MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004463	CGCTCA	2	12	164240	164251	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27375278
4002	NC_004463	CTTTT	2	10	164255	164264	0 %	80 %	0 %	20 %	27375278
4003	NC_004463	CG	5	10	164343	164352	0 %	0 %	50 %	50 %	27375278
4004	NC_004463	GTC	2	6	164383	164388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375278
4005	NC_004463	ACCG	2	8	164468	164475	25 %	0 %	25 %	50 %	27375278
4006	NC_004463	GAA	2	6	164637	164642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_004463	CTGC	2	8	164670	164677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_004463	GCA	2	6	164740	164745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375279
4009	NC_004463	CGG	2	6	164753	164758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375279
4010	NC_004463	CG	3	6	164777	164782	0 %	0 %	50 %	50 %	27375279
4011	NC_004463	CGCGG	2	10	164792	164801	0 %	0 %	60 %	40 %	27375279
4012	NC_004463	GCT	2	6	164842	164847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375279
4013	NC_004463	CGA	2	6	164968	164973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375279
4014	NC_004463	GCT	2	6	164978	164983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375279
4015	NC_004463	CGC	2	6	165030	165035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_004463	GCC	2	6	165047	165052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_004463	CGT	2	6	165073	165078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_004463	CGTT	2	8	165156	165163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_004463	TCGGT	2	10	165173	165182	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4020	NC_004463	GAC	2	6	165208	165213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_004463	GCG	2	6	165242	165247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_004463	CCGG	2	8	165250	165257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_004463	GCC	2	6	165267	165272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_004463	TCG	2	6	165309	165314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375280
4025	NC_004463	GC	3	6	165331	165336	0 %	0 %	50 %	50 %	27375280
4026	NC_004463	GGC	2	6	165365	165370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375280
4027	NC_004463	GC	3	6	165389	165394	0 %	0 %	50 %	50 %	27375280
4028	NC_004463	TCA	2	6	165433	165438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375280
4029	NC_004463	CTCGCG	2	12	165458	165469	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	27375280
4030	NC_004463	GC	3	6	165502	165507	0 %	0 %	50 %	50 %	27375280
4031	NC_004463	GGTC	2	8	165514	165521	0 %	25 %	50 %	25 %	27375280
4032	NC_004463	GGC	2	6	165530	165535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375280
4033	NC_004463	GTCA	2	8	165569	165576	25 %	25 %	25 %	25 %	27375280
4034	NC_004463	ACA	2	6	165659	165664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375281
4035	NC_004463	GGCA	2	8	165693	165700	25 %	0 %	50 %	25 %	27375281
4036	NC_004463	TGG	2	6	165710	165715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375281
4037	NC_004463	GCG	2	6	165720	165725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375281
4038	NC_004463	ATC	2	6	165751	165756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375281
4039	NC_004463	TCG	2	6	165760	165765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375281
4040	NC_004463	GAC	2	6	165768	165773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375281
4041	NC_004463	GCA	2	6	165791	165796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375281
4042	NC_004463	TCG	2	6	165846	165851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375281
4043	NC_004463	GCCT	2	8	165871	165878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_004463	GCGA	2	8	165883	165890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_004463	TCG	2	6	165952	165957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_004463	CCGCG	2	10	165958	165967	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4047	NC_004463	CG	4	8	165964	165971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_004463	GCTC	2	8	166061	166068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_004463	CCG	2	6	166125	166130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_004463	GCG	2	6	166257	166262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375282
4051	NC_004463	GCT	2	6	166380	166385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375282
4052	NC_004463	CGC	2	6	166418	166423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375282
4053	NC_004463	TGC	2	6	166433	166438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375282
4054	NC_004463	CGA	2	6	166443	166448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375282
4055	NC_004463	AAG	2	6	166522	166527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375282
4056	NC_004463	GAA	2	6	166530	166535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375282
4057	NC_004463	CGC	2	6	166554	166559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375282
4058	NC_004463	GAA	3	9	166608	166616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375282
4059	NC_004463	CTT	2	6	166623	166628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_004463	GCA	2	6	166666	166671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_004463	ACC	3	9	166777	166785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375283
4062	NC_004463	T	6	6	166804	166809	0 %	100 %	0 %	0 %	27375283
4063	NC_004463	GAACC	2	10	166867	166876	40 %	0 %	20 %	40 %	27375283
4064	NC_004463	CTG	2	6	166904	166909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375283
4065	NC_004463	CTGC	2	8	166967	166974	0 %	25 %	25 %	50 %	27375283
4066	NC_004463	CGA	2	6	167044	167049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375283
4067	NC_004463	CG	3	6	167191	167196	0 %	0 %	50 %	50 %	27375283
4068	NC_004463	TCG	2	6	167284	167289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375283
4069	NC_004463	CGA	3	9	167354	167362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375283
4070	NC_004463	CGC	2	6	167393	167398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375283
4071	NC_004463	CG	3	6	167405	167410	0 %	0 %	50 %	50 %	27375283
4072	NC_004463	CCT	2	6	167416	167421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375283
