MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004463	TCT	2	6	126950	126955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_004463	GGC	2	6	126957	126962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_004463	AGCCGG	2	12	126999	127010	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_004463	GCG	2	6	127023	127028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_004463	GGT	2	6	127136	127141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375243
3006	NC_004463	AGAT	2	8	127279	127286	50 %	25 %	25 %	0 %	27375243
3007	NC_004463	GCT	2	6	127307	127312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375243
3008	NC_004463	GCC	2	6	127318	127323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375243
3009	NC_004463	GCGTC	2	10	127325	127334	0 %	20 %	40 %	40 %	27375243
3010	NC_004463	GGC	2	6	127345	127350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375243
3011	NC_004463	GTT	2	6	127374	127379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375243
3012	NC_004463	CCGG	2	8	127412	127419	0 %	0 %	50 %	50 %	27375243
3013	NC_004463	CGA	2	6	127454	127459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375243
3014	NC_004463	CCG	3	9	127537	127545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375243
3015	NC_004463	GAG	2	6	127633	127638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375243
3016	NC_004463	CGC	2	6	127664	127669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375243
3017	NC_004463	CAGCG	2	10	127690	127699	20 %	0 %	40 %	40 %	27375243
3018	NC_004463	TCC	2	6	127702	127707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375243
3019	NC_004463	ATC	2	6	127756	127761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375243
3020	NC_004463	CGT	2	6	127775	127780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375243
3021	NC_004463	CGCC	2	8	127781	127788	0 %	0 %	25 %	75 %	27375243
3022	NC_004463	GTT	2	6	127800	127805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375243
3023	NC_004463	TCG	2	6	127822	127827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375243
3024	NC_004463	GCA	2	6	127847	127852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375243
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3026	NC_004463	GCC	2	6	127926	127931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375243
3027	NC_004463	A	6	6	128144	128149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_004463	CGT	2	6	128287	128292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375244
3029	NC_004463	GCG	2	6	128293	128298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375244
3030	NC_004463	TGC	2	6	128307	128312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375244
3031	NC_004463	T	6	6	128320	128325	0 %	100 %	0 %	0 %	27375244
3032	NC_004463	CTG	2	6	128326	128331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375244
3033	NC_004463	ACGC	2	8	128332	128339	25 %	0 %	25 %	50 %	27375244
3034	NC_004463	TGG	2	6	128356	128361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375244
3035	NC_004463	GC	4	8	128364	128371	0 %	0 %	50 %	50 %	27375244
3036	NC_004463	GCC	2	6	128398	128403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375244
3037	NC_004463	CGC	2	6	128470	128475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375244
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3041	NC_004463	CGA	2	6	128571	128576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375244
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3043	NC_004463	CG	3	6	128634	128639	0 %	0 %	50 %	50 %	27375244
3044	NC_004463	CAG	2	6	128641	128646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375244
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3057	NC_004463	GCT	2	6	129007	129012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_004463	TCT	2	6	129013	129018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_004463	TGC	2	6	129019	129024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_004463	ACC	2	6	129036	129041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_004463	CCG	2	6	129049	129054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_004463	CGG	2	6	129134	129139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_004463	CGC	2	6	129163	129168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_004463	ATC	2	6	129192	129197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3066	NC_004463	CG	3	6	129227	129232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_004463	CTG	2	6	129260	129265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375245
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3071	NC_004463	GC	3	6	129440	129445	0 %	0 %	50 %	50 %	27375245
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3088	NC_004463	CGGC	2	8	130167	130174	0 %	0 %	50 %	50 %	27375245
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3125	NC_004463	GC	3	6	131360	131365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_004463	CG	3	6	131368	131373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_004463	CGT	2	6	131427	131432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3154	NC_004463	TCG	3	9	132504	132512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375249
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3238	NC_004463	GC	3	6	135481	135486	0 %	0 %	50 %	50 %	27375251
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3242	NC_004463	CTT	2	6	135560	135565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_004463	TC	3	6	135615	135620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3244	NC_004463	CT	3	6	135630	135635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3245	NC_004463	GC	3	6	135645	135650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3246	NC_004463	GA	3	6	135652	135657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_004463	CGC	2	6	135673	135678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3248	NC_004463	CAC	2	6	135729	135734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375252
3249	NC_004463	GCCCT	2	10	135756	135765	0 %	20 %	20 %	60 %	27375252
3250	NC_004463	CG	3	6	135820	135825	0 %	0 %	50 %	50 %	27375252
3251	NC_004463	GCT	2	6	135880	135885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375252
3252	NC_004463	GCC	2	6	135910	135915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375252
3253	NC_004463	CCT	2	6	135941	135946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375252
