC	2	8	169062	169069	0 %	0 %	25 %	75 %	115360461
5016	NC_008392	CGA	2	6	169074	169079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5017	NC_008392	CGC	2	6	169099	169104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360461
5018	NC_008392	GCC	2	6	169113	169118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360461
5019	NC_008392	GC	3	6	169127	169132	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5020	NC_008392	GCCG	2	8	169137	169144	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5021	NC_008392	CGG	2	6	169157	169162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360461
5022	NC_008392	CG	4	8	169170	169177	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5023	NC_008392	ACGC	2	8	169187	169194	25 %	0 %	25 %	50 %	115360461
5024	NC_008392	ACG	2	6	169328	169333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5025	NC_008392	GCACGC	2	12	169362	169373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115360461
5026	NC_008392	GC	4	8	169386	169393	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5027	NC_008392	AGCGC	2	10	169436	169445	20 %	0 %	40 %	40 %	115360461
5028	NC_008392	CG	3	6	169470	169475	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5029	NC_008392	GAGC	2	8	169506	169513	25 %	0 %	50 %	25 %	115360461
5030	NC_008392	TGC	2	6	169619	169624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5031	NC_008392	CGTC	2	8	169653	169660	0 %	25 %	25 %	50 %	115360461
5032	NC_008392	GCA	2	6	169700	169705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5033	NC_008392	GCGTC	2	10	169724	169733	0 %	20 %	40 %	40 %	115360461
5034	NC_008392	CAG	2	6	169735	169740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5035	NC_008392	CGCGG	2	10	169741	169750	0 %	0 %	60 %	40 %	115360461
5036	NC_008392	CCG	2	6	169791	169796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360461
5037	NC_008392	GCC	2	6	169868	169873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360461
5038	NC_008392	CG	3	6	169879	169884	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5039	NC_008392	ACGC	2	8	169914	169921	25 %	0 %	25 %	50 %	115360461
5040	NC_008392	GCG	2	6	169922	169927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360461
5041	NC_008392	GCG	2	6	169933	169938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360461
5042	NC_008392	TCG	2	6	169961	169966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5043	NC_008392	CGG	2	6	169979	169984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360461
5044	NC_008392	CGC	2	6	169986	169991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360461
5045	NC_008392	GAC	2	6	169992	169997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5046	NC_008392	TGC	2	6	170012	170017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5047	NC_008392	TTCG	2	8	170061	170068	0 %	50 %	25 %	25 %	115360461
5048	NC_008392	GC	3	6	170109	170114	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5049	NC_008392	GAC	2	6	170118	170123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5050	NC_008392	CGC	2	6	170127	170132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360461
5051	NC_008392	TGC	2	6	170158	170163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5052	NC_008392	GACGC	2	10	170176	170185	20 %	0 %	40 %	40 %	115360461
5053	NC_008392	CTG	2	6	170191	170196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5054	NC_008392	GC	3	6	170252	170257	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5055	NC_008392	CG	3	6	170259	170264	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5056	NC_008392	CCGG	2	8	170281	170288	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5057	NC_008392	GCT	2	6	170310	170315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5058	NC_008392	TGC	2	6	170339	170344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5059	NC_008392	CGT	2	6	170354	170359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5060	NC_008392	TGG	2	6	170381	170386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115360461
5061	NC_008392	CGA	2	6	170391	170396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5062	NC_008392	GC	3	6	170400	170405	0 %	0 %	50 %	50 %	115360461
5063	NC_008392	CGAT	2	8	170408	170415	25 %	25 %	25 %	25 %	115360461
5064	NC_008392	GGC	2	6	170428	170433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360461
5065	NC_008392	AGC	2	6	170440	170445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360461
5066	NC_008392	GCC	3	9	170470	170478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_008392	CG	3	6	170491	170496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_008392	GCCG	2	8	170544	170551	0 %	0 %	50 %	50 %	115360462
5069	NC_008392	ATCG	2	8	170562	170569	25 %	25 %	25 %	25 %	115360462
5070	NC_008392	GCA	3	9	170586	170594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5071	NC_008392	TCG	2	6	170672	170677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5072	NC_008392	CGC	2	6	170787	170792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360462
5073	NC_008392	CAG	2	6	170875	170880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5074	NC_008392	CG	3	6	170936	170941	0 %	0 %	50 %	50 %	115360462
5075	NC_008392	TCG	2	6	170942	170947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5076	NC_008392	CCG	3	9	170970	170978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360462
5077	NC_008392	CAG	3	9	170980	170988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5078	NC_008392	CAA	2	6	170989	170994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115360462
