MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus cereus ATCC 14579 plasmid pBClin15

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004721	TAA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004721	CAT	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004721	CAA	2	6	151	156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004721	ATC	2	6	197	202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004721	ATT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004721	ATA	2	6	321	326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004721	GAG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004721	CAT	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899112
9	NC_004721	AAG	2	6	425	430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899112
10	NC_004721	TTA	2	6	508	513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899112
11	NC_004721	GGA	2	6	525	530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899112
12	NC_004721	GCA	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899113
13	NC_004721	TTC	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29899113
14	NC_004721	AGA	2	6	813	818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899113
15	NC_004721	ATT	2	6	925	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899113
16	NC_004721	TGT	2	6	1100	1105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899114
17	NC_004721	AGA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899114
18	NC_004721	CAT	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899114
19	NC_004721	AGT	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899114
20	NC_004721	TAA	2	6	1395	1400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899115
21	NC_004721	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899115
22	NC_004721	TAG	2	6	1461	1466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899115
23	NC_004721	CTA	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899115
24	NC_004721	GTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899115
25	NC_004721	TTA	2	6	1712	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899115
26	NC_004721	GGT	2	6	1804	1809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899115
27	NC_004721	AGA	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899115
28	NC_004721	TCA	2	6	1848	1853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899115
29	NC_004721	ATG	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899115
30	NC_004721	AGA	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899115
31	NC_004721	AGA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899115
32	NC_004721	AAG	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
33	NC_004721	ATT	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
34	NC_004721	ACT	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899116
35	NC_004721	TAC	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899116
36	NC_004721	TAA	2	6	2562	2567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899116
37	NC_004721	GAC	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899116
38	NC_004721	AGA	2	6	2823	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
39	NC_004721	TTA	2	6	2844	2849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
40	NC_004721	CGT	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899116
41	NC_004721	TAC	2	6	3077	3082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899116
42	NC_004721	ATT	2	6	3105	3110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
43	NC_004721	ACT	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899116
44	NC_004721	TTG	2	6	3242	3247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899116
45	NC_004721	AAC	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899116
46	NC_004721	AAC	2	6	3551	3556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899116
47	NC_004721	ATG	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899116
48	NC_004721	AAG	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
49	NC_004721	AAG	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
50	NC_004721	GAA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
51	NC_004721	GAA	2	6	3921	3926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
52	NC_004721	TTA	2	6	3940	3945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
53	NC_004721	TAT	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
54	NC_004721	ATG	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899116
55	NC_004721	TAA	2	6	4103	4108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899116
56	NC_004721	TAT	2	6	4150	4155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899116
57	NC_004721	AGA	2	6	4266	4271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899116
58	NC_004721	CAT	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899117
59	NC_004721	AGG	2	6	4499	4504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004721	TCG	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004721	AGA	2	6	4613	4618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004721	TAG	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004721	TGA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004721	AGA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004721	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004721	GGA	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004721	GAT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004721	GAA	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004721	GAA	2	6	4906	4911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004721	GAG	2	6	4924	4929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004721	CAC	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29899118
72	NC_004721	GGA	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899118
73	NC_004721	GAC	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899118
74	NC_004721	GAG	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899118
75	NC_004721	AAG	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899118
76	NC_004721	GCA	2	6	5214	5219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899118
77	NC_004721	CAT	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899118
78	NC_004721	TGA	2	6	5333	5338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899118
79	NC_004721	AGG	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899118
80	NC_004721	TAG	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899118
81	NC_004721	AAC	2	6	5596	5601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899118
82	NC_004721	CCA	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29899118
83	NC_004721	TAT	2	6	5818	5823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899119
84	NC_004721	GAA	2	6	5825	5830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899119
85	NC_004721	TCC	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29899119
86	NC_004721	GAA	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899119
87	NC_004721	TAG	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899120
88	NC_004721	CGT	2	6	6224	6229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899120
89	NC_004721	ATC	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899120
90	NC_004721	GAA	2	6	6291	6296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899120
91	NC_004721	TGA	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899120
92	NC_004721	GTA	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899120
93	NC_004721	AAG	2	6	6445	6450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899120
94	NC_004721	AGG	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899120
95	NC_004721	AGG	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004721	TGG	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004721	GCA	2	6	7009	7014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899121
98	NC_004721	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899121
99	NC_004721	CAA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899121
100	NC_004721	ATT	2	6	7123	7128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899121
101	NC_004721	TTA	2	6	7139	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899121
102	NC_004721	ACG	2	6	7222	7227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29899121
103	NC_004721	AAT	2	6	7244	7249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899121
