MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Burkholderia cepacia AMMD plasmid 1

Total Repeats: 1136

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008385	GAT	2	6	37763	37768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345522
1002	NC_008385	GA	3	6	37839	37844	50 %	0 %	50 %	0 %	115345522
1003	NC_008385	GCG	2	6	37901	37906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345522
1004	NC_008385	TGCGA	2	10	37975	37984	20 %	20 %	40 %	20 %	115345522
1005	NC_008385	GCG	2	6	38006	38011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345522
1006	NC_008385	TGA	3	9	38059	38067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345522
1007	NC_008385	CGC	2	6	38086	38091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345522
1008	NC_008385	GCT	2	6	38212	38217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345522
1009	NC_008385	GC	3	6	38218	38223	0 %	0 %	50 %	50 %	115345522
1010	NC_008385	TGGCGA	2	12	38299	38310	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115345522
1011	NC_008385	CG	3	6	38315	38320	0 %	0 %	50 %	50 %	115345522
1012	NC_008385	TTG	2	6	38349	38354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345522
1013	NC_008385	GTC	2	6	38372	38377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345522
1014	NC_008385	GGC	2	6	38384	38389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345522
1015	NC_008385	AGGG	2	8	38397	38404	25 %	0 %	75 %	0 %	115345522
1016	NC_008385	CAG	2	6	38413	38418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345522
1017	NC_008385	TGG	2	6	38452	38457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345522
1018	NC_008385	CACG	2	8	38496	38503	25 %	0 %	25 %	50 %	115345523
1019	NC_008385	GTT	2	6	38518	38523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345523
1020	NC_008385	GGT	2	6	38539	38544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345523
1021	NC_008385	GTAG	2	8	38566	38573	25 %	25 %	50 %	0 %	115345523
1022	NC_008385	GC	4	8	38580	38587	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
1023	NC_008385	CG	3	6	38625	38630	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
1024	NC_008385	CCAC	2	8	38637	38644	25 %	0 %	0 %	75 %	115345523
1025	NC_008385	GC	3	6	38714	38719	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
1026	NC_008385	GC	4	8	38851	38858	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
1027	NC_008385	CGG	2	6	38877	38882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345523
1028	NC_008385	CGG	2	6	38928	38933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345523
1029	NC_008385	CCAC	2	8	39008	39015	25 %	0 %	0 %	75 %	115345523
1030	NC_008385	GAC	2	6	39076	39081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345523
1031	NC_008385	GCC	2	6	39082	39087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345523
1032	NC_008385	GCG	2	6	39106	39111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345523
1033	NC_008385	CG	3	6	39110	39115	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
1034	NC_008385	CGG	2	6	39146	39151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345523
1035	NC_008385	CCG	2	6	39152	39157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345523
1036	NC_008385	GCG	2	6	39175	39180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345523
1037	NC_008385	CG	3	6	39186	39191	0 %	0 %	50 %	50 %	115345523
1038	NC_008385	CGG	2	6	39195	39200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345523
1039	NC_008385	CTT	2	6	39211	39216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345523
1040	NC_008385	CGGC	2	8	39286	39293	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1041	NC_008385	TGG	2	6	39344	39349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345524
1042	NC_008385	CGA	2	6	39374	39379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345524
1043	NC_008385	CGG	2	6	39418	39423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345524
1044	NC_008385	GTA	3	9	39438	39446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345524
1045	NC_008385	CG	3	6	39487	39492	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1046	NC_008385	GCA	2	6	39659	39664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345524
1047	NC_008385	GAT	2	6	39732	39737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345524
1048	NC_008385	GC	3	6	39760	39765	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1049	NC_008385	GCG	2	6	39771	39776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345524
1050	NC_008385	AGC	2	6	39787	39792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345524
1051	NC_008385	TCA	2	6	39821	39826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345524
1052	NC_008385	GC	4	8	39978	39985	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1053	NC_008385	TGCGC	2	10	40025	40034	0 %	20 %	40 %	40 %	115345524
1054	NC_008385	GTG	2	6	40039	40044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345524
1055	NC_008385	TCG	2	6	40147	40152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345524
1056	NC_008385	CG	3	6	40194	40199	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1057	NC_008385	GCCG	2	8	40203	40210	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1058	NC_008385	GCG	2	6	40279	40284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345524
1059	NC_008385	ATG	2	6	40285	40290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345524
1060	NC_008385	GCG	2	6	40418	40423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345524
1061	NC_008385	GCA	2	6	40475	40480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345524
1062	NC_008385	TGA	2	6	40502	40507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345524
1063	NC_008385	CGGC	2	8	40509	40516	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1064	NC_008385	GCC	2	6	40636	40641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345524
1065	NC_008385	GTA	2	6	40683	40688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345524
1066	NC_008385	GCCG	2	8	40689	40696	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1067	NC_008385	CCA	2	6	40697	40702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345524