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3258	NC_004463	CCGG	2	8	136118	136125	0 %	0 %	50 %	50 %	27375252
3259	NC_004463	GC	3	6	136131	136136	0 %	0 %	50 %	50 %	27375252
3260	NC_004463	CAG	2	6	136143	136148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375252
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3263	NC_004463	TCA	2	6	136244	136249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375252
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3265	NC_004463	GCA	2	6	136340	136345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375252
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3267	NC_004463	CG	3	6	136400	136405	0 %	0 %	50 %	50 %	27375252
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3275	NC_004463	GAC	2	6	136884	136889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375252
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3280	NC_004463	CTT	2	6	137094	137099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375252
3281	NC_004463	GC	3	6	137110	137115	0 %	0 %	50 %	50 %	27375252
3282	NC_004463	CGC	3	9	137118	137126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375252
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3285	NC_004463	GAC	2	6	137247	137252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375252
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3301	NC_004463	GCA	2	6	137729	137734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375252
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3309	NC_004463	CGGCC	2	10	137966	137975	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3310	NC_004463	CAG	2	6	138101	138106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375253
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3319	NC_004463	CG	3	6	138457	138462	0 %	0 %	50 %	50 %	27375253
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3321	NC_004463	GCGTTG	2	12	138525	138536	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	27375253
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3341	NC_004463	CG	3	6	139136	139141	0 %	0 %	50 %	50 %	27375254
3342	NC_004463	AGC	2	6	139148	139153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375254
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3351	NC_004463	CG	3	6	139486	139491	0 %	0 %	50 %	50 %	27375254
3352	NC_004463	CGC	2	6	139495	139500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375254
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3355	NC_004463	TTG	2	6	139629	139634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3356	NC_004463	TGT	2	6	139637	139642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3357	NC_004463	GC	3	6	139657	139662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3358	NC_004463	TTCGC	2	10	139725	139734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3359	NC_004463	CTT	2	6	139772	139777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375255
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3362	NC_004463	CTT	2	6	139880	139885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375255
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3364	NC_004463	TCA	2	6	139975	139980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375255
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3369	NC_004463	GC	3	6	140115	140120	0 %	0 %	50 %	50 %	27375255
3370	NC_004463	GTC	2	6	140123	140128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375255
3371	NC_004463	CAG	3	9	140156	140164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375255
3372	NC_004463	ATCGA	2	10	140187	140196	40 %	20 %	20 %	20 %	27375255
3373	NC_004463	GCG	2	6	140218	140223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375255
3374	NC_004463	GCC	2	6	140234	140239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375255
3375	NC_004463	GCC	2	6	140259	140264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375255
3376	NC_004463	CGC	2	6	140287	140292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375255
3377	NC_004463	CCTTGG	2	12	140314	140325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375255
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3379	NC_004463	CGC	2	6	140383	140388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375255
3380	NC_004463	GCC	2	6	140399	140404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375255
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3384	NC_004463	TGGCC	2	10	140521	140530	0 %	20 %	40 %	40 %	27375255
3385	NC_004463	ATG	2	6	140610	140615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375255
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3391	NC_004463	TTG	2	6	140742	140747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375255
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3398	NC_004463	GGC	2	6	141010	141015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3399	NC_004463	GCA	2	6	141072	141077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375256
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3403	NC_004463	TCG	2	6	141294	141299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375256
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3447	NC_004463	TCG	2	6	142906	142911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375257
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3468	NC_004463	CCA	2	6	143745	143750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3470	NC_004463	CGCC	2	8	143846	143853	0 %	0 %	25 %	75 %	27375259
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3484	NC_004463	GC	3	6	144429	144434	0 %	0 %	50 %	50 %	27375259
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3493	NC_004463	GCG	2	6	144629	144634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375259
3494	NC_004463	CAG	2	6	144693	144698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375259
3495	NC_004463	GCC	2	6	144720	144725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375259
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3497	NC_004463	CGC	2	6	144771	144776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375259
3498	NC_004463	GAA	2	6	145026	145031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375259
3499	NC_004463	GAA	2	6	145035	145040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375259
3500	NC_004463	GAT	2	6	145056	145061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375259

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