MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae) chromosome

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004545	ATTTTT	2	12	2511	2522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004545	TTTTAT	2	12	3435	3446	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904515
3	NC_004545	AAATTA	2	12	4099	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904517
4	NC_004545	GAAAAA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	27904517
5	NC_004545	AATTGT	2	12	5604	5615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904519
6	NC_004545	TGCTTC	2	12	5616	5627	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	27904519
7	NC_004545	AAAACA	2	12	6234	6245	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27904519
8	NC_004545	TTTAGA	2	12	9092	9103	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904522
9	NC_004545	AACTCC	2	12	11452	11463	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	27904523
10	NC_004545	AAGTAT	2	12	11793	11804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904523
11	NC_004545	TCTTGA	2	12	12100	12111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	27904524
12	NC_004545	ATTTTA	2	12	12154	12165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904524
13	NC_004545	AAGTTA	2	12	12974	12985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904524
14	NC_004545	TTTAAT	2	12	15422	15433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904528
15	NC_004545	TAAAAG	2	12	15626	15637	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27904528
16	NC_004545	TAAGTA	2	12	17322	17333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004545	TTTAAG	2	12	20185	20196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004545	TAAATT	2	12	22529	22540	50 %	50 %	0 %	0 %	27904534
19	NC_004545	TTAACT	2	12	25598	25609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904538
20	NC_004545	ATTTAA	2	12	25797	25808	50 %	50 %	0 %	0 %	27904538
21	NC_004545	ATATAA	2	12	26562	26573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004545	GAATTA	2	12	27128	27139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904539
23	NC_004545	TTTTAA	2	12	27990	28001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904540
24	NC_004545	ATGTTA	2	12	31700	31711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904542
25	NC_004545	ATTTAG	2	12	32970	32981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904543
26	NC_004545	AAACAA	2	12	33431	33442	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27904543
27	NC_004545	CTCTTC	2	12	41450	41461	0 %	50 %	0 %	50 %	27904546
28	NC_004545	TTTAAC	2	12	42803	42814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904547
29	NC_004545	ACTTTA	2	12	43505	43516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904547
30	NC_004545	TGAATA	2	12	44009	44020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904547
31	NC_004545	TAATAT	2	12	45546	45557	50 %	50 %	0 %	0 %	27904547
32	NC_004545	TTTATT	2	12	46600	46611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004545	TATTAA	2	12	51512	51523	50 %	50 %	0 %	0 %	27904554
34	NC_004545	TTAATT	2	12	52543	52554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004545	CTGATG	2	12	54905	54916	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	27904556
36	NC_004545	CTTTTT	2	12	55597	55608	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904557
37	NC_004545	ATAGTT	2	12	56964	56975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904558
38	NC_004545	TTCTTT	2	12	57654	57665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904559
39	NC_004545	GTTTAG	2	12	61345	61356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27904561
40	NC_004545	TTTTTA	2	12	62206	62217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004545	AAATTA	2	12	63573	63584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904563
42	NC_004545	AAATAT	2	12	63615	63626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904563
43	NC_004545	AGATAT	2	12	65454	65465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904565
44	NC_004545	TTAATA	2	12	66383	66394	50 %	50 %	0 %	0 %	27904566
45	NC_004545	TTTTTA	2	12	67377	67388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904567
46	NC_004545	TAAAAA	2	12	69807	69818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004545	TAAAAT	2	12	72092	72103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904570
48	NC_004545	ATTTAT	2	12	73418	73429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004545	TTTAGA	2	12	74682	74693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904571
50	NC_004545	TAAATT	2	12	75106	75117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004545	AATAGA	2	12	75259	75270	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27904572
52	NC_004545	TAAAAA	2	12	77184	77195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904573
53	NC_004545	ATCATT	2	12	78658	78669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904575
54	NC_004545	TAAGAA	2	12	80978	80989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27904578
55	NC_004545	TATAAT	2	12	81906	81917	50 %	50 %	0 %	0 %	27904578
56	NC_004545	TTTTTA	2	12	82003	82014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004545	TTTAAT	2	12	84983	84994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904583
58	NC_004545	ATTTTA	2	12	86116	86127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004545	TAGAAT	2	12	87290	87301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904586
60	NC_004545	ATTAAT	2	12	87769	87780	50 %	50 %	0 %	0 %	27904586
61	NC_004545	AAATTT	2	12	89680	89691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004545	AGATTT	2	12	90896	90907	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904588
63	NC_004545	GATTGG	2	12	90915	90926	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	27904588
64	NC_004545	TTTTTC	2	12	91142	91153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904588
