MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia AU 1054 chromosome 1

Total Repeats: 96719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008060	GTC	2	6	49564	49569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1502	NC_008060	GAC	2	6	49585	49590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1503	NC_008060	CGCTGC	2	12	49595	49606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	107021613
1504	NC_008060	CGC	2	6	49628	49633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021613
1505	NC_008060	CG	3	6	49639	49644	0 %	0 %	50 %	50 %	107021613
1506	NC_008060	CTG	2	6	49651	49656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1507	NC_008060	ACG	2	6	49658	49663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1508	NC_008060	CGA	2	6	49680	49685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1509	NC_008060	ACG	2	6	49693	49698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1510	NC_008060	CGC	2	6	49731	49736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021613
1511	NC_008060	CGCA	2	8	49744	49751	25 %	0 %	25 %	50 %	107021613
1512	NC_008060	CG	3	6	49761	49766	0 %	0 %	50 %	50 %	107021613
1513	NC_008060	AGC	2	6	49787	49792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1514	NC_008060	GCG	2	6	49835	49840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021613
1515	NC_008060	GC	3	6	49845	49850	0 %	0 %	50 %	50 %	107021613
1516	NC_008060	CGG	3	9	49893	49901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021613
1517	NC_008060	CGG	2	6	49910	49915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021613
1518	NC_008060	TCA	2	6	50015	50020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021613
1519	NC_008060	TCA	2	6	50036	50041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021613
1520	NC_008060	GAC	2	6	50067	50072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1521	NC_008060	CGA	2	6	50085	50090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1522	NC_008060	TCG	2	6	50099	50104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021613
1523	NC_008060	CG	3	6	50156	50161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_008060	CT	3	6	50209	50214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_008060	CAT	2	6	50281	50286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021614
1526	NC_008060	CAG	2	6	50290	50295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021614
1527	NC_008060	AGC	2	6	50303	50308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021614
1528	NC_008060	GCC	3	9	50330	50338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021614
1529	NC_008060	GCC	2	6	50350	50355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021614
1530	NC_008060	AGC	2	6	50366	50371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021614
1531	NC_008060	CGCGAT	2	12	50473	50484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	107021614
1532	NC_008060	CGG	2	6	50571	50576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021614
1533	NC_008060	TTCG	2	8	50682	50689	0 %	50 %	25 %	25 %	107021614
1534	NC_008060	GGC	2	6	50695	50700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021614
1535	NC_008060	GCG	2	6	50717	50722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021614
1536	NC_008060	TCG	2	6	50726	50731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021614
1537	NC_008060	GCG	2	6	50747	50752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021614
1538	NC_008060	CG	3	6	50787	50792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_008060	CG	3	6	50796	50801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_008060	GTT	2	6	50804	50809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008060	TG	3	6	50889	50894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008060	CGGAT	2	10	50896	50905	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1543	NC_008060	CGATG	2	10	50915	50924	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1544	NC_008060	GTT	2	6	50973	50978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008060	GAAAA	2	10	50987	50996	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008060	TGC	2	6	51063	51068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_008060	CCA	2	6	51124	51129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_008060	GGT	2	6	51136	51141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008060	AAG	2	6	51168	51173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008060	AG	3	6	51185	51190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008060	G	6	6	51196	51201	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008060	T	6	6	51224	51229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008060	CGAT	2	8	51254	51261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_008060	CGA	2	6	51422	51427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_008060	GTT	2	6	51431	51436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_008060	TGC	2	6	51440	51445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_008060	TTCGC	2	10	51483	51492	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1558	NC_008060	TA	4	8	51560	51567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008060	ATGT	2	8	51697	51704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008060	CGA	2	6	51735	51740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_008060	TCGATA	2	12	51796	51807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	107021615
1562	NC_008060	GCA	2	6	51824	51829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021615
1563	NC_008060	GCGA	2	8	51904	51911	25 %	0 %	50 %	25 %	107021615
1564	NC_008060	CCG	2	6	51970	51975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021615
1565	NC_008060	AGG	2	6	52009	52014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	107021615
1566	NC_008060	CGAT	2	8	52048	52055	25 %	25 %	25 %	25 %	107021616
1567	NC_008060	GTC	2	6	52108	52113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021616
1568	NC_008060	GCC	2	6	52132	52137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021616
1569	NC_008060	CAA	2	6	52165	52170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	107021616
1570	NC_008060	GAC	2	6	52198	52203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021616
1571	NC_008060	TGT	2	6	52247	52252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	107021616
1572	NC_008060	TCG	2	6	52286	52291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021616
1573	NC_008060	CG	3	6	52427	52432	0 %	0 %	50 %	50 %	107021617
1574	NC_008060	GTC	2	6	52488	52493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021617
1575	NC_008060	TCG	2	6	52517	52522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021617
1576	NC_008060	TCGAT	2	10	52529	52538	20 %	40 %	20 %	20 %	107021617
1577	NC_008060	CGAT	2	8	52571	52578	25 %	25 %	25 %	25 %	107021617
1578	NC_008060	T	6	6	52620	52625	0 %	100 %	0 %	0 %	107021617
