MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004463	CGT	2	6	22852	22857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375134
502	NC_004463	ATCA	2	8	22860	22867	50 %	25 %	0 %	25 %	27375134
503	NC_004463	CAA	3	9	22973	22981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375134
504	NC_004463	CAG	2	6	23055	23060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375134
505	NC_004463	GCT	2	6	23095	23100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_004463	GTT	2	6	23101	23106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004463	CCG	2	6	23121	23126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_004463	TGT	2	6	23162	23167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004463	AGGC	2	8	23252	23259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
510	NC_004463	TCG	2	6	23263	23268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_004463	GCG	2	6	23298	23303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_004463	CTCGTG	2	12	23360	23371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_004463	ACGA	2	8	23378	23385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_004463	TCAA	2	8	23389	23396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_004463	GAG	2	6	23418	23423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004463	CAT	2	6	23500	23505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_004463	GCAAC	2	10	23543	23552	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
518	NC_004463	ACG	2	6	23561	23566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_004463	CAG	3	9	23574	23582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_004463	TCG	2	6	23669	23674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375135
521	NC_004463	CAACC	2	10	23749	23758	40 %	0 %	0 %	60 %	27375135
522	NC_004463	CG	3	6	23773	23778	0 %	0 %	50 %	50 %	27375135
523	NC_004463	GCAA	2	8	23859	23866	50 %	0 %	25 %	25 %	27375135
524	NC_004463	GAT	2	6	23895	23900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375135
525	NC_004463	CGA	2	6	23936	23941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375135
526	NC_004463	CG	3	6	23969	23974	0 %	0 %	50 %	50 %	27375135
527	NC_004463	TGA	2	6	24048	24053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_004463	CGTC	2	8	24087	24094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_004463	CTT	2	6	24103	24108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_004463	CTC	2	6	24121	24126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_004463	CGC	2	6	24228	24233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_004463	AAC	2	6	24242	24247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_004463	TTC	2	6	24272	24277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_004463	GAC	2	6	24281	24286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_004463	AGG	2	6	24289	24294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004463	CCG	2	6	24403	24408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_004463	GCC	2	6	24443	24448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_004463	CTAG	2	8	24510	24517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_004463	AGT	2	6	24748	24753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375136
540	NC_004463	T	6	6	24778	24783	0 %	100 %	0 %	0 %	27375136
541	NC_004463	TGC	2	6	24852	24857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375136
542	NC_004463	AGC	2	6	24859	24864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375136
543	NC_004463	GAG	2	6	24918	24923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375136
544	NC_004463	CGT	2	6	24963	24968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375136
545	NC_004463	CGCC	2	8	25055	25062	0 %	0 %	25 %	75 %	27375136
546	NC_004463	GAA	2	6	25074	25079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375136
547	NC_004463	CAT	2	6	25095	25100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375136
548	NC_004463	GGC	2	6	25116	25121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375136
549	NC_004463	GCG	2	6	25126	25131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375136
550	NC_004463	CGA	2	6	25241	25246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375136
551	NC_004463	GAC	3	9	25263	25271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375136
552	NC_004463	GCTGG	2	10	25278	25287	0 %	20 %	60 %	20 %	27375136
553	NC_004463	CCT	2	6	25357	25362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375136
554	NC_004463	TCG	2	6	25442	25447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375136
555	NC_004463	TTGC	2	8	25459	25466	0 %	50 %	25 %	25 %	27375136
556	NC_004463	CGC	2	6	25525	25530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375136
557	NC_004463	GGCG	2	8	25542	25549	0 %	0 %	75 %	25 %	27375136
558	NC_004463	GGC	2	6	25569	25574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375136
559	NC_004463	TCG	2	6	25636	25641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375136
560	NC_004463	AAT	2	6	25647	25652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27375136
561	NC_004463	CCAG	2	8	25676	25683	25 %	0 %	25 %	50 %	27375136
562	NC_004463	GCTT	2	8	25696	25703	0 %	50 %	25 %	25 %	27375136
563	NC_004463	ATTG	2	8	25811	25818	25 %	50 %	25 %	0 %	27375136
564	NC_004463	GCC	2	6	25854	25859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375136
565	NC_004463	TGG	2	6	25864	25869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375136
566	NC_004463	TTC	2	6	25914	25919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375136
567	NC_004463	GAA	2	6	25962	25967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375136
568	NC_004463	TCG	2	6	25984	25989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375136
569	NC_004463	CGCC	2	8	26109	26116	0 %	0 %	25 %	75 %	27375136