104	NC_004721	TAT	2	6	7320	7325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899121
105	NC_004721	TCT	2	6	7370	7375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29899121
106	NC_004721	AAT	2	6	7538	7543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899121
107	NC_004721	GGT	2	6	7673	7678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899121
108	NC_004721	AGA	2	6	7768	7773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899121
109	NC_004721	GGT	2	6	7931	7936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899121
110	NC_004721	AGG	2	6	8075	8080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004721	TCA	2	6	8102	8107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899122
112	NC_004721	ATG	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899123
113	NC_004721	TGA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899124
114	NC_004721	AGT	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899124
115	NC_004721	GAT	2	6	8808	8813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899124
116	NC_004721	GGT	2	6	8980	8985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899124
117	NC_004721	ATT	2	6	9021	9026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004721	GTT	2	6	9114	9119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004721	TAT	2	6	9250	9255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004721	AGG	2	6	9309	9314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004721	ATG	2	6	9343	9348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899125
122	NC_004721	TCA	2	6	9450	9455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899125
123	NC_004721	AGG	2	6	9599	9604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899125
124	NC_004721	CTG	2	6	9629	9634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899126
125	NC_004721	GTC	2	6	9744	9749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899126
126	NC_004721	TTC	2	6	9750	9755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29899126
127	NC_004721	AAG	2	6	9767	9772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899126
128	NC_004721	TGA	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899126
129	NC_004721	AAG	2	6	9860	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899126
130	NC_004721	GAT	2	6	9867	9872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899126
131	NC_004721	CTA	2	6	10001	10006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899126
132	NC_004721	TAT	2	6	10054	10059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899126
133	NC_004721	TTA	2	6	10093	10098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899126
134	NC_004721	ATG	2	6	10238	10243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899127
135	NC_004721	TAT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899127
136	NC_004721	ATC	2	6	10308	10313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899127
137	NC_004721	ACC	2	6	10396	10401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29899127
138	NC_004721	ACT	2	6	10514	10519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899127
139	NC_004721	GGT	2	6	10576	10581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899127
140	NC_004721	TGA	2	6	10650	10655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899127
141	NC_004721	TGG	2	6	10692	10697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899127
142	NC_004721	GAT	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899127
143	NC_004721	CAA	2	6	10826	10831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899127
144	NC_004721	GAA	2	6	10869	10874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899127
145	NC_004721	AAG	2	6	11163	11168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899128
146	NC_004721	TGG	2	6	11233	11238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899128
147	NC_004721	AAC	2	6	11248	11253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899128
148	NC_004721	TGG	2	6	11257	11262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899128
149	NC_004721	TCA	2	6	11334	11339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899128
150	NC_004721	TCT	2	6	11370	11375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29899128
151	NC_004721	CAA	2	6	11562	11567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899129
152	NC_004721	CTA	2	6	11987	11992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899129
153	NC_004721	GTT	2	6	12116	12121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899129
154	NC_004721	AAC	2	6	12181	12186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899129
155	NC_004721	TAA	2	6	12254	12259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899130
156	NC_004721	CAA	2	6	12268	12273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899130
157	NC_004721	ATT	2	6	12285	12290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899130
158	NC_004721	CAA	2	6	12354	12359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899130
159	NC_004721	GTT	2	6	12473	12478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899130
160	NC_004721	ATC	2	6	12500	12505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899130
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162	NC_004721	AAC	2	6	12562	12567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899130
163	NC_004721	TGT	2	6	12644	12649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899130
164	NC_004721	ACT	2	6	12724	12729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899130
165	NC_004721	AGA	2	6	12794	12799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899130
166	NC_004721	CTA	2	6	12814	12819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899130
167	NC_004721	ATG	2	6	12835	12840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899130
168	NC_004721	TCA	2	6	12855	12860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899130
169	NC_004721	GTA	2	6	12880	12885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899130
170	NC_004721	TAG	2	6	13367	13372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899130
171	NC_004721	ATG	2	6	13381	13386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899130
172	NC_004721	CTG	2	6	13470	13475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899130
173	NC_004721	TGT	2	6	13487	13492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29899130
174	NC_004721	GAT	2	6	13596	13601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899130
175	NC_004721	GTA	2	6	13747	13752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899130
176	NC_004721	TTA	2	6	13846	13851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899130
177	NC_004721	TTA	2	6	13887	13892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899130
178	NC_004721	TTA	2	6	13907	13912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29899130
179	NC_004721	ACA	2	6	14022	14027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29899130
180	NC_004721	TAC	2	6	14080	14085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899130
181	NC_004721	AGG	2	6	14183	14188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29899130
182	NC_004721	ATG	3	9	14320	14328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899131
183	NC_004721	AGA	2	6	14465	14470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899131
184	NC_004721	CAT	2	6	14520	14525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899132
185	NC_004721	AAG	2	6	14616	14621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899132
186	NC_004721	ATG	2	6	14692	14697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899132
187	NC_004721	GTG	2	6	14728	14733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899132
188	NC_004721	TGA	2	6	14813	14818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29899132
189	NC_004721	CAT	2	6	14862	14867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29899132
190	NC_004721	AAG	2	6	14937	14942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29899132
191	NC_004721	AAT	2	6	15027	15032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29899132
192	NC_004721	CTG	2	6	15109	15114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29899132
193	NC_004721	TGG	2	6	15153	15158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29899132
194	NC_004721	CTT	2	6	15191	15196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_004721	TGT	2	6	15229	15234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.