MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 50097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004307	AGC	2	6	234119	234124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465900
5002	NC_004307	TGG	2	6	234132	234137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465900
5003	NC_004307	TTC	2	6	234275	234280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465900
5004	NC_004307	TCG	2	6	234365	234370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465900
5005	NC_004307	TTC	2	6	234419	234424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465900
5006	NC_004307	GCC	2	6	234454	234459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465900
5007	NC_004307	GCA	2	6	234477	234482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465900
5008	NC_004307	CAG	2	6	234490	234495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465900
5009	NC_004307	TGGT	2	8	234528	234535	0 %	50 %	50 %	0 %	23465900
5010	NC_004307	TTCCT	2	10	234536	234545	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5011	NC_004307	GAA	2	6	234613	234618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465901
5012	NC_004307	CTG	2	6	234654	234659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465901
5013	NC_004307	CCG	2	6	234672	234677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465901
5014	NC_004307	CGG	2	6	234681	234686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465901
5015	NC_004307	GC	3	6	234752	234757	0 %	0 %	50 %	50 %	23465901
5016	NC_004307	GAT	3	9	234802	234810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465901
5017	NC_004307	TCG	2	6	234896	234901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465901
5018	NC_004307	GCGG	2	8	234928	234935	0 %	0 %	75 %	25 %	23465901
5019	NC_004307	GGC	2	6	235056	235061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465901
5020	NC_004307	GGC	2	6	235096	235101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465901
5021	NC_004307	TGA	2	6	235116	235121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465901
5022	NC_004307	GAC	2	6	235122	235127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465901
5023	NC_004307	ATA	2	6	235168	235173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23465901
5024	NC_004307	TCG	2	6	235283	235288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465901
5025	NC_004307	CGG	2	6	235329	235334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465901
5026	NC_004307	GTT	2	6	235410	235415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23465901
5027	NC_004307	TGG	2	6	235424	235429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465901
5028	NC_004307	CA	3	6	235500	235505	50 %	0 %	0 %	50 %	23465901
5029	NC_004307	AGCG	2	8	235529	235536	25 %	0 %	50 %	25 %	23465901
5030	NC_004307	GAT	2	6	235552	235557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465901
5031	NC_004307	GTG	2	6	235568	235573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465901
5032	NC_004307	CGG	2	6	235595	235600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465901
5033	NC_004307	GC	3	6	235710	235715	0 %	0 %	50 %	50 %	23465901
5034	NC_004307	GTG	2	6	235799	235804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465901
5035	NC_004307	TTG	2	6	235806	235811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23465901
5036	NC_004307	TCC	2	6	235826	235831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_004307	GTT	2	6	235850	235855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_004307	ATTG	2	8	235902	235909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_004307	CAAT	2	8	235913	235920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_004307	GT	3	6	235931	235936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_004307	GTC	2	6	235950	235955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_004307	GAA	2	6	236023	236028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_004307	GGA	2	6	236033	236038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_004307	TCG	2	6	236190	236195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465902
5045	NC_004307	ACG	2	6	236376	236381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465902
5046	NC_004307	GCC	3	9	236387	236395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465902
5047	NC_004307	CGGC	2	8	236523	236530	0 %	0 %	50 %	50 %	23465902
5048	NC_004307	CCG	2	6	236648	236653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465902
5049	NC_004307	TCG	2	6	236668	236673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465902
5050	NC_004307	CG	3	6	236672	236677	0 %	0 %	50 %	50 %	23465902
5051	NC_004307	GAGGCC	2	12	236687	236698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	23465902
5052	NC_004307	GC	3	6	236722	236727	0 %	0 %	50 %	50 %	23465902
5053	NC_004307	GGC	2	6	236789	236794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465902
5054	NC_004307	CCGGC	2	10	236888	236897	0 %	0 %	40 %	60 %	23465902
5055	NC_004307	GCC	2	6	236939	236944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465902
5056	NC_004307	GGC	2	6	236947	236952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465902
5057	NC_004307	GT	3	6	237191	237196	0 %	50 %	50 %	0 %	23465903
5058	NC_004307	GGC	2	6	237217	237222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465903
5059	NC_004307	TGA	2	6	237261	237266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465903
5060	NC_004307	GCCC	2	8	237346	237353	0 %	0 %	25 %	75 %	23465903
5061	NC_004307	TGC	2	6	237371	237376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465903
5062	NC_004307	CTG	2	6	237384	237389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465903
5063	NC_004307	CTT	2	6	237400	237405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465903
5064	NC_004307	ATC	2	6	237422	237427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465903
5065	NC_004307	CGT	2	6	237636	237641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465903
5066	NC_004307	GGA	2	6	237718	237723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465903
