MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004463	CGA	2	6	224186	224191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375338
5502	NC_004463	ATC	2	6	224217	224222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375338
5503	NC_004463	GGCC	2	8	224240	224247	0 %	0 %	50 %	50 %	27375338
5504	NC_004463	CTG	2	6	224253	224258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375338
5505	NC_004463	ACC	2	6	224262	224267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375338
5506	NC_004463	TGG	2	6	224311	224316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375338
5507	NC_004463	GGA	2	6	224420	224425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375338
5508	NC_004463	CCG	2	6	224432	224437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375338
5509	NC_004463	CAG	2	6	224454	224459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375338
5510	NC_004463	GC	3	6	224493	224498	0 %	0 %	50 %	50 %	27375338
5511	NC_004463	TCC	2	6	224499	224504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375338
5512	NC_004463	ACC	2	6	224505	224510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375338
5513	NC_004463	CCGGAG	2	12	224511	224522	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	27375338
5514	NC_004463	CCG	2	6	224533	224538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375338
5515	NC_004463	CGA	2	6	224561	224566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375338
5516	NC_004463	CAG	2	6	224574	224579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375338
5517	NC_004463	GAA	2	6	224615	224620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375338
5518	NC_004463	GCC	2	6	224654	224659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_004463	GTC	2	6	224706	224711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375339
5520	NC_004463	CG	3	6	224735	224740	0 %	0 %	50 %	50 %	27375339
5521	NC_004463	ACG	2	6	224772	224777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375339
5522	NC_004463	ATC	2	6	224779	224784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375339
5523	NC_004463	GAC	2	6	224827	224832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375339
5524	NC_004463	GCC	2	6	224842	224847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375339
5525	NC_004463	GC	3	6	224861	224866	0 %	0 %	50 %	50 %	27375339
5526	NC_004463	AAC	2	6	224872	224877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375339
5527	NC_004463	TCCGC	2	10	224948	224957	0 %	20 %	20 %	60 %	27375339
5528	NC_004463	CAT	2	6	224979	224984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375339
5529	NC_004463	CGG	3	9	224991	224999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375339
5530	NC_004463	TGG	2	6	225011	225016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375339
5531	NC_004463	GCG	2	6	225090	225095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375339
5532	NC_004463	CGG	2	6	225104	225109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375339
5533	NC_004463	CGTC	2	8	225113	225120	0 %	25 %	25 %	50 %	27375339
5534	NC_004463	TCG	2	6	225128	225133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375339
5535	NC_004463	ACG	2	6	225142	225147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375339
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5537	NC_004463	GC	3	6	225157	225162	0 %	0 %	50 %	50 %	27375339
5538	NC_004463	GCG	2	6	225187	225192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375339
5539	NC_004463	CG	3	6	225212	225217	0 %	0 %	50 %	50 %	27375339
5540	NC_004463	GCC	2	6	225223	225228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375339
5541	NC_004463	CGG	2	6	225248	225253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375339
5542	NC_004463	CGGC	2	8	225257	225264	0 %	0 %	50 %	50 %	27375339
5543	NC_004463	TCA	2	6	225272	225277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375339
5544	NC_004463	TCA	2	6	225402	225407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375339
5545	NC_004463	TTCAG	2	10	225434	225443	20 %	40 %	20 %	20 %	27375339
5546	NC_004463	GTC	2	6	225495	225500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_004463	GAC	2	6	225515	225520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_004463	CGC	2	6	225534	225539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511113
5549	NC_004463	GC	3	6	225576	225581	0 %	0 %	50 %	50 %	161511113
5550	NC_004463	TCG	2	6	225616	225621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511113
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5552	NC_004463	TCG	2	6	225670	225675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511113
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5554	NC_004463	TCT	2	6	225704	225709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511113
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5556	NC_004463	GC	4	8	225911	225918	0 %	0 %	50 %	50 %	161511113
5557	NC_004463	TTG	2	6	225922	225927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511113
5558	NC_004463	AGGC	2	8	225934	225941	25 %	0 %	50 %	25 %	161511113
5559	NC_004463	GC	3	6	225959	225964	0 %	0 %	50 %	50 %	161511113
5560	NC_004463	TGG	2	6	226055	226060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511113
