MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004463	CG	3	6	45917	45922	0 %	0 %	50 %	50 %	27375162
1002	NC_004463	GGC	2	6	45957	45962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375162
1003	NC_004463	GCC	2	6	46008	46013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375162
1004	NC_004463	GCG	2	6	46067	46072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375163
1005	NC_004463	GAG	2	6	46080	46085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375163
1006	NC_004463	GC	3	6	46086	46091	0 %	0 %	50 %	50 %	27375163
1007	NC_004463	ACGT	2	8	46244	46251	25 %	25 %	25 %	25 %	27375163
1008	NC_004463	C	6	6	46258	46263	0 %	0 %	0 %	100 %	27375163
1009	NC_004463	TCG	2	6	46265	46270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375163
1010	NC_004463	TAC	2	6	46291	46296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_004463	AACT	2	8	46305	46312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_004463	GCG	2	6	46424	46429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375164
1013	NC_004463	GCG	2	6	46457	46462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375164
1014	NC_004463	GCC	2	6	46508	46513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375164
1015	NC_004463	ACG	2	6	46570	46575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375164
1016	NC_004463	GCC	2	6	46587	46592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375164
1017	NC_004463	CGG	2	6	46687	46692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375164
1018	NC_004463	GC	3	6	46697	46702	0 %	0 %	50 %	50 %	27375164
1019	NC_004463	TCG	2	6	46710	46715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375164
1020	NC_004463	CGA	2	6	46786	46791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375164
1021	NC_004463	CGG	2	6	46841	46846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375164
1022	NC_004463	CGC	2	6	46991	46996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375164
1023	NC_004463	GC	3	6	46995	47000	0 %	0 %	50 %	50 %	27375164
1024	NC_004463	CGG	2	6	47029	47034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375164
1025	NC_004463	CGA	2	6	47047	47052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_004463	GTCT	2	8	47137	47144	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_004463	CAC	2	6	47170	47175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_004463	AGACC	2	10	47197	47206	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1029	NC_004463	CCA	2	6	47296	47301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375165
1030	NC_004463	CG	4	8	47307	47314	0 %	0 %	50 %	50 %	27375165
1031	NC_004463	CG	3	6	47356	47361	0 %	0 %	50 %	50 %	27375165
1032	NC_004463	ACC	2	6	47388	47393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375165
1033	NC_004463	CTC	2	6	47411	47416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375165
1034	NC_004463	CAA	2	6	47426	47431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375165
1035	NC_004463	GGC	2	6	47487	47492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375165
1036	NC_004463	GC	3	6	47506	47511	0 %	0 %	50 %	50 %	27375165
1037	NC_004463	ATCGC	2	10	47622	47631	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_004463	TTG	2	6	47742	47747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375166
1039	NC_004463	AGG	2	6	47760	47765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375166
1040	NC_004463	GAA	2	6	47800	47805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375166
1041	NC_004463	ACG	2	6	47954	47959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375166
1042	NC_004463	CGT	2	6	48018	48023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_004463	ATCTG	2	10	48075	48084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_004463	GA	3	6	48262	48267	50 %	0 %	50 %	0 %	27375167
1045	NC_004463	GGCGC	2	10	48275	48284	0 %	0 %	60 %	40 %	27375167
1046	NC_004463	TGA	2	6	48385	48390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375167
1047	NC_004463	GC	3	6	48413	48418	0 %	0 %	50 %	50 %	27375167
1048	NC_004463	TCGTC	2	10	48461	48470	0 %	40 %	20 %	40 %	27375167
1049	NC_004463	TCG	2	6	48496	48501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375167
1050	NC_004463	CCAA	2	8	48517	48524	50 %	0 %	0 %	50 %	27375167
1051	NC_004463	CCCG	2	8	48636	48643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1052	NC_004463	CGGG	2	8	48651	48658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_004463	GCCCTC	2	12	48719	48730	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	27375168
1054	NC_004463	TCG	2	6	48777	48782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375168
1055	NC_004463	GGC	2	6	48830	48835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375168
1056	NC_004463	GA	3	6	48933	48938	50 %	0 %	50 %	0 %	27375168
1057	NC_004463	GTT	2	6	48962	48967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375168
1058	NC_004463	TCT	2	6	48973	48978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375168
