MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 128175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_004663	TCT	2	6	24958	24963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345439
503	NC_004663	CAA	2	6	25125	25130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345439
504	NC_004663	CTC	2	6	25220	25225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345439
505	NC_004663	CGG	2	6	25238	25243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345439
506	NC_004663	ATG	2	6	25346	25351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345439
507	NC_004663	CTA	2	6	25398	25403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345439
508	NC_004663	TGA	2	6	25461	25466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345439
509	NC_004663	GTT	2	6	25504	25509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345439
510	NC_004663	ATC	2	6	25627	25632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345439
511	NC_004663	CTT	2	6	25704	25709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345439
512	NC_004663	AT	3	6	25791	25796	50 %	50 %	0 %	0 %	29345439
513	NC_004663	A	6	6	25875	25880	100 %	0 %	0 %	0 %	29345439
514	NC_004663	CAA	2	6	25996	26001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345439
515	NC_004663	AT	3	6	26064	26069	50 %	50 %	0 %	0 %	29345439
516	NC_004663	GCC	2	6	26080	26085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345439
517	NC_004663	GCA	3	9	26093	26101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345439
518	NC_004663	TAT	2	6	26119	26124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345439
519	NC_004663	ATA	2	6	26188	26193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345440
520	NC_004663	TG	3	6	26228	26233	0 %	50 %	50 %	0 %	29345440
521	NC_004663	GAT	2	6	26242	26247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345440
522	NC_004663	GAA	2	6	26281	26286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345440
523	NC_004663	TA	3	6	26330	26335	50 %	50 %	0 %	0 %	29345440
524	NC_004663	TATG	2	8	26380	26387	25 %	50 %	25 %	0 %	29345440
525	NC_004663	G	6	6	26412	26417	0 %	0 %	100 %	0 %	29345440
526	NC_004663	GCC	2	6	26521	26526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345440
527	NC_004663	TTC	2	6	26551	26556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345440
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529	NC_004663	TCCC	2	8	26718	26725	0 %	25 %	0 %	75 %	29345440
530	NC_004663	CAA	2	6	26727	26732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345440
531	NC_004663	TGC	2	6	26766	26771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345440
532	NC_004663	GCA	2	6	26881	26886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345440
533	NC_004663	GTG	2	6	26903	26908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345440
534	NC_004663	GAT	2	6	26968	26973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345440
535	NC_004663	CGAA	2	8	26981	26988	50 %	0 %	25 %	25 %	29345440
536	NC_004663	CA	3	6	27047	27052	50 %	0 %	0 %	50 %	29345440
537	NC_004663	TGT	2	6	27053	27058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345440
538	NC_004663	TGTA	2	8	27100	27107	25 %	50 %	25 %	0 %	29345440
539	NC_004663	GAAA	2	8	27236	27243	75 %	0 %	25 %	0 %	29345440
540	NC_004663	TCA	2	6	27368	27373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345440
541	NC_004663	CAA	2	6	27570	27575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345440
542	NC_004663	CGT	2	6	27595	27600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345440
543	NC_004663	TGA	2	6	27684	27689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345440
544	NC_004663	T	6	6	27773	27778	0 %	100 %	0 %	0 %	29345440
545	NC_004663	GGAGTT	2	12	27808	27819	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29345440
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547	NC_004663	TGT	2	6	27848	27853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345440
548	NC_004663	AAT	2	6	27856	27861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345440
549	NC_004663	AT	3	6	27874	27879	50 %	50 %	0 %	0 %	29345440
550	NC_004663	CGCT	2	8	27952	27959	0 %	25 %	25 %	50 %	29345440
551	NC_004663	AAT	2	6	27961	27966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345440
552	NC_004663	GGATG	2	10	27985	27994	20 %	20 %	60 %	0 %	29345440
553	NC_004663	TTC	2	6	28022	28027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_004663	AAC	2	6	28042	28047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_004663	ATT	2	6	28053	28058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004663	TCTT	2	8	28066	28073	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_004663	AT	3	6	28202	28207	50 %	50 %	0 %	0 %	29345441
558	NC_004663	ATCTTC	2	12	28222	28233	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29345441