65	NC_004545	CTAATT	2	12	92202	92213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_004545	TGTTAA	2	12	94572	94583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904590
67	NC_004545	GTTTTG	2	12	94698	94709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27904590
68	NC_004545	TAAATC	2	12	95928	95939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27904591
69	NC_004545	AATCTA	2	12	99301	99312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27904593
70	NC_004545	TAAGAT	2	12	99788	99799	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004545	AATTAT	2	12	101070	101081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004545	TAATTG	2	12	101573	101584	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904595
73	NC_004545	ATTAAA	2	12	103099	103110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904596
74	NC_004545	TCATTA	2	12	103134	103145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904596
75	NC_004545	ATCAAG	2	12	103286	103297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27904596
76	NC_004545	CATGGA	2	12	103366	103377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27904596
77	NC_004545	TTAGTT	2	12	103503	103514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904596
78	NC_004545	GAAGTT	2	12	104545	104556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27904597
79	NC_004545	ATTTAA	2	12	106607	106618	50 %	50 %	0 %	0 %	27904599
80	NC_004545	TCTAAT	2	12	106882	106893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904599
81	NC_004545	ATTTTT	3	18	112639	112656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004545	TAAAAA	2	12	112971	112982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904606
83	NC_004545	TTAAAT	2	12	113602	113613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004545	AAAATA	2	12	117342	117353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904609
85	NC_004545	ATTTTT	2	12	117539	117550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904609
86	NC_004545	TAAAAT	2	12	119342	119353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004545	TTGTTT	2	12	119615	119626	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27904611
88	NC_004545	AATTTT	2	12	121667	121678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904613
89	NC_004545	GGTTTA	2	12	124083	124094	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27904616
90	NC_004545	TAGGTT	2	12	124366	124377	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	27904616
91	NC_004545	TTTTTA	2	12	127851	127862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904620
92	NC_004545	ATAGTT	2	12	132563	132574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904622
93	NC_004545	TAAAGT	2	12	132969	132980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904623
94	NC_004545	ATAGCT	2	12	135250	135261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904627
95	NC_004545	ATATTA	2	12	135566	135577	50 %	50 %	0 %	0 %	27904627
96	NC_004545	AAAAAC	2	12	136301	136312	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	27904627
97	NC_004545	ATATTT	2	12	137440	137451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004545	TGCTAA	2	12	138864	138875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904629
99	NC_004545	GCTATA	2	12	138943	138954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904629
100	NC_004545	TTTTTA	2	12	139499	139510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	27904629
101	NC_004545	TTTCTA	2	12	140198	140209	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27904629
102	NC_004545	AAATAA	2	12	144114	144125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004545	TGTTTT	2	12	152603	152614	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27904640
104	NC_004545	TTTTAA	2	12	152784	152795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904640
105	NC_004545	ATATTG	2	12	155179	155190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904642
106	NC_004545	TTTTTA	2	12	156770	156781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004545	ATTTGT	2	12	157936	157947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904644
108	NC_004545	CTACTG	2	12	159387	159398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	27904645
109	NC_004545	TCATTA	2	12	160367	160378	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	27904645
110	NC_004545	CTTGTT	2	12	160645	160656	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_004545	TAAACA	2	12	160665	160676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_004545	TTGTAT	2	12	161020	161031	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904646
113	NC_004545	ATTTTG	2	12	163313	163324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904648
114	NC_004545	TTAAAT	2	12	163800	163811	50 %	50 %	0 %	0 %	27904649
115	NC_004545	CAATTC	2	12	165546	165557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904650
116	NC_004545	TTTTAG	2	12	167777	167788	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904651
117	NC_004545	AATATA	2	12	167889	167900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904651
118	NC_004545	TTTTCT	2	12	167937	167948	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904651
119	NC_004545	GTCATC	2	12	169071	169082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	27904652
120	NC_004545	ACCTAG	2	12	169318	169329	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27904652
121	NC_004545	CATTAA	2	12	169371	169382	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27904652
122	NC_004545	ATTTTA	2	12	171076	171087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904656
123	NC_004545	TTAATA	2	12	172233	172244	50 %	50 %	0 %	0 %	27904656
124	NC_004545	TAGTAT	2	12	173400	173411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	27904657
125	NC_004545	CAGGAA	2	12	174027	174038	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	27904657
126	NC_004545	TTCTAT	2	12	176260	176271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	27904659
127	NC_004545	ATATAG	2	12	177493	177504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904660
