MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004463	GC	3	6	183469	183474	0 %	0 %	50 %	50 %	27375299
4502	NC_004463	GCC	3	9	183499	183507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375299
4503	NC_004463	CAC	2	6	183517	183522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375299
4504	NC_004463	GCC	2	6	183526	183531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375299
4505	NC_004463	GC	3	6	183541	183546	0 %	0 %	50 %	50 %	27375299
4506	NC_004463	GCCG	2	8	183616	183623	0 %	0 %	50 %	50 %	27375299
4507	NC_004463	CGA	2	6	183648	183653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375299
4508	NC_004463	GCC	2	6	183671	183676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375299
4509	NC_004463	GCG	2	6	183679	183684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375299
4510	NC_004463	TGG	2	6	183690	183695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375299
4511	NC_004463	ACCC	2	8	183700	183707	25 %	0 %	0 %	75 %	27375299
4512	NC_004463	CAT	2	6	183709	183714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375299
4513	NC_004463	CGA	2	6	183717	183722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375299
4514	NC_004463	GC	3	6	183733	183738	0 %	0 %	50 %	50 %	27375299
4515	NC_004463	GCC	2	6	183842	183847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375299
4516	NC_004463	GAT	2	6	183931	183936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_004463	TGCC	2	8	183951	183958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_004463	GTC	2	6	184012	184017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375300
4519	NC_004463	CCG	2	6	184105	184110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375300
4520	NC_004463	CGG	2	6	184204	184209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375301
4521	NC_004463	CCG	2	6	184244	184249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375301
4522	NC_004463	CCA	2	6	184363	184368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375301
4523	NC_004463	CG	3	6	184373	184378	0 %	0 %	50 %	50 %	27375301
4524	NC_004463	CTG	2	6	184413	184418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375301
4525	NC_004463	CGA	2	6	184436	184441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375301
4526	NC_004463	CGC	2	6	184445	184450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375301
4527	NC_004463	CGCGGC	2	12	184470	184481	0 %	0 %	50 %	50 %	27375301
4528	NC_004463	CCG	2	6	184523	184528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375301
4529	NC_004463	GGA	2	6	184550	184555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375301
4530	NC_004463	GC	3	6	184577	184582	0 %	0 %	50 %	50 %	27375301
4531	NC_004463	TGG	2	6	184642	184647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375301
4532	NC_004463	CGG	2	6	184660	184665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375301
4533	NC_004463	GTG	2	6	184689	184694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375301
4534	NC_004463	CAA	2	6	184706	184711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375301
4535	NC_004463	CGC	2	6	184766	184771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375301
4536	NC_004463	AAG	2	6	184794	184799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375301
4537	NC_004463	GCC	2	6	184809	184814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375301
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4539	NC_004463	GCA	2	6	184862	184867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375301
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4541	NC_004463	GCCA	2	8	184953	184960	25 %	0 %	25 %	50 %	27375301
4542	NC_004463	CCT	2	6	184961	184966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375301
4543	NC_004463	ACC	2	6	185025	185030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375301
4544	NC_004463	GAG	2	6	185052	185057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375301
4545	NC_004463	CTT	2	6	185226	185231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_004463	CGC	2	6	185253	185258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_004463	TCC	2	6	185268	185273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_004463	CGA	2	6	185352	185357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375302
4549	NC_004463	CGA	2	6	185394	185399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375302
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4552	NC_004463	CG	3	6	185481	185486	0 %	0 %	50 %	50 %	27375302
4553	NC_004463	TCA	2	6	185516	185521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375302
4554	NC_004463	TGCG	2	8	185710	185717	0 %	25 %	50 %	25 %	27375302
4555	NC_004463	TCGC	2	8	185758	185765	0 %	25 %	25 %	50 %	27375302
4556	NC_004463	CCG	2	6	185771	185776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375302
4557	NC_004463	CG	3	6	185826	185831	0 %	0 %	50 %	50 %	27375302
4558	NC_004463	CAT	2	6	185874	185879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375302
4559	NC_004463	GCG	2	6	185900	185905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375302
4560	NC_004463	CAC	2	6	185916	185921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375302
4561	NC_004463	GCC	2	6	185977	185982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375302
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4563	NC_004463	GCC	2	6	186022	186027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375302
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4565	NC_004463	CGG	2	6	186099	186104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375302
4566	NC_004463	CGC	2	6	186120	186125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375302
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4570	NC_004463	CGT	2	6	186265	186270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_004463	AGC	2	6	186289	186294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_004463	T	7	7	186377	186383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_004463	ACG	2	6	186589	186594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_004463	CT	3	6	186642	186647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_004463	CG	3	6	186693	186698	0 %	0 %	50 %	50 %	27375303
4576	NC_004463	GCT	2	6	186716	186721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375303
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4579	NC_004463	GCC	2	6	186800	186805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375303
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4588	NC_004463	GAA	2	6	187382	187387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375303
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4590	NC_004463	TCG	2	6	187537	187542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375303
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4598	NC_004463	GC	3	6	187780	187785	0 %	0 %	50 %	50 %	27375303
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4605	NC_004463	ACG	2	6	187962	187967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375303
4606	NC_004463	CCG	2	6	187968	187973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375303
4607	NC_004463	GCC	3	9	188070	188078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375303
4608	NC_004463	CGC	2	6	188114	188119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375303
4609	NC_004463	GTCGT	2	10	188193	188202	0 %	40 %	40 %	20 %	27375303
4610	NC_004463	GC	3	6	188241	188246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_004463	CG	3	6	188255	188260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_004463	TC	3	6	188262	188267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_004463	AGGTG	2	10	188390	188399	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_004463	AGC	2	6	188431	188436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_004463	GCA	2	6	188460	188465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375304
4616	NC_004463	CGCC	2	8	188487	188494	0 %	0 %	25 %	75 %	27375304
4617	NC_004463	CGAGGT	2	12	188556	188567	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	27375304
4618	NC_004463	GCT	2	6	188568	188573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375304
4619	NC_004463	CGA	2	6	188574	188579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375304
4620	NC_004463	TGA	2	6	188580	188585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375304
4621	NC_004463	TCG	2	6	188663	188668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375304
4622	NC_004463	AGC	3	9	188669	188677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375304
4623	NC_004463	CGC	2	6	188727	188732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375304
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4743	NC_004463	CAT	2	6	192928	192933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375308
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4994	NC_004463	CGC	2	6	203572	203577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375317
4995	NC_004463	ACC	2	6	203594	203599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375317
4996	NC_004463	CGCGAC	2	12	203617	203628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	27375317
4997	NC_004463	CGA	2	6	203703	203708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375317
4998	NC_004463	TCGT	2	8	203714	203721	0 %	50 %	25 %	25 %	27375317
4999	NC_004463	GCCG	2	8	203743	203750	0 %	0 %	50 %	50 %	27375317
5000	NC_004463	GCG	2	6	203772	203777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375317

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