MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid cp26

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006128	TAAAA	2	10	3659	3668	80 %	20 %	0 %	0 %	51038601
2	NC_006128	TAAAA	2	10	3886	3895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006128	TATAA	2	10	3917	3926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006128	TTTTA	2	10	4232	4241	20 %	80 %	0 %	0 %	51038602
5	NC_006128	AAAAT	2	10	4721	4730	80 %	20 %	0 %	0 %	51038604
6	NC_006128	ATTAG	2	10	4969	4978	40 %	40 %	20 %	0 %	51038604
7	NC_006128	GAAAA	2	10	5255	5264	80 %	0 %	20 %	0 %	51038604
8	NC_006128	TAAAA	2	10	6210	6219	80 %	20 %	0 %	0 %	51038605
9	NC_006128	ACTTT	2	10	7650	7659	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006128	TATTG	2	10	8586	8595	20 %	60 %	20 %	0 %	51038607
11	NC_006128	AAAAT	2	10	8715	8724	80 %	20 %	0 %	0 %	51038608
12	NC_006128	GAAAT	2	10	10035	10044	60 %	20 %	20 %	0 %	51038610
13	NC_006128	ACAAA	2	10	10968	10977	80 %	0 %	0 %	20 %	51038611
14	NC_006128	ATCTA	2	10	12120	12129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_006128	TTGTT	2	10	12226	12235	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006128	TTTAG	2	10	12332	12341	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006128	TCTTA	2	10	12899	12908	20 %	60 %	0 %	20 %	51038612
18	NC_006128	AAAGT	2	10	13673	13682	60 %	20 %	20 %	0 %	51038612
19	NC_006128	GATTT	2	10	14112	14121	20 %	60 %	20 %	0 %	51038612
20	NC_006128	TTTAT	2	10	14154	14163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006128	TTTTA	2	10	14251	14260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006128	TTAAA	2	10	17034	17043	60 %	40 %	0 %	0 %	51038614
23	NC_006128	GAAAA	2	10	17479	17488	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006128	GCTTT	2	10	17714	17723	0 %	60 %	20 %	20 %	51038615
25	NC_006128	ACAAT	2	10	19597	19606	60 %	20 %	0 %	20 %	51038616
26	NC_006128	ATTTT	2	10	19969	19978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006128	TAAAT	2	10	20039	20048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006128	TCTTT	2	10	20129	20138	0 %	80 %	0 %	20 %	51038617
29	NC_006128	TAAAT	2	10	20766	20775	60 %	40 %	0 %	0 %	51038617
30	NC_006128	ATTTT	2	10	21972	21981	20 %	80 %	0 %	0 %	51038618
31	NC_006128	TTATA	2	10	22485	22494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006128	AAGAT	2	10	23415	23424	60 %	20 %	20 %	0 %	51038621
33	NC_006128	TTTTA	2	10	23625	23634	20 %	80 %	0 %	0 %	51038621
34	NC_006128	TAAAG	4	20	23812	23831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006128	ATATA	2	10	23857	23866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006128	ATAAA	2	10	24139	24148	80 %	20 %	0 %	0 %	51038622
37	NC_006128	AAATT	2	10	25252	25261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006128	GAAGA	2	10	26776	26785	60 %	0 %	40 %	0 %	51038623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.