MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus licheniformis ATCC 14580 chromosome

Total Repeats: 1421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006270	CTTCAT	2	12	15607	15618	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	163119171
2	NC_006270	CGGTGT	2	12	17021	17032	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	52078500
3	NC_006270	ACAGTC	2	12	18673	18684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078501
4	NC_006270	AAGGTG	2	12	31995	32006	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	163119173
5	NC_006270	TTTGTT	2	12	34169	34180	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	52078518
6	NC_006270	ACATCA	2	12	39947	39958	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	163119175
7	NC_006270	TATTGA	2	12	41860	41871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	52078521
8	NC_006270	CGGAAT	2	12	43338	43349	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078522
9	NC_006270	CAAGAC	2	12	44361	44372	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	52078524
10	NC_006270	TTTTTC	2	12	48812	48823	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	163119177
11	NC_006270	GAACAG	2	12	49046	49057	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	163119177
12	NC_006270	CTTGAA	2	12	49981	49992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_006270	AGGAAA	2	12	53507	53518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163119178
14	NC_006270	TAAAGA	2	12	53676	53687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163119178
15	NC_006270	GAGCGG	2	12	58892	58903	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	163119180
16	NC_006270	ATCAGC	2	12	69453	69464	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006270	GCCGGA	2	12	69909	69920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	52078552
18	NC_006270	CGATGA	2	12	70702	70713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078552
19	NC_006270	GATTGT	2	12	74086	74097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	52078557
20	NC_006270	AAGTTA	2	12	74566	74577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	52078558
21	NC_006270	TCGATG	2	12	77493	77504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078559
22	NC_006270	AAAGAT	2	12	86097	86108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163119182
23	NC_006270	TTGATA	2	12	86509	86520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006270	TTGAGC	2	12	89877	89888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078571
25	NC_006270	ACATTC	2	12	97016	97027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006270	TAAAGT	2	12	100374	100385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006270	AGTCAA	2	12	100393	100404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_006270	GTTGCA	2	12	104094	104105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078581
29	NC_006270	GACAAA	2	12	106441	106452	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52078583
30	NC_006270	CAGATG	2	12	109545	109556	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078586
31	NC_006270	CTTGAT	2	12	110990	111001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52078587
32	NC_006270	AGGAAC	2	12	113634	113645	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52078589
33	NC_006270	CGCTTG	2	12	114796	114807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078591
34	NC_006270	GTTTTT	2	12	116459	116470	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006270	CATTTA	2	12	117745	117756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	52078596
36	NC_006270	AGAAGC	2	12	118333	118344	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52078597
37	NC_006270	TTTGAT	2	12	118403	118414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	52078597
38	NC_006270	TCTTGC	2	12	119485	119496	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	161760692
39	NC_006270	CTGTAG	2	12	119696	119707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161760691
40	NC_006270	ATCACA	2	12	129946	129957	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	52078606
41	NC_006270	TGCCGT	2	12	130068	130079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078606
42	NC_006270	ACAAAG	2	12	130373	130384	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52078606
43	NC_006270	AAAGGT	2	12	134165	134176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	52078609
44	NC_006270	GTCGGT	2	12	140783	140794	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161760690
45	NC_006270	CAAAGG	2	12	140986	140997	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	161760690
46	NC_006270	CGGCTG	2	12	141295	141306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163119190
47	NC_006270	GAAATC	2	12	144660	144671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	52078631
48	NC_006270	GAAAAG	2	12	146007	146018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52078634
49	NC_006270	AAACAA	2	12	146048	146059	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	52078634
50	NC_006270	AAAAAG	2	12	147774	147785	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52078637
51	NC_006270	TGCAGA	2	12	148275	148286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078638
52	NC_006270	ATGGAA	2	12	150979	150990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	52078641
53	NC_006270	ACATTC	2	12	159972	159983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006270	TTTTAT	2	12	163509	163520	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006270	CGGCTT	2	12	169317	169328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078658
56	NC_006270	TGCTTC	2	12	170950	170961	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	52078658
57	NC_006270	GGGGCG	2	12	179951	179962	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	163119194
58	NC_006270	TTATAG	2	12	183348	183359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006270	GCGATG	2	12	184192	184203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52078670
60	NC_006270	GAAATG	2	12	184957	184968	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	52078670
61	NC_006270	CAACCC	2	12	186569	186580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52078672
62	NC_006270	GGCGAT	2	12	190674	190685	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52078678
63	NC_006270	AGGATC	2	12	194577	194588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078682
64	NC_006270	TCCGTC	2	12	199825	199836	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	52078686
65	NC_006270	GAATCC	2	12	200041	200052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078686
66	NC_006270	TTGTTT	2	12	201157	201168	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	52078687
67	NC_006270	TTTTAT	2	12	210644	210655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006270	GCAGCG	2	12	221003	221014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163119201
69	NC_006270	GGGATT	2	12	226432	226443	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	52078707
70	NC_006270	GGTTTT	2	12	226632	226643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52078708