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560	NC_004663	ATC	2	6	28333	28338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345441
561	NC_004663	CCG	2	6	28339	28344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345441
562	NC_004663	TGATA	2	10	28349	28358	40 %	40 %	20 %	0 %	29345441
563	NC_004663	A	7	7	28410	28416	100 %	0 %	0 %	0 %	29345441
564	NC_004663	TTA	2	6	28492	28497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345441
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566	NC_004663	ATC	2	6	28642	28647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345441
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570	NC_004663	AT	3	6	28832	28837	50 %	50 %	0 %	0 %	29345441
571	NC_004663	GA	3	6	28901	28906	50 %	0 %	50 %	0 %	29345441
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574	NC_004663	ATA	2	6	29023	29028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345441
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579	NC_004663	AATA	2	8	29220	29227	75 %	25 %	0 %	0 %	29345442
580	NC_004663	T	6	6	29233	29238	0 %	100 %	0 %	0 %	29345442
581	NC_004663	T	6	6	29255	29260	0 %	100 %	0 %	0 %	29345442
582	NC_004663	TCTT	2	8	29322	29329	0 %	75 %	0 %	25 %	29345442
583	NC_004663	AT	3	6	29365	29370	50 %	50 %	0 %	0 %	29345442
584	NC_004663	TC	3	6	29555	29560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_004663	AAG	2	6	29561	29566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_004663	TCAT	2	8	29625	29632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_004663	TTA	2	6	29633	29638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_004663	GTC	2	6	29653	29658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_004663	ATT	2	6	29683	29688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345443
590	NC_004663	TG	3	6	29714	29719	0 %	50 %	50 %	0 %	29345443
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593	NC_004663	TG	3	6	29794	29799	0 %	50 %	50 %	0 %	29345443
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598	NC_004663	ATTGA	2	10	29941	29950	40 %	40 %	20 %	0 %	29345443
599	NC_004663	AGTT	2	8	30051	30058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004663	T	6	6	30061	30066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004663	CTAAA	2	10	30120	30129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_004663	A	6	6	30148	30153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004663	A	6	6	30200	30205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004663	CT	3	6	30249	30254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_004663	TCT	2	6	30293	30298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345444
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611	NC_004663	AGAT	2	8	31059	31066	50 %	25 %	25 %	0 %	29345444
612	NC_004663	CAA	3	9	31142	31150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345444
613	NC_004663	AAT	2	6	31199	31204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345444
614	NC_004663	TA	3	6	31232	31237	50 %	50 %	0 %	0 %	29345444
615	NC_004663	CTTC	2	8	31242	31249	0 %	50 %	0 %	50 %	29345444
616	NC_004663	GCC	2	6	31265	31270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345444
617	NC_004663	GGAA	2	8	31333	31340	50 %	0 %	50 %	0 %	29345444
618	NC_004663	ACA	2	6	31357	31362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345444
619	NC_004663	ATAC	2	8	31427	31434	50 %	25 %	0 %	25 %	29345444
620	NC_004663	GAAAA	2	10	31466	31475	80 %	0 %	20 %	0 %	29345444
621	NC_004663	AAAG	2	8	31476	31483	75 %	0 %	25 %	0 %	29345444
622	NC_004663	GCA	2	6	31484	31489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345444
623	NC_004663	AGAGG	2	10	31514	31523	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004663	A	7	7	31538	31544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004663	AT	3	6	31546	31551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004663	TGGG	2	8	31562	31569	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004663	A	6	6	31573	31578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004663	AAT	2	6	31591	31596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004663	AGA	2	6	31613	31618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_004663	A	6	6	31635	31640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_004663	GTAAA	2	10	31658	31667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004663	AGA	2	6	31684	31689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_004663	TCAT	2	8	31771	31778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_004663	TTA	2	6	31787	31792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004663	T	6	6	31879	31884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004663	TTAC	2	8	31901	31908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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