MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia garinii PBi chromosome linear

Total Repeats: 25106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_006156	TAT	2	6	900437	900442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25002	NC_006156	ATTG	2	8	900460	900467	25 %	50 %	25 %	0 %	51599093
25003	NC_006156	CTTCTA	2	12	900501	900512	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	51599093
25004	NC_006156	GTT	2	6	900523	900528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51599093
25005	NC_006156	AAT	2	6	900532	900537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51599093
25006	NC_006156	T	6	6	900562	900567	0 %	100 %	0 %	0 %	51599093
25007	NC_006156	ATT	2	6	900576	900581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25008	NC_006156	TAT	2	6	900587	900592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25009	NC_006156	T	6	6	900635	900640	0 %	100 %	0 %	0 %	51599093
25010	NC_006156	TAA	2	6	900653	900658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51599093
25011	NC_006156	TAT	2	6	900668	900673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25012	NC_006156	TTC	2	6	900689	900694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51599093
25013	NC_006156	TAT	2	6	900701	900706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25014	NC_006156	GAAT	2	8	900743	900750	50 %	25 %	25 %	0 %	51599093
25015	NC_006156	TGTA	2	8	900765	900772	25 %	50 %	25 %	0 %	51599093
25016	NC_006156	ATTT	2	8	900890	900897	25 %	75 %	0 %	0 %	51599093
25017	NC_006156	T	9	9	900895	900903	0 %	100 %	0 %	0 %	51599093
25018	NC_006156	ATT	2	6	900924	900929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25019	NC_006156	GCT	2	6	900944	900949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51599093
25020	NC_006156	ATT	2	6	900980	900985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25021	NC_006156	AAT	2	6	900988	900993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51599093
25022	NC_006156	T	6	6	901014	901019	0 %	100 %	0 %	0 %	51599093
25023	NC_006156	TCT	2	6	901023	901028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51599093
25024	NC_006156	CTG	2	6	901057	901062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51599093
25025	NC_006156	TTA	2	6	901069	901074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25026	NC_006156	ATT	2	6	901082	901087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25027	NC_006156	TTA	2	6	901153	901158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25028	NC_006156	GTG	2	6	901171	901176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51599093
25029	NC_006156	T	6	6	901177	901182	0 %	100 %	0 %	0 %	51599093
25030	NC_006156	T	6	6	901212	901217	0 %	100 %	0 %	0 %	51599093
25031	NC_006156	TTA	2	6	901221	901226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599093
25032	NC_006156	AATATT	2	12	901269	901280	50 %	50 %	0 %	0 %	51599093
25033	NC_006156	TTC	2	6	901293	901298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51599093
25034	NC_006156	GTA	2	6	901302	901307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25035	NC_006156	T	6	6	901356	901361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25036	NC_006156	T	7	7	901373	901379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25037	NC_006156	TAA	2	6	901387	901392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25038	NC_006156	T	6	6	901393	901398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25039	NC_006156	TAA	2	6	901407	901412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25040	NC_006156	T	6	6	901423	901428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25041	NC_006156	AT	3	6	901450	901455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25042	NC_006156	AATA	2	8	901501	901508	75 %	25 %	0 %	0 %	51599094
25043	NC_006156	A	6	6	901532	901537	100 %	0 %	0 %	0 %	51599094
25044	NC_006156	GAA	2	6	901559	901564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51599094
25045	NC_006156	TAT	2	6	901585	901590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599094
25046	NC_006156	A	6	6	901592	901597	100 %	0 %	0 %	0 %	51599094
25047	NC_006156	TGA	2	6	901606	901611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51599094
25048	NC_006156	CAAGA	2	10	901632	901641	60 %	0 %	20 %	20 %	51599094
25049	NC_006156	A	6	6	901666	901671	100 %	0 %	0 %	0 %	51599094
25050	NC_006156	CTT	2	6	901722	901727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51599094
25051	NC_006156	ATT	2	6	901812	901817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599094
25052	NC_006156	ATA	2	6	901836	901841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51599094
25053	NC_006156	GTAA	2	8	901868	901875	50 %	25 %	25 %	0 %	51599094