1059	NC_004463	AGG	2	6	49107	49112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_004463	CG	3	6	49126	49131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_004463	GGC	2	6	49138	49143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_004463	GAA	2	6	49157	49162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_004463	CGC	2	6	49171	49176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_004463	ATCC	2	8	49221	49228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_004463	GA	3	6	49304	49309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004463	TGC	2	6	49329	49334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_004463	GACG	2	8	49353	49360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_004463	CG	3	6	49379	49384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_004463	GCA	2	6	49388	49393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_004463	GAT	2	6	49485	49490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004463	TG	3	6	49518	49523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_004463	CGC	2	6	49637	49642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_004463	AGG	2	6	49653	49658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004463	ATG	2	6	49670	49675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004463	GAGAA	2	10	49694	49703	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_004463	GCC	2	6	49784	49789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375169
1077	NC_004463	GC	3	6	49848	49853	0 %	0 %	50 %	50 %	27375169
1078	NC_004463	TCGGC	2	10	49898	49907	0 %	20 %	40 %	40 %	27375169
1079	NC_004463	GCC	2	6	49987	49992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375169
1080	NC_004463	TCA	2	6	50125	50130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375170
1081	NC_004463	CAA	2	6	50158	50163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375170
1082	NC_004463	CCG	2	6	50188	50193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375170
1083	NC_004463	CGT	2	6	50221	50226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375170
1084	NC_004463	A	6	6	50306	50311	100 %	0 %	0 %	0 %	27375170
1085	NC_004463	CG	3	6	50355	50360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_004463	CCCG	2	8	50386	50393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1087	NC_004463	AGA	2	6	50410	50415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_004463	ATGAA	2	10	50434	50443	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_004463	CGGC	2	8	50459	50466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_004463	ACG	2	6	50475	50480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_004463	TTC	2	6	50497	50502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_004463	CGT	2	6	50548	50553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_004463	AGC	2	6	50608	50613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_004463	ATC	2	6	50677	50682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_004463	GCAG	2	8	50712	50719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_004463	TTC	2	6	50752	50757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375171
1097	NC_004463	TGC	2	6	50831	50836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375171
1098	NC_004463	ATCGC	2	10	50996	51005	20 %	20 %	20 %	40 %	27375171
1099	NC_004463	AC	3	6	51014	51019	50 %	0 %	0 %	50 %	27375171
1100	NC_004463	GGC	2	6	51033	51038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375171
1101	NC_004463	GAG	2	6	51199	51204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375171
1102	NC_004463	CGGA	2	8	51253	51260	25 %	0 %	50 %	25 %	27375171
1103	NC_004463	CGG	2	6	51343	51348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375171
1104	NC_004463	GAG	2	6	51352	51357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375171
1105	NC_004463	CAG	2	6	51382	51387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375171
1106	NC_004463	GAA	2	6	51403	51408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375171
1107	NC_004463	ATG	2	6	51421	51426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375171
1108	NC_004463	ATCG	2	8	51447	51454	25 %	25 %	25 %	25 %	27375171
1109	NC_004463	CCGG	2	8	51483	51490	0 %	0 %	50 %	50 %	27375171
1110	NC_004463	GCCC	2	8	51507	51514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1111	NC_004463	GAT	3	9	51718	51726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375172
1112	NC_004463	TG	3	6	51838	51843	0 %	50 %	50 %	0 %	27375172
1113	NC_004463	GAA	2	6	51919	51924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375172
1114	NC_004463	TGG	3	9	51966	51974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375172
1115	NC_004463	CCA	4	12	52009	52020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375172
1116	NC_004463	AGC	2	6	52038	52043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375172
1117	NC_004463	GGC	2	6	52148	52153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_004463	GC	3	6	52199	52204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_004463	GGT	2	6	52205	52210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_004463	AAG	2	6	52277	52282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375173
1121	NC_004463	CGG	2	6	52321	52326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375173
1122	NC_004463	CGG	2	6	52386	52391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375173
1123	NC_004463	GCCGA	2	10	52400	52409	20 %	0 %	40 %	40 %	27375173
1124	NC_004463	GCA	2	6	52480	52485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375173
1125	NC_004463	GCT	2	6	52534	52539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375173
1126	NC_004463	GAG	2	6	52601	52606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375173
1127	NC_004463	TTCA	2	8	52622	52629	25 %	50 %	0 %	25 %	27375173
1128	NC_004463	AGA	2	6	52630	52635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375173
1129	NC_004463	ATG	2	6	52640	52645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375173
1130	NC_004463	CT	3	6	52656	52661	0 %	50 %	0 %	50 %	27375173
1131	NC_004463	T	7	7	52687	52693	0 %	100 %	0 %	0 %	27375173
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1133	NC_004463	GA	3	6	52773	52778	50 %	0 %	50 %	0 %	27375173
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