MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia pseudomallei 1710b chromosome I

Total Repeats: 13107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007434	CAAA	2	8	1545	1552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007434	TCAA	2	8	1846	1853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007434	CTTT	2	8	2626	2633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007434	TGTC	2	8	2767	2774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007434	GTTT	2	8	2921	2928	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007434	ATGC	2	8	3189	3196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007434	TCGC	2	8	3460	3467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007434	GTCT	2	8	3721	3728	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007434	GGTA	2	8	4865	4872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007434	TTTC	2	8	5400	5407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007434	CTCA	2	8	5885	5892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007434	ACTT	2	8	5928	5935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007434	CGGG	2	8	6737	6744	0 %	0 %	75 %	25 %	76811136
14	NC_007434	CCGC	2	8	7340	7347	0 %	0 %	25 %	75 %	76811136
15	NC_007434	GGCG	2	8	7730	7737	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007434	CGGC	2	8	7895	7902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007434	CCGT	2	8	8223	8230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007434	ACCG	2	8	8288	8295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007434	GGTT	2	8	8299	8306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007434	CGAT	2	8	8386	8393	25 %	25 %	25 %	25 %	76810093
21	NC_007434	CAGG	2	8	8415	8422	25 %	0 %	50 %	25 %	76810093
22	NC_007434	CTAT	2	8	8636	8643	25 %	50 %	0 %	25 %	76810093
23	NC_007434	GGCT	2	8	8769	8776	0 %	25 %	50 %	25 %	76810093
24	NC_007434	GCCA	2	8	9695	9702	25 %	0 %	25 %	50 %	76811396
25	NC_007434	ACGC	2	8	9870	9877	25 %	0 %	25 %	50 %	76811396
26	NC_007434	GACG	2	8	10271	10278	25 %	0 %	50 %	25 %	76811396
27	NC_007434	TCGA	2	8	10326	10333	25 %	25 %	25 %	25 %	76811396
28	NC_007434	GTAC	2	8	10403	10410	25 %	25 %	25 %	25 %	76811396
29	NC_007434	ACCG	2	8	10573	10580	25 %	0 %	25 %	50 %	76810812
30	NC_007434	GCTC	2	8	10876	10883	0 %	25 %	25 %	50 %	76810812
31	NC_007434	GCCG	2	8	11795	11802	0 %	0 %	50 %	50 %	76809324
32	NC_007434	GGCG	2	8	11930	11937	0 %	0 %	75 %	25 %	76809324
33	NC_007434	CGCC	2	8	11938	11945	0 %	0 %	25 %	75 %	76809324
34	NC_007434	CGCC	2	8	11965	11972	0 %	0 %	25 %	75 %	76809324
35	NC_007434	GTCG	2	8	12480	12487	0 %	25 %	50 %	25 %	76808748
36	NC_007434	CGCT	2	8	13134	13141	0 %	25 %	25 %	50 %	76808748
37	NC_007434	ACCC	2	8	13203	13210	25 %	0 %	0 %	75 %	76808748
38	NC_007434	GTCG	2	8	14100	14107	0 %	25 %	50 %	25 %	76810005
39	NC_007434	GCCG	2	8	14777	14784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007434	CGGC	2	8	14807	14814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007434	GTAT	2	8	14824	14831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007434	CGAG	2	8	14875	14882	25 %	0 %	50 %	25 %	76809132
43	NC_007434	AGAA	2	8	15308	15315	75 %	0 %	25 %	0 %	76809132
44	NC_007434	CCTG	2	8	15363	15370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007434	CGCC	2	8	15623	15630	0 %	0 %	25 %	75 %	76811849
46	NC_007434	TTCG	2	8	15698	15705	0 %	50 %	25 %	25 %	76811849
47	NC_007434	CGGC	2	8	15991	15998	0 %	0 %	50 %	50 %	76811849
48	NC_007434	CGGC	2	8	16204	16211	0 %	0 %	50 %	50 %	76811849
