MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 50097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004307	TGG	3	9	138036	138044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464740
3002	NC_004307	ATG	2	6	138063	138068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464740
3003	NC_004307	GCA	3	9	138124	138132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464740
3004	NC_004307	CAGCT	2	10	138204	138213	20 %	20 %	20 %	40 %	23464740
3005	NC_004307	CAT	2	6	138220	138225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464740
3006	NC_004307	GAA	2	6	138286	138291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464740
3007	NC_004307	GGT	2	6	138302	138307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464740
3008	NC_004307	TGG	2	6	138358	138363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464740
3009	NC_004307	GGA	2	6	138395	138400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23464740
3010	NC_004307	ATC	2	6	138459	138464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464740
3011	NC_004307	GGT	2	6	138478	138483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464740
3012	NC_004307	CG	3	6	138503	138508	0 %	0 %	50 %	50 %	23464740
3013	NC_004307	CGG	2	6	138511	138516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464740
3014	NC_004307	TGA	2	6	138583	138588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464740
3015	NC_004307	GGCG	2	8	138595	138602	0 %	0 %	75 %	25 %	23464740
3016	NC_004307	GGT	2	6	138622	138627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464740
3017	NC_004307	TGG	2	6	138670	138675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464740
3018	NC_004307	GC	3	6	138693	138698	0 %	0 %	50 %	50 %	23464740
3019	NC_004307	GCG	3	9	138719	138727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464740
3020	NC_004307	CGC	2	6	138748	138753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464740
3021	NC_004307	CCTT	2	8	138789	138796	0 %	50 %	0 %	50 %	23464740
3022	NC_004307	CGG	2	6	138836	138841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464740
3023	NC_004307	GCT	2	6	138964	138969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464740
3024	NC_004307	GCG	2	6	138981	138986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464740
3025	NC_004307	GCT	3	9	138997	139005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464740
3026	NC_004307	CTT	2	6	139049	139054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23464740
3027	NC_004307	AGC	2	6	139094	139099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464740
3028	NC_004307	ACG	2	6	139128	139133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464740
3029	NC_004307	CG	3	6	139132	139137	0 %	0 %	50 %	50 %	23464740
3030	NC_004307	CTT	2	6	139151	139156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23464740
3031	NC_004307	CGC	2	6	139159	139164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464740
3032	NC_004307	GC	3	6	139193	139198	0 %	0 %	50 %	50 %	23464740
3033	NC_004307	CCAG	2	8	139244	139251	25 %	0 %	25 %	50 %	23464740
3034	NC_004307	CGC	3	9	139294	139302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464740
3035	NC_004307	ACC	2	6	139308	139313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464740
3036	NC_004307	GCG	2	6	139350	139355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464740
3037	NC_004307	CGT	2	6	139375	139380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464740
3038	NC_004307	GCC	2	6	139382	139387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464740
3039	NC_004307	TGG	3	9	139405	139413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464740
3040	NC_004307	TGA	2	6	139468	139473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464740
3041	NC_004307	TCG	2	6	139518	139523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464740
3042	NC_004307	CG	3	6	139543	139548	0 %	0 %	50 %	50 %	23464740
3043	NC_004307	GCG	2	6	139598	139603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464740
3044	NC_004307	CAC	2	6	139613	139618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464740
3045	NC_004307	GTC	2	6	139628	139633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464740
3046	NC_004307	GAT	2	6	139673	139678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464740
3047	NC_004307	CCT	2	6	139723	139728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23464740
3048	NC_004307	GC	3	6	139731	139736	0 %	0 %	50 %	50 %	23464740
3049	NC_004307	GCC	2	6	139754	139759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464740
3050	NC_004307	CCA	2	6	139774	139779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464740
3051	NC_004307	TCC	2	6	139806	139811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23464740
3052	NC_004307	CAC	2	6	139817	139822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464740
3053	NC_004307	ATT	3	9	139881	139889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23464740
3054	NC_004307	TGT	2	6	139898	139903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_004307	A	6	6	139925	139930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_004307	TCA	2	6	139946	139951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_004307	ACT	2	6	139964	139969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464741
