MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo

Total Repeats: 1001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008277	AATCA	2	10	2372	2381	60 %	20 %	0 %	20 %	111114825
2	NC_008277	AATCC	2	10	3349	3358	40 %	20 %	0 %	40 %	111114826
3	NC_008277	AAAGA	2	10	3842	3851	80 %	0 %	20 %	0 %	111114826
4	NC_008277	TCAAT	2	10	3904	3913	40 %	40 %	0 %	20 %	111114826
5	NC_008277	ATTCC	2	10	5054	5063	20 %	40 %	0 %	40 %	111114827
6	NC_008277	CCTTG	2	10	5122	5131	0 %	40 %	20 %	40 %	111114827
7	NC_008277	GTATT	2	10	5892	5901	20 %	60 %	20 %	0 %	111114827
8	NC_008277	ACAAT	2	10	7090	7099	60 %	20 %	0 %	20 %	111114828
9	NC_008277	ATTCT	2	10	7109	7118	20 %	60 %	0 %	20 %	111114828
10	NC_008277	TAAAT	2	10	7815	7824	60 %	40 %	0 %	0 %	111114829
11	NC_008277	AATTT	2	10	8088	8097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008277	TTTCA	2	10	9061	9070	20 %	60 %	0 %	20 %	111114831
13	NC_008277	TTAAA	2	10	10066	10075	60 %	40 %	0 %	0 %	111114832
14	NC_008277	AATTC	2	10	10569	10578	40 %	40 %	0 %	20 %	111114833
15	NC_008277	TTCAT	2	10	11471	11480	20 %	60 %	0 %	20 %	111114834
16	NC_008277	ACTTA	2	10	12276	12285	40 %	40 %	0 %	20 %	111114835
17	NC_008277	CAAAT	2	10	12428	12437	60 %	20 %	0 %	20 %	111114835
18	NC_008277	TAAAA	2	10	12697	12706	80 %	20 %	0 %	0 %	111114836
19	NC_008277	AACAT	2	10	12747	12756	60 %	20 %	0 %	20 %	111114836
20	NC_008277	AATAT	2	10	14369	14378	60 %	40 %	0 %	0 %	111114836
21	NC_008277	ACAAG	2	10	14418	14427	60 %	0 %	20 %	20 %	111114836
22	NC_008277	AAAAT	2	10	16001	16010	80 %	20 %	0 %	0 %	111114839
23	NC_008277	TTAAA	2	10	16582	16591	60 %	40 %	0 %	0 %	111114839
24	NC_008277	ATTCA	2	10	16629	16638	40 %	40 %	0 %	20 %	111114840
25	NC_008277	TATCA	2	10	17562	17571	40 %	40 %	0 %	20 %	111114840
26	NC_008277	AAAGA	2	10	17882	17891	80 %	0 %	20 %	0 %	111114841
27	NC_008277	CAATC	2	10	18333	18342	40 %	20 %	0 %	40 %	111114842
28	NC_008277	TAAAC	2	10	19667	19676	60 %	20 %	0 %	20 %	111114842
29	NC_008277	AAACA	2	10	21561	21570	80 %	0 %	0 %	20 %	111114844
30	NC_008277	AATTA	2	10	22552	22561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008277	ATTTT	2	10	23888	23897	20 %	80 %	0 %	0 %	111114847
32	NC_008277	TCCCC	2	10	24380	24389	0 %	20 %	0 %	80 %	111114847
33	NC_008277	CAAAA	2	10	26509	26518	80 %	0 %	0 %	20 %	111114850
34	NC_008277	AAAAT	2	10	28711	28720	80 %	20 %	0 %	0 %	111114853
35	NC_008277	TAACC	2	10	29273	29282	40 %	20 %	0 %	40 %	111114853
36	NC_008277	TTAAA	2	10	29387	29396	60 %	40 %	0 %	0 %	111114854
37	NC_008277	AAATA	2	10	31246	31255	80 %	20 %	0 %	0 %	111114855
38	NC_008277	TTTGA	2	10	32450	32459	20 %	60 %	20 %	0 %	111114858
39	NC_008277	TCACT	2	10	32997	33006	20 %	40 %	0 %	40 %	111114858
40	NC_008277	ATTTC	2	10	35437	35446	20 %	60 %	0 %	20 %	111114859
41	NC_008277	TAAAT	2	10	35644	35653	60 %	40 %	0 %	0 %	111114860
42	NC_008277	ATTTT	2	10	36629	36638	20 %	80 %	0 %	0 %	111114861
43	NC_008277	AATAA	2	10	36709	36718	80 %	20 %	0 %	0 %	111114861
44	NC_008277	GCAAA	2	10	37950	37959	60 %	0 %	20 %	20 %	111114862
45	NC_008277	ATCAA	2	10	39080	39089	60 %	20 %	0 %	20 %	111114862
46	NC_008277	TATCA	2	10	41210	41219	40 %	40 %	0 %	20 %	111114864