1068	NC_008385	GCC	2	6	40726	40731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345524
1069	NC_008385	GAA	2	6	40800	40805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345524
1070	NC_008385	TCT	2	6	40814	40819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345524
1071	NC_008385	CTT	2	6	40827	40832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345524
1072	NC_008385	ATGAAG	2	12	40873	40884	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115345524
1073	NC_008385	ACC	2	6	40972	40977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345524
1074	NC_008385	ACG	2	6	41005	41010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345524
1075	NC_008385	CCG	2	6	41029	41034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345524
1076	NC_008385	GCA	2	6	41066	41071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345524
1077	NC_008385	CGTG	2	8	41126	41133	0 %	25 %	50 %	25 %	115345524
1078	NC_008385	CCG	2	6	41189	41194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345524
1079	NC_008385	GC	3	6	41256	41261	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
1080	NC_008385	AGT	2	6	41459	41464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345524
1081	NC_008385	TGC	2	6	41570	41575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345524
1082	NC_008385	GGC	2	6	41604	41609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345524
1083	NC_008385	CGG	2	6	41654	41659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345524
1084	NC_008385	CTT	2	6	41703	41708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345524
1085	NC_008385	TGC	2	6	41851	41856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345525
1086	NC_008385	GTA	2	6	41864	41869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345525
1087	NC_008385	CGG	2	6	41880	41885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345525
1088	NC_008385	GC	3	6	41947	41952	0 %	0 %	50 %	50 %	115345525
1089	NC_008385	CTT	2	6	41989	41994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345525
1090	NC_008385	GC	3	6	42010	42015	0 %	0 %	50 %	50 %	115345525
1091	NC_008385	CAG	2	6	42020	42025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345525
1092	NC_008385	CG	3	6	42101	42106	0 %	0 %	50 %	50 %	115345525
1093	NC_008385	GCG	2	6	42189	42194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345526
1094	NC_008385	GC	3	6	42211	42216	0 %	0 %	50 %	50 %	115345526
1095	NC_008385	GCG	2	6	42228	42233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345526
1096	NC_008385	GAA	2	6	42251	42256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345526
1097	NC_008385	TCA	2	6	42262	42267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345526
1098	NC_008385	GC	3	6	42274	42279	0 %	0 %	50 %	50 %	115345526
1099	NC_008385	CAG	2	6	42284	42289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345526
1100	NC_008385	GAA	2	6	42323	42328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345526
1101	NC_008385	CGC	2	6	42340	42345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345526
1102	NC_008385	GCC	2	6	42359	42364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345526
1103	NC_008385	GAT	2	6	42380	42385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345526
1104	NC_008385	CAGC	2	8	42434	42441	25 %	0 %	25 %	50 %	115345526
1105	NC_008385	AG	3	6	42453	42458	50 %	0 %	50 %	0 %	115345526
1106	NC_008385	CCG	2	6	42459	42464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345526
1107	NC_008385	G	6	6	42490	42495	0 %	0 %	100 %	0 %	115345526
1108	NC_008385	CAG	2	6	42497	42502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345526
1109	NC_008385	GAA	2	6	42503	42508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345526
1110	NC_008385	AGG	2	6	42513	42518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345526
1111	NC_008385	TTGC	2	8	42574	42581	0 %	50 %	25 %	25 %	115345526
1112	NC_008385	AAC	2	6	42693	42698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345527
1113	NC_008385	TGA	2	6	42758	42763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345527
1114	NC_008385	ATCCA	2	10	42777	42786	40 %	20 %	0 %	40 %	115345527
1115	NC_008385	GTT	2	6	42795	42800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345527
1116	NC_008385	GCA	2	6	42814	42819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345527
1117	NC_008385	CCT	2	6	42820	42825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345527
1118	NC_008385	TCGG	2	8	42894	42901	0 %	25 %	50 %	25 %	115345527
1119	NC_008385	GGT	2	6	42915	42920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345527
1120	NC_008385	CAG	2	6	42924	42929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345527
1121	NC_008385	CGG	2	6	42977	42982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345527
1122	NC_008385	GAT	2	6	43008	43013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345527
1123	NC_008385	TCGG	2	8	43024	43031	0 %	25 %	50 %	25 %	115345527
1124	NC_008385	TGA	2	6	43052	43057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345527
1125	NC_008385	GCC	2	6	43092	43097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345527
1126	NC_008385	GC	4	8	43118	43125	0 %	0 %	50 %	50 %	115345527
1127	NC_008385	CAAT	2	8	43133	43140	50 %	25 %	0 %	25 %	115345527
1128	NC_008385	GCG	2	6	43151	43156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345527
1129	NC_008385	CTT	2	6	43209	43214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345527
1130	NC_008385	GGTG	2	8	43227	43234	0 %	25 %	75 %	0 %	115345527
1131	NC_008385	CGG	2	6	43245	43250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345527
1132	NC_008385	GAT	2	6	43350	43355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345527
1133	NC_008385	CAG	2	6	43479	43484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345527
1134	NC_008385	CTT	3	9	43509	43517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345527
1135	NC_008385	TGT	2	6	43535	43540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345527
1136	NC_008385	GGTC	2	8	43553	43560	0 %	25 %	50 %	25 %	115345527

< Previous 1 23Next >