MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 plasmid p5482

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004703	TC	3	6	1548	1553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004703	CA	3	6	2720	2725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_004703	CG	3	6	4172	4177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004703	GA	5	10	4365	4374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004703	AT	3	6	4442	4447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004703	AT	3	6	4879	4884	50 %	50 %	0 %	0 %	29611506
7	NC_004703	TA	3	6	7654	7659	50 %	50 %	0 %	0 %	29611508
8	NC_004703	GT	3	6	8164	8169	0 %	50 %	50 %	0 %	29611508
9	NC_004703	TA	3	6	9982	9987	50 %	50 %	0 %	0 %	29611511
10	NC_004703	AG	3	6	11371	11376	50 %	0 %	50 %	0 %	29611511
11	NC_004703	GT	3	6	11443	11448	0 %	50 %	50 %	0 %	29611511
12	NC_004703	GA	3	6	12644	12649	50 %	0 %	50 %	0 %	29611512
13	NC_004703	AT	4	8	13181	13188	50 %	50 %	0 %	0 %	29611513
14	NC_004703	AG	3	6	14458	14463	50 %	0 %	50 %	0 %	29611515
15	NC_004703	TA	3	6	14840	14845	50 %	50 %	0 %	0 %	29611515
16	NC_004703	TA	3	6	15452	15457	50 %	50 %	0 %	0 %	29611516
17	NC_004703	TA	3	6	15738	15743	50 %	50 %	0 %	0 %	29611516
18	NC_004703	AT	4	8	15813	15820	50 %	50 %	0 %	0 %	29611516
19	NC_004703	AT	3	6	17669	17674	50 %	50 %	0 %	0 %	29611519
20	NC_004703	TA	3	6	19028	19033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004703	GA	3	6	19696	19701	50 %	0 %	50 %	0 %	29611522
22	NC_004703	AG	3	6	19886	19891	50 %	0 %	50 %	0 %	29611522
23	NC_004703	TA	3	6	20220	20225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004703	TC	3	6	20497	20502	0 %	50 %	0 %	50 %	29611523
25	NC_004703	TA	3	6	20881	20886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004703	AC	3	6	21446	21451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004703	AC	16	32	22076	22107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004703	GT	4	8	22110	22117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004703	AT	3	6	22217	22222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004703	TC	3	6	22249	22254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004703	TG	3	6	23792	23797	0 %	50 %	50 %	0 %	29611528
32	NC_004703	GA	3	6	26427	26432	50 %	0 %	50 %	0 %	29611531
33	NC_004703	AT	3	6	26924	26929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004703	TA	3	6	26931	26936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004703	TG	3	6	26955	26960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004703	AC	3	6	27923	27928	50 %	0 %	0 %	50 %	29611533
37	NC_004703	CT	3	6	28525	28530	0 %	50 %	0 %	50 %	29611534
38	NC_004703	TA	3	6	29323	29328	50 %	50 %	0 %	0 %	29611535
39	NC_004703	TA	3	6	29377	29382	50 %	50 %	0 %	0 %	29611535
40	NC_004703	AT	3	6	29455	29460	50 %	50 %	0 %	0 %	29611535
41	NC_004703	GA	3	6	29588	29593	50 %	0 %	50 %	0 %	29611535
42	NC_004703	TC	4	8	29790	29797	0 %	50 %	0 %	50 %	29611535
43	NC_004703	TA	3	6	30084	30089	50 %	50 %	0 %	0 %	29611535
44	NC_004703	AT	3	6	30329	30334	50 %	50 %	0 %	0 %	29611535
45	NC_004703	AT	3	6	30447	30452	50 %	50 %	0 %	0 %	29611536
46	NC_004703	TA	3	6	30840	30845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004703	GA	3	6	31287	31292	50 %	0 %	50 %	0 %	29611537
48	NC_004703	TA	3	6	31680	31685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004703	TA	3	6	33011	33016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.