MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus E33L plasmid pE33L466

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007103	AGTGCT	2	12	494	505	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007103	AATTAA	2	12	2459	2470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007103	CTGAAA	2	12	2614	2625	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67077893
4	NC_007103	AAAGTC	2	12	5980	5991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67077894
5	NC_007103	AAAGCA	2	12	6524	6535	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	67077895
6	NC_007103	CAGGAG	2	12	6846	6857	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007103	GAAAAA	2	12	9908	9919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67077899
8	NC_007103	TTCATT	2	12	10415	10426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007103	CTAATT	2	12	12037	12048	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007103	AAAGGG	2	12	12087	12098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007103	TGAAAA	2	12	14614	14625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007103	AATTGC	2	12	15310	15321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67077905
13	NC_007103	ATAAAG	2	12	18898	18909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67077907
14	NC_007103	TAATTT	2	12	29781	29792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67077921
15	NC_007103	TGGAGC	2	12	30745	30756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007103	ACCGAT	2	12	41882	41893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007103	AAAAAT	2	12	42900	42911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	67077930
18	NC_007103	ATTATA	2	12	45217	45228	50 %	50 %	0 %	0 %	67077932
19	NC_007103	GTATAA	2	12	47575	47586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67077935
20	NC_007103	ATGATT	2	12	50825	50836	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007103	CTTTTT	2	12	51600	51611	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67077937
22	NC_007103	TTGTTT	2	12	51757	51768	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	67077937
23	NC_007103	TTTTCA	2	12	52373	52384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	67077937
24	NC_007103	ATACAT	2	12	57467	57478	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67077942
25	NC_007103	CAGGTG	2	12	58252	58263	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	67077943
26	NC_007103	TTCATA	2	12	58327	58338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67077943
27	NC_007103	GTTGAA	2	12	61850	61861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67077945
28	NC_007103	CAAGAA	2	12	67383	67394	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	67077949
29	NC_007103	TCCATT	2	12	68075	68086	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	67077950
30	NC_007103	TATGAA	2	12	79648	79659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67077959
31	NC_007103	CACCTG	2	12	79723	79734	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	67077959
32	NC_007103	ATCTAA	2	12	85072	85083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007103	ACTCAT	2	12	85449	85460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67077964
34	NC_007103	CAAGCA	2	12	94949	94960	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	67077974
35	NC_007103	CTGAAA	2	12	98858	98869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67077976
36	NC_007103	ATTTTG	2	12	100602	100613	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67077979
37	NC_007103	CCCTTC	2	12	100936	100947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67077979
38	NC_007103	AAAATT	2	12	101656	101667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67077979
39	NC_007103	TTTAAT	2	12	104296	104307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67077981
40	NC_007103	TACTAT	2	12	107593	107604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67077983
41	NC_007103	TCCATA	2	12	107723	107734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67077983
42	NC_007103	TATGAA	2	12	115329	115340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67077991
43	NC_007103	CACCTG	2	12	115404	115415	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	67077991
44	NC_007103	TTACAT	2	12	117148	117159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67077993
45	NC_007103	TTCATA	2	12	118686	118697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007103	TATGAA	2	12	120978	120989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67077995
47	NC_007103	ATTTTT	2	12	122823	122834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007103	CAAATT	2	12	125818	125829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007103	GTTTTT	9	54	127622	127675	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007103	TTTTTG	3	18	127677	127694	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007103	TTTTTG	2	12	127701	127712	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007103	TTTTTG	7	42	127719	127760	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007103	CCTCTA	2	12	130570	130581	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	67078005
54	NC_007103	GAAATT	2	12	133037	133048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007103	TCTCCT	2	12	142040	142051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007103	TCCTCT	2	12	151643	151654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007103	TTCATC	2	12	152775	152786	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	67078021
58	NC_007103	TATCAT	2	12	154545	154556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007103	AATTTG	2	12	158606	158617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078025
60	NC_007103	TTCATA	2	12	164631	164642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67078034
61	NC_007103	TTTATC	2	12	165320	165331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007103	ACAAAA	2	12	166256	166267	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	67078035
63	NC_007103	ATTTTC	2	12	167605	167616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007103	AAAATT	2	12	168206	168217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078038
65	NC_007103	TAAAGA	2	12	175021	175032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007103	ATAAAT	2	12	176511	176522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078047
67	NC_007103	AGTTTT	2	12	178703	178714	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67078049