25054	NC_006156	TCT	2	6	901895	901900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51599094
25055	NC_006156	TGA	2	6	901903	901908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51599094
25056	NC_006156	TAT	2	6	901933	901938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599094
25057	NC_006156	TTTA	2	8	901957	901964	25 %	75 %	0 %	0 %	51599094
25058	NC_006156	AATA	2	8	902002	902009	75 %	25 %	0 %	0 %	51599094
25059	NC_006156	TAA	2	6	902017	902022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51599094
25060	NC_006156	AG	3	6	902033	902038	50 %	0 %	50 %	0 %	51599094
25061	NC_006156	A	8	8	902081	902088	100 %	0 %	0 %	0 %	51599094
25062	NC_006156	GAA	2	6	902114	902119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51599094
25063	NC_006156	TCT	2	6	902120	902125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51599094
25064	NC_006156	A	6	6	902275	902280	100 %	0 %	0 %	0 %	51599094
25065	NC_006156	TGA	2	6	902350	902355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51599094
25066	NC_006156	AGA	2	6	902416	902421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51599094
25067	NC_006156	ATA	2	6	902474	902479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51599094
25068	NC_006156	ATG	2	6	902526	902531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51599094
25069	NC_006156	TAA	2	6	902593	902598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51599094
25070	NC_006156	GTT	2	6	902599	902604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51599094
25071	NC_006156	GAA	2	6	902606	902611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51599094
25072	NC_006156	GTG	2	6	902661	902666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51599094
25073	NC_006156	ATGT	2	8	902674	902681	25 %	50 %	25 %	0 %	51599094
25074	NC_006156	AG	3	6	902696	902701	50 %	0 %	50 %	0 %	51599094
25075	NC_006156	TAAA	2	8	902738	902745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25076	NC_006156	TTA	2	6	902777	902782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599095
25077	NC_006156	GATT	2	8	902862	902869	25 %	50 %	25 %	0 %	51599095
25078	NC_006156	A	7	7	902871	902877	100 %	0 %	0 %	0 %	51599095
25079	NC_006156	CAA	2	6	902948	902953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51599095
25080	NC_006156	ATG	2	6	903049	903054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51599095
25081	NC_006156	GTAT	2	8	903077	903084	25 %	50 %	25 %	0 %	51599095
25082	NC_006156	ATT	2	6	903137	903142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599095
25083	NC_006156	AGA	2	6	903216	903221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51599095
25084	NC_006156	TAT	2	6	903309	903314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51599095
25085	NC_006156	ATTACA	2	12	903412	903423	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51599095
25086	NC_006156	AGA	2	6	903432	903437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51599095
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25088	NC_006156	TG	3	6	903471	903476	0 %	50 %	50 %	0 %	51599095
25089	NC_006156	AAT	2	6	903493	903498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51599095
25090	NC_006156	TCT	2	6	903516	903521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51599095
25091	NC_006156	AGA	2	6	903669	903674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51599095
25092	NC_006156	GTT	2	6	903697	903702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51599095
25093	NC_006156	ATTT	2	8	903771	903778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25094	NC_006156	A	6	6	903786	903791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25095	NC_006156	AGG	2	6	903798	903803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25096	NC_006156	AGT	2	6	903829	903834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25097	NC_006156	AAT	2	6	903840	903845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25098	NC_006156	CTG	2	6	903890	903895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25099	NC_006156	GA	3	6	903941	903946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25100	NC_006156	TAT	2	6	904005	904010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25101	NC_006156	TTA	2	6	904058	904063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25102	NC_006156	TTG	2	6	904076	904081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25103	NC_006156	TTA	2	6	904097	904102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25104	NC_006156	AAG	2	6	904144	904149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25105	NC_006156	T	6	6	904193	904198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25106	NC_006156	CCCTT	2	10	904235	904244	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.