MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 5259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004307	ACGC	2	8	294	301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004307	TGCT	2	8	803	810	0 %	50 %	25 %	25 %	23464630
3	NC_004307	GCTG	2	8	1632	1639	0 %	25 %	50 %	25 %	23464630
4	NC_004307	CCTG	2	8	1941	1948	0 %	25 %	25 %	50 %	23464630
5	NC_004307	GACC	2	8	2007	2014	25 %	0 %	25 %	50 %	23464630
6	NC_004307	AGCG	2	8	2312	2319	25 %	0 %	50 %	25 %	23464631
7	NC_004307	TGGA	2	8	2321	2328	25 %	25 %	50 %	0 %	23464631
8	NC_004307	GCCT	2	8	2456	2463	0 %	25 %	25 %	50 %	23464631
9	NC_004307	GTAT	2	8	2566	2573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004307	TCCA	2	8	4149	4156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004307	CCTA	2	8	4645	4652	25 %	25 %	0 %	50 %	23464634
12	NC_004307	TTCC	2	8	5105	5112	0 %	50 %	0 %	50 %	23464634
13	NC_004307	GCCA	2	8	5236	5243	25 %	0 %	25 %	50 %	23464634
14	NC_004307	CCAG	2	8	5360	5367	25 %	0 %	25 %	50 %	23464634
15	NC_004307	GCCG	2	8	5712	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	23464634
16	NC_004307	AAGG	2	8	6221	6228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004307	CCCG	2	8	6458	6465	0 %	0 %	25 %	75 %	23464635
18	NC_004307	CGGC	2	8	6518	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	23464635
19	NC_004307	GCGT	2	8	7898	7905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_004307	TGGC	2	8	8041	8048	0 %	25 %	50 %	25 %	23464637
21	NC_004307	GACC	2	8	8174	8181	25 %	0 %	25 %	50 %	23464637
22	NC_004307	ACCA	2	8	8331	8338	50 %	0 %	0 %	50 %	23464637
23	NC_004307	AGCG	2	8	8542	8549	25 %	0 %	50 %	25 %	23464637
24	NC_004307	AGGA	2	8	9034	9041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004307	ACCG	2	8	9062	9069	25 %	0 %	25 %	50 %	23464638
26	NC_004307	CCTG	2	8	10240	10247	0 %	25 %	25 %	50 %	23464638
27	NC_004307	GAAG	2	8	10447	10454	50 %	0 %	50 %	0 %	23464638
28	NC_004307	GTTC	2	8	10698	10705	0 %	50 %	25 %	25 %	23464638
29	NC_004307	TAGC	2	8	11672	11679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004307	CTGA	2	8	11724	11731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_004307	CGGC	2	8	11888	11895	0 %	0 %	50 %	50 %	23464639
32	NC_004307	TGGC	2	8	12359	12366	0 %	25 %	50 %	25 %	23464639
33	NC_004307	TCCT	2	8	12580	12587	0 %	50 %	0 %	50 %	23464639
34	NC_004307	GGTC	2	8	12729	12736	0 %	25 %	50 %	25 %	23464639
35	NC_004307	TTTC	2	8	12777	12784	0 %	75 %	0 %	25 %	23464639
36	NC_004307	CGAG	2	8	13411	13418	25 %	0 %	50 %	25 %	23464640
37	NC_004307	CCGG	2	8	13915	13922	0 %	0 %	50 %	50 %	23464640
38	NC_004307	CTTC	2	8	15081	15088	0 %	50 %	0 %	50 %	23464641
39	NC_004307	CTGC	2	8	15337	15344	0 %	25 %	25 %	50 %	23464641
40	NC_004307	ACCT	2	8	15851	15858	25 %	25 %	0 %	50 %	23464641
41	NC_004307	TCTG	2	8	15868	15875	0 %	50 %	25 %	25 %	23464641
42	NC_004307	CCGG	2	8	17118	17125	0 %	0 %	50 %	50 %	23464642
43	NC_004307	GCGT	2	8	17160	17167	0 %	25 %	50 %	25 %	23464642
44	NC_004307	ACGT	2	8	17878	17885	25 %	25 %	25 %	25 %	23464643
45	NC_004307	ACAA	2	8	18493	18500	75 %	0 %	0 %	25 %	23464643
46	NC_004307	CGGT	2	8	18523	18530	0 %	25 %	50 %	25 %	23464643
47	NC_004307	CCGA	2	8	18974	18981	25 %	0 %	25 %	50 %	23464643