49	NC_007434	ATCG	2	8	16550	16557	25 %	25 %	25 %	25 %	76811849
50	NC_007434	CGAG	2	8	16799	16806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007434	GCCG	2	8	16897	16904	0 %	0 %	50 %	50 %	76809859
52	NC_007434	CCGT	2	8	17051	17058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007434	CGAA	2	8	17256	17263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007434	CCGA	2	8	17281	17288	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007434	CGGC	2	8	17787	17794	0 %	0 %	50 %	50 %	76808786
56	NC_007434	GACG	2	8	18001	18008	25 %	0 %	50 %	25 %	76808786
57	NC_007434	CGCA	2	8	18047	18054	25 %	0 %	25 %	50 %	76808786
58	NC_007434	TGGA	2	8	18821	18828	25 %	25 %	50 %	0 %	76808786
59	NC_007434	ACTT	2	8	18935	18942	25 %	50 %	0 %	25 %	76808786
60	NC_007434	GTCG	2	8	19384	19391	0 %	25 %	50 %	25 %	76808786
61	NC_007434	CGTG	2	8	19458	19465	0 %	25 %	50 %	25 %	76808786
62	NC_007434	CGAT	2	8	19578	19585	25 %	25 %	25 %	25 %	76808786
63	NC_007434	CGCC	2	8	19755	19762	0 %	0 %	25 %	75 %	76808786
64	NC_007434	ACCG	2	8	19900	19907	25 %	0 %	25 %	50 %	76808786
65	NC_007434	GGCT	2	8	20081	20088	0 %	25 %	50 %	25 %	76808786
66	NC_007434	GGGC	2	8	20908	20915	0 %	0 %	75 %	25 %	76808786
67	NC_007434	ATCG	3	12	21126	21137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007434	GCAA	2	8	21316	21323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007434	CGCC	2	8	21465	21472	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_007434	CGGC	2	8	21566	21573	0 %	0 %	50 %	50 %	76808552
71	NC_007434	ACGT	2	8	21979	21986	25 %	25 %	25 %	25 %	76808552
72	NC_007434	CGGC	2	8	22350	22357	0 %	0 %	50 %	50 %	76808552
73	NC_007434	CGGG	2	8	22551	22558	0 %	0 %	75 %	25 %	76808552
74	NC_007434	CACG	2	8	22737	22744	25 %	0 %	25 %	50 %	76808552
75	NC_007434	CGGA	2	8	24091	24098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007434	CGCC	2	8	24111	24118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_007434	GGCG	2	8	24536	24543	0 %	0 %	75 %	25 %	162210031
78	NC_007434	GCCG	2	8	24938	24945	0 %	0 %	50 %	50 %	162210031
79	NC_007434	CCGC	2	8	25043	25050	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_007434	GGCC	2	8	25114	25121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007434	CTCG	2	8	25341	25348	0 %	25 %	25 %	50 %	76811198
82	NC_007434	ATCG	2	8	25845	25852	25 %	25 %	25 %	25 %	76811198
83	NC_007434	CGCT	2	8	26091	26098	0 %	25 %	25 %	50 %	76809600
84	NC_007434	GGGC	2	8	26462	26469	0 %	0 %	75 %	25 %	76809600
85	NC_007434	CCGC	2	8	26818	26825	0 %	0 %	25 %	75 %	76809600
86	NC_007434	TGCC	2	8	27170	27177	0 %	25 %	25 %	50 %	76809969
87	NC_007434	GCGG	2	8	27482	27489	0 %	0 %	75 %	25 %	76809969
88	NC_007434	AAAT	2	8	28079	28086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007434	TTTG	2	8	28441	28448	0 %	75 %	25 %	0 %	76809135
90	NC_007434	CCGC	2	8	28757	28764	0 %	0 %	25 %	75 %	76809135
91	NC_007434	GCCG	2	8	29877	29884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007434	CCGG	2	8	30292	30299	0 %	0 %	50 %	50 %	76810854
93	NC_007434	CAGC	2	8	30469	30476	25 %	0 %	25 %	50 %	76810854
94	NC_007434	TCGC	2	8	30986	30993	0 %	25 %	25 %	50 %	76810854
95	NC_007434	CGGG	2	8	31095	31102	0 %	0 %	75 %	25 %	76810854
96	NC_007434	GACC	2	8	31451	31458	25 %	0 %	25 %	50 %	76811687
97	NC_007434	GGCG	2	8	31478	31485	0 %	0 %	75 %	25 %	76811687
98	NC_007434	CCGC	2	8	32032	32039	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_007434	GTTT	2	8	32145	32152	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007434	GCCG	2	8	32769	32776	0 %	0 %	50 %	50 %	76809113
