MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella henselae str. Houston-1 chromosome

Total Repeats: 44259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005956	TTGGT	2	10	158995	159004	0 %	60 %	40 %	0 %	49474936
3502	NC_005956	CT	3	6	159044	159049	0 %	50 %	0 %	50 %	49474936
3503	NC_005956	TAA	2	6	159079	159084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49474936
3504	NC_005956	TTC	2	6	159135	159140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474936
3505	NC_005956	TGT	2	6	159211	159216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474936
3506	NC_005956	GAAGA	2	10	159221	159230	60 %	0 %	40 %	0 %	49474936
3507	NC_005956	TTG	2	6	159333	159338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474936
3508	NC_005956	TCT	2	6	159344	159349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474936
3509	NC_005956	GCT	2	6	159476	159481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474936
3510	NC_005956	TTAT	2	8	159510	159517	25 %	75 %	0 %	0 %	49474936
3511	NC_005956	ATG	2	6	159567	159572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474936
3512	NC_005956	CTTT	2	8	159575	159582	0 %	75 %	0 %	25 %	49474936
3513	NC_005956	ATT	2	6	159614	159619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474936
3514	NC_005956	GAT	2	6	159620	159625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474936
3515	NC_005956	TGC	2	6	159681	159686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474936
3516	NC_005956	GTT	3	9	159704	159712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474936
3517	NC_005956	CCA	2	6	159725	159730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49474936
3518	NC_005956	CAA	2	6	159854	159859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474936
3519	NC_005956	ACA	2	6	159864	159869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474936
3520	NC_005956	GTT	3	9	159955	159963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474936
3521	NC_005956	TGA	2	6	160003	160008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474936
3522	NC_005956	GAA	2	6	160058	160063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474936
3523	NC_005956	GC	3	6	160069	160074	0 %	0 %	50 %	50 %	49474936
3524	NC_005956	TAT	2	6	160110	160115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474936
3525	NC_005956	TCG	2	6	160120	160125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474936
3526	NC_005956	TCGT	2	8	160186	160193	0 %	50 %	25 %	25 %	49474936
3527	NC_005956	CGT	2	6	160208	160213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474936
3528	NC_005956	GGA	2	6	160217	160222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49474936
3529	NC_005956	TGA	2	6	160276	160281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474936
3530	NC_005956	TAA	2	6	160388	160393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_005956	AG	3	6	160437	160442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_005956	CGT	2	6	160605	160610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474937
3533	NC_005956	TGT	2	6	160756	160761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474937
3534	NC_005956	TAT	2	6	160801	160806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474937
3535	NC_005956	TGT	2	6	160838	160843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474937
3536	NC_005956	TTA	2	6	161000	161005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474937
3537	NC_005956	ATTT	2	8	161016	161023	25 %	75 %	0 %	0 %	49474937
3538	NC_005956	TGA	2	6	161033	161038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474937
3539	NC_005956	CTT	2	6	161172	161177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474937
3540	NC_005956	GAA	2	6	161181	161186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49474937
3541	NC_005956	TGA	2	6	161189	161194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474937
3542	NC_005956	TTGA	2	8	161265	161272	25 %	50 %	25 %	0 %	49474937
3543	NC_005956	A	6	6	161319	161324	100 %	0 %	0 %	0 %	49474937
3544	NC_005956	ACAG	2	8	161335	161342	50 %	0 %	25 %	25 %	49474937
3545	NC_005956	TCT	2	6	161349	161354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474937
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3547	NC_005956	TGA	2	6	161558	161563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474937
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3550	NC_005956	TCTTT	2	10	161831	161840	0 %	80 %	0 %	20 %	49474938
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3553	NC_005956	TGT	2	6	161911	161916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474938
3554	NC_005956	GTGAA	2	10	161946	161955	40 %	20 %	40 %	0 %	49474938
3555	NC_005956	ATT	2	6	162039	162044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474938
3556	NC_005956	ATGG	2	8	162071	162078	25 %	25 %	50 %	0 %	49474938
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3558	NC_005956	CGT	3	9	162104	162112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474938
