MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004463	CGG	2	6	145195	145200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375259
3502	NC_004463	TGC	2	6	145276	145281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_004463	GCT	2	6	145359	145364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3504	NC_004463	CGT	2	6	145398	145403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3505	NC_004463	CAG	2	6	145432	145437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3506	NC_004463	TCA	2	6	145448	145453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375260
3507	NC_004463	TCG	2	6	145478	145483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3508	NC_004463	GCT	2	6	145605	145610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3509	NC_004463	ATC	2	6	145612	145617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375260
3510	NC_004463	GC	3	6	145628	145633	0 %	0 %	50 %	50 %	27375260
3511	NC_004463	CGT	2	6	145734	145739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3512	NC_004463	GGC	2	6	145803	145808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375260
3513	NC_004463	CCT	2	6	145844	145849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375260
3514	NC_004463	TGA	2	6	145853	145858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375260
3515	NC_004463	CGT	2	6	145929	145934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3516	NC_004463	GCG	2	6	145976	145981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375260
3517	NC_004463	CGA	2	6	146019	146024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3518	NC_004463	CCG	2	6	146060	146065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375260
3519	NC_004463	GCTC	2	8	146069	146076	0 %	25 %	25 %	50 %	27375260
3520	NC_004463	GCG	2	6	146127	146132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375260
3521	NC_004463	GAT	2	6	146211	146216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375260
3522	NC_004463	AAC	2	6	146257	146262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375260
3523	NC_004463	TCG	2	6	146327	146332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375260
3524	NC_004463	ACC	2	6	146368	146373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375260
3525	NC_004463	GCCG	2	8	146388	146395	0 %	0 %	50 %	50 %	27375260
3526	NC_004463	CGC	2	6	146402	146407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375260
3527	NC_004463	CGC	2	6	146441	146446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375260
3528	NC_004463	CTT	2	6	146460	146465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375260
3529	NC_004463	AG	3	6	146497	146502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_004463	TCT	2	6	146519	146524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3531	NC_004463	CGGC	2	8	146537	146544	0 %	0 %	50 %	50 %	27375261
3532	NC_004463	CACTGC	2	12	146557	146568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27375261
3533	NC_004463	TCG	3	9	146578	146586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3534	NC_004463	GTG	2	6	146595	146600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375261
3535	NC_004463	CGG	2	6	146609	146614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3536	NC_004463	GCT	2	6	146621	146626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3537	NC_004463	CGG	2	6	146627	146632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3538	NC_004463	CAC	2	6	146678	146683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375261
3539	NC_004463	CAT	2	6	146705	146710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375261
3540	NC_004463	TGC	3	9	146734	146742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3541	NC_004463	TGA	2	6	146761	146766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3542	NC_004463	CAG	2	6	146775	146780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3543	NC_004463	CGG	2	6	146792	146797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3544	NC_004463	TCT	2	6	146863	146868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3545	NC_004463	TGA	2	6	146896	146901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3546	NC_004463	CGT	2	6	146906	146911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3547	NC_004463	GC	4	8	146926	146933	0 %	0 %	50 %	50 %	27375261
3548	NC_004463	CGTTCC	2	12	146941	146952	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	27375261
3549	NC_004463	CGG	2	6	146981	146986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3550	NC_004463	GGCT	2	8	147036	147043	0 %	25 %	50 %	25 %	27375261
3551	NC_004463	CCG	2	6	147051	147056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375261
3552	NC_004463	ACG	2	6	147132	147137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3553	NC_004463	ATG	2	6	147195	147200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3554	NC_004463	TCG	2	6	147247	147252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3555	NC_004463	CCT	2	6	147253	147258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375261
3556	NC_004463	CGT	2	6	147272	147277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3557	NC_004463	GCT	2	6	147284	147289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3558	NC_004463	CTCG	2	8	147290	147297	0 %	25 %	25 %	50 %	27375261
3559	NC_004463	CTT	2	6	147317	147322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3560	NC_004463	ACGA	2	8	147324	147331	50 %	0 %	25 %	25 %	27375261
3561	NC_004463	CGG	2	6	147335	147340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3562	NC_004463	GAT	2	6	147347	147352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3563	NC_004463	GATCTG	2	12	147365	147376	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	27375261
3564	NC_004463	TCT	2	6	147421	147426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3565	NC_004463	GGT	2	6	147491	147496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375261
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3567	NC_004463	TTC	2	6	147534	147539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3568	NC_004463	TTC	2	6	147570	147575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3569	NC_004463	CAC	2	6	147581	147586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375261
3570	NC_004463	GAT	2	6	147587	147592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3571	NC_004463	GAT	2	6	147671	147676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3572	NC_004463	CGG	2	6	147710	147715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3573	NC_004463	CTG	2	6	147729	147734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3574	NC_004463	GCC	2	6	147740	147745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375261
3575	NC_004463	TGC	2	6	147757	147762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3576	NC_004463	ACA	2	6	147763	147768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375261
3577	NC_004463	ATC	2	6	147801	147806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375261
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3579	NC_004463	GTG	2	6	147813	147818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375261
3580	NC_004463	ATT	2	6	147841	147846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27375261
3581	NC_004463	GTTCTG	2	12	147899	147910	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	27375261
3582	NC_004463	GTC	2	6	147912	147917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
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3587	NC_004463	CG	3	6	148136	148141	0 %	0 %	50 %	50 %	27375261
3588	NC_004463	CCT	2	6	148159	148164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375261
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3591	NC_004463	GTG	2	6	148220	148225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375261
3592	NC_004463	GAA	2	6	148232	148237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375261
3593	NC_004463	AGC	2	6	148287	148292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3594	NC_004463	ATC	2	6	148305	148310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375261
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3601	NC_004463	CTCG	2	8	148592	148599	0 %	25 %	25 %	50 %	27375262
3602	NC_004463	TGA	2	6	148615	148620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375262
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3605	NC_004463	TCGACC	2	12	148708	148719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27375262
3606	NC_004463	TGC	3	9	148741	148749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375262
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3609	NC_004463	CGCAGA	2	12	148804	148815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375262
3610	NC_004463	TGGC	2	8	148818	148825	0 %	25 %	50 %	25 %	27375262
3611	NC_004463	GCC	2	6	148845	148850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375262
3612	NC_004463	CAGCG	2	10	148908	148917	20 %	0 %	40 %	40 %	27375262
3613	NC_004463	CTT	2	6	148931	148936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375262
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3618	NC_004463	GAC	2	6	149177	149182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375263
3619	NC_004463	GGT	2	6	149233	149238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375263
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3621	NC_004463	TGA	2	6	149265	149270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375263
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3740	NC_004463	GC	3	6	153448	153453	0 %	0 %	50 %	50 %	27375267
3741	NC_004463	CGAA	2	8	153602	153609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3742	NC_004463	CGG	2	6	153711	153716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375268
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3922	NC_004463	CTG	2	6	161606	161611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3985	NC_004463	CGA	2	6	163709	163714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3988	NC_004463	GC	3	6	163839	163844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3995	NC_004463	CG	3	6	164115	164120	0 %	0 %	50 %	50 %	27375278
3996	NC_004463	CCG	2	6	164133	164138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375278
3997	NC_004463	GA	3	6	164159	164164	50 %	0 %	50 %	0 %	27375278
3998	NC_004463	CGA	2	6	164169	164174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375278
3999	NC_004463	CGG	2	6	164190	164195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375278
4000	NC_004463	CTTG	2	8	164196	164203	0 %	50 %	25 %	25 %	27375278

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