3058	NC_004307	CGG	2	6	140000	140005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464741
3059	NC_004307	CG	3	6	140082	140087	0 %	0 %	50 %	50 %	23464741
3060	NC_004307	CAG	2	6	140094	140099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464741
3061	NC_004307	GCG	2	6	140113	140118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464741
3062	NC_004307	CGC	2	6	140156	140161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464741
3063	NC_004307	AGC	2	6	140168	140173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464741
3064	NC_004307	GAT	2	6	140181	140186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464741
3065	NC_004307	TCA	2	6	140192	140197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464741
3066	NC_004307	GCC	2	6	140205	140210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464741
3067	NC_004307	GGA	2	6	140295	140300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23464741
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3069	NC_004307	CGT	2	6	140366	140371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464741
3070	NC_004307	CGG	2	6	140387	140392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464741
3071	NC_004307	CG	3	6	140472	140477	0 %	0 %	50 %	50 %	23464741
3072	NC_004307	GAA	2	6	140510	140515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464741
3073	NC_004307	CGG	2	6	140540	140545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464741
3074	NC_004307	AGT	2	6	140576	140581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464741
3075	NC_004307	GCA	2	6	140624	140629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464741
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3078	NC_004307	GCC	2	6	140719	140724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464741
3079	NC_004307	GTC	2	6	140785	140790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464741
3080	NC_004307	CGG	2	6	140858	140863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464741
3081	NC_004307	GAT	2	6	140890	140895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464741
3082	NC_004307	TCAGGC	2	12	140952	140963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_004307	GTC	2	6	141062	141067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_004307	CCG	2	6	141110	141115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_004307	TGACGC	2	12	141136	141147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_004307	ACA	2	6	141180	141185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_004307	GCC	2	6	141264	141269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_004307	GTT	2	6	141303	141308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_004307	CCG	2	6	141406	141411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464742
3090	NC_004307	CGG	2	6	141422	141427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464742
3091	NC_004307	TGG	2	6	141492	141497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464742
3092	NC_004307	GTC	2	6	141507	141512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3093	NC_004307	GTC	2	6	141525	141530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3094	NC_004307	CAT	2	6	141545	141550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464742
3095	NC_004307	GCC	2	6	141554	141559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464742
3096	NC_004307	GTGG	2	8	141566	141573	0 %	25 %	75 %	0 %	23464742
3097	NC_004307	TCG	2	6	141607	141612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3098	NC_004307	CG	3	6	141754	141759	0 %	0 %	50 %	50 %	23464742
3099	NC_004307	ATG	2	6	141768	141773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464742
3100	NC_004307	CACC	2	8	141779	141786	25 %	0 %	0 %	75 %	23464742
3101	NC_004307	TGA	2	6	141868	141873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464742
3102	NC_004307	GCC	2	6	141890	141895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464742
3103	NC_004307	AGATGG	2	12	141979	141990	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	23464742
3104	NC_004307	TTC	2	6	141993	141998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23464742
3105	NC_004307	ACT	2	6	142126	142131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464742
3106	NC_004307	GC	3	6	142228	142233	0 %	0 %	50 %	50 %	23464742
3107	NC_004307	GCC	2	6	142314	142319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464742
3108	NC_004307	GCG	2	6	142390	142395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464742
3109	NC_004307	TGC	2	6	142411	142416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3110	NC_004307	GCC	2	6	142446	142451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464742
3111	NC_004307	TGC	2	6	142453	142458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3112	NC_004307	AAG	2	6	142467	142472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464742
3113	NC_004307	CGA	2	6	142505	142510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3114	NC_004307	GAT	2	6	142529	142534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464742
3115	NC_004307	ACG	2	6	142540	142545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3116	NC_004307	GTC	2	6	142561	142566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3117	NC_004307	CGT	2	6	142572	142577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464742