68	NC_007103	CTTTTT	2	12	179105	179116	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007103	CAACAG	2	12	180514	180525	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	67078051
70	NC_007103	TAGATT	2	12	186440	186451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078059
71	NC_007103	TGCTTG	2	12	187391	187402	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	67078059
72	NC_007103	CTTTCT	2	12	188413	188424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007103	ATTTAA	2	12	191973	191984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007103	CAAGGA	2	12	199223	199234	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007103	ATTTGA	2	12	200212	200223	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078075
76	NC_007103	TTAGAT	2	12	200745	200756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078076
77	NC_007103	AAAGTA	2	12	204403	204414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007103	AATATT	2	12	204643	204654	50 %	50 %	0 %	0 %	67078082
79	NC_007103	TTCATT	2	12	207168	207179	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007103	TAAAAA	2	12	207314	207325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007103	GTTACT	2	12	208102	208113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67078086
82	NC_007103	GTTACT	2	12	208345	208356	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67078086
83	NC_007103	GTTACT	2	12	208588	208599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67078086
84	NC_007103	CGCTTC	2	12	210548	210559	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	67078087
85	NC_007103	ATTTAC	2	12	210833	210844	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67078087
86	NC_007103	TTATAT	2	12	212773	212784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007103	CATATC	2	12	213218	213229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078090
88	NC_007103	TGACAT	2	12	214970	214981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007103	TGTACC	2	12	219198	219209	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	67078093
90	NC_007103	ATGTCA	2	12	220679	220690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67078095
91	NC_007103	TTCATT	2	12	220767	220778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	67078095
92	NC_007103	TTTTAT	2	12	221885	221896	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67078096
93	NC_007103	ATGAAG	2	12	222344	222355	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	67078096
94	NC_007103	GATTTT	2	12	224975	224986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67078097
95	NC_007103	TTTTCT	2	12	228043	228054	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67078100
96	NC_007103	TGAAAA	2	12	231098	231109	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078102
97	NC_007103	TATTTC	2	12	231194	231205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	67078102
98	NC_007103	GAAATT	2	12	232348	232359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67078102
99	NC_007103	AAGATA	2	12	234520	234531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078103
100	NC_007103	ATAAAA	2	12	238241	238252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	67078107
101	NC_007103	GGTACT	2	12	244772	244783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	67078112
102	NC_007103	GAAAAA	2	12	247465	247476	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67078118
103	NC_007103	CAGTTT	2	12	257810	257821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67078129
104	NC_007103	CAATTA	2	12	257853	257864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67078129
105	NC_007103	TTCAAT	2	12	258111	258122	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67078130
106	NC_007103	TTTTTC	2	12	262146	262157	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67078134
107	NC_007103	ATCCAA	2	12	267145	267156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007103	GAATAA	2	12	267651	267662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078138
109	NC_007103	TGATAT	2	12	268602	268613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078139
110	NC_007103	TGAACG	2	12	269658	269669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007103	TTGTCT	2	12	270655	270666	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007103	TATCAA	2	12	272191	272202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67078142
113	NC_007103	ATTTTT	2	12	274031	274042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007103	GAAGCA	2	12	277138	277149	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	67078148
115	NC_007103	ATTCAA	2	12	277208	277219	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67078148
116	NC_007103	GAGTTA	2	12	280321	280332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078151
117	NC_007103	CGCTAT	2	12	284286	284297	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	67078156
118	NC_007103	AATTAG	2	12	285205	285216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67078157
119	NC_007103	AAAAGT	2	12	285292	285303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078157
120	NC_007103	AGATTT	2	12	288307	288318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007103	TTTTAT	2	12	289856	289867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007103	GATTTA	2	12	290471	290482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078162
123	NC_007103	GAACCA	2	12	296550	296561	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	67078166
124	NC_007103	TTAAAT	2	12	297472	297483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007103	ATTGGG	2	12	302208	302219	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	67078170
126	NC_007103	ACTGTA	2	12	304801	304812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67078172
127	NC_007103	TTGTTC	2	12	308970	308981	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	67078177
128	NC_007103	TTATAT	2	12	310312	310323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007103	ATTTTC	2	12	313748	313759	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_007103	CGCACC	2	12	316167	316178	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	67078185
131	NC_007103	AGGAAA	2	12	319966	319977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078187
132	NC_007103	TGAAAA	2	12	320317	320328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078187
133	NC_007103	TTTTTG	2	12	323600	323611	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	67078188
