MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid cp26

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006128	TAA	2	6	40	45	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038598
2	NC_006128	ACA	2	6	53	58	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038598
3	NC_006128	ATA	2	6	121	126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038598
4	NC_006128	ATT	2	6	221	226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038598
5	NC_006128	TAA	2	6	302	307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038598
6	NC_006128	TAT	2	6	318	323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038598
7	NC_006128	TAA	2	6	342	347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038599
8	NC_006128	CAG	2	6	417	422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038599
9	NC_006128	CTG	2	6	648	653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51038599
10	NC_006128	TAA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006128	ATT	2	6	863	868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
12	NC_006128	ATC	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038600
13	NC_006128	TAA	2	6	1138	1143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038600
14	NC_006128	TCA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038600
15	NC_006128	TAT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
16	NC_006128	TGT	2	6	1201	1206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038600
17	NC_006128	AAT	2	6	1245	1250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038600
18	NC_006128	TTC	2	6	1324	1329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038600
19	NC_006128	ATT	2	6	1342	1347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
20	NC_006128	TAT	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
21	NC_006128	AAC	2	6	1489	1494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038600
22	NC_006128	TAA	2	6	1500	1505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038600
23	NC_006128	TAT	2	6	1506	1511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
24	NC_006128	GAC	2	6	1596	1601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038600
25	NC_006128	TAA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038600
26	NC_006128	ATT	2	6	1670	1675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
27	NC_006128	TTA	2	6	1823	1828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
28	NC_006128	TAT	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
29	NC_006128	ATT	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
30	NC_006128	ATT	2	6	2009	2014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
31	NC_006128	ATT	2	6	2110	2115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
32	NC_006128	TAT	2	6	2124	2129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038600
33	NC_006128	AAT	3	9	2547	2555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038601
34	NC_006128	AAT	2	6	2651	2656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038601
35	NC_006128	ATA	2	6	2757	2762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038601
36	NC_006128	CAT	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038601
37	NC_006128	CAC	2	6	2872	2877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51038601
38	NC_006128	CAA	2	6	2995	3000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038601
39	NC_006128	ATT	2	6	3114	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038601
40	NC_006128	ACA	3	9	3186	3194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038601
41	NC_006128	CAG	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038601
42	NC_006128	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038601
43	NC_006128	AGC	2	6	3392	3397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038601
44	NC_006128	TCC	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51038601
45	NC_006128	TCC	2	6	3464	3469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51038601
46	NC_006128	ACA	2	6	3522	3527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038601
47	NC_006128	ATA	2	6	3616	3621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038601
48	NC_006128	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038601
49	NC_006128	AGT	2	6	3764	3769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038601
50	NC_006128	TCC	2	6	3802	3807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51038601
51	NC_006128	TAT	2	6	3826	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006128	ATA	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006128	TAT	2	6	3929	3934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006128	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038602
55	NC_006128	TGT	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038602
56	NC_006128	ATA	2	6	4188	4193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038602
57	NC_006128	GAA	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038602
58	NC_006128	ATA	2	6	4317	4322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038602
59	NC_006128	AGG	2	6	4339	4344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51038602
60	NC_006128	GTT	2	6	4478	4483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038603
61	NC_006128	TGT	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038603
62	NC_006128	CAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51038603
63	NC_006128	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038603
64	NC_006128	AAT	2	6	4576	4581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038603
65	NC_006128	AAG	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038603
66	NC_006128	TAT	2	6	4863	4868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038604
67	NC_006128	ATT	2	6	4940	4945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038604
68	NC_006128	GAA	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038604
69	NC_006128	AAT	2	6	5079	5084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038604
70	NC_006128	AAC	2	6	5175	5180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038604
71	NC_006128	ATT	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038604
72	NC_006128	TTA	2	6	5219	5224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038604
73	NC_006128	AGA	2	6	5238	5243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038604
74	NC_006128	AAG	2	6	5333	5338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038604
75	NC_006128	ATA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038604
76	NC_006128	TAC	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038604
77	NC_006128	AAT	2	6	5551	5556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038604
78	NC_006128	ATA	2	6	5672	5677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038604
79	NC_006128	TAG	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038604
80	NC_006128	GAA	2	6	5710	5715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038604
81	NC_006128	ATA	2	6	5758	5763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038604
82	NC_006128	ATA	3	9	5829	5837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038605
83	NC_006128	TAG	2	6	5903	5908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038605
84	NC_006128	ATC	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038605
85	NC_006128	ATT	2	6	6024	6029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038605
