MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 50097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004307	GGC	2	6	160834	160839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_004307	CGT	2	6	160860	160865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_004307	GGTG	2	8	160889	160896	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_004307	GGT	2	6	160901	160906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_004307	CGT	2	6	160971	160976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_004307	GCCG	2	8	160985	160992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_004307	TGGCG	2	10	161006	161015	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3508	NC_004307	GTG	2	6	161020	161025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_004307	TCGAA	2	10	161092	161101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3510	NC_004307	TGA	2	6	161143	161148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_004307	GTC	2	6	161152	161157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_004307	GTG	2	6	161197	161202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_004307	TG	3	6	161201	161206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_004307	TTGC	2	8	161207	161214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_004307	TGG	2	6	161224	161229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_004307	GCC	2	6	161287	161292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_004307	ACCG	2	8	161333	161340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_004307	G	6	6	161366	161371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_004307	AGT	2	6	161422	161427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_004307	GCGA	2	8	161429	161436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_004307	GAT	2	6	161442	161447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_004307	GC	3	6	161484	161489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_004307	GCCG	2	8	161526	161533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_004307	GGGAG	2	10	161756	161765	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_004307	GAT	2	6	161949	161954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_004307	GGA	2	6	161993	161998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_004307	G	6	6	162023	162028	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_004307	TC	3	6	162079	162084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_004307	CGG	2	6	162216	162221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_004307	TCG	3	9	162232	162240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_004307	CGT	2	6	162260	162265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_004307	AGG	2	6	162322	162327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_004307	AGC	2	6	162338	162343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_004307	CAC	2	6	162416	162421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_004307	GA	3	6	162533	162538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_004307	GCC	2	6	162677	162682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_004307	TCCGGG	2	12	162708	162719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_004307	GTA	2	6	162771	162776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_004307	GCCG	2	8	162806	162813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_004307	GGT	2	6	162818	162823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_004307	GAT	2	6	162887	162892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_004307	GCC	2	6	162959	162964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_004307	TGG	2	6	162983	162988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_004307	AC	3	6	163086	163091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_004307	CGG	2	6	163267	163272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_004307	CG	3	6	163515	163520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_004307	AGTGCA	2	12	163687	163698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3548	NC_004307	GAC	2	6	163719	163724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_004307	CCGGTG	2	12	163759	163770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_004307	TCG	2	6	163876	163881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_004307	CGT	2	6	163956	163961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_004307	GAG	2	6	164003	164008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_004307	TCC	2	6	164300	164305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_004307	GCC	2	6	164390	164395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_004307	AGA	2	6	164431	164436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_004307	GCG	2	6	164440	164445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_004307	CGC	3	9	164545	164553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_004307	CAA	2	6	164616	164621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_004307	AGA	2	6	164683	164688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_004307	GAAATT	2	12	164747	164758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	23465854
3561	NC_004307	ATC	2	6	164813	164818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465854
3562	NC_004307	ACG	2	6	164889	164894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465854
3563	NC_004307	GCA	2	6	164931	164936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465854
3564	NC_004307	CCG	2	6	164991	164996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465854
3565	NC_004307	GCC	2	6	164999	165004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465854
3566	NC_004307	CAG	2	6	165100	165105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465854
3567	NC_004307	CAC	2	6	165107	165112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465854
3568	NC_004307	ATG	2	6	165140	165145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465854
3569	NC_004307	GTC	2	6	165206	165211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465854