134	NC_007103	TGAAAA	2	12	324223	324234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078188
135	NC_007103	ATGTCT	2	12	324782	324793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67078188
136	NC_007103	TAGATG	2	12	326127	326138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67078188
137	NC_007103	AAATTC	2	12	327350	327361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67078190
138	NC_007103	TAGAAA	2	12	327946	327957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078191
139	NC_007103	GTTCTA	2	12	328817	328828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	67078192
140	NC_007103	TAGATT	2	12	332735	332746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078197
141	NC_007103	TGCTTG	2	12	333686	333697	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	67078197
142	NC_007103	CATATT	2	12	334173	334184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67078198
143	NC_007103	TTTATA	2	12	334996	335007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007103	TGAAAA	2	12	336227	336238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007103	CAAAAG	2	12	336943	336954	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	67078200
146	NC_007103	AGAAAA	2	12	344043	344054	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67078208
147	NC_007103	AAGGAA	2	12	346293	346304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67078210
148	NC_007103	TTATAT	2	12	350054	350065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67078213
149	NC_007103	GTATGT	2	12	350662	350673	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	67078213
150	NC_007103	CATTCT	2	12	352545	352556	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007103	TAAAAA	2	12	356634	356645	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007103	GTTTTA	2	12	357099	357110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	67078218
153	NC_007103	ACTTTA	2	12	357185	357196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67078218
154	NC_007103	CTTTTT	2	12	358744	358755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67078220
155	NC_007103	TTCAAC	2	12	359279	359290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67078220
156	NC_007103	TATGGT	2	12	364617	364628	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	67078224
157	NC_007103	GAAGCA	2	12	368260	368271	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	67078229
158	NC_007103	AAGGAC	2	12	375099	375110	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	67078234
159	NC_007103	ATTAAA	2	12	375468	375479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007103	TATTTA	2	12	379115	379126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_007103	TTATAA	2	12	379134	379145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007103	GGATTG	2	12	383003	383014	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	67078240
163	NC_007103	GCATAT	2	12	383269	383280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	67078240
164	NC_007103	ATAATG	2	12	383401	383412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67078240
165	NC_007103	CAGGAG	2	12	388990	389001	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	67078242
166	NC_007103	AAATCC	2	12	397064	397075	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	67078248
167	NC_007103	TTTATT	2	12	398110	398121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	67078250
168	NC_007103	TTGATA	2	12	398124	398135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078250
169	NC_007103	TTCTTT	2	12	405332	405343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_007103	TAGATT	2	12	407547	407558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67078260
171	NC_007103	TGCTTG	2	12	408498	408509	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	67078260
172	NC_007103	CAAAAG	2	12	410072	410083	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_007103	TATGAA	2	12	415680	415691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67078268
174	NC_007103	AATACG	2	12	415816	415827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	67078268
175	NC_007103	AGAAAA	2	12	418838	418849	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67078271
176	NC_007103	AAAGAA	2	12	419604	419615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67078271
177	NC_007103	AAAATT	2	12	429527	429538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078279
178	NC_007103	AGGGAA	2	12	429604	429615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_007103	TTTTCT	2	12	429973	429984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	67078280
180	NC_007103	AAAACA	2	12	430729	430740	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	67078281
181	NC_007103	TACATA	2	12	433521	433532	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67078285
182	NC_007103	CAGGTG	2	12	434164	434175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	67078286
183	NC_007103	TTCATA	2	12	434239	434250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	67078286
184	NC_007103	AATACG	2	12	436485	436496	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
185	NC_007103	AATATA	2	12	437126	437137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67078287
186	NC_007103	AGAAAA	2	12	437270	437281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	67078287
187	NC_007103	TAAAAA	2	12	445568	445579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	67078296
188	NC_007103	TTTTAT	2	12	446856	446867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_007103	CAAGCA	2	12	447281	447292	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	67078299
190	NC_007103	AAATCT	2	12	448231	448242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67078299
191	NC_007103	TATGAA	2	12	452535	452546	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	67078304
192	NC_007103	CACCTG	2	12	452610	452621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	67078304
193	NC_007103	AATTTT	2	12	455756	455767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_007103	AAGATA	2	12	458855	458866	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	67078311
195	NC_007103	AGCAAA	2	12	463505	463516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	67078317
196	NC_007103	AGCAAA	2	12	463787	463798	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	67078317
197	NC_007103	ATGCAA	2	12	464790	464801	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.