MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia AU 1054 chromosome 3

Total Repeats: 34781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008062	TGCCGA	2	12	16716	16727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	107028247
502	NC_008062	TGG	2	6	16740	16745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	107028247
503	NC_008062	CGG	2	6	16794	16799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028247
504	NC_008062	CGC	2	6	16800	16805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028247
505	NC_008062	GAT	2	6	16852	16857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107028247
506	NC_008062	CGA	2	6	16915	16920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028247
507	NC_008062	GCG	2	6	16952	16957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028247
508	NC_008062	CG	3	6	16963	16968	0 %	0 %	50 %	50 %	107028247
509	NC_008062	GC	4	8	17050	17057	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
510	NC_008062	GCC	2	6	17074	17079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
511	NC_008062	CGC	2	6	17100	17105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
512	NC_008062	CGG	2	6	17129	17134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
513	NC_008062	GC	3	6	17142	17147	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
514	NC_008062	GGC	3	9	17148	17156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
515	NC_008062	GC	3	6	17163	17168	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
516	NC_008062	CGC	2	6	17175	17180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
517	NC_008062	GCG	2	6	17203	17208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
518	NC_008062	CCGGCG	2	12	17216	17227	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
519	NC_008062	CGG	2	6	17232	17237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
520	NC_008062	CGGC	2	8	17240	17247	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
521	NC_008062	GGC	2	6	17251	17256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
522	NC_008062	GCG	2	6	17273	17278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
523	NC_008062	CGGC	2	8	17297	17304	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
524	NC_008062	GC	3	6	17399	17404	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
525	NC_008062	CGC	2	6	17417	17422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
526	NC_008062	TTCG	2	8	17460	17467	0 %	50 %	25 %	25 %	107028248
527	NC_008062	GTCG	2	8	17481	17488	0 %	25 %	50 %	25 %	107028248
528	NC_008062	GCG	2	6	17528	17533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
529	NC_008062	CTG	2	6	17562	17567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028248
530	NC_008062	ACG	2	6	17570	17575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028248
531	NC_008062	TGC	2	6	17576	17581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028248
532	NC_008062	GC	3	6	17588	17593	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
533	NC_008062	CCG	2	6	17662	17667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
534	NC_008062	CGT	2	6	17700	17705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028248
535	NC_008062	CG	3	6	17709	17714	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
536	NC_008062	CGT	2	6	17718	17723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028248
537	NC_008062	GCC	2	6	17745	17750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
538	NC_008062	CGA	2	6	17892	17897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028248
539	NC_008062	TGC	2	6	17906	17911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028248
540	NC_008062	CGGGAT	2	12	17919	17930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	107028248
541	NC_008062	GCC	2	6	17940	17945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
542	NC_008062	TTG	2	6	18052	18057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	107028248
543	NC_008062	TTG	2	6	18064	18069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	107028248
544	NC_008062	GC	3	6	18113	18118	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
545	NC_008062	CGAAC	2	10	18126	18135	40 %	0 %	20 %	40 %	107028248
546	NC_008062	CTG	2	6	18216	18221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028248
547	NC_008062	GACGT	2	10	18226	18235	20 %	20 %	40 %	20 %	107028248
548	NC_008062	CGC	3	9	18251	18259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
549	NC_008062	GCC	2	6	18267	18272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
550	NC_008062	CTG	2	6	18321	18326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028248
551	NC_008062	GCCG	2	8	18369	18376	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
552	NC_008062	GCC	2	6	18435	18440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
553	NC_008062	CCTGC	2	10	18486	18495	0 %	20 %	20 %	60 %	107028248
554	NC_008062	GCG	2	6	18545	18550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
555	NC_008062	TCG	2	6	18557	18562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028248
556	NC_008062	CAG	2	6	18621	18626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028248
557	NC_008062	CCG	2	6	18701	18706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
