MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008273	CCT	2	6	20174	20179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_008273	TAT	2	6	20185	20190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008273	TTA	2	6	20234	20239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008273	T	6	6	20287	20292	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
505	NC_008273	TCA	2	6	20315	20320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074108
506	NC_008273	CAT	2	6	20334	20339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074108
507	NC_008273	T	7	7	20347	20353	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
508	NC_008273	ATC	2	6	20359	20364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074108
509	NC_008273	CAT	2	6	20376	20381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074108
510	NC_008273	CATCC	2	10	20430	20439	20 %	20 %	0 %	60 %	111074108
511	NC_008273	T	6	6	20452	20457	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
512	NC_008273	T	7	7	20539	20545	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
513	NC_008273	TCT	2	6	20549	20554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074108
514	NC_008273	T	6	6	20561	20566	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
515	NC_008273	TTC	2	6	20590	20595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074108
516	NC_008273	T	9	9	20598	20606	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
517	NC_008273	TTC	2	6	20698	20703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074108
518	NC_008273	GAA	2	6	20711	20716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074108
519	NC_008273	TCC	2	6	20722	20727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111074108
520	NC_008273	T	6	6	20732	20737	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
521	NC_008273	CTT	2	6	20754	20759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074108
522	NC_008273	T	7	7	20758	20764	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
523	NC_008273	T	6	6	20810	20815	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
524	NC_008273	ACT	2	6	20824	20829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074108
525	NC_008273	A	7	7	20860	20866	100 %	0 %	0 %	0 %	111074108
526	NC_008273	ATA	2	6	20873	20878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074108
527	NC_008273	T	7	7	20889	20895	0 %	100 %	0 %	0 %	111074108
528	NC_008273	ATT	2	6	20903	20908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008273	TTTTA	2	10	20927	20936	20 %	80 %	0 %	0 %	111074109
530	NC_008273	TTC	2	6	20939	20944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074109
531	NC_008273	CAG	2	6	20973	20978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074109
532	NC_008273	TTA	2	6	20996	21001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074109
533	NC_008273	TTA	2	6	21057	21062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074109
534	NC_008273	ATA	2	6	21112	21117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074109
535	NC_008273	TTA	2	6	21164	21169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074109
536	NC_008273	CTT	2	6	21246	21251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074109
537	NC_008273	TTA	2	6	21284	21289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074109
538	NC_008273	ACT	2	6	21343	21348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074109
539	NC_008273	ACC	2	6	21364	21369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074109
540	NC_008273	CTCA	2	8	21391	21398	25 %	25 %	0 %	50 %	111074109
541	NC_008273	ATA	2	6	21449	21454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074109
542	NC_008273	AATGC	2	10	21504	21513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
543	NC_008273	TAA	2	6	21515	21520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008273	T	8	8	21527	21534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008273	TC	3	6	21617	21622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_008273	CAAAT	2	10	21667	21676	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_008273	TA	3	6	21691	21696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008273	TCTT	2	8	21714	21721	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_008273	T	6	6	21817	21822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008273	TA	3	6	21852	21857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008273	TTACTT	2	12	21864	21875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
552	NC_008273	TAA	2	6	21918	21923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074110
553	NC_008273	AAT	2	6	21943	21948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074110
554	NC_008273	AAAAT	2	10	21998	22007	80 %	20 %	0 %	0 %	111074110
555	NC_008273	A	6	6	22011	22016	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
556	NC_008273	A	6	6	22023	22028	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
557	NC_008273	A	6	6	22042	22047	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
558	NC_008273	AAT	2	6	22098	22103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074110
559	NC_008273	CTGG	2	8	22145	22152	0 %	25 %	50 %	25 %	111074110
560	NC_008273	TTA	2	6	22251	22256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074110
561	NC_008273	A	7	7	22279	22285	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
562	NC_008273	GAA	2	6	22366	22371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074110
563	NC_008273	A	7	7	22370	22376	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
564	NC_008273	TCT	2	6	22473	22478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074110
565	NC_008273	AAAT	2	8	22500	22507	75 %	25 %	0 %	0 %	111074110
566	NC_008273	ATTT	3	12	22526	22537	25 %	75 %	0 %	0 %	111074110
567	NC_008273	ATA	2	6	22613	22618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074110
568	NC_008273	TCT	2	6	22630	22635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074110
569	NC_008273	CAAA	2	8	22637	22644	75 %	0 %	0 %	25 %	111074110