48	NC_004307	CAGC	2	8	19094	19101	25 %	0 %	25 %	50 %	23464643
49	NC_004307	TCAG	2	8	19329	19336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_004307	CGGC	2	8	19877	19884	0 %	0 %	50 %	50 %	23464644
51	NC_004307	GACG	2	8	21504	21511	25 %	0 %	50 %	25 %	23464645
52	NC_004307	TGCG	2	8	22097	22104	0 %	25 %	50 %	25 %	23464645
53	NC_004307	CACC	2	8	22127	22134	25 %	0 %	0 %	75 %	23464645
54	NC_004307	GCCC	2	8	22554	22561	0 %	0 %	25 %	75 %	23464646
55	NC_004307	CGTG	2	8	23597	23604	0 %	25 %	50 %	25 %	23464646
56	NC_004307	CGTA	2	8	23864	23871	25 %	25 %	25 %	25 %	23464646
57	NC_004307	CAGC	2	8	25197	25204	25 %	0 %	25 %	50 %	23464647
58	NC_004307	ATGC	2	8	25261	25268	25 %	25 %	25 %	25 %	23464647
59	NC_004307	GCCA	2	8	25843	25850	25 %	0 %	25 %	50 %	23464648
60	NC_004307	GACC	2	8	26939	26946	25 %	0 %	25 %	50 %	23464649
61	NC_004307	GGAA	2	8	27257	27264	50 %	0 %	50 %	0 %	23464650
62	NC_004307	GGCC	2	8	27609	27616	0 %	0 %	50 %	50 %	23464650
63	NC_004307	CTCA	2	8	27995	28002	25 %	25 %	0 %	50 %	23464651
64	NC_004307	CTCG	2	8	29068	29075	0 %	25 %	25 %	50 %	23464652
65	NC_004307	GGGC	2	8	30503	30510	0 %	0 %	75 %	25 %	23464653
66	NC_004307	ACGG	2	8	31226	31233	25 %	0 %	50 %	25 %	23464653
67	NC_004307	CCGC	2	8	33325	33332	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_004307	TGAC	2	8	33407	33414	25 %	25 %	25 %	25 %	23464656
69	NC_004307	GACG	2	8	33463	33470	25 %	0 %	50 %	25 %	23464656
70	NC_004307	CATC	2	8	34320	34327	25 %	25 %	0 %	50 %	23464656
71	NC_004307	TGAG	2	8	36057	36064	25 %	25 %	50 %	0 %	23464657
72	NC_004307	TTTG	2	8	36070	36077	0 %	75 %	25 %	0 %	23464657
73	NC_004307	GGCC	2	8	36295	36302	0 %	0 %	50 %	50 %	23464657
74	NC_004307	ACGC	2	8	36702	36709	25 %	0 %	25 %	50 %	23464657
75	NC_004307	CAGC	2	8	37375	37382	25 %	0 %	25 %	50 %	23464657
76	NC_004307	CCTG	2	8	37581	37588	0 %	25 %	25 %	50 %	23464658
77	NC_004307	GCCG	2	8	37852	37859	0 %	0 %	50 %	50 %	23464658
78	NC_004307	CTGG	2	8	38883	38890	0 %	25 %	50 %	25 %	23464659
79	NC_004307	GTCA	2	8	39100	39107	25 %	25 %	25 %	25 %	23464659
80	NC_004307	GGCC	2	8	39210	39217	0 %	0 %	50 %	50 %	23464659
81	NC_004307	TCGA	2	8	39584	39591	25 %	25 %	25 %	25 %	23464659
82	NC_004307	GCAA	2	8	40507	40514	50 %	0 %	25 %	25 %	23464660
83	NC_004307	GTTG	2	8	40531	40538	0 %	50 %	50 %	0 %	23464660
84	NC_004307	TGCG	2	8	40990	40997	0 %	25 %	50 %	25 %	23464660
85	NC_004307	CGAT	2	8	41067	41074	25 %	25 %	25 %	25 %	23464660
86	NC_004307	AGTG	2	8	41333	41340	25 %	25 %	50 %	0 %	23464660
87	NC_004307	TTCC	2	8	42999	43006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_004307	TGGC	2	8	44330	44337	0 %	25 %	50 %	25 %	23464662
89	NC_004307	CATT	2	8	44698	44705	25 %	50 %	0 %	25 %	23464663
90	NC_004307	GGCC	2	8	44780	44787	0 %	0 %	50 %	50 %	23464663
91	NC_004307	TCGG	2	8	44877	44884	0 %	25 %	50 %	25 %	23464663
92	NC_004307	TCCT	2	8	45012	45019	0 %	50 %	0 %	50 %	23464663
93	NC_004307	GCCG	2	8	45060	45067	0 %	0 %	50 %	50 %	23464663
94	NC_004307	CAAA	2	8	45702	45709	75 %	0 %	0 %	25 %	23464664
95	NC_004307	TGTC	2	8	45924	45931	0 %	50 %	25 %	25 %	23464664
96	NC_004307	GCCG	2	8	46612	46619	0 %	0 %	50 %	50 %	23464664