71	NC_006270	CTTTTT	2	12	227902	227913	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_006270	AAAACT	2	12	237546	237557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	52078718
73	NC_006270	CAATGC	2	12	237832	237843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078719
74	NC_006270	ATTCGG	2	12	238654	238665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078719
75	NC_006270	TTGGGC	2	12	241616	241627	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	52078722
76	NC_006270	GGAAGA	2	12	242863	242874	50 %	0 %	50 %	0 %	52078723
77	NC_006270	GGCTGC	2	12	246410	246421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52078727
78	NC_006270	GATGCC	2	12	247376	247387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52078728
79	NC_006270	CGGATA	2	12	256908	256919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078735
80	NC_006270	AGAAAG	2	12	262256	262267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52078740
81	NC_006270	TCGGCG	2	12	262512	262523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52078741
82	NC_006270	GCTGGG	2	12	266551	266562	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_006270	AAGCTG	2	12	268980	268991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078747
84	NC_006270	TTTGTC	2	12	270859	270870	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	52078749
85	NC_006270	TTCGGC	2	12	277940	277951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078755
86	NC_006270	AAACGG	2	12	282136	282147	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_006270	TATACA	2	12	293547	293558	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	52078773
88	NC_006270	ACGATG	2	12	295907	295918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52078775
89	NC_006270	CTGCGG	2	12	299437	299448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163119209
90	NC_006270	CGTAAT	2	12	317202	317213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	52078792
91	NC_006270	AAAGAA	2	12	324304	324315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52078799
92	NC_006270	CTTTTT	2	12	328000	328011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	52078803
93	NC_006270	TGAATT	2	12	329002	329013	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	52078803
94	NC_006270	AACAAA	2	12	331940	331951	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	52078807
95	NC_006270	AACGAA	2	12	332597	332608	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	52078808
96	NC_006270	AGAGAA	2	12	338434	338445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006270	GTTTTT	2	12	339535	339546	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	52078814
98	NC_006270	AAATCA	2	12	341892	341903	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	52078816
99	NC_006270	GCGCTG	2	12	344247	344258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52078818
100	NC_006270	CGATTG	2	12	344959	344970	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078818
101	NC_006270	CTTTTG	2	12	347651	347662	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	52078821
102	NC_006270	TATCGA	2	12	348389	348400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	52078822
103	NC_006270	TTGACC	2	12	350546	350557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	52078824
104	NC_006270	GCGGAT	2	12	351561	351572	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52078825
105	NC_006270	TGTTTG	2	12	354215	354226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163119213
106	NC_006270	AGAAAA	2	12	355708	355719	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006270	CCGCAT	2	12	356383	356394	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	52078828
108	NC_006270	CATCGA	2	12	361147	361158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078835
109	NC_006270	CAGATC	2	12	361346	361357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52078835
110	NC_006270	ATTGGG	2	12	364683	364694	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	52078838
111	NC_006270	AAATTT	2	12	366172	366183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006270	AGCCGG	2	12	373593	373604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	52078844
113	NC_006270	CGGCTT	2	12	387078	387089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078849
114	NC_006270	CGGAAA	2	12	389366	389377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52078849
115	NC_006270	GCGCCG	2	12	392771	392782	0 %	0 %	50 %	50 %	52078850
116	NC_006270	GAACAG	2	12	393317	393328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52078850
117	NC_006270	TATTCA	2	12	396166	396177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	52078850
118	NC_006270	CAGCGG	2	12	396702	396713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	52078850
119	NC_006270	CGGCTT	2	12	397846	397857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078850
120	NC_006270	AAAAGC	2	12	411837	411848	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163119221
121	NC_006270	GAAAAA	2	12	415923	415934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52078865
122	NC_006270	CCGGAA	2	12	418036	418047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52078866
123	NC_006270	TCCGGT	2	12	420678	420689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52078869
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129	NC_006270	CCGATT	2	12	453321	453332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	52078898
130	NC_006270	TGAAAA	2	12	457412	457423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	52078901
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137	NC_006270	TGATAA	2	12	466183	466194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006270	ATTCGG	2	12	476991	477002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52078920
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146	NC_006270	TACGGC	2	12	496582	496593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52078934
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216	NC_006270	TCGGCG	2	12	708555	708566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	52079136
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224	NC_006270	ATCTTC	2	12	725153	725164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	52079152
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227	NC_006270	TGAAGC	2	12	736104	736115	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52079163
228	NC_006270	ACGCCG	2	12	736978	736989	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	52079163
229	NC_006270	ATCGAA	2	12	737552	737563	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	163119279
230	NC_006270	CATTGT	2	12	742905	742916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52079170
231	NC_006270	ATGCTG	2	12	744530	744541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52079170
232	NC_006270	AGCGTC	2	12	746053	746064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52079172
233	NC_006270	CATTAC	2	12	750647	750658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52079176