5079	NC_008392	ACG	2	6	171002	171007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5080	NC_008392	CGT	2	6	171015	171020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5081	NC_008392	GGC	2	6	171075	171080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360462
5082	NC_008392	CGC	2	6	171084	171089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360462
5083	NC_008392	GCA	2	6	171129	171134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5084	NC_008392	GAC	2	6	171145	171150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5085	NC_008392	CGT	2	6	171201	171206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5086	NC_008392	GC	3	6	171224	171229	0 %	0 %	50 %	50 %	115360462
5087	NC_008392	GCC	2	6	171244	171249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360462
5088	NC_008392	GCCG	2	8	171264	171271	0 %	0 %	50 %	50 %	115360462
5089	NC_008392	AGC	3	9	171275	171283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360462
5090	NC_008392	CGG	2	6	171320	171325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360462
5091	NC_008392	GC	4	8	171351	171358	0 %	0 %	50 %	50 %	115360462
5092	NC_008392	CGCT	2	8	171405	171412	0 %	25 %	25 %	50 %	115360462
5093	NC_008392	GCC	2	6	171433	171438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360462
5094	NC_008392	TCC	2	6	171443	171448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115360462
5095	NC_008392	T	7	7	171561	171567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_008392	GAAT	2	8	171585	171592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008392	TCG	2	6	171597	171602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_008392	CGAC	2	8	171662	171669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_008392	GCG	2	6	171675	171680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_008392	CGT	3	9	171683	171691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_008392	GTT	2	6	171727	171732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115360463
5102	NC_008392	CGAT	2	8	171743	171750	25 %	25 %	25 %	25 %	115360463
5103	NC_008392	CGT	2	6	171805	171810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360463
5104	NC_008392	GCC	2	6	171832	171837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360463
5105	NC_008392	CTT	2	6	171847	171852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115360463
5106	NC_008392	TCG	2	6	171881	171886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360463
5107	NC_008392	GAC	2	6	171887	171892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360463
5108	NC_008392	CGT	2	6	171946	171951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360463
5109	NC_008392	TGCAA	2	10	172008	172017	40 %	20 %	20 %	20 %	115360463
5110	NC_008392	GCC	2	6	172185	172190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360464
5111	NC_008392	ACG	2	6	172233	172238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360464
5112	NC_008392	GCCG	2	8	172286	172293	0 %	0 %	50 %	50 %	115360464
5113	NC_008392	GCG	2	6	172306	172311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360464
5114	NC_008392	GCC	2	6	172323	172328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360464
5115	NC_008392	GCA	2	6	172396	172401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360464
5116	NC_008392	GCC	2	6	172406	172411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360464
5117	NC_008392	CGG	2	6	172426	172431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360464
5118	NC_008392	TCG	2	6	172552	172557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360464
5119	NC_008392	AGC	2	6	172599	172604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360464
5120	NC_008392	GA	3	6	172639	172644	50 %	0 %	50 %	0 %	115360464
5121	NC_008392	TCG	2	6	172648	172653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360464
5122	NC_008392	CGT	2	6	172708	172713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360464
5123	NC_008392	GCC	2	6	172731	172736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360464
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5153	NC_008392	GCC	2	6	173938	173943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5241	NC_008392	CGCTG	2	10	176413	176422	0 %	20 %	40 %	40 %	115360466
5242	NC_008392	CGC	2	6	176425	176430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360466
5243	NC_008392	GGCG	2	8	176467	176474	0 %	0 %	75 %	25 %	115360466
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5245	NC_008392	GCCG	2	8	176573	176580	0 %	0 %	50 %	50 %	115360466
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5249	NC_008392	CG	3	6	176728	176733	0 %	0 %	50 %	50 %	115360466
5250	NC_008392	GCG	2	6	176776	176781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360466
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5283	NC_008392	CGCGG	2	10	177842	177851	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5285	NC_008392	CCG	2	6	177985	177990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5328	NC_008392	GCAT	2	8	179335	179342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5352	NC_008392	CGG	2	6	180333	180338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360470
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5356	NC_008392	ATC	2	6	180403	180408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360471
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5358	NC_008392	GTC	2	6	180465	180470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360471
5359	NC_008392	GCCC	3	12	180543	180554	0 %	0 %	25 %	75 %	115360471
5360	NC_008392	CGT	2	6	180611	180616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360471
