MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008273	AT	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	111074076
2	NC_008273	TC	3	6	919	924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008273	AT	3	6	1304	1309	50 %	50 %	0 %	0 %	111074077
4	NC_008273	TA	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008273	TA	3	6	1608	1613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008273	AT	3	6	2921	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	111074080
7	NC_008273	AT	3	6	3330	3335	50 %	50 %	0 %	0 %	111074081
8	NC_008273	AT	4	8	3606	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	111074081
9	NC_008273	AT	3	6	4000	4005	50 %	50 %	0 %	0 %	111074082
10	NC_008273	TA	3	6	4372	4377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008273	AT	3	6	4671	4676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008273	TA	3	6	4725	4730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008273	AT	3	6	5072	5077	50 %	50 %	0 %	0 %	111074086
14	NC_008273	AT	3	6	5882	5887	50 %	50 %	0 %	0 %	111074086
15	NC_008273	TA	3	6	8130	8135	50 %	50 %	0 %	0 %	111074090
16	NC_008273	GT	3	6	8534	8539	0 %	50 %	50 %	0 %	111074092
17	NC_008273	AT	4	8	10364	10371	50 %	50 %	0 %	0 %	111074094
18	NC_008273	TA	3	6	10839	10844	50 %	50 %	0 %	0 %	111074095
19	NC_008273	AT	3	6	10855	10860	50 %	50 %	0 %	0 %	111074095
20	NC_008273	AT	3	6	11158	11163	50 %	50 %	0 %	0 %	111074096
21	NC_008273	TC	3	6	11409	11414	0 %	50 %	0 %	50 %	111074097
22	NC_008273	CT	3	6	11486	11491	0 %	50 %	0 %	50 %	111074097
23	NC_008273	AT	3	6	12497	12502	50 %	50 %	0 %	0 %	111074098
24	NC_008273	AG	3	6	13585	13590	50 %	0 %	50 %	0 %	111074100
25	NC_008273	AT	3	6	13807	13812	50 %	50 %	0 %	0 %	111074100
26	NC_008273	TA	3	6	13848	13853	50 %	50 %	0 %	0 %	111074100
27	NC_008273	CG	3	6	13930	13935	0 %	0 %	50 %	50 %	111074100
28	NC_008273	TC	4	8	15254	15261	0 %	50 %	0 %	50 %	111074102
29	NC_008273	AG	3	6	16091	16096	50 %	0 %	50 %	0 %	111074103
30	NC_008273	AT	3	6	16262	16267	50 %	50 %	0 %	0 %	111074103
31	NC_008273	TA	3	6	16340	16345	50 %	50 %	0 %	0 %	111074103
32	NC_008273	TA	3	6	16648	16653	50 %	50 %	0 %	0 %	111074103
33	NC_008273	CA	3	6	16699	16704	50 %	0 %	0 %	50 %	111074103
34	NC_008273	TG	3	6	16729	16734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008273	TC	3	6	16804	16809	0 %	50 %	0 %	50 %	111074104
36	NC_008273	AT	3	6	17051	17056	50 %	50 %	0 %	0 %	111074104
37	NC_008273	GT	4	8	17109	17116	0 %	50 %	50 %	0 %	111074104
38	NC_008273	TC	3	6	17218	17223	0 %	50 %	0 %	50 %	111074104
39	NC_008273	AT	4	8	17709	17716	50 %	50 %	0 %	0 %	111074104
40	NC_008273	AT	3	6	18051	18056	50 %	50 %	0 %	0 %	111074104
41	NC_008273	CA	3	6	18524	18529	50 %	0 %	0 %	50 %	111074105
42	NC_008273	AT	3	6	18788	18793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008273	TC	3	6	21617	21622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008273	TA	3	6	21691	21696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008273	TA	3	6	21852	21857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008273	AC	3	6	23017	23022	50 %	0 %	0 %	50 %	111074111
47	NC_008273	AT	3	6	24138	24143	50 %	50 %	0 %	0 %	111074112
48	NC_008273	TA	3	6	24667	24672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008273	TA	4	8	24677	24684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008273	AT	3	6	24803	24808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008273	AT	5	10	24986	24995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008273	AT	3	6	25391	25396	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
53	NC_008273	AT	3	6	25532	25537	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
54	NC_008273	AT	3	6	25586	25591	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
55	NC_008273	TA	3	6	26052	26057	50 %	50 %	0 %	0 %	111074114
56	NC_008273	TA	3	6	26891	26896	50 %	50 %	0 %	0 %	111074115
57	NC_008273	AT	3	6	27037	27042	50 %	50 %	0 %	0 %	111074115
58	NC_008273	AT	3	6	27766	27771	50 %	50 %	0 %	0 %	111074117
59	NC_008273	TA	3	6	28693	28698	50 %	50 %	0 %	0 %	111074117
60	NC_008273	TA	3	6	29131	29136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.