5067	NC_004307	CCGATG	2	12	237764	237775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	23465903
5068	NC_004307	TCT	2	6	237801	237806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465903
5069	NC_004307	GAT	2	6	237817	237822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465903
5070	NC_004307	GCA	2	6	237909	237914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465903
5071	NC_004307	TGA	2	6	237939	237944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465903
5072	NC_004307	TCGA	2	8	237952	237959	25 %	25 %	25 %	25 %	23465903
5073	NC_004307	CAG	2	6	237970	237975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465903
5074	NC_004307	TTTGCC	2	12	237985	237996	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	23465903
5075	NC_004307	GCA	2	6	238023	238028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465903
5076	NC_004307	TCCT	2	8	238030	238037	0 %	50 %	0 %	50 %	23465903
5077	NC_004307	CCGA	2	8	238045	238052	25 %	0 %	25 %	50 %	23465903
5078	NC_004307	GC	3	6	238103	238108	0 %	0 %	50 %	50 %	23465903
5079	NC_004307	TGGT	2	8	238115	238122	0 %	50 %	50 %	0 %	23465903
5080	NC_004307	AAC	3	9	238127	238135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465903
5081	NC_004307	GCG	2	6	238159	238164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465903
5082	NC_004307	CGG	2	6	238170	238175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465903
5083	NC_004307	GTC	2	6	238195	238200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465903
5084	NC_004307	TCC	2	6	238234	238239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_004307	TTG	2	6	238268	238273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_004307	TCG	2	6	238307	238312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_004307	TAA	2	6	238336	238341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_004307	TG	3	6	238355	238360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_004307	GGT	2	6	238452	238457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_004307	CGC	2	6	238463	238468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_004307	GCG	2	6	238515	238520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_004307	CGGG	2	8	238537	238544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5093	NC_004307	GGA	2	6	238557	238562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_004307	ATC	2	6	238577	238582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465904
5095	NC_004307	CAAAG	2	10	238642	238651	60 %	0 %	20 %	20 %	23465904
5096	NC_004307	GCC	2	6	238694	238699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465904
5097	NC_004307	GCGT	2	8	238749	238756	0 %	25 %	50 %	25 %	23465904
5098	NC_004307	CCAT	2	8	238818	238825	25 %	25 %	0 %	50 %	23465904
5099	NC_004307	GGCC	2	8	238927	238934	0 %	0 %	50 %	50 %	23465904
5100	NC_004307	GGC	2	6	238964	238969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465904
5101	NC_004307	TCGGCA	2	12	238986	238997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	23465904
5102	NC_004307	CG	3	6	239089	239094	0 %	0 %	50 %	50 %	23465904
5103	NC_004307	CTT	2	6	239095	239100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465904
5104	NC_004307	CCCA	2	8	239123	239130	25 %	0 %	0 %	75 %	23465904
5105	NC_004307	TGC	2	6	239178	239183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465904
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5108	NC_004307	GAG	2	6	239300	239305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465904
5109	NC_004307	ACT	2	6	239331	239336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465904
5110	NC_004307	AAC	2	6	239430	239435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_004307	CG	3	6	239461	239466	0 %	0 %	50 %	50 %	23465905
5112	NC_004307	CG	3	6	239513	239518	0 %	0 %	50 %	50 %	23465905
5113	NC_004307	GC	3	6	239529	239534	0 %	0 %	50 %	50 %	23465905
5114	NC_004307	GTC	2	6	239556	239561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465905
5115	NC_004307	GCC	2	6	239568	239573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465905
5116	NC_004307	GGC	2	6	239585	239590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465905
5117	NC_004307	GAG	2	6	239601	239606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465905
5118	NC_004307	ACT	2	6	239617	239622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465905
5119	NC_004307	GGCC	2	8	239771	239778	0 %	0 %	50 %	50 %	23465905
5120	NC_004307	CAC	2	6	239792	239797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465905
5121	NC_004307	GCC	2	6	239881	239886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465905
5122	NC_004307	CCTGGC	2	12	239921	239932	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	23465905
5123	NC_004307	TCG	2	6	239983	239988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465905
5124	NC_004307	CGC	2	6	240101	240106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465905
5125	NC_004307	GTG	2	6	240114	240119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465905
5126	NC_004307	CGCGGG	2	12	240173	240184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465905
5127	NC_004307	CAT	2	6	240185	240190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465905
5128	NC_004307	GGA	2	6	240257	240262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465905
5129	NC_004307	CG	3	6	240265	240270	0 %	0 %	50 %	50 %	23465905
5130	NC_004307	TCA	2	6	240283	240288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465905
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5134	NC_004307	CGG	2	6	240434	240439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465905
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5140	NC_004307	GAT	2	6	240780	240785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_004307	CGT	2	6	240819	240824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_004307	TGA	2	6	240962	240967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_004307	GA	3	6	240984	240989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5187	NC_004307	CGC	2	6	242725	242730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5223	NC_004307	CAAGA	2	10	243906	243915	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5231	NC_004307	GTGTG	2	10	244216	244225	0 %	40 %	60 %	0 %	23465908