86	NC_006128	TAA	2	6	6147	6152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038605
87	NC_006128	ATT	2	6	6192	6197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038605
88	NC_006128	AAT	2	6	6227	6232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038605
89	NC_006128	TAA	2	6	6350	6355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038605
90	NC_006128	GAA	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038605
91	NC_006128	TAA	2	6	6495	6500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006128	ATT	2	6	6521	6526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006128	TTA	2	6	6600	6605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038606
94	NC_006128	AAG	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038606
95	NC_006128	TAA	2	6	6697	6702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038606
96	NC_006128	ATT	2	6	6847	6852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038606
97	NC_006128	TAA	2	6	6890	6895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038606
98	NC_006128	ATT	2	6	6900	6905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038606
99	NC_006128	TAA	2	6	7022	7027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038606
100	NC_006128	AAG	2	6	7063	7068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038606
101	NC_006128	ATA	2	6	7105	7110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038606
102	NC_006128	ATT	2	6	7165	7170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038606
103	NC_006128	ATT	2	6	7196	7201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038606
104	NC_006128	TAT	2	6	7241	7246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038606
105	NC_006128	ATT	2	6	7252	7257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038606
106	NC_006128	ATG	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038606
107	NC_006128	ATA	2	6	7345	7350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038606
108	NC_006128	CCT	2	6	7368	7373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51038606
109	NC_006128	CTT	2	6	7536	7541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038606
110	NC_006128	AAG	2	6	7555	7560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038606
111	NC_006128	TAT	3	9	7672	7680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006128	TAA	2	6	7746	7751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
113	NC_006128	TAA	2	6	7761	7766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
114	NC_006128	ACT	2	6	7820	7825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038607
115	NC_006128	TGT	2	6	7857	7862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038607
116	NC_006128	ACA	2	6	8059	8064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038607
117	NC_006128	TAA	2	6	8073	8078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
118	NC_006128	ATA	2	6	8128	8133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
119	NC_006128	GAA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038607
120	NC_006128	TAA	2	6	8187	8192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
121	NC_006128	CTT	2	6	8259	8264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038607
122	NC_006128	AGA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038607
123	NC_006128	ATA	2	6	8332	8337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
124	NC_006128	GAA	2	6	8377	8382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038607
125	NC_006128	GAA	2	6	8395	8400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038607
126	NC_006128	TTC	2	6	8416	8421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038607
127	NC_006128	TAA	2	6	8498	8503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
128	NC_006128	TAA	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
129	NC_006128	ATA	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038607
130	NC_006128	TAA	2	6	8751	8756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038608
131	NC_006128	CAA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038608
132	NC_006128	TAT	2	6	8914	8919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038608
133	NC_006128	AAG	2	6	9016	9021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038608
134	NC_006128	AGT	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038608
135	NC_006128	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038608
136	NC_006128	GGT	2	6	9202	9207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51038609
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268	NC_006128	AAT	2	6	17382	17387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_006128	AAT	2	6	17393	17398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_006128	AAT	2	6	17404	17409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_006128	AAT	2	6	17415	17420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_006128	AAT	2	6	17426	17431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_006128	AAT	2	6	17437	17442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_006128	ATT	2	6	17455	17460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_006128	TTG	2	6	17490	17495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_006128	TAA	2	6	17499	17504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_006128	TTA	2	6	25172	25177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_006128	TAT	2	6	25378	25383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_006128	TAA	2	6	25418	25423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_006128	CAT	2	6	25444	25449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038623
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395	NC_006128	AGA	2	6	25592	25597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038623
396	NC_006128	GCA	3	9	25689	25697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038623
397	NC_006128	GCT	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51038623
398	NC_006128	AGT	2	6	25748	25753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038623
399	NC_006128	GGA	2	6	25932	25937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51038623
400	NC_006128	TTG	2	6	25951	25956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038623
401	NC_006128	TGG	2	6	26240	26245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51038623
402	NC_006128	AAC	2	6	26299	26304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038623
403	NC_006128	TGT	2	6	26369	26374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038623
404	NC_006128	GCA	2	6	26526	26531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038623
405	NC_006128	TTA	2	6	26540	26545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038623
406	NC_006128	GGA	2	6	26625	26630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51038623
407	NC_006128	TCT	2	6	26707	26712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038623
408	NC_006128	GAA	2	6	26787	26792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038623
409	NC_006128	GGA	2	6	26865	26870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51038623
410	NC_006128	ATA	2	6	26875	26880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038623
411	NC_006128	TCA	2	6	26938	26943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038623
412	NC_006128	GGA	2	6	27018	27023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51038623
413	NC_006128	AAC	2	6	27086	27091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.