47	NC_008277	ATCTT	2	10	41252	41261	20 %	60 %	0 %	20 %	111114865
48	NC_008277	AAACT	2	10	42636	42645	60 %	20 %	0 %	20 %	111114866
49	NC_008277	GATTT	2	10	43772	43781	20 %	60 %	20 %	0 %	111114867
50	NC_008277	TCTTT	2	10	44096	44105	0 %	80 %	0 %	20 %	111114867
51	NC_008277	TGCAA	2	10	45463	45472	40 %	20 %	20 %	20 %	111114868
52	NC_008277	AAATT	2	10	45491	45500	60 %	40 %	0 %	0 %	111114868
53	NC_008277	AAGTA	2	10	46296	46305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008277	ACTAA	2	10	46884	46893	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008277	TAAAT	2	10	51090	51099	60 %	40 %	0 %	0 %	111114877
56	NC_008277	ATAAA	2	10	56409	56418	80 %	20 %	0 %	0 %	111114881
57	NC_008277	TAAAT	2	10	56544	56553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008277	TATTT	2	10	56554	56563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008277	CCCCT	2	10	56837	56846	0 %	20 %	0 %	80 %	111114882
60	NC_008277	TTAAA	2	10	59132	59141	60 %	40 %	0 %	0 %	111114885
61	NC_008277	ATTTT	2	10	59306	59315	20 %	80 %	0 %	0 %	111114885
62	NC_008277	TTTGT	2	10	60211	60220	0 %	80 %	20 %	0 %	111114886
63	NC_008277	TTATT	2	10	60295	60304	20 %	80 %	0 %	0 %	111114888
64	NC_008277	CATTA	2	10	63068	63077	40 %	40 %	0 %	20 %	111114890
65	NC_008277	AGAGA	2	10	63399	63408	60 %	0 %	40 %	0 %	111114890
66	NC_008277	AAAGG	2	10	63513	63522	60 %	0 %	40 %	0 %	111114890
67	NC_008277	TCTTG	2	10	65053	65062	0 %	60 %	20 %	20 %	111114892
68	NC_008277	ATTTT	2	10	69442	69451	20 %	80 %	0 %	0 %	111114895
69	NC_008277	TTTAT	2	10	69800	69809	20 %	80 %	0 %	0 %	111114895
70	NC_008277	TAAAA	2	10	74775	74784	80 %	20 %	0 %	0 %	111114900
71	NC_008277	TCAAA	2	10	76615	76624	60 %	20 %	0 %	20 %	111114902
72	NC_008277	AATAA	2	10	76690	76699	80 %	20 %	0 %	0 %	111114902
73	NC_008277	TAAAC	2	10	78464	78473	60 %	20 %	0 %	20 %	111114903
74	NC_008277	ATTTT	2	10	80165	80174	20 %	80 %	0 %	0 %	111114905
75	NC_008277	TTTCA	2	10	80565	80574	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008277	AAAAT	2	10	80693	80702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008277	AGTAA	2	10	80748	80757	60 %	20 %	20 %	0 %	111114906
78	NC_008277	ATTTA	2	10	80861	80870	40 %	60 %	0 %	0 %	111114906
79	NC_008277	TGATT	2	10	82498	82507	20 %	60 %	20 %	0 %	111114907
80	NC_008277	AATAA	2	10	84415	84424	80 %	20 %	0 %	0 %	111114910
81	NC_008277	TCTTT	2	10	84824	84833	0 %	80 %	0 %	20 %	111114910
82	NC_008277	CTTTT	2	10	88083	88092	0 %	80 %	0 %	20 %	111114913
83	NC_008277	ATCTC	2	10	88286	88295	20 %	40 %	0 %	40 %	111114913
84	NC_008277	AATTT	2	10	89529	89538	40 %	60 %	0 %	0 %	111114914
85	NC_008277	CCCAA	2	10	89637	89646	40 %	0 %	0 %	60 %	111114915
86	NC_008277	TCCCA	2	10	90328	90337	20 %	20 %	0 %	60 %	111114915
87	NC_008277	GTCCT	2	10	90471	90480	0 %	40 %	20 %	40 %	111114915
88	NC_008277	TTATC	2	10	94068	94077	20 %	60 %	0 %	20 %	111114919
89	NC_008277	TTAAA	2	10	94342	94351	60 %	40 %	0 %	0 %	111114920
90	NC_008277	TAATA	2	10	94503	94512	60 %	40 %	0 %	0 %	111114920
91	NC_008277	TTCAA	2	10	96235	96244	40 %	40 %	0 %	20 %	111114920
92	NC_008277	ATTTA	2	10	98112	98121	40 %	60 %	0 %	0 %	111114922
