MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004463	CGGC	2	8	243676	243683	0 %	0 %	50 %	50 %	27375357
6002	NC_004463	TGATGG	2	12	243705	243716	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	27375357
6003	NC_004463	AGG	2	6	243728	243733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375357
6004	NC_004463	CGC	2	6	243741	243746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375357
6005	NC_004463	GC	3	6	243752	243757	0 %	0 %	50 %	50 %	27375357
6006	NC_004463	CG	3	6	243835	243840	0 %	0 %	50 %	50 %	27375357
6007	NC_004463	GC	3	6	243949	243954	0 %	0 %	50 %	50 %	27375357
6008	NC_004463	CTT	2	6	243979	243984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375357
6009	NC_004463	TTC	2	6	243992	243997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375357
6010	NC_004463	GCGG	2	8	244021	244028	0 %	0 %	75 %	25 %	27375357
6011	NC_004463	TCT	2	6	244074	244079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375357
6012	NC_004463	TCT	2	6	244089	244094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375357
6013	NC_004463	CGC	2	6	244101	244106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375357
6014	NC_004463	AT	3	6	244250	244255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_004463	T	6	6	244307	244312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_004463	CGGC	2	8	244479	244486	0 %	0 %	50 %	50 %	27375359
6017	NC_004463	TCG	2	6	244511	244516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375359
6018	NC_004463	GCC	2	6	244574	244579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375359
6019	NC_004463	GCG	2	6	244664	244669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375359
6020	NC_004463	TCG	2	6	244697	244702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375359
6021	NC_004463	CAA	2	6	244710	244715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375359
6022	NC_004463	GTC	2	6	244756	244761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375359
6023	NC_004463	CGG	2	6	244767	244772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375359
6024	NC_004463	GGC	2	6	244899	244904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375359
6025	NC_004463	GCC	2	6	244936	244941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375359
6026	NC_004463	CGA	2	6	244982	244987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375359
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6028	NC_004463	CGG	2	6	245054	245059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375359
6029	NC_004463	CGG	2	6	245117	245122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375359
6030	NC_004463	GCG	2	6	245127	245132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375359
6031	NC_004463	CAT	2	6	245136	245141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375359
6032	NC_004463	CCGG	2	8	245206	245213	0 %	0 %	50 %	50 %	27375360
6033	NC_004463	TCA	2	6	245242	245247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375360
6034	NC_004463	CGC	2	6	245282	245287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375360
6035	NC_004463	CGC	2	6	245333	245338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375360
6036	NC_004463	ACC	2	6	245343	245348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375360
6037	NC_004463	GGC	2	6	245349	245354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375360
6038	NC_004463	CGA	2	6	245513	245518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6039	NC_004463	GCT	2	6	245525	245530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6040	NC_004463	ACG	3	9	245577	245585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6041	NC_004463	GC	3	6	245641	245646	0 %	0 %	50 %	50 %	27375360
6042	NC_004463	GC	3	6	245648	245653	0 %	0 %	50 %	50 %	27375360
6043	NC_004463	GCCC	2	8	245668	245675	0 %	0 %	25 %	75 %	27375360
6044	NC_004463	TCG	2	6	245751	245756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6045	NC_004463	CATT	2	8	245867	245874	25 %	50 %	0 %	25 %	27375360
6046	NC_004463	CGAC	2	8	245890	245897	25 %	0 %	25 %	50 %	27375360
6047	NC_004463	GTC	2	6	245928	245933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375360
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6049	NC_004463	GAC	2	6	245969	245974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6050	NC_004463	GTC	2	6	245979	245984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6051	NC_004463	GCA	2	6	246040	246045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6052	NC_004463	CTG	2	6	246051	246056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375360
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6054	NC_004463	TCG	2	6	246121	246126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6055	NC_004463	TCG	3	9	246208	246216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375360
6056	NC_004463	CG	3	6	246259	246264	0 %	0 %	50 %	50 %	27375360
6057	NC_004463	CGG	2	6	246290	246295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375360
6058	NC_004463	GC	3	6	246300	246305	0 %	0 %	50 %	50 %	27375360
6059	NC_004463	AAG	2	6	246315	246320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375360
6060	NC_004463	GCA	2	6	246326	246331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375360
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6062	NC_004463	CAA	2	6	246572	246577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375360
6063	NC_004463	GCA	2	6	246642	246647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375360
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6070	NC_004463	TGATC	2	10	246885	246894	20 %	40 %	20 %	20 %	27375361
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6078	NC_004463	CG	4	8	247212	247219	0 %	0 %	50 %	50 %	27375361
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6107	NC_004463	CGC	2	6	248537	248542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375362
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6109	NC_004463	CAG	2	6	248588	248593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375362
6110	NC_004463	GC	3	6	248637	248642	0 %	0 %	50 %	50 %	27375362
6111	NC_004463	CGA	2	6	248653	248658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375362
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6119	NC_004463	AC	3	6	248860	248865	50 %	0 %	0 %	50 %	27375362
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6121	NC_004463	CATG	2	8	248911	248918	25 %	25 %	25 %	25 %	27375362
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6123	NC_004463	AGC	2	6	248934	248939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375362
6124	NC_004463	ATG	3	9	248946	248954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375362
6125	NC_004463	GGT	2	6	248960	248965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375362
6126	NC_004463	CGG	2	6	248983	248988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375362
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6128	NC_004463	ATGG	2	8	249025	249032	25 %	25 %	50 %	0 %	27375362
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6355	NC_004463	TCGC	2	8	257483	257490	0 %	25 %	25 %	50 %	27375371
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6371	NC_004463	GCT	2	6	257987	257992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375371
6372	NC_004463	GGA	2	6	258056	258061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375371
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6375	NC_004463	CGA	2	6	258125	258130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375371
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6382	NC_004463	GCT	2	6	258496	258501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6383	NC_004463	GCT	2	6	258523	258528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6385	NC_004463	CGC	2	6	258660	258665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375372
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6399	NC_004463	CG	3	6	259459	259464	0 %	0 %	50 %	50 %	27375372
6400	NC_004463	ATTG	2	8	259473	259480	25 %	50 %	25 %	0 %	27375372
6401	NC_004463	CGC	2	6	259542	259547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375372
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6404	NC_004463	CCG	2	6	259783	259788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375372
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6406	NC_004463	CG	3	6	259850	259855	0 %	0 %	50 %	50 %	27375372
6407	NC_004463	CCGG	2	8	260000	260007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6433	NC_004463	TCC	2	6	261378	261383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6435	NC_004463	ATC	2	6	261509	261514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375374
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6439	NC_004463	GC	3	6	261725	261730	0 %	0 %	50 %	50 %	27375374
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6444	NC_004463	TCG	2	6	261870	261875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375374
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6465	NC_004463	CG	3	6	262835	262840	0 %	0 %	50 %	50 %	27375375
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6493	NC_004463	GC	3	6	263930	263935	0 %	0 %	50 %	50 %	27375376
6494	NC_004463	GCC	2	6	263961	263966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375376
6495	NC_004463	CGA	2	6	264035	264040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375376
6496	NC_004463	CGG	2	6	264135	264140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375376
6497	NC_004463	CAT	2	6	264169	264174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375376
6498	NC_004463	CG	4	8	264176	264183	0 %	0 %	50 %	50 %	27375376
6499	NC_004463	GCTC	2	8	264299	264306	0 %	25 %	25 %	50 %	27375377
6500	NC_004463	GCC	2	6	264309	264314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375377

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