MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacteroides fragilis NCTC 9343 plasmid pBF9343

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006873	AGAAA	2	10	370	379	80 %	0 %	20 %	0 %	60650142
2	NC_006873	TGCTT	2	10	832	841	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_006873	AGGCA	2	10	871	880	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_006873	ACGAA	2	10	1383	1392	60 %	0 %	20 %	20 %	60650143
5	NC_006873	AAAAG	2	10	2832	2841	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006873	ACAGT	2	10	4418	4427	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006873	AGGAA	2	10	7484	7493	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006873	AGAAA	2	10	8495	8504	80 %	0 %	20 %	0 %	60650154
9	NC_006873	AAAAG	2	10	8698	8707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006873	TTCAA	2	10	9601	9610	40 %	40 %	0 %	20 %	60650155
11	NC_006873	TGATA	2	10	10216	10225	40 %	40 %	20 %	0 %	60650155
12	NC_006873	AAAAG	2	10	10542	10551	80 %	0 %	20 %	0 %	60650155
13	NC_006873	AATAA	2	10	11200	11209	80 %	20 %	0 %	0 %	60650156
14	NC_006873	TTTAT	2	10	11993	12002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006873	AATGT	2	10	12379	12388	40 %	40 %	20 %	0 %	60650158
16	NC_006873	CTAGT	2	10	12996	13005	20 %	40 %	20 %	20 %	60650159
17	NC_006873	AAAGA	2	10	14026	14035	80 %	0 %	20 %	0 %	60650159
18	NC_006873	ATGGC	2	10	15241	15250	20 %	20 %	40 %	20 %	60650160
19	NC_006873	TAATA	2	10	18155	18164	60 %	40 %	0 %	0 %	60650166
20	NC_006873	CCTTT	2	10	19212	19221	0 %	60 %	0 %	40 %	60650167
21	NC_006873	GGTTT	2	10	20423	20432	0 %	60 %	40 %	0 %	60650168
22	NC_006873	ATTTT	2	10	20475	20484	20 %	80 %	0 %	0 %	60650168
23	NC_006873	CTTTT	2	10	20850	20859	0 %	80 %	0 %	20 %	60650168
24	NC_006873	AATCT	2	10	21065	21074	40 %	40 %	0 %	20 %	60650169
25	NC_006873	ATGTA	2	10	21586	21595	40 %	40 %	20 %	0 %	60650169
26	NC_006873	AAAAG	2	10	21774	21783	80 %	0 %	20 %	0 %	60650170
27	NC_006873	CTTCT	2	10	23367	23376	0 %	60 %	0 %	40 %	60650172
28	NC_006873	ATGAA	2	10	23526	23535	60 %	20 %	20 %	0 %	60650173
29	NC_006873	TTTTC	2	10	24308	24317	0 %	80 %	0 %	20 %	60650174
30	NC_006873	TATTG	2	10	24481	24490	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006873	TGCAA	2	10	24628	24637	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006873	ATTGT	2	10	25691	25700	20 %	60 %	20 %	0 %	60650175
33	NC_006873	TTTGT	2	10	26365	26374	0 %	80 %	20 %	0 %	60650176
34	NC_006873	CTTTT	2	10	28723	28732	0 %	80 %	0 %	20 %	60650179
35	NC_006873	TTCTT	2	10	29456	29465	0 %	80 %	0 %	20 %	60650180
36	NC_006873	TCTTT	2	10	29673	29682	0 %	80 %	0 %	20 %	60650180
37	NC_006873	ATTTT	2	10	30301	30310	20 %	80 %	0 %	0 %	60650181
38	NC_006873	TATCT	2	10	30920	30929	20 %	60 %	0 %	20 %	60650182
39	NC_006873	ATGAT	2	10	32929	32938	40 %	40 %	20 %	0 %	60650185
40	NC_006873	TTTTC	2	10	34103	34112	0 %	80 %	0 %	20 %	60650185
41	NC_006873	CAATA	2	10	34236	34245	60 %	20 %	0 %	20 %	60650185
42	NC_006873	TTCGT	2	10	34794	34803	0 %	60 %	20 %	20 %	60650185
43	NC_006873	AAAAG	2	10	35184	35193	80 %	0 %	20 %	0 %	60650185
44	NC_006873	TGTAT	2	10	35350	35359	20 %	60 %	20 %	0 %	60650185
45	NC_006873	CTTTT	2	10	35548	35557	0 %	80 %	0 %	20 %	60650185
46	NC_006873	TGCTT	2	10	36450	36459	0 %	60 %	20 %	20 %	60650188

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.