93	NC_008277	TACTT	2	10	98295	98304	20 %	60 %	0 %	20 %	111114922
94	NC_008277	ACCTC	2	10	100719	100728	20 %	20 %	0 %	60 %	111114925
95	NC_008277	ATCAA	2	10	103306	103315	60 %	20 %	0 %	20 %	111114927
96	NC_008277	TTAGT	2	10	103427	103436	20 %	60 %	20 %	0 %	111114927
97	NC_008277	GCATT	2	10	104505	104514	20 %	40 %	20 %	20 %	111114928
98	NC_008277	TTTTA	2	10	105549	105558	20 %	80 %	0 %	0 %	111114930
99	NC_008277	CATAA	2	10	106559	106568	60 %	20 %	0 %	20 %	111114930
100	NC_008277	TGAAT	2	10	107402	107411	40 %	40 %	20 %	0 %	111114931
101	NC_008277	AATCT	2	10	107447	107456	40 %	40 %	0 %	20 %	111114931
102	NC_008277	TACAA	2	10	107873	107882	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008277	CTATA	2	10	109720	109729	40 %	40 %	0 %	20 %	111114933
104	NC_008277	GCACT	2	10	113067	113076	20 %	20 %	20 %	40 %	111114938
105	NC_008277	AATAA	2	10	113923	113932	80 %	20 %	0 %	0 %	111114938
106	NC_008277	ATTTA	2	10	114371	114380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008277	CAATA	2	10	115393	115402	60 %	20 %	0 %	20 %	111114940
108	NC_008277	TTTCC	2	10	115898	115907	0 %	60 %	0 %	40 %	111114940
109	NC_008277	TAATA	2	10	115998	116007	60 %	40 %	0 %	0 %	111114940
110	NC_008277	AAAAG	2	10	116512	116521	80 %	0 %	20 %	0 %	111114941
111	NC_008277	AAAAT	2	10	116720	116729	80 %	20 %	0 %	0 %	111114941
112	NC_008277	AAAAT	2	10	117245	117254	80 %	20 %	0 %	0 %	111114941
113	NC_008277	AAATT	2	10	117755	117764	60 %	40 %	0 %	0 %	111114942
114	NC_008277	TTTAA	2	10	118973	118982	40 %	60 %	0 %	0 %	111114944
115	NC_008277	TATCA	2	10	119853	119862	40 %	40 %	0 %	20 %	111114945
116	NC_008277	ATTTC	2	10	120127	120136	20 %	60 %	0 %	20 %	111114945
117	NC_008277	TCTCT	2	10	122219	122228	0 %	60 %	0 %	40 %	111114950
118	NC_008277	ACCAT	2	10	123220	123229	40 %	20 %	0 %	40 %	111114950
119	NC_008277	ACTCT	2	10	124990	124999	20 %	40 %	0 %	40 %	111114952
120	NC_008277	AAAAT	2	10	125567	125576	80 %	20 %	0 %	0 %	111114953
121	NC_008277	AATAG	2	10	127885	127894	60 %	20 %	20 %	0 %	111114955
122	NC_008277	TTTGC	2	10	128514	128523	0 %	60 %	20 %	20 %	111114955
123	NC_008277	TAAAA	2	10	129261	129270	80 %	20 %	0 %	0 %	111114955
124	NC_008277	ATTAT	2	10	129653	129662	40 %	60 %	0 %	0 %	111114955
125	NC_008277	TTTTA	2	10	129682	129691	20 %	80 %	0 %	0 %	111114955
126	NC_008277	TTATA	2	10	130895	130904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008277	TATTT	2	10	131441	131450	20 %	80 %	0 %	0 %	111114957
128	NC_008277	ATTTT	2	10	132218	132227	20 %	80 %	0 %	0 %	111114958
129	NC_008277	TAAAA	2	10	132919	132928	80 %	20 %	0 %	0 %	111114958
130	NC_008277	AAATC	2	10	133250	133259	60 %	20 %	0 %	20 %	111114958
131	NC_008277	AAAAG	2	10	133920	133929	80 %	0 %	20 %	0 %	111114959
132	NC_008277	AAATT	2	10	134479	134488	60 %	40 %	0 %	0 %	111114959
133	NC_008277	AAGCA	2	10	135439	135448	60 %	0 %	20 %	20 %	111114959
134	NC_008277	AAATA	2	10	136930	136939	80 %	20 %	0 %	0 %	111114960
135	NC_008277	CAAAA	2	10	137884	137893	80 %	0 %	0 %	20 %	111114962
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137	NC_008277	AATCA	2	10	141506	141515	60 %	20 %	0 %	20 %	111114964
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