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5562	NC_004463	CGGA	2	8	226113	226120	25 %	0 %	50 %	25 %	161511113
5563	NC_004463	TCG	2	6	226136	226141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511113
5564	NC_004463	GC	3	6	226146	226151	0 %	0 %	50 %	50 %	161511113
5565	NC_004463	ACC	2	6	226192	226197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511113
5566	NC_004463	CG	5	10	226275	226284	0 %	0 %	50 %	50 %	161511113
5567	NC_004463	CCGAG	2	10	226298	226307	20 %	0 %	40 %	40 %	161511113
5568	NC_004463	TGCG	2	8	226318	226325	0 %	25 %	50 %	25 %	161511113
5569	NC_004463	CGT	2	6	226349	226354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511113
5570	NC_004463	GAA	2	6	226368	226373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511113
5571	NC_004463	C	6	6	226499	226504	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5572	NC_004463	TCC	2	6	226596	226601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_004463	TTG	2	6	226629	226634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375341
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5578	NC_004463	CCCGGC	2	12	226767	226778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375341
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5580	NC_004463	GC	4	8	226823	226830	0 %	0 %	50 %	50 %	27375341
5581	NC_004463	GGC	2	6	226851	226856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375341
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5591	NC_004463	CGC	2	6	227087	227092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375341
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5594	NC_004463	CG	3	6	227188	227193	0 %	0 %	50 %	50 %	27375341
5595	NC_004463	GATC	2	8	227216	227223	25 %	25 %	25 %	25 %	27375341
5596	NC_004463	CGG	2	6	227261	227266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375341
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5599	NC_004463	ATC	2	6	227334	227339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375341
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5601	NC_004463	CGA	2	6	227366	227371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375341
5602	NC_004463	GC	3	6	227385	227390	0 %	0 %	50 %	50 %	27375341
5603	NC_004463	CGC	2	6	227399	227404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375341
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5605	NC_004463	CG	4	8	227552	227559	0 %	0 %	50 %	50 %	27375342
5606	NC_004463	GC	3	6	227667	227672	0 %	0 %	50 %	50 %	27375342
5607	NC_004463	CGGC	2	8	227708	227715	0 %	0 %	50 %	50 %	27375342
5608	NC_004463	CGG	3	9	227720	227728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375342
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5610	NC_004463	GCG	2	6	227778	227783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375342
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5614	NC_004463	ATCT	2	8	228019	228026	25 %	50 %	0 %	25 %	27375343
5615	NC_004463	CGA	2	6	228047	228052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375343
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5617	NC_004463	CTGC	2	8	228151	228158	0 %	25 %	25 %	50 %	27375343
5618	NC_004463	CGC	2	6	228242	228247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375343
5619	NC_004463	GAACA	2	10	228316	228325	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5620	NC_004463	CCGGCA	2	12	228339	228350	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	27375344
5621	NC_004463	CGA	2	6	228393	228398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375344
5622	NC_004463	GC	3	6	228446	228451	0 %	0 %	50 %	50 %	27375344
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5624	NC_004463	CGC	3	9	228471	228479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375344
5625	NC_004463	CGT	2	6	228498	228503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375344
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5744	NC_004463	GA	3	6	232957	232962	50 %	0 %	50 %	0 %	27375349
5745	NC_004463	CGT	2	6	232983	232988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375349
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5866	NC_004463	CGGC	2	8	237802	237809	0 %	0 %	50 %	50 %	27375353
5867	NC_004463	CGA	2	6	237863	237868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375353
5868	NC_004463	ACGATG	2	12	237916	237927	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27375353
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5993	NC_004463	GCC	2	6	243409	243414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375357
5994	NC_004463	CGG	2	6	243447	243452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375357
5995	NC_004463	CCG	2	6	243456	243461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375357
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5997	NC_004463	CCG	2	6	243482	243487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375357
5998	NC_004463	CTT	2	6	243601	243606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375357
5999	NC_004463	ACA	2	6	243617	243622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375357
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