4073	NC_004463	CCAT	2	8	167434	167441	25 %	25 %	0 %	50 %	27375283
4074	NC_004463	GAG	2	6	167514	167519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375283
4075	NC_004463	GCGATC	2	12	167565	167576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27375283
4076	NC_004463	GCG	2	6	167582	167587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375283
4077	NC_004463	CGA	2	6	167651	167656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375283
4078	NC_004463	AAG	2	6	167658	167663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375283
4079	NC_004463	CAT	2	6	167675	167680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375283
4080	NC_004463	CGG	3	9	167714	167722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375283
4081	NC_004463	GCG	2	6	167740	167745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375283
4082	NC_004463	GAT	2	6	167768	167773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375283
4083	NC_004463	CGA	2	6	167774	167779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375283
4084	NC_004463	GCC	2	6	167870	167875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375283
4085	NC_004463	CGG	2	6	167917	167922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375283
4086	NC_004463	GGC	2	6	167926	167931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375283
4087	NC_004463	GC	3	6	168037	168042	0 %	0 %	50 %	50 %	27375283
4088	NC_004463	GTG	2	6	168057	168062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375283
4089	NC_004463	CCGG	2	8	168089	168096	0 %	0 %	50 %	50 %	27375283
4090	NC_004463	GCC	2	6	168137	168142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375283
4091	NC_004463	CGG	2	6	168157	168162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375283
4092	NC_004463	CGG	2	6	168206	168211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_004463	CCG	2	6	168242	168247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_004463	CGC	2	6	168259	168264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_004463	ACC	2	6	168335	168340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_004463	GGA	2	6	168359	168364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_004463	ATC	2	6	168434	168439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375284
4098	NC_004463	CG	4	8	168447	168454	0 %	0 %	50 %	50 %	27375284
4099	NC_004463	CGG	2	6	168490	168495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375284
4100	NC_004463	CGG	2	6	168511	168516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375284
4101	NC_004463	GCT	2	6	168544	168549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375284
4102	NC_004463	AAG	2	6	168563	168568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375284
4103	NC_004463	GTG	2	6	168608	168613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375284
4104	NC_004463	GCC	2	6	168627	168632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_004463	CT	3	6	168640	168645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_004463	CTCG	2	8	168656	168663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_004463	TCG	2	6	168665	168670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_004463	GAC	2	6	168788	168793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_004463	GCG	2	6	168804	168809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_004463	CGA	2	6	168849	168854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375285
4111	NC_004463	CGC	2	6	168867	168872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375285
4112	NC_004463	AG	4	8	168887	168894	50 %	0 %	50 %	0 %	27375285
4113	NC_004463	CCAGG	2	10	168901	168910	20 %	0 %	40 %	40 %	27375285
4114	NC_004463	GCA	2	6	168924	168929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375285
4115	NC_004463	TCG	2	6	169022	169027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375285
4116	NC_004463	GCG	2	6	169038	169043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375285
4117	NC_004463	CAT	2	6	169081	169086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375285
4118	NC_004463	CAG	3	9	169087	169095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375285
4119	NC_004463	GTG	2	6	169106	169111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375285
4120	NC_004463	CGA	2	6	169143	169148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375285
4121	NC_004463	CGC	2	6	169159	169164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375285
4122	NC_004463	AGC	2	6	169201	169206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375285
4123	NC_004463	GAG	2	6	169311	169316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_004463	CGT	2	6	169412	169417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375286
4125	NC_004463	GCG	2	6	169465	169470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375286
4126	NC_004463	CGC	2	6	169483	169488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375286
4127	NC_004463	GCG	2	6	169500	169505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375286
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4130	NC_004463	CGG	2	6	169641	169646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375286
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4231	NC_004463	CGG	2	6	172966	172971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375289
4232	NC_004463	GCCC	2	8	172993	173000	0 %	0 %	25 %	75 %	27375289
4233	NC_004463	GC	3	6	173007	173012	0 %	0 %	50 %	50 %	27375289
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4243	NC_004463	CTG	2	6	173273	173278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375289
4244	NC_004463	GGCG	2	8	173311	173318	0 %	0 %	75 %	25 %	27375289
4245	NC_004463	GCT	2	6	173341	173346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375289
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4497	NC_004463	CGG	2	6	183369	183374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375299
4498	NC_004463	CGGCG	2	10	183393	183402	0 %	0 %	60 %	40 %	27375299
4499	NC_004463	ATG	2	6	183416	183421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375299
4500	NC_004463	CGT	2	6	183423	183428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375299

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