MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae) plasmid pBBp1

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004555	CAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28191367
2	NC_004555	ATG	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28191367
3	NC_004555	TAG	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28191367
4	NC_004555	TAT	2	6	170	175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191367
5	NC_004555	TAG	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28191367
6	NC_004555	TCA	2	6	331	336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28191367
7	NC_004555	TCT	2	6	349	354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28191367
8	NC_004555	TTA	3	9	556	564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191368
9	NC_004555	TAA	2	6	614	619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191368
10	NC_004555	AAT	2	6	815	820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191368
11	NC_004555	GAA	2	6	854	859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28191368
12	NC_004555	CAA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28191368
13	NC_004555	ATA	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191368
14	NC_004555	ATT	2	6	1046	1051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191368
15	NC_004555	TTC	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28191368
16	NC_004555	TAA	2	6	1189	1194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191368
17	NC_004555	GTA	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004555	ATA	2	6	1398	1403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
19	NC_004555	CTC	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28191366
20	NC_004555	AGA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28191366
21	NC_004555	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28191366
22	NC_004555	TAT	2	6	1546	1551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191366
23	NC_004555	GTT	2	6	1803	1808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28191366
24	NC_004555	AAT	2	6	1819	1824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
25	NC_004555	AAT	2	6	1877	1882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
26	NC_004555	GGT	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28191366
27	NC_004555	TAA	2	6	1987	1992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
28	NC_004555	AAT	2	6	2009	2014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28191366
29	NC_004555	TTA	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28191366
30	NC_004555	AGA	2	6	2222	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28191366
31	NC_004555	TAT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.