3570	NC_004307	CTG	2	6	165218	165223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465854
3571	NC_004307	CTG	2	6	165232	165237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465854
3572	NC_004307	TGG	2	6	165343	165348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465854
3573	NC_004307	AAG	2	6	165351	165356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465854
3574	NC_004307	GTA	2	6	165480	165485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465854
3575	NC_004307	GTT	2	6	165539	165544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23465854
3576	NC_004307	GTA	2	6	165587	165592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_004307	T	7	7	165662	165668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_004307	TTA	2	6	165797	165802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23465855
3579	NC_004307	TGG	2	6	165838	165843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465855
3580	NC_004307	CAT	2	6	165927	165932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465855
3581	NC_004307	GCCGA	2	10	166013	166022	20 %	0 %	40 %	40 %	23465855
3582	NC_004307	GCT	2	6	166103	166108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465855
3583	NC_004307	CG	3	6	166158	166163	0 %	0 %	50 %	50 %	23465855
3584	NC_004307	ACT	2	6	166193	166198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465855
3585	NC_004307	GGC	2	6	166236	166241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465855
3586	NC_004307	ACA	2	6	166352	166357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465855
3587	NC_004307	CCG	2	6	166400	166405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465855
3588	NC_004307	CCA	2	6	166442	166447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465855
3589	NC_004307	ACA	2	6	166481	166486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465855
3590	NC_004307	TGC	2	6	166551	166556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465855
3591	NC_004307	GAA	2	6	166576	166581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465855
3592	NC_004307	TGCC	2	8	166717	166724	0 %	25 %	25 %	50 %	23465855
3593	NC_004307	TGG	2	6	166730	166735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465855
3594	NC_004307	ATG	2	6	166813	166818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465855
3595	NC_004307	GGC	2	6	166903	166908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465855
3596	NC_004307	GTG	2	6	166926	166931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465855
3597	NC_004307	CAG	2	6	166994	166999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465855
3598	NC_004307	CTG	2	6	167035	167040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465855
3599	NC_004307	CGCA	2	8	167085	167092	25 %	0 %	25 %	50 %	23465855
3600	NC_004307	TGC	2	6	167135	167140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465855
3601	NC_004307	CAT	2	6	167163	167168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465856
3602	NC_004307	GCA	2	6	167327	167332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465856
3603	NC_004307	GCGT	2	8	167447	167454	0 %	25 %	50 %	25 %	23465856
3604	NC_004307	CACG	2	8	167481	167488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_004307	CGC	2	6	167524	167529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_004307	TGAG	2	8	167563	167570	25 %	25 %	50 %	0 %	23465857
3607	NC_004307	CAT	2	6	167573	167578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465857
3608	NC_004307	TGC	2	6	167642	167647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465857
3609	NC_004307	GAG	2	6	167733	167738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465857
3610	NC_004307	GC	3	6	167822	167827	0 %	0 %	50 %	50 %	23465857
3611	NC_004307	GCGCC	2	10	167846	167855	0 %	0 %	40 %	60 %	23465857
3612	NC_004307	GCC	2	6	167865	167870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465857
3613	NC_004307	CGG	2	6	167966	167971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465857
3614	NC_004307	TCA	2	6	167995	168000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465857
3615	NC_004307	GCC	2	6	168021	168026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465857
3616	NC_004307	CGCC	2	8	168055	168062	0 %	0 %	25 %	75 %	23465857
3617	NC_004307	CGG	2	6	168143	168148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465857
3618	NC_004307	CAT	2	6	168329	168334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465857
3619	NC_004307	CGA	2	6	168338	168343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465857
3620	NC_004307	CTG	2	6	168360	168365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465857
3621	NC_004307	GCC	2	6	168366	168371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465857
3622	NC_004307	CGC	2	6	168584	168589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465857
3623	NC_004307	GTC	2	6	168627	168632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465857
3624	NC_004307	TGC	2	6	168718	168723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465857
3625	NC_004307	CGG	2	6	168728	168733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465857
3626	NC_004307	CCGC	2	8	168736	168743	0 %	0 %	25 %	75 %	23465857
3627	NC_004307	CGC	2	6	168746	168751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465857
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3748	NC_004307	CG	3	6	173662	173667	0 %	0 %	50 %	50 %	23465862
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3993	NC_004307	CATC	2	8	184459	184466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3994	NC_004307	GGTGCC	2	12	184509	184520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	23465869
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3997	NC_004307	GCA	2	6	184625	184630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465869
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4000	NC_004307	CAT	2	6	184787	184792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465869

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