570	NC_004463	GT	3	6	26120	26125	0 %	50 %	50 %	0 %	27375136
571	NC_004463	ATC	2	6	26133	26138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375136
572	NC_004463	CGAA	2	8	26199	26206	50 %	0 %	25 %	25 %	27375136
573	NC_004463	TCC	2	6	26233	26238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375136
574	NC_004463	TC	3	6	26240	26245	0 %	50 %	0 %	50 %	27375136
575	NC_004463	ACC	2	6	26247	26252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375136
576	NC_004463	C	6	6	26299	26304	0 %	0 %	0 %	100 %	27375136
577	NC_004463	AAG	2	6	26365	26370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375136
578	NC_004463	CGG	2	6	26432	26437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375136
579	NC_004463	TCCG	2	8	26517	26524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_004463	AGA	2	6	26534	26539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375137
581	NC_004463	CGA	3	9	26591	26599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375137
582	NC_004463	TAAGA	2	10	26612	26621	60 %	20 %	20 %	0 %	27375137
583	NC_004463	TCG	2	6	26626	26631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375137
584	NC_004463	CGGCT	2	10	26667	26676	0 %	20 %	40 %	40 %	27375137
585	NC_004463	CG	3	6	26680	26685	0 %	0 %	50 %	50 %	27375137
586	NC_004463	TGA	2	6	26735	26740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375137
587	NC_004463	GGAT	2	8	26746	26753	25 %	25 %	50 %	0 %	27375137
588	NC_004463	CGG	2	6	26777	26782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375137
589	NC_004463	CGAC	2	8	26870	26877	25 %	0 %	25 %	50 %	27375137
590	NC_004463	CCGC	2	8	26899	26906	0 %	0 %	25 %	75 %	27375137
591	NC_004463	GCG	2	6	26907	26912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375137
592	NC_004463	TCT	2	6	26972	26977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375137
593	NC_004463	TTG	2	6	27031	27036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375137
594	NC_004463	CAG	2	6	27213	27218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375137
595	NC_004463	GC	3	6	27219	27224	0 %	0 %	50 %	50 %	27375137
596	NC_004463	CCG	2	6	27250	27255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375137
597	NC_004463	CAC	2	6	27416	27421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_004463	ATC	2	6	27457	27462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_004463	CCG	2	6	27547	27552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_004463	ATT	2	6	27576	27581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004463	TCC	2	6	27639	27644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_004463	GAGCG	2	10	27672	27681	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
603	NC_004463	GC	3	6	27790	27795	0 %	0 %	50 %	50 %	27375138
604	NC_004463	GA	3	6	27957	27962	50 %	0 %	50 %	0 %	27375138
605	NC_004463	CGT	2	6	28015	28020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_004463	TCA	2	6	28186	28191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_004463	CCG	2	6	28206	28211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_004463	GCA	2	6	28239	28244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004463	CGG	2	6	28312	28317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_004463	CAA	2	6	28449	28454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_004463	CG	3	6	28494	28499	0 %	0 %	50 %	50 %	27375139
612	NC_004463	AGG	2	6	28516	28521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375139
613	NC_004463	GCA	2	6	28677	28682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375139
614	NC_004463	CTA	2	6	28793	28798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375139
615	NC_004463	ATG	2	6	28825	28830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375139
616	NC_004463	A	6	6	28868	28873	100 %	0 %	0 %	0 %	27375139
617	NC_004463	CTG	2	6	28947	28952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375139
618	NC_004463	GCC	2	6	29042	29047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375139
619	NC_004463	CAT	2	6	29048	29053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375139
620	NC_004463	GCGAC	2	10	29111	29120	20 %	0 %	40 %	40 %	27375139
621	NC_004463	GAA	2	6	29130	29135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375139
622	NC_004463	GAG	2	6	29235	29240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375139
623	NC_004463	GGA	2	6	29276	29281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375139
624	NC_004463	GAT	2	6	29298	29303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375139
625	NC_004463	CGA	2	6	29304	29309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375139
626	NC_004463	GAA	2	6	29314	29319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375139
627	NC_004463	TGC	2	6	29337	29342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_004463	ACA	2	6	29446	29451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375140
629	NC_004463	GAA	2	6	29471	29476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375140
630	NC_004463	ATG	2	6	29502	29507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375140
631	NC_004463	CAT	2	6	29521	29526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375140
632	NC_004463	ACG	2	6	29538	29543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375140
633	NC_004463	CTG	2	6	29549	29554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375140
634	NC_004463	CGCC	2	8	29646	29653	0 %	0 %	25 %	75 %	27375140
635	NC_004463	TGA	2	6	29724	29729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004463	GCGCG	2	10	29761	29770	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
637	NC_004463	TTG	2	6	29805	29810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375141
638	NC_004463	GCG	2	6	29852	29857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375141
639	NC_004463	G	7	7	30003	30009	0 %	0 %	100 %	0 %	27375141