5232	NC_004307	GCAC	2	8	244230	244237	25 %	0 %	25 %	50 %	23465908
5233	NC_004307	TCG	2	6	244252	244257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465908
5234	NC_004307	TGC	2	6	244264	244269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465908
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5240	NC_004307	GTG	2	6	244467	244472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465908
5241	NC_004307	CG	4	8	244544	244551	0 %	0 %	50 %	50 %	23465908
5242	NC_004307	CAT	2	6	244574	244579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465908
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5245	NC_004307	TGG	2	6	244761	244766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465908
5246	NC_004307	GC	3	6	244859	244864	0 %	0 %	50 %	50 %	23465908
5247	NC_004307	CCG	2	6	244873	244878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465908
5248	NC_004307	GATC	2	8	244891	244898	25 %	25 %	25 %	25 %	23465908
5249	NC_004307	CGTC	2	8	244906	244913	0 %	25 %	25 %	50 %	23465908
5250	NC_004307	CGCA	2	8	244934	244941	25 %	0 %	25 %	50 %	23465908
5251	NC_004307	CCG	2	6	244977	244982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465908
5252	NC_004307	TCG	2	6	245011	245016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465908
5253	NC_004307	GA	3	6	245059	245064	50 %	0 %	50 %	0 %	23465908
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5255	NC_004307	CG	3	6	245225	245230	0 %	0 %	50 %	50 %	23465909
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5282	NC_004307	GCT	2	6	246278	246283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465909
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5354	NC_004307	TCCTTG	2	12	248957	248968	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	23465911
5355	NC_004307	TGTA	2	8	249000	249007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_004307	GTT	2	6	249008	249013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_004307	ATC	2	6	249019	249024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5358	NC_004307	GCG	2	6	249135	249140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5359	NC_004307	TGGGCT	2	12	249191	249202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5360	NC_004307	TCGCG	2	10	249272	249281	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5367	NC_004307	GGTC	2	8	249576	249583	0 %	25 %	50 %	25 %	23465912
5368	NC_004307	GAT	2	6	249622	249627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465912
5369	NC_004307	CG	3	6	249635	249640	0 %	0 %	50 %	50 %	23465912
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5371	NC_004307	CGG	2	6	249729	249734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465912
5372	NC_004307	CAT	2	6	249966	249971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465912
5373	NC_004307	CCA	2	6	250011	250016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465912
5374	NC_004307	GCC	2	6	250018	250023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465912
5375	NC_004307	CGG	2	6	250081	250086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465912
5376	NC_004307	CAA	2	6	250147	250152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465912
5377	NC_004307	CAC	2	6	250155	250160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465912
5378	NC_004307	CGG	2	6	250169	250174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465912
5379	NC_004307	TG	3	6	250260	250265	0 %	50 %	50 %	0 %	23465912
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5382	NC_004307	AAC	2	6	250450	250455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5383	NC_004307	ATC	2	6	250480	250485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5386	NC_004307	TCTG	2	8	250583	250590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5387	NC_004307	CGA	2	6	250637	250642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_004307	GAT	2	6	250739	250744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_004307	GAG	2	6	250839	250844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_004307	CAT	2	6	250910	250915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465913
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5402	NC_004307	AGA	2	6	251351	251356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5403	NC_004307	CAT	2	6	251417	251422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465914
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5481	NC_004307	CGG	2	6	255125	255130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465915
5482	NC_004307	GCCAAA	2	12	255153	255164	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	23465915
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5484	NC_004307	ATCGC	2	10	255265	255274	20 %	20 %	20 %	40 %	23465915
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5490	NC_004307	GCT	2	6	255545	255550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465915
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5492	NC_004307	CGC	2	6	255579	255584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465915
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5494	NC_004307	GCC	2	6	255666	255671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465915
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5496	NC_004307	GCC	2	6	255699	255704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465915
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5498	NC_004307	GCC	3	9	255723	255731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465915
5499	NC_004307	GC	4	8	255761	255768	0 %	0 %	50 %	50 %	23465915
5500	NC_004307	GCC	2	6	255846	255851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465915

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