558	NC_008062	CGG	2	6	18710	18715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
559	NC_008062	GCG	2	6	18718	18723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028248
560	NC_008062	CGGC	2	8	18776	18783	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
561	NC_008062	GC	3	6	18782	18787	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
562	NC_008062	GCC	2	6	18792	18797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
563	NC_008062	CCG	2	6	18809	18814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028248
564	NC_008062	GC	3	6	18836	18841	0 %	0 %	50 %	50 %	107028248
565	NC_008062	CAT	2	6	18879	18884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107028248
566	NC_008062	GA	3	6	18963	18968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008062	GCC	2	6	18999	19004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_008062	CGG	2	6	19014	19019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008062	TTG	2	6	19025	19030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008062	GCGAC	2	10	19126	19135	20 %	0 %	40 %	40 %	107028249
571	NC_008062	AGC	2	6	19200	19205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028249
572	NC_008062	CGC	2	6	19219	19224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028249
573	NC_008062	GGT	2	6	19226	19231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	107028249
574	NC_008062	TCT	2	6	19237	19242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107028249
575	NC_008062	GCA	2	6	19258	19263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028249
576	NC_008062	TGCG	2	8	19285	19292	0 %	25 %	50 %	25 %	107028249
577	NC_008062	ACC	2	6	19344	19349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107028249
578	NC_008062	GTC	2	6	19361	19366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028249
579	NC_008062	CTG	2	6	19376	19381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028249
580	NC_008062	CTG	2	6	19448	19453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028249
581	NC_008062	CGT	2	6	19519	19524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028249
582	NC_008062	CG	3	6	19541	19546	0 %	0 %	50 %	50 %	107028249
583	NC_008062	GCCC	2	8	19573	19580	0 %	0 %	25 %	75 %	107028249
584	NC_008062	CGC	2	6	19621	19626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028249
585	NC_008062	GC	3	6	19625	19630	0 %	0 %	50 %	50 %	107028249
586	NC_008062	ACG	2	6	19644	19649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028249
587	NC_008062	GCCG	2	8	19697	19704	0 %	0 %	50 %	50 %	107028249
588	NC_008062	GGT	2	6	19760	19765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	107028249
589	NC_008062	GACG	2	8	19775	19782	25 %	0 %	50 %	25 %	107028249
590	NC_008062	CCAG	2	8	19807	19814	25 %	0 %	25 %	50 %	107028249
591	NC_008062	CGA	2	6	19855	19860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028249
592	NC_008062	CAT	2	6	19865	19870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107028249
593	NC_008062	CTC	2	6	19899	19904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_008062	GAAA	2	8	19915	19922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008062	TGA	2	6	19935	19940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107028250
596	NC_008062	GCG	2	6	19965	19970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028250
597	NC_008062	GCGCC	2	10	19992	20001	0 %	0 %	40 %	60 %	107028250
598	NC_008062	CGT	2	6	20019	20024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028250
599	NC_008062	CGT	2	6	20031	20036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028250
600	NC_008062	CGC	2	6	20055	20060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028250
601	NC_008062	CG	3	6	20066	20071	0 %	0 %	50 %	50 %	107028250
602	NC_008062	CGG	2	6	20073	20078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028250
603	NC_008062	GCA	2	6	20088	20093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028250
604	NC_008062	CCG	2	6	20097	20102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028250
605	NC_008062	GCA	2	6	20148	20153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028250
606	NC_008062	TCGC	2	8	20168	20175	0 %	25 %	25 %	50 %	107028250
607	NC_008062	CGT	2	6	20205	20210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028250
608	NC_008062	CG	3	6	20215	20220	0 %	0 %	50 %	50 %	107028250
609	NC_008062	GTC	2	6	20224	20229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028250
610	NC_008062	GGC	2	6	20265	20270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028250
611	NC_008062	CGT	2	6	20280	20285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028250
612	NC_008062	CGC	2	6	20382	20387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028250
613	NC_008062	CG	3	6	20421	20426	0 %	0 %	50 %	50 %	107028250
614	NC_008062	GGC	2	6	20439	20444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028250
615	NC_008062	TCG	2	6	20450	20455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028250
616	NC_008062	ACG	2	6	20456	20461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028250
617	NC_008062	GCG	2	6	20487	20492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028250
618	NC_008062	GCCG	2	8	20506	20513	0 %	0 %	50 %	50 %	107028250