640	NC_004463	GC	3	6	30114	30119	0 %	0 %	50 %	50 %	27375141
641	NC_004463	GGGC	2	8	30141	30148	0 %	0 %	75 %	25 %	27375141
642	NC_004463	CAT	2	6	30205	30210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375141
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644	NC_004463	AG	3	6	30222	30227	50 %	0 %	50 %	0 %	27375141
645	NC_004463	GGC	2	6	30232	30237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375141
646	NC_004463	GGC	2	6	30311	30316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375141
647	NC_004463	ACG	2	6	30337	30342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375141
648	NC_004463	TCG	2	6	30345	30350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375141
649	NC_004463	CCA	2	6	30498	30503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375141
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651	NC_004463	GC	4	8	30724	30731	0 %	0 %	50 %	50 %	27375141
652	NC_004463	TGA	2	6	30801	30806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375141
653	NC_004463	GC	3	6	30885	30890	0 %	0 %	50 %	50 %	27375141
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657	NC_004463	GTC	2	6	31082	31087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375141
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659	NC_004463	GTC	2	6	31251	31256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375141
660	NC_004463	GAA	2	6	31389	31394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375142
661	NC_004463	GGC	2	6	31404	31409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375142
662	NC_004463	GGC	2	6	31467	31472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375142
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665	NC_004463	CTG	2	6	31627	31632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375142
666	NC_004463	CTG	2	6	31750	31755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_004463	TTC	2	6	31771	31776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375143
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669	NC_004463	GGC	2	6	31812	31817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375143
670	NC_004463	TCG	2	6	31832	31837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375143
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672	NC_004463	GAT	2	6	31927	31932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375143
673	NC_004463	TTA	2	6	31948	31953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
674	NC_004463	GCCG	2	8	31997	32004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
675	NC_004463	GC	3	6	32078	32083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
676	NC_004463	CGA	2	6	32122	32127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
677	NC_004463	ATTA	2	8	32193	32200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
678	NC_004463	AC	3	6	32206	32211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
679	NC_004463	CG	3	6	32233	32238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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683	NC_004463	TTCT	2	8	32371	32378	0 %	75 %	0 %	25 %	27375144
684	NC_004463	CGG	2	6	32393	32398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375144
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689	NC_004463	CAA	2	6	32542	32547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
690	NC_004463	ATG	2	6	32593	32598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
691	NC_004463	TCC	2	6	32661	32666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
692	NC_004463	CTG	2	6	32771	32776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
693	NC_004463	TGC	2	6	32791	32796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
694	NC_004463	GTC	2	6	32800	32805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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697	NC_004463	GGA	2	6	32864	32869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
698	NC_004463	TGAC	2	8	32886	32893	25 %	25 %	25 %	25 %	27375145
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713	NC_004463	GTC	2	6	33743	33748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
714	NC_004463	GCC	2	6	33750	33755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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743	NC_004463	GCT	2	6	35294	35299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375150
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747	NC_004463	CGAG	2	8	35454	35461	25 %	0 %	50 %	25 %	27375150
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749	NC_004463	ATC	2	6	35570	35575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
750	NC_004463	GGCC	2	8	35601	35608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
751	NC_004463	TCT	2	6	35669	35674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_004463	ACT	2	6	35708	35713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_004463	GTG	2	6	35726	35731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
754	NC_004463	CTG	2	6	35849	35854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375151
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756	NC_004463	GGCT	2	8	35966	35973	0 %	25 %	50 %	25 %	27375151
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758	NC_004463	ACGG	2	8	36178	36185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
759	NC_004463	TCA	2	6	36216	36221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
760	NC_004463	CGG	2	6	36223	36228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
761	NC_004463	AGAT	2	8	36252	36259	50 %	25 %	25 %	0 %	27375152
762	NC_004463	ATA	2	6	36307	36312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27375152
763	NC_004463	GCGCG	2	10	36339	36348	0 %	0 %	60 %	40 %	27375152
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