MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM400

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004604	TTCCT	2	10	85	94	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_004604	TTTTC	2	10	457	466	0 %	80 %	0 %	20 %	294663010
3	NC_004604	TTGTA	2	10	572	581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004604	AAATA	2	10	936	945	80 %	20 %	0 %	0 %	294663012
5	NC_004604	ATTGA	2	10	1377	1386	40 %	40 %	20 %	0 %	294663013
6	NC_004604	TTTTA	2	10	2020	2029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004604	ATCCA	2	10	2372	2381	40 %	20 %	0 %	40 %	28894898
8	NC_004604	GAAGC	2	10	3877	3886	40 %	0 %	40 %	20 %	28894901
9	NC_004604	TCTCT	2	10	5154	5163	0 %	60 %	0 %	40 %	294663014
10	NC_004604	TTTTC	2	10	5273	5282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_004604	TTCTA	2	10	10027	10036	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_004604	TCTTA	2	10	14479	14488	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004604	ACTAA	2	10	14713	14722	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004604	TGTTT	2	10	14981	14990	0 %	80 %	20 %	0 %	294663019
15	NC_004604	AAAGA	2	10	16954	16963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004604	TTTGG	2	10	18765	18774	0 %	60 %	40 %	0 %	294663022
17	NC_004604	AATTA	2	10	18848	18857	60 %	40 %	0 %	0 %	294663022
18	NC_004604	CTAAA	2	10	18946	18955	60 %	20 %	0 %	20 %	294663022
19	NC_004604	AACTG	2	10	19471	19480	40 %	20 %	20 %	20 %	294663022
20	NC_004604	AATAA	2	10	21763	21772	80 %	20 %	0 %	0 %	294663025
21	NC_004604	ACCCA	2	10	22781	22790	40 %	0 %	0 %	60 %	294663026
22	NC_004604	ATCTG	2	10	23235	23244	20 %	40 %	20 %	20 %	294663026
23	NC_004604	AGGTT	2	10	24911	24920	20 %	40 %	40 %	0 %	294663028
24	NC_004604	CTTTG	2	10	26463	26472	0 %	60 %	20 %	20 %	294663031
25	NC_004604	TTTTC	2	10	27474	27483	0 %	80 %	0 %	20 %	28894881
26	NC_004604	TAATA	2	10	28968	28977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004604	TTTAT	2	10	31807	31816	20 %	80 %	0 %	0 %	294663036
28	NC_004604	AAAAG	2	10	33863	33872	80 %	0 %	20 %	0 %	294663038
29	NC_004604	CAATA	2	10	35628	35637	60 %	20 %	0 %	20 %	28894886
30	NC_004604	TTTCA	2	10	37421	37430	20 %	60 %	0 %	20 %	294663041
31	NC_004604	ACTTA	2	10	39463	39472	40 %	40 %	0 %	20 %	294663044
32	NC_004604	TTCAA	2	10	39856	39865	40 %	40 %	0 %	20 %	294663045
33	NC_004604	TTTTC	2	10	39937	39946	0 %	80 %	0 %	20 %	294663045
34	NC_004604	TTATT	2	10	40427	40436	20 %	80 %	0 %	0 %	294663045
35	NC_004604	AAATT	2	10	40863	40872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004604	CATCA	2	10	40948	40957	40 %	20 %	0 %	40 %	294663046
37	NC_004604	TGATT	2	10	50972	50981	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004604	CACGA	2	10	51618	51627	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.