MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 50097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_004307	CGA	2	6	2252609	2252614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466353
50002	NC_004307	CCA	2	6	2252654	2252659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23466353
50003	NC_004307	TCG	2	6	2252662	2252667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23466353
50004	NC_004307	CG	4	8	2252716	2252723	0 %	0 %	50 %	50 %	23466353
50005	NC_004307	TGCG	2	8	2252741	2252748	0 %	25 %	50 %	25 %	23466353
50006	NC_004307	ATG	2	6	2252761	2252766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23466353
50007	NC_004307	CGA	2	6	2252804	2252809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466353
50008	NC_004307	CCA	3	9	2252813	2252821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23466353
50009	NC_004307	GAT	2	6	2252883	2252888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50010	NC_004307	CAT	2	6	2252904	2252909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23466354
50011	NC_004307	AGTC	2	8	2252924	2252931	25 %	25 %	25 %	25 %	23466354
50012	NC_004307	GTG	2	6	2252967	2252972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466354
50013	NC_004307	CGA	2	6	2252998	2253003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466354
50014	NC_004307	GCG	2	6	2253030	2253035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23466354
50015	NC_004307	CGG	2	6	2253169	2253174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23466354
50016	NC_004307	TCG	2	6	2253211	2253216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23466354
50017	NC_004307	ACG	2	6	2253254	2253259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466354
50018	NC_004307	GTG	2	6	2253264	2253269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466354
50019	NC_004307	CTC	2	6	2253278	2253283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23466354
50020	NC_004307	GC	3	6	2253338	2253343	0 %	0 %	50 %	50 %	23466354
50021	NC_004307	CAG	2	6	2253350	2253355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466354
50022	NC_004307	TGA	2	6	2253372	2253377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23466354
50023	NC_004307	GCGT	2	8	2253406	2253413	0 %	25 %	50 %	25 %	23466354
50024	NC_004307	GCG	2	6	2253510	2253515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23466354
50025	NC_004307	GCGCTC	2	12	2253626	2253637	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	23466354
50026	NC_004307	ACC	2	6	2253639	2253644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23466354
50027	NC_004307	GGC	2	6	2253649	2253654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23466354
50028	NC_004307	GGCG	2	8	2253658	2253665	0 %	0 %	75 %	25 %	23466354
50029	NC_004307	TCG	2	6	2253693	2253698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23466354
50030	NC_004307	CATC	2	8	2253718	2253725	25 %	25 %	0 %	50 %	23466354
50031	NC_004307	CGC	2	6	2253730	2253735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23466354
50032	NC_004307	GCC	2	6	2253737	2253742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23466354
50033	NC_004307	ACG	2	6	2253743	2253748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466354
50034	NC_004307	GC	3	6	2253772	2253777	0 %	0 %	50 %	50 %	23466354
50035	NC_004307	CCTT	2	8	2253784	2253791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50036	NC_004307	AGGC	2	8	2253797	2253804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50037	NC_004307	TCT	2	6	2253829	2253834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50038	NC_004307	CGA	2	6	2253873	2253878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466355
50039	NC_004307	CGA	2	6	2253885	2253890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466355
50040	NC_004307	ATA	2	6	2253935	2253940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23466355
50041	NC_004307	GCA	2	6	2253948	2253953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466355
50042	NC_004307	CAC	2	6	2253985	2253990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23466355
50043	NC_004307	TGG	2	6	2254044	2254049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466355
50044	NC_004307	CG	3	6	2254050	2254055	0 %	0 %	50 %	50 %	23466355
50045	NC_004307	GAC	2	6	2254079	2254084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466355
50046	NC_004307	GCC	2	6	2254178	2254183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23466355
50047	NC_004307	A	6	6	2254190	2254195	100 %	0 %	0 %	0 %	23466355
50048	NC_004307	CGG	2	6	2254259	2254264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23466355
50049	NC_004307	TCG	2	6	2254292	2254297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23466355
50050	NC_004307	TCA	2	6	2254323	2254328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23466355
50051	NC_004307	CTC	3	9	2254369	2254377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23466355
50052	NC_004307	CCG	2	6	2254433	2254438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23466355
50053	NC_004307	CAG	2	6	2254513	2254518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466355
50054	NC_004307	GTG	2	6	2254550	2254555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466355
50055	NC_004307	CAGAT	2	10	2254594	2254603	40 %	20 %	20 %	20 %	23466355
50056	NC_004307	TGCAC	2	10	2254620	2254629	20 %	20 %	20 %	40 %	23466355
50057	NC_004307	GGC	2	6	2254669	2254674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23466355
50058	NC_004307	CCA	2	6	2254725	2254730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23466355
50059	NC_004307	CCA	2	6	2254767	2254772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23466355
50060	NC_004307	GCG	2	6	2254883	2254888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23466355
50061	NC_004307	C	6	6	2254934	2254939	0 %	0 %	0 %	100 %	23466355
50062	NC_004307	ACT	2	6	2254946	2254951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50063	NC_004307	GCCT	2	8	2254966	2254973	0 %	25 %	25 %	50 %	23466356
50064	NC_004307	GAA	2	6	2255047	2255052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23466356
50065	NC_004307	CCA	2	6	2255154	2255159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23466356
50066	NC_004307	GC	3	6	2255188	2255193	0 %	0 %	50 %	50 %	23466356
50067	NC_004307	TCC	2	6	2255225	2255230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23466356
50068	NC_004307	GCC	2	6	2255256	2255261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23466356
50069	NC_004307	TGG	2	6	2255331	2255336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466356
50070	NC_004307	GTC	2	6	2255353	2255358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23466356
50071	NC_004307	CG	3	6	2255509	2255514	0 %	0 %	50 %	50 %	23466356
50072	NC_004307	CGG	2	6	2255550	2255555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23466356
50073	NC_004307	GAA	2	6	2255568	2255573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23466356
50074	NC_004307	TGG	2	6	2255585	2255590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466356
50075	NC_004307	TGG	2	6	2255592	2255597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466356
50076	NC_004307	CAC	2	6	2255666	2255671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50077	NC_004307	GTG	2	6	2255705	2255710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50078	NC_004307	TGG	2	6	2255711	2255716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50079	NC_004307	TGA	2	6	2255719	2255724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50080	NC_004307	GTT	2	6	2255725	2255730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50081	NC_004307	GAA	2	6	2255762	2255767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50082	NC_004307	TCC	2	6	2255830	2255835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23466357
50083	NC_004307	TCG	2	6	2255898	2255903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23466357
50084	NC_004307	TGG	2	6	2255910	2255915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466357
50085	NC_004307	AGG	2	6	2255974	2255979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23466357
50086	NC_004307	GAT	2	6	2256050	2256055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23466357
50087	NC_004307	CAG	2	6	2256161	2256166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466357
50088	NC_004307	CAG	2	6	2256170	2256175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466357
50089	NC_004307	CAG	2	6	2256254	2256259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23466357
50090	NC_004307	TGC	2	6	2256267	2256272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23466357
50091	NC_004307	CCG	2	6	2256276	2256281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23466357
50092	NC_004307	CTT	2	6	2256327	2256332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23466357
50093	NC_004307	GTG	2	6	2256334	2256339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466357
50094	NC_004307	GGT	2	6	2256441	2256446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23466357
50095	NC_004307	GTT	2	6	2256461	2256466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23466357
50096	NC_004307	AAT	2	6	2256528	2256533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23466357
50097	NC_004307	TTCT	2	8	2256625	2256632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.