1579	NC_008060	GCG	2	6	52698	52703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_008060	GCC	2	6	52739	52744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_008060	CG	3	6	52788	52793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_008060	GCT	2	6	52901	52906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021618
1583	NC_008060	GCG	2	6	52935	52940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021618
1584	NC_008060	GAT	3	9	53013	53021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107021618
1585	NC_008060	GTC	2	6	53022	53027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021618
1586	NC_008060	GCG	2	6	53172	53177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021619
1587	NC_008060	GT	3	6	53178	53183	0 %	50 %	50 %	0 %	107021619
1588	NC_008060	TCG	2	6	53253	53258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021619
1589	NC_008060	CGAA	2	8	53308	53315	50 %	0 %	25 %	25 %	107021619
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1591	NC_008060	GCA	2	6	53515	53520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_008060	AGTC	2	8	53625	53632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_008060	GTG	2	6	53651	53656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008060	GCCG	2	8	53674	53681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_008060	GGC	2	6	53703	53708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_008060	ACC	2	6	53717	53722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_008060	GC	4	8	53729	53736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_008060	CTG	2	6	53754	53759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021620
1599	NC_008060	CGGC	2	8	53798	53805	0 %	0 %	50 %	50 %	107021620
1600	NC_008060	ACC	2	6	53809	53814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107021620
1601	NC_008060	CAG	2	6	53850	53855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021620
1602	NC_008060	GCA	2	6	53882	53887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021620
1603	NC_008060	CCG	2	6	53903	53908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021620
1604	NC_008060	CGTC	2	8	53928	53935	0 %	25 %	25 %	50 %	107021620
1605	NC_008060	GCA	2	6	53962	53967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021620
1606	NC_008060	CGT	2	6	53982	53987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021620
1607	NC_008060	GCC	2	6	53993	53998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021620
1608	NC_008060	ACCG	2	8	54000	54007	25 %	0 %	25 %	50 %	107021620
1609	NC_008060	CGC	2	6	54018	54023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021620
1610	NC_008060	ACC	2	6	54127	54132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107021620
1611	NC_008060	ATC	2	6	54133	54138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021620
1612	NC_008060	GCG	3	9	54176	54184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021620
1613	NC_008060	CG	3	6	54194	54199	0 %	0 %	50 %	50 %	107021620
1614	NC_008060	CCG	2	6	54208	54213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021620
1615	NC_008060	ACGA	2	8	54238	54245	50 %	0 %	25 %	25 %	107021620
1616	NC_008060	GCC	2	6	54247	54252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021620
1617	NC_008060	CG	4	8	54268	54275	0 %	0 %	50 %	50 %	107021620
1618	NC_008060	CGGC	2	8	54323	54330	0 %	0 %	50 %	50 %	107021620
1619	NC_008060	CTG	2	6	54372	54377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021620
1620	NC_008060	CG	3	6	54396	54401	0 %	0 %	50 %	50 %	107021620
1621	NC_008060	GC	4	8	54436	54443	0 %	0 %	50 %	50 %	107021620
1622	NC_008060	TCG	3	9	54445	54453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021620
1623	NC_008060	GTTC	2	8	54485	54492	0 %	50 %	25 %	25 %	107021620
1624	NC_008060	TCA	2	6	54511	54516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021621
1625	NC_008060	AAGG	2	8	54522	54529	50 %	0 %	50 %	0 %	107021621
1626	NC_008060	GC	4	8	54569	54576	0 %	0 %	50 %	50 %	107021621
1627	NC_008060	CGA	2	6	54655	54660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021621
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1629	NC_008060	GCCG	2	8	54691	54698	0 %	0 %	50 %	50 %	107021621
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1763	NC_008060	CGG	2	6	61179	61184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1764	NC_008060	TCC	2	6	61272	61277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1765	NC_008060	TGA	2	6	61305	61310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1766	NC_008060	ACC	2	6	61450	61455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1767	NC_008060	GTTT	2	8	61459	61466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1768	NC_008060	TCC	2	6	61536	61541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1769	NC_008060	GGA	2	6	61553	61558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1770	NC_008060	GGT	2	6	61673	61678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1771	NC_008060	CGG	2	6	61760	61765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1772	NC_008060	CTCAT	2	10	61787	61796	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1773	NC_008060	CGT	2	6	61868	61873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1774	NC_008060	GCT	2	6	61922	61927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1775	NC_008060	GT	3	6	62121	62126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1776	NC_008060	GT	3	6	62256	62261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1777	NC_008060	AC	3	6	62265	62270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1778	NC_008060	CTT	2	6	62284	62289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1779	NC_008060	GCAAC	2	10	62312	62321	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1780	NC_008060	TGA	2	6	62335	62340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1781	NC_008060	GAT	2	6	62402	62407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1782	NC_008060	CCCG	2	8	62463	62470	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1783	NC_008060	GCG	2	6	62496	62501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1785	NC_008060	TCAA	2	8	62632	62639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1786	NC_008060	TCT	2	6	62649	62654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1885	NC_008060	ACGC	2	8	66717	66724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1886	NC_008060	T	6	6	66763	66768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1887	NC_008060	GCG	2	6	66817	66822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021626
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1996	NC_008060	GC	3	6	71207	71212	0 %	0 %	50 %	50 %	107021631
1997	NC_008060	AGC	2	6	71234	71239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021631
1998	NC_008060	CGCA	2	8	71281	71288	25 %	0 %	25 %	50 %	107021631
1999	NC_008060	CGG	2	6	71303	71308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021631
2000	NC_008060	CGGC	2	8	71354	71361	0 %	0 %	50 %	50 %	107021631

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