234	NC_006270	ACAAAA	2	12	759682	759693	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	163119284
235	NC_006270	ATGCAG	2	12	762826	762837	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52079183
236	NC_006270	CAAGCT	2	12	769939	769950	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52079191
237	NC_006270	TTGCGA	2	12	770880	770891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52079192
238	NC_006270	GACGGA	2	12	773020	773031	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	52079194
239	NC_006270	AATTCC	2	12	773972	773983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52079195
240	NC_006270	GGAACA	2	12	777378	777389	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52079198
241	NC_006270	CAAATG	2	12	781685	781696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	52079202
242	NC_006270	TCGGAT	2	12	782766	782777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52079204
243	NC_006270	TCAAGA	2	12	788975	788986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	52079209
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245	NC_006270	GGAGCG	2	12	792940	792951	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	163119288
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248	NC_006270	TTTGCT	2	12	801761	801772	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	52079226
249	NC_006270	TAGTCG	2	12	802425	802436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52079227
250	NC_006270	CGAGCG	2	12	804817	804828	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	52079228
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254	NC_006270	GATATT	2	12	809673	809684	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	52079231
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256	NC_006270	GAAGGG	2	12	815600	815611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163119294
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262	NC_006270	GACCTC	2	12	829847	829858	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	52079244
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264	NC_006270	GTATGC	2	12	833941	833952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163119295
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268	NC_006270	GCATCA	2	12	843360	843371	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52079257
269	NC_006270	GGCAGT	2	12	844910	844921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52079259
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294	NC_006270	GTGCTG	2	12	942380	942391	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
295	NC_006270	GGTGGC	2	12	945616	945627	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	52079352
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320	NC_006270	GTTATA	2	12	1030209	1030220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
321	NC_006270	GTCAGA	2	12	1030597	1030608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163119321
322	NC_006270	GAGGAA	2	12	1031665	1031676	50 %	0 %	50 %	0 %	163119321
323	NC_006270	GCTTGA	2	12	1036017	1036028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52079448
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333	NC_006270	AAGACG	2	12	1064820	1064831	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	52079473
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335	NC_006270	TCGGCA	2	12	1069625	1069636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52079477
336	NC_006270	CGAAGC	2	12	1072065	1072076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52079479
337	NC_006270	AGCTGA	2	12	1074384	1074395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163119328
338	NC_006270	GAAAAA	2	12	1075300	1075311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	52079481
339	NC_006270	CTTTTA	2	12	1075494	1075505	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	52079482
340	NC_006270	GCTCCT	2	12	1079678	1079689	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	163119331
341	NC_006270	CCTTTG	2	12	1080606	1080617	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	52079489
342	NC_006270	CTGCCG	2	12	1084523	1084534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	52079493
343	NC_006270	TAATCG	2	12	1086075	1086086	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	52079495
344	NC_006270	CTCCGC	2	12	1086474	1086485	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	52079495
345	NC_006270	AGCCTG	2	12	1092365	1092376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	52079500
346	NC_006270	GGCAAG	2	12	1097660	1097671	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
347	NC_006270	TAGTAT	2	12	1098721	1098732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
348	NC_006270	TAGTCA	2	12	1099968	1099979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
349	NC_006270	CTTTTA	2	12	1101871	1101882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
350	NC_006270	GAACTT	2	12	1103149	1103160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	52079509
351	NC_006270	TCGGAG	2	12	1103748	1103759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52079509
352	NC_006270	TGAAAT	2	12	1104489	1104500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	52079510
353	NC_006270	CTGATG	2	12	1108803	1108814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52079515
354	NC_006270	TCCGCT	2	12	1109637	1109648	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	52079516
355	NC_006270	AATTTA	2	12	1110383	1110394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
356	NC_006270	GGTGAT	2	12	1111483	1111494	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	52079517
357	NC_006270	TCATTG	2	12	1111609	1111620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
358	NC_006270	GTTCCT	2	12	1116149	1116160	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	52079522
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361	NC_006270	TATCGT	2	12	1125252	1125263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	52079531
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379	NC_006270	GAGCTG	2	12	1214940	1214951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	52079612
380	NC_006270	TGACTT	2	12	1216211	1216222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	163119347
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445	NC_006270	GTCAAA	2	12	1394996	1395007	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	52079794
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459	NC_006270	ATGATT	2	12	1440432	1440443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
460	NC_006270	GAAACC	2	12	1440584	1440595	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_006270	ATGACC	2	12	1442716	1442727	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	52079857
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464	NC_006270	TTGACG	2	12	1445439	1445450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	52079860
465	NC_006270	GTTGAG	2	12	1445595	1445606	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	52079861
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