MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007984	ATGTAC	2	12	3200	3211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676501
2	NC_007984	TCTATG	2	12	4267	4278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94676501
3	NC_007984	ATAATT	2	12	5823	5834	50 %	50 %	0 %	0 %	94676501
4	NC_007984	GTTTAT	2	12	6190	6201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94676768
5	NC_007984	AAACGT	2	12	6294	6305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676768
6	NC_007984	AACTAC	2	12	7237	7248	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94676948
7	NC_007984	TTATAT	2	12	10602	10613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007984	TTTAAT	2	12	10768	10779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007984	ATCAAA	2	12	16038	16049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	94676730
10	NC_007984	TACTTT	2	12	20363	20374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94677044
11	NC_007984	TTATAT	2	12	21963	21974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007984	AGCATT	2	12	23435	23446	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676804
13	NC_007984	AATCGG	2	12	31277	31288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94677001
14	NC_007984	ATTAAT	2	12	36757	36768	50 %	50 %	0 %	0 %	94676573
15	NC_007984	GTAATG	2	12	43462	43473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676546
16	NC_007984	GCTGAT	2	12	45944	45955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94676505
17	NC_007984	ATTGGT	2	12	46469	46480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	94676505
18	NC_007984	AAGCAG	2	12	47237	47248	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	94676764
19	NC_007984	TAGTGC	2	12	54294	54305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94676797
20	NC_007984	AACATA	2	12	55992	56003	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	94676692
21	NC_007984	AATTTA	2	12	59835	59846	50 %	50 %	0 %	0 %	94676949
22	NC_007984	TTTTAT	2	12	61027	61038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	94676519
23	NC_007984	GGTGGG	2	12	61217	61228	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	94676519
24	NC_007984	AGTGAT	2	12	63711	63722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676873
25	NC_007984	AAAAAC	2	12	64387	64398	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	94676873
26	NC_007984	TACCAT	2	12	65560	65571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94676796
27	NC_007984	TCGTAT	2	12	72768	72779	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94676875
28	NC_007984	ATGGTA	2	12	74406	74417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676567
29	NC_007984	TAATCT	2	12	77581	77592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676849
30	NC_007984	CTTTTA	2	12	78966	78977	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94676849
31	NC_007984	TAAACC	2	12	79852	79863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94676814
32	NC_007984	GCAGTA	2	12	81258	81269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94676983
33	NC_007984	AGAAAA	2	12	81699	81710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007984	TAACGA	2	12	86932	86943	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676684
35	NC_007984	TGCTAA	2	12	91696	91707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676584
36	NC_007984	ATTAAT	2	12	92971	92982	50 %	50 %	0 %	0 %	94676654
37	NC_007984	TCTGGT	2	12	94689	94700	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94676763
38	NC_007984	TTTAAT	2	12	100855	100866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94676713
39	NC_007984	AACGTC	2	12	105303	105314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94677048
40	NC_007984	TATACC	2	12	106216	106227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94676823
41	NC_007984	TAATAT	2	12	110598	110609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007984	TTAAGG	2	12	110751	110762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676590
43	NC_007984	TAACCA	2	12	115101	115112	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94676630
44	NC_007984	AGAATT	2	12	116089	116100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94676630
45	NC_007984	ATCTAT	2	12	116938	116949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94677010
46	NC_007984	TATTTT	2	12	118839	118850	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007984	CTATTA	2	12	119113	119124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007984	TTAATT	2	12	120255	120266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007984	AAGTAA	2	12	121177	121188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007984	GGTTAT	2	12	125662	125673	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	94676499
51	NC_007984	GATAAA	2	12	127226	127237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94676906
52	NC_007984	GAATAA	2	12	130053	130064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94676805
53	NC_007984	CAGCTT	2	12	130250	130261	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94676805
54	NC_007984	ATGAAA	2	12	134725	134736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94676564
55	NC_007984	ACAAAA	2	12	135227	135238	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	94676564
56	NC_007984	TGGTAA	2	12	135976	135987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676646
57	NC_007984	CAAGTA	2	12	138667	138678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676850
58	NC_007984	AGCAGG	2	12	139750	139761	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	94677005
59	NC_007984	AGAACA	2	12	141424	141435	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	94677005
60	NC_007984	ATATTT	2	12	142970	142981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94676988
61	NC_007984	ATCGTA	2	12	143090	143101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676975
62	NC_007984	CATCCT	2	12	144908	144919	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	94676498
63	NC_007984	CATCAG	2	12	145058	145069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94676498
64	NC_007984	TTACGA	2	12	145243	145254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676498
65	NC_007984	CGAGCA	2	12	145414	145425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94676498