101	NC_007434	CGCC	2	8	32876	32883	0 %	0 %	25 %	75 %	76809113
102	NC_007434	AAAC	2	8	33146	33153	75 %	0 %	0 %	25 %	76809113
103	NC_007434	TCGT	2	8	33217	33224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007434	GCCG	2	8	33278	33285	0 %	0 %	50 %	50 %	76810021
105	NC_007434	CGGC	2	8	33768	33775	0 %	0 %	50 %	50 %	76810021
106	NC_007434	CGCT	2	8	33890	33897	0 %	25 %	25 %	50 %	76810021
107	NC_007434	CGGC	2	8	34291	34298	0 %	0 %	50 %	50 %	76810021
108	NC_007434	GCGG	2	8	34329	34336	0 %	0 %	75 %	25 %	76810021
109	NC_007434	CTCG	2	8	34375	34382	0 %	25 %	25 %	50 %	76810021
110	NC_007434	GGGC	2	8	34413	34420	0 %	0 %	75 %	25 %	76810021
111	NC_007434	AGAT	2	8	35013	35020	50 %	25 %	25 %	0 %	76811302
112	NC_007434	CGCC	2	8	35499	35506	0 %	0 %	25 %	75 %	76810559
113	NC_007434	ATGG	2	8	35905	35912	25 %	25 %	50 %	0 %	76810559
114	NC_007434	CACG	2	8	36822	36829	25 %	0 %	25 %	50 %	76810559
115	NC_007434	GCCG	2	8	36970	36977	0 %	0 %	50 %	50 %	76810559
116	NC_007434	AAAC	2	8	37182	37189	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007434	ACGC	2	8	37236	37243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007434	TCGT	2	8	37281	37288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007434	ATAG	2	8	37717	37724	50 %	25 %	25 %	0 %	76808984
120	NC_007434	CCGG	2	8	37895	37902	0 %	0 %	50 %	50 %	76808984
121	NC_007434	ACGA	2	8	38059	38066	50 %	0 %	25 %	25 %	76808984
122	NC_007434	TTCA	2	8	38319	38326	25 %	50 %	0 %	25 %	76808984
123	NC_007434	CGAT	2	8	39020	39027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007434	TTGC	2	8	39232	39239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007434	GCTG	2	8	39600	39607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007434	CTGC	2	8	39636	39643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007434	CTGC	2	8	39917	39924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007434	CACG	2	8	40104	40111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007434	CGGC	2	8	40517	40524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007434	CCGA	2	8	40639	40646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007434	CATG	2	8	40659	40666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007434	CGCC	2	8	40726	40733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_007434	GGCC	2	8	42296	42303	0 %	0 %	50 %	50 %	76811254
134	NC_007434	GAGC	2	8	42490	42497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007434	GGCC	2	8	43809	43816	0 %	0 %	50 %	50 %	76809830
136	NC_007434	GTCT	2	8	43850	43857	0 %	50 %	25 %	25 %	76809830
137	NC_007434	AATC	2	8	43892	43899	50 %	25 %	0 %	25 %	76810400
138	NC_007434	CCGC	2	8	43974	43981	0 %	0 %	25 %	75 %	76810400
139	NC_007434	GCGA	2	8	44015	44022	25 %	0 %	50 %	25 %	76810400
140	NC_007434	GCCG	2	8	44639	44646	0 %	0 %	50 %	50 %	76811551
141	NC_007434	CCTC	2	8	44954	44961	0 %	25 %	0 %	75 %	76811551
142	NC_007434	AACG	2	8	45292	45299	50 %	0 %	25 %	25 %	76809308
143	NC_007434	GATC	2	8	45318	45325	25 %	25 %	25 %	25 %	76809308
144	NC_007434	GGGC	2	8	45491	45498	0 %	0 %	75 %	25 %	76809308
145	NC_007434	GCTG	2	8	45714	45721	0 %	25 %	50 %	25 %	76809308
146	NC_007434	CCGC	2	8	46202	46209	0 %	0 %	25 %	75 %	76810357
147	NC_007434	ATCG	2	8	46424	46431	25 %	25 %	25 %	25 %	76810357
148	NC_007434	CGCC	2	8	46519	46526	0 %	0 %	25 %	75 %	76810357