570	NC_008273	CTAT	2	8	22691	22698	25 %	50 %	0 %	25 %	111074111
571	NC_008273	ATA	2	6	22765	22770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074111
572	NC_008273	TTTC	2	8	22771	22778	0 %	75 %	0 %	25 %	111074111
573	NC_008273	TAA	2	6	22927	22932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074111
574	NC_008273	AC	3	6	23017	23022	50 %	0 %	0 %	50 %	111074111
575	NC_008273	A	6	6	23043	23048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008273	TTGTT	2	10	23088	23097	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008273	TAA	2	6	23107	23112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008273	T	6	6	23116	23121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008273	T	7	7	23142	23148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008273	T	6	6	23151	23156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008273	TAC	2	6	23227	23232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
582	NC_008273	ATCT	2	8	23254	23261	25 %	50 %	0 %	25 %	111074112
583	NC_008273	AATTTT	2	12	23357	23368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074112
584	NC_008273	T	7	7	23395	23401	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
585	NC_008273	TTTA	2	8	23417	23424	25 %	75 %	0 %	0 %	111074112
586	NC_008273	GCA	2	6	23472	23477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074112
587	NC_008273	TCA	2	6	23478	23483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
588	NC_008273	AACTC	2	10	23544	23553	40 %	20 %	0 %	40 %	111074112
589	NC_008273	TAC	2	6	23576	23581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
590	NC_008273	CAA	2	6	23590	23595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074112
591	NC_008273	TAA	2	6	23599	23604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074112
592	NC_008273	CAT	2	6	23608	23613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
593	NC_008273	ATT	2	6	23621	23626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074112
594	NC_008273	TAA	2	6	23633	23638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074112
595	NC_008273	CTT	2	6	23683	23688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074112
596	NC_008273	CAT	2	6	23731	23736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
597	NC_008273	A	6	6	23844	23849	100 %	0 %	0 %	0 %	111074112
598	NC_008273	TACT	2	8	23850	23857	25 %	50 %	0 %	25 %	111074112
599	NC_008273	ACT	2	6	23897	23902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
600	NC_008273	ACT	2	6	23918	23923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
601	NC_008273	TAA	2	6	23959	23964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074112
602	NC_008273	CCAT	2	8	23966	23973	25 %	25 %	0 %	50 %	111074112
603	NC_008273	TTG	2	6	23977	23982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074112
604	NC_008273	CTA	2	6	23986	23991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
605	NC_008273	AAT	2	6	24019	24024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074112
606	NC_008273	ATTT	2	8	24049	24056	25 %	75 %	0 %	0 %	111074112
607	NC_008273	ACA	2	6	24066	24071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074112
608	NC_008273	AT	3	6	24138	24143	50 %	50 %	0 %	0 %	111074112
609	NC_008273	CCA	2	6	24219	24224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074112
610	NC_008273	T	6	6	24338	24343	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
611	NC_008273	T	6	6	24364	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
612	NC_008273	TTG	2	6	24419	24424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074112
613	NC_008273	ATT	2	6	24452	24457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074112
614	NC_008273	T	6	6	24456	24461	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
615	NC_008273	T	7	7	24474	24480	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
616	NC_008273	TAAA	3	12	24516	24527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008273	T	6	6	24551	24556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008273	A	10	10	24571	24580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008273	AAT	2	6	24644	24649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008273	T	9	9	24656	24664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008273	TA	3	6	24667	24672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008273	TA	4	8	24677	24684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008273	T	6	6	24699	24704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008273	TTAT	2	8	24711	24718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008273	A	7	7	24730	24736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008273	CCA	2	6	24779	24784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_008273	TTTAT	2	10	24795	24804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008273	AT	3	6	24803	24808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008273	TAT	2	6	24838	24843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008273	A	6	6	24876	24881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008273	A	7	7	24888	24894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008273	CTA	2	6	24915	24920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_008273	CACT	2	8	24937	24944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_008273	AT	5	10	24986	24995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008273	T	8	8	25022	25029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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774	NC_008273	ATCA	2	8	29684	29691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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778	NC_008273	ATTA	2	8	29726	29733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
779	NC_008273	A	7	7	29741	29747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
780	NC_008273	TAA	2	6	29748	29753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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