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3562	NC_005956	TGGA	2	8	162207	162214	25 %	25 %	50 %	0 %	49474938
3563	NC_005956	T	6	6	162358	162363	0 %	100 %	0 %	0 %	49474938
3564	NC_005956	T	6	6	162376	162381	0 %	100 %	0 %	0 %	49474938
3565	NC_005956	AGC	2	6	162385	162390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49474938
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3569	NC_005956	GCA	2	6	162536	162541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49474938
3570	NC_005956	GGTTT	2	10	162581	162590	0 %	60 %	40 %	0 %	49474938
3571	NC_005956	AG	3	6	162622	162627	50 %	0 %	50 %	0 %	49474938
3572	NC_005956	CTT	2	6	162641	162646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49474938
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3574	NC_005956	TGA	2	6	162703	162708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474938
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3576	NC_005956	TTTA	2	8	162748	162755	25 %	75 %	0 %	0 %	49474938
3577	NC_005956	T	6	6	162779	162784	0 %	100 %	0 %	0 %	49474938
3578	NC_005956	T	7	7	162829	162835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_005956	AAG	3	9	162848	162856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_005956	CAA	2	6	162980	162985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49474939
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3582	NC_005956	GCT	2	6	163090	163095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474939
3583	NC_005956	GCTG	2	8	163237	163244	0 %	25 %	50 %	25 %	49474939
3584	NC_005956	AT	3	6	163275	163280	50 %	50 %	0 %	0 %	49474939
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3587	NC_005956	TAAG	2	8	163369	163376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_005956	GT	3	6	163407	163412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_005956	GGT	2	6	163474	163479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49474940
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3591	NC_005956	GC	3	6	163534	163539	0 %	0 %	50 %	50 %	49474940
3592	NC_005956	TG	3	6	163564	163569	0 %	50 %	50 %	0 %	49474940
3593	NC_005956	GTA	2	6	163609	163614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474940
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3596	NC_005956	TTA	2	6	163749	163754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474940
3597	NC_005956	TGT	2	6	163794	163799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474940
3598	NC_005956	TTTA	2	8	163855	163862	25 %	75 %	0 %	0 %	49474940
3599	NC_005956	GTC	2	6	163910	163915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474940
3600	NC_005956	TTG	2	6	163921	163926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474940
3601	NC_005956	TATGC	2	10	163987	163996	20 %	40 %	20 %	20 %	49474940
3602	NC_005956	TAC	2	6	164278	164283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49474940
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3604	NC_005956	TGA	2	6	164304	164309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474940
3605	NC_005956	TGC	2	6	164343	164348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474940
3606	NC_005956	ATCG	2	8	164407	164414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_005956	T	6	6	164440	164445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_005956	GGT	2	6	164571	164576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49474941
3609	NC_005956	TTG	2	6	164581	164586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49474941
3610	NC_005956	TGG	2	6	164610	164615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49474941
3611	NC_005956	TAT	2	6	164666	164671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474941
3612	NC_005956	ATG	2	6	164724	164729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49474941
3613	NC_005956	CGG	2	6	164764	164769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49474941
3614	NC_005956	CCA	2	6	164778	164783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49474941
3615	NC_005956	T	6	6	164800	164805	0 %	100 %	0 %	0 %	49474941
3616	NC_005956	TTA	2	6	164818	164823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474941
3617	NC_005956	T	7	7	164827	164833	0 %	100 %	0 %	0 %	49474941
3618	NC_005956	TATTT	2	10	164846	164855	20 %	80 %	0 %	0 %	49474941
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3620	NC_005956	CTG	2	6	164941	164946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49474941
3621	NC_005956	AT	3	6	164965	164970	50 %	50 %	0 %	0 %	49474941
3622	NC_005956	GTG	2	6	164995	165000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49474941
3623	NC_005956	TAT	2	6	165060	165065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49474941
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3625	NC_005956	CAAT	2	8	165109	165116	50 %	25 %	0 %	25 %	49474941
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