619	NC_008062	TCG	2	6	20537	20542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028250
620	NC_008062	CGC	2	6	20553	20558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028250
621	NC_008062	GCC	2	6	20586	20591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028250
622	NC_008062	GCG	2	6	20593	20598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028250
623	NC_008062	CGAC	2	8	20601	20608	25 %	0 %	25 %	50 %	107028250
624	NC_008062	GCC	2	6	20611	20616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028250
625	NC_008062	CGACGT	2	12	20628	20639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	107028250
626	NC_008062	GCCG	2	8	20671	20678	0 %	0 %	50 %	50 %	107028250
627	NC_008062	GC	3	6	20718	20723	0 %	0 %	50 %	50 %	107028250
628	NC_008062	GCCG	2	8	20755	20762	0 %	0 %	50 %	50 %	107028250
629	NC_008062	CAG	2	6	20773	20778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028250
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650	NC_008062	ACG	2	6	21379	21384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028251
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654	NC_008062	CCGC	2	8	21539	21546	0 %	0 %	25 %	75 %	107028251
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757	NC_008062	TTCG	2	8	25046	25053	0 %	50 %	25 %	25 %	107028257
758	NC_008062	CGC	2	6	25110	25115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028257
759	NC_008062	GCC	2	6	25158	25163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028257
760	NC_008062	CTG	2	6	25179	25184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028257
761	NC_008062	CGC	2	6	25283	25288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028257
762	NC_008062	GCACGG	2	12	25289	25300	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	107028257
763	NC_008062	CGG	2	6	25345	25350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107028257
764	NC_008062	CGA	2	6	25354	25359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028257
765	NC_008062	CCG	2	6	25395	25400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028257
766	NC_008062	TGC	3	9	25405	25413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028257
767	NC_008062	TGC	2	6	25417	25422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028257
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769	NC_008062	CGCTGG	2	12	25444	25455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	107028257
770	NC_008062	GC	3	6	25534	25539	0 %	0 %	50 %	50 %	107028257
771	NC_008062	TCG	2	6	25570	25575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028257
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774	NC_008062	GCT	2	6	25709	25714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028257
775	NC_008062	GC	4	8	25730	25737	0 %	0 %	50 %	50 %	107028257
776	NC_008062	CGA	2	6	25753	25758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028257
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779	NC_008062	CGA	2	6	25900	25905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028257
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781	NC_008062	CG	4	8	25928	25935	0 %	0 %	50 %	50 %	107028257
782	NC_008062	ACT	2	6	25943	25948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107028257
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789	NC_008062	CG	3	6	26122	26127	0 %	0 %	50 %	50 %	107028257
790	NC_008062	TGC	2	6	26158	26163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028257
791	NC_008062	TCGC	2	8	26241	26248	0 %	25 %	25 %	50 %	107028257
792	NC_008062	GCT	2	6	26249	26254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028257
793	NC_008062	ACG	2	6	26276	26281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107028257
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795	NC_008062	CAC	2	6	26352	26357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107028257
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798	NC_008062	GAC	2	6	26415	26420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
799	NC_008062	ATC	2	6	26433	26438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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845	NC_008062	CAT	2	6	27902	27907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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851	NC_008062	A	6	6	28225	28230	100 %	0 %	0 %	0 %	107028260
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862	NC_008062	CGC	2	6	28713	28718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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864	NC_008062	GGA	2	6	28730	28735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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870	NC_008062	CGC	2	6	29054	29059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107028261
871	NC_008062	CTG	2	6	29085	29090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028261
872	NC_008062	CGT	2	6	29095	29100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107028261
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877	NC_008062	CCG	2	6	29294	29299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1000	NC_008062	CCT	2	6	33367	33372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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