128	NC_004545	TAAATT	2	12	180204	180215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004545	ATGTCT	2	12	180782	180793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_004545	CAATGG	2	12	184184	184195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27904665
131	NC_004545	GTAAAT	2	12	184708	184719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004545	TATTTT	2	12	184847	184858	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004545	TATTAA	2	12	186233	186244	50 %	50 %	0 %	0 %	27904666
134	NC_004545	AAATAT	2	12	186865	186876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904667
135	NC_004545	TGCAAA	2	12	189350	189361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27904669
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138	NC_004545	TTTAAT	2	12	195335	195346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004545	ATAGTA	2	12	205142	205153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904682
140	NC_004545	TCCAGA	2	12	205681	205692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27904683
141	NC_004545	AATAGA	2	12	207614	207625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	27904684
142	NC_004545	TATGTA	2	12	209313	209324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004545	TATATT	2	12	211609	211620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904687
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146	NC_004545	TAAAAA	2	12	215209	215220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	27904688
147	NC_004545	TAGAAT	2	12	216345	216356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	27904688
148	NC_004545	GTATAT	2	12	217409	217420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004545	TTGTAT	2	12	218864	218875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004545	GGATCT	2	12	221352	221363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	27904690
151	NC_004545	TACTGG	2	12	222249	222260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	27904691
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154	NC_004545	TATTGT	2	12	226162	226173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	27904695
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157	NC_004545	TACGTA	2	12	228072	228083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	27904696
158	NC_004545	CCTATA	2	12	228323	228334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27904696
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161	NC_004545	TAATAT	2	12	232156	232167	50 %	50 %	0 %	0 %	27904699
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164	NC_004545	ATTTAA	2	12	236850	236861	50 %	50 %	0 %	0 %	27904703
165	NC_004545	TATCTC	2	12	237633	237644	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	27904704
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172	NC_004545	TCTGTT	2	12	244800	244811	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	27904710
173	NC_004545	TTTTTA	2	12	245906	245917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_004545	TATTTA	2	12	249568	249579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27904714
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179	NC_004545	TTTTAA	2	12	254931	254942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_004545	ATTATA	2	12	256590	256601	50 %	50 %	0 %	0 %	27904720
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192	NC_004545	TCGTTT	2	12	286354	286365	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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219	NC_004545	AATATT	2	12	333830	333841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_004545	TTTATC	2	12	334059	334070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	161511183
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229	NC_004545	AAAAAT	2	12	350796	350807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_004545	AAGCAG	2	12	351366	351377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	27904793
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232	NC_004545	TTTAAA	2	12	352218	352229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_004545	TTTTTC	2	12	352727	352738	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	27904794
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238	NC_004545	ATTAAC	2	12	357724	357735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	27904799
239	NC_004545	TAAAAT	2	12	358531	358542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_004545	TAATAT	2	12	359343	359354	50 %	50 %	0 %	0 %	27904800
241	NC_004545	ATATTA	2	12	361611	361622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_004545	AATTAA	2	12	361630	361641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_004545	TAAAAT	2	12	361878	361889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_004545	AGAATT	2	12	363586	363597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161511182
245	NC_004545	ACAAAA	2	12	363663	363674	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	161511182
246	NC_004545	AAACAA	2	12	364012	364023	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	161511182
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248	NC_004545	AATATA	2	12	365856	365867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_004545	AAATTA	2	12	369844	369855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_004545	AAATTA	2	12	370341	370352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27904809
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253	NC_004545	CATAAT	2	12	373524	373535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_004545	ATTTAA	2	12	374532	374543	50 %	50 %	0 %	0 %	27904814
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261	NC_004545	AAATTT	2	12	387644	387655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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368	NC_004545	GTTTTT	2	12	525435	525446	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	27904936
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.