97	NC_004307	CTTT	2	8	46821	46828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_004307	CGAG	2	8	47458	47465	25 %	0 %	50 %	25 %	23464665
99	NC_004307	GACC	2	8	47737	47744	25 %	0 %	25 %	50 %	23464665
100	NC_004307	TCGG	2	8	47793	47800	0 %	25 %	50 %	25 %	23464665
101	NC_004307	ATGC	2	8	47829	47836	25 %	25 %	25 %	25 %	23464665
102	NC_004307	TGCG	2	8	48455	48462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_004307	CTGC	2	8	48722	48729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_004307	CAAG	2	8	50246	50253	50 %	0 %	25 %	25 %	23464667
105	NC_004307	TGTT	2	8	50485	50492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004307	CGGC	2	8	50544	50551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004307	CAGC	2	8	50873	50880	25 %	0 %	25 %	50 %	23464668
108	NC_004307	TCAA	2	8	51514	51521	50 %	25 %	0 %	25 %	23464669
109	NC_004307	GCTG	2	8	51614	51621	0 %	25 %	50 %	25 %	23464669
110	NC_004307	GAAT	2	8	52498	52505	50 %	25 %	25 %	0 %	23464671
111	NC_004307	CGGC	2	8	52984	52991	0 %	0 %	50 %	50 %	23464671
112	NC_004307	TTGC	2	8	53456	53463	0 %	50 %	25 %	25 %	23464671
113	NC_004307	CAGT	2	8	53554	53561	25 %	25 %	25 %	25 %	23464671
114	NC_004307	TCGT	2	8	53793	53800	0 %	50 %	25 %	25 %	23464671
115	NC_004307	GACC	2	8	54451	54458	25 %	0 %	25 %	50 %	23464671
116	NC_004307	GTGA	2	8	54486	54493	25 %	25 %	50 %	0 %	23464671
117	NC_004307	AGGC	2	8	54565	54572	25 %	0 %	50 %	25 %	23464671
118	NC_004307	CGGC	2	8	55031	55038	0 %	0 %	50 %	50 %	23464672
119	NC_004307	ACAG	2	8	55039	55046	50 %	0 %	25 %	25 %	23464672
120	NC_004307	GAAC	2	8	55387	55394	50 %	0 %	25 %	25 %	23464672
121	NC_004307	GATG	2	8	56026	56033	25 %	25 %	50 %	0 %	23464673
122	NC_004307	TCCG	2	8	56514	56521	0 %	25 %	25 %	50 %	23464673
123	NC_004307	GTGC	2	8	57037	57044	0 %	25 %	50 %	25 %	23464674
124	NC_004307	GCAT	2	8	57590	57597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_004307	AAGG	2	8	57750	57757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004307	CGCC	2	8	59006	59013	0 %	0 %	25 %	75 %	23464676
127	NC_004307	CGTA	2	8	59360	59367	25 %	25 %	25 %	25 %	23464676
128	NC_004307	AACC	2	8	59369	59376	50 %	0 %	0 %	50 %	23464676
129	NC_004307	TTGA	2	8	59863	59870	25 %	50 %	25 %	0 %	23464676
130	NC_004307	GCGG	2	8	60291	60298	0 %	0 %	75 %	25 %	23464677
131	NC_004307	CAGC	2	8	61108	61115	25 %	0 %	25 %	50 %	23464678
132	NC_004307	CAAG	2	8	61189	61196	50 %	0 %	25 %	25 %	23464678
133	NC_004307	GCCA	2	8	61343	61350	25 %	0 %	25 %	50 %	23464678
134	NC_004307	GCAA	2	8	61643	61650	50 %	0 %	25 %	25 %	23464678
135	NC_004307	GTCG	2	8	61667	61674	0 %	25 %	50 %	25 %	23464678
136	NC_004307	CGCC	2	8	61743	61750	0 %	0 %	25 %	75 %	23464678
137	NC_004307	GATG	2	8	61956	61963	25 %	25 %	50 %	0 %	23464678
138	NC_004307	GCCG	2	8	62241	62248	0 %	0 %	50 %	50 %	23464678
139	NC_004307	GCTC	2	8	62935	62942	0 %	25 %	25 %	50 %	23464678
140	NC_004307	ACGT	2	8	64870	64877	25 %	25 %	25 %	25 %	23464679
141	NC_004307	GCTG	2	8	66226	66233	0 %	25 %	50 %	25 %	23464679
142	NC_004307	CGCC	2	8	66300	66307	0 %	0 %	25 %	75 %	23464679
143	NC_004307	CGTG	2	8	66670	66677	0 %	25 %	50 %	25 %	23464679
144	NC_004307	ATGA	2	8	66749	66756	50 %	25 %	25 %	0 %	23464679
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