149	NC_007434	CGGA	2	8	46740	46747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007434	CATG	2	8	46748	46755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007434	GCGG	2	8	46772	46779	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_007434	CCGG	2	8	46993	47000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007434	GATT	2	8	47191	47198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007434	CACG	2	8	47455	47462	25 %	0 %	25 %	50 %	76810998
155	NC_007434	AGCG	2	8	47573	47580	25 %	0 %	50 %	25 %	76810998
156	NC_007434	CACG	2	8	48435	48442	25 %	0 %	25 %	50 %	76811959
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159	NC_007434	CGGG	2	8	50146	50153	0 %	0 %	75 %	25 %	76809238
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161	NC_007434	TGGC	2	8	50732	50739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_007434	TAAC	2	8	51096	51103	50 %	25 %	0 %	25 %	76810880
163	NC_007434	TTGA	2	8	51346	51353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_007434	GCCG	2	8	51808	51815	0 %	0 %	50 %	50 %	76809682
165	NC_007434	CGCC	2	8	51870	51877	0 %	0 %	25 %	75 %	76809682
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167	NC_007434	GGCC	2	8	52224	52231	0 %	0 %	50 %	50 %	76809682
168	NC_007434	GACC	2	8	52248	52255	25 %	0 %	25 %	50 %	76809682
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172	NC_007434	GTCG	2	8	53544	53551	0 %	25 %	50 %	25 %	76811966
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174	NC_007434	CGCC	2	8	54121	54128	0 %	0 %	25 %	75 %	76811569
175	NC_007434	GTCG	2	8	54146	54153	0 %	25 %	50 %	25 %	76811569
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195	NC_007434	GCCG	2	8	59294	59301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
196	NC_007434	CGCC	2	8	59655	59662	0 %	0 %	25 %	75 %	76811025
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198	NC_007434	CCGG	2	8	60362	60369	0 %	0 %	50 %	50 %	76808931
199	NC_007434	CCGG	2	8	60533	60540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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232	NC_007434	CGCC	2	8	70869	70876	0 %	0 %	25 %	75 %	76810205
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271	NC_007434	CGGC	3	12	84140	84151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
272	NC_007434	GTCG	2	8	84526	84533	0 %	25 %	50 %	25 %	76810308
273	NC_007434	ACCA	2	8	84732	84739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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275	NC_007434	CGGC	2	8	85354	85361	0 %	0 %	50 %	50 %	76809263
276	NC_007434	GCCG	2	8	86220	86227	0 %	0 %	50 %	50 %	76808646
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279	NC_007434	CGAT	2	8	87349	87356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
280	NC_007434	CTCG	2	8	87881	87888	0 %	25 %	25 %	50 %	76810515
281	NC_007434	CGAC	2	8	87949	87956	25 %	0 %	25 %	50 %	76810515
282	NC_007434	CGGC	2	8	87967	87974	0 %	0 %	50 %	50 %	76810515
283	NC_007434	GCCC	2	8	88223	88230	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
284	NC_007434	GCCG	2	8	88278	88285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
285	NC_007434	CGGC	2	8	88369	88376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
286	NC_007434	TCAT	2	8	88548	88555	25 %	50 %	0 %	25 %	76809761
287	NC_007434	CGAT	2	8	88854	88861	25 %	25 %	25 %	25 %	76809761
288	NC_007434	CAGC	2	8	88862	88869	25 %	0 %	25 %	50 %	76809761
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425	NC_007434	GGCC	2	8	131939	131946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
426	NC_007434	GACC	2	8	132524	132531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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