3118	NC_004307	GCC	2	6	142710	142715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464742
3119	NC_004307	CGG	2	6	142802	142807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464742
3120	NC_004307	GGC	2	6	142899	142904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_004307	CTC	2	6	142919	142924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_004307	TC	3	6	142923	142928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_004307	AATCCG	2	12	142969	142980	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	23464743
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3244	NC_004307	ATTTG	2	10	148713	148722	20 %	60 %	20 %	0 %	23464749
3245	NC_004307	GGA	2	6	148725	148730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23464749
3246	NC_004307	GAGCCT	2	12	148738	148749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	23464749
3247	NC_004307	GAT	2	6	148783	148788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464749
3248	NC_004307	GGC	2	6	148818	148823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464749
3249	NC_004307	GGT	2	6	149050	149055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464749
3250	NC_004307	GC	3	6	149094	149099	0 %	0 %	50 %	50 %	23464749
3251	NC_004307	CCGG	2	8	149131	149138	0 %	0 %	50 %	50 %	23464749
3252	NC_004307	TCA	2	6	149226	149231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464749
3253	NC_004307	CGGTC	2	10	149387	149396	0 %	20 %	40 %	40 %	23464749
3254	NC_004307	GCC	2	6	149419	149424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464749
3255	NC_004307	TGG	2	6	149486	149491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464749
3256	NC_004307	CAT	2	6	149511	149516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_004307	GA	3	6	149571	149576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_004307	ATG	2	6	149583	149588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_004307	GTGAA	2	10	149707	149716	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_004307	CTG	2	6	149779	149784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_004307	CGA	3	9	149822	149830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_004307	ACG	2	6	149840	149845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_004307	AAG	2	6	149908	149913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_004307	CAA	2	6	149955	149960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464750
3265	NC_004307	CCT	2	6	149979	149984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23464750
3266	NC_004307	GTG	2	6	149992	149997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464750
3267	NC_004307	TAC	2	6	150094	150099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464750
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3269	NC_004307	CGTG	2	8	150162	150169	0 %	25 %	50 %	25 %	23464750
3270	NC_004307	GGC	2	6	150293	150298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3271	NC_004307	CTG	2	6	150331	150336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3272	NC_004307	TGAAT	2	10	150355	150364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_004307	CAA	2	6	150459	150464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3274	NC_004307	AAC	2	6	150469	150474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3275	NC_004307	CTG	2	6	150589	150594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464751
3276	NC_004307	CTG	2	6	150616	150621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464751
3277	NC_004307	T	6	6	150628	150633	0 %	100 %	0 %	0 %	23464751
3278	NC_004307	ATTG	2	8	150685	150692	25 %	50 %	25 %	0 %	23464751
3279	NC_004307	GCA	2	6	150693	150698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464751
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3294	NC_004307	CT	3	6	151395	151400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3295	NC_004307	GAT	2	6	151407	151412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3297	NC_004307	GATT	2	8	151598	151605	25 %	50 %	25 %	0 %	23464752
3298	NC_004307	GA	3	6	151628	151633	50 %	0 %	50 %	0 %	23464752
3299	NC_004307	CTG	2	6	151661	151666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464752
3300	NC_004307	G	6	6	151734	151739	0 %	0 %	100 %	0 %	23464752
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3302	NC_004307	CCG	2	6	151833	151838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3303	NC_004307	AAC	2	6	151881	151886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464753
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3365	NC_004307	AACTT	2	10	154792	154801	40 %	40 %	0 %	20 %	23464753
3366	NC_004307	CAG	2	6	154929	154934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464753
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3368	NC_004307	TCCA	2	8	155028	155035	25 %	25 %	0 %	50 %	23464753
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3496	NC_004307	ATC	2	6	160422	160427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_004307	AC	3	6	160619	160624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3498	NC_004307	GCA	2	6	160648	160653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3499	NC_004307	CCT	2	6	160763	160768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3500	NC_004307	CG	3	6	160814	160819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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