66	NC_007984	TTTCTA	2	12	147672	147683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94676682
67	NC_007984	TAAACA	2	12	149715	149726	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	94676570
68	NC_007984	ATATAA	2	12	149997	150008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94676570
69	NC_007984	ATTACT	2	12	152583	152594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676723
70	NC_007984	TCTCCA	2	12	153588	153599	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	94676723
71	NC_007984	GTATCA	2	12	153777	153788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676723
72	NC_007984	TTAACA	2	12	155596	155607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676666
73	NC_007984	AATAGG	2	12	157796	157807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94676940
74	NC_007984	TGCTGT	2	12	159279	159290	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94676613
75	NC_007984	TAATTA	2	12	162177	162188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007984	TTTATT	2	12	164331	164342	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	94676520
77	NC_007984	AATTAC	2	12	166988	166999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676928
78	NC_007984	ATACTA	2	12	170670	170681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007984	ATCTAG	2	12	179757	179768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676929
80	NC_007984	CTGCTC	2	12	181634	181645	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	94676853
81	NC_007984	TGAGAT	2	12	182136	182147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007984	TACAGA	2	12	187909	187920	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676508
83	NC_007984	TAGTTT	2	12	188239	188250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94676732
84	NC_007984	AATAGC	2	12	191033	191044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676888
85	NC_007984	TAGTAT	2	12	191424	191435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676981
86	NC_007984	GCTATA	2	12	191825	191836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676981
87	NC_007984	TAATCA	2	12	193667	193678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676920
88	NC_007984	ATCTAA	2	12	194768	194779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676759
89	NC_007984	CTCTTG	2	12	196866	196877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	94676665
90	NC_007984	AATTAA	2	12	203284	203295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007984	TTTAGC	2	12	205071	205082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94676731
92	NC_007984	TGATTA	2	12	208857	208868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676876
93	NC_007984	TTAATT	2	12	210338	210349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94676597
94	NC_007984	CCTGCA	2	12	211006	211017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	94676755
95	NC_007984	CTTTAT	2	12	222828	222839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94676984
96	NC_007984	GTTACA	2	12	224478	224489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676894
97	NC_007984	TTTATT	2	12	225328	225339	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007984	TTCCTG	2	12	232817	232828	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	94676694
99	NC_007984	CGATGA	2	12	237224	237235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94676521
100	NC_007984	GAATTT	2	12	238791	238802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007984	TTCTGT	2	12	243115	243126	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007984	TATTGG	2	12	245658	245669	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	94676748
103	NC_007984	TCTAAA	2	12	248794	248805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676685
104	NC_007984	TTTAGT	2	12	249925	249936	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94676956
105	NC_007984	CATTAT	2	12	254214	254225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676472
106	NC_007984	TTTCAT	2	12	256684	256695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	162139369
107	NC_007984	TTAATA	2	12	258632	258643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007984	TAATTC	2	12	260672	260683	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676670
109	NC_007984	CTACTG	2	12	260905	260916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94676670
110	NC_007984	ACAGAA	2	12	262430	262441	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	94676886
111	NC_007984	ATTAGG	2	12	263324	263335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676886
112	NC_007984	TGATAA	2	12	266647	266658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94676509
113	NC_007984	TATTGA	2	12	269084	269095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676952
114	NC_007984	GTATTA	2	12	269443	269454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676952
115	NC_007984	ACTAGC	2	12	269646	269657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94676777
116	NC_007984	GTTAAT	2	12	271294	271305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676844
117	NC_007984	GAGCGT	2	12	271603	271614	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	94676844
118	NC_007984	ATATTC	2	12	279082	279093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676556
119	NC_007984	AGCTAT	2	12	279487	279498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676789
120	NC_007984	CAGCTA	2	12	280290	280301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94676789
121	NC_007984	ATCTTT	2	12	282544	282555	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94676626
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232	NC_007984	AATTAA	2	12	524294	524305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_007984	AAGATA	2	12	524398	524409	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94676591
234	NC_007984	ACTTCA	2	12	525546	525557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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238	NC_007984	TATATT	2	12	530336	530347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_007984	TACTAA	2	12	533703	533714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_007984	CCAGTA	2	12	534599	534610	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94676625
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.