5361	NC_008392	CG	5	10	180653	180662	0 %	0 %	50 %	50 %	115360471
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5365	NC_008392	GTCG	2	8	180839	180846	0 %	25 %	50 %	25 %	115360471
5366	NC_008392	ACGCG	2	10	180854	180863	20 %	0 %	40 %	40 %	115360471
5367	NC_008392	GCC	2	6	180893	180898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360471
5368	NC_008392	TGGT	2	8	180927	180934	0 %	50 %	50 %	0 %	115360471
5369	NC_008392	GAC	2	6	180941	180946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360471
5370	NC_008392	TGGTC	2	10	180949	180958	0 %	40 %	40 %	20 %	115360471
5371	NC_008392	CGT	2	6	180959	180964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360471
5372	NC_008392	CG	3	6	180965	180970	0 %	0 %	50 %	50 %	115360471
5373	NC_008392	CG	3	6	180994	180999	0 %	0 %	50 %	50 %	115360471
5374	NC_008392	CGTC	2	8	181015	181022	0 %	25 %	25 %	50 %	115360471
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5386	NC_008392	CCGA	2	8	181644	181651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5387	NC_008392	GCC	2	6	181666	181671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5393	NC_008392	CCG	2	6	181859	181864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360472
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5401	NC_008392	AGC	2	6	182107	182112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360472
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5404	NC_008392	CACCG	2	10	182157	182166	20 %	0 %	20 %	60 %	115360472
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5438	NC_008392	CCGAT	2	10	183116	183125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5439	NC_008392	ACGCG	2	10	183147	183156	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5440	NC_008392	CAT	2	6	183315	183320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360473
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5445	NC_008392	CGAC	2	8	183494	183501	25 %	0 %	25 %	50 %	115360473
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5452	NC_008392	CCA	2	6	183726	183731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115360473
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5454	NC_008392	CGA	2	6	183822	183827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360473
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5456	NC_008392	TCG	2	6	183953	183958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360473
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5460	NC_008392	TCG	2	6	184019	184024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360473
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5467	NC_008392	CG	3	6	184238	184243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5468	NC_008392	GCAG	2	8	184254	184261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5469	NC_008392	GACG	2	8	184275	184282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5470	NC_008392	GTG	2	6	184361	184366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5471	NC_008392	GCCA	2	8	184492	184499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5472	NC_008392	CG	3	6	184524	184529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5473	NC_008392	GCC	2	6	184537	184542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5474	NC_008392	GCT	2	6	184554	184559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5475	NC_008392	GCCG	2	8	184605	184612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5476	NC_008392	GC	3	6	184617	184622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5477	NC_008392	GCCGG	2	10	184658	184667	0 %	0 %	60 %	40 %	115360474
5478	NC_008392	CTG	2	6	184669	184674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360474
5479	NC_008392	CTT	2	6	184689	184694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115360474
5480	NC_008392	GCG	2	6	184751	184756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360474
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5482	NC_008392	CG	3	6	184820	184825	0 %	0 %	50 %	50 %	115360474
5483	NC_008392	TCA	2	6	184851	184856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360474
5484	NC_008392	CCGA	2	8	184955	184962	25 %	0 %	25 %	50 %	115360474
5485	NC_008392	CGT	2	6	184992	184997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360474
5486	NC_008392	GCG	2	6	185024	185029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360474
5487	NC_008392	GCC	2	6	185030	185035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360474
5488	NC_008392	CGA	2	6	185041	185046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360474
5489	NC_008392	CG	3	6	185064	185069	0 %	0 %	50 %	50 %	115360474
5490	NC_008392	CG	3	6	185123	185128	0 %	0 %	50 %	50 %	115360474
5491	NC_008392	TCA	2	6	185130	185135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360474
5492	NC_008392	GCA	2	6	185170	185175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360474
5493	NC_008392	CGA	2	6	185187	185192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360474
5494	NC_008392	CAT	2	6	185212	185217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360474
5495	NC_008392	CG	3	6	185226	185231	0 %	0 %	50 %	50 %	115360474
5496	NC_008392	GCGCGT	2	12	185253	185264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115360474
5497	NC_008392	CG	3	6	185293	185298	0 %	0 %	50 %	50 %	115360474
5498	NC_008392	CG	3	6	185300	185305	0 %	0 %	50 %	50 %	115360474
5499	NC_008392	CG	3	6	185345	185350	0 %	0 %	50 %	50 %	115360474
5500	NC_008392	GCG	2	6	185385	185390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360474

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