MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A plasmid pDOJH10L

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004252	CAA	2	6	14	19	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004252	GAA	2	6	120	125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004252	CAT	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004252	AGG	2	6	420	425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004252	CCG	2	6	476	481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_004252	CAA	2	6	521	526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004252	GAG	3	9	546	554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004252	CTG	2	6	564	569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004252	GAA	3	9	596	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004252	CGG	2	6	668	673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004252	GTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004252	CGG	2	6	830	835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004252	TGC	2	6	881	886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004252	GAT	2	6	983	988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004252	CCG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_004252	GCG	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004252	GGC	2	6	1111	1116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_004252	GAT	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004252	CGG	2	6	1268	1273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004252	TGC	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004252	CGG	2	6	1468	1473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004252	CGA	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004252	CGG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004252	GCT	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004252	CGG	2	6	1623	1628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004252	CTG	2	6	1847	1852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307855
27	NC_004252	ACC	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307855
28	NC_004252	TGG	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307855
29	NC_004252	TGC	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307855
30	NC_004252	ATT	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23307855
31	NC_004252	CGG	2	6	2425	2430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307856
32	NC_004252	TCC	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307856
33	NC_004252	GGC	2	6	2589	2594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307856
34	NC_004252	GGC	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307856
35	NC_004252	GCC	2	6	2722	2727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307856
36	NC_004252	GAG	2	6	2750	2755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307856
37	NC_004252	GCC	2	6	2804	2809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307856
38	NC_004252	TGG	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307856
39	NC_004252	GTT	2	6	2981	2986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23307856
40	NC_004252	TCT	2	6	3031	3036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307856
41	NC_004252	CGC	2	6	3110	3115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307856
42	NC_004252	CGA	2	6	3151	3156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307856
43	NC_004252	TCC	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307856
44	NC_004252	TCT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307856
45	NC_004252	GCA	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307856
46	NC_004252	TCG	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307856
47	NC_004252	GAC	2	6	3501	3506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004252	GCC	2	6	3585	3590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307857
49	NC_004252	CGA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307857
50	NC_004252	TGG	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307857
51	NC_004252	GAC	3	9	3831	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307857
52	NC_004252	ACG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307857
53	NC_004252	GCC	2	6	3872	3877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307857
54	NC_004252	ACG	2	6	4481	4486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307858
55	NC_004252	TCA	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307858
56	NC_004252	CAT	2	6	4501	4506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307858
57	NC_004252	CCG	2	6	4528	4533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307858
58	NC_004252	TCG	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307858
59	NC_004252	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23307858
60	NC_004252	TCG	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307858
61	NC_004252	ACT	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307858
62	NC_004252	AAC	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23307858
63	NC_004252	CCA	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307858
64	NC_004252	TGG	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307858
65	NC_004252	CTA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307858
66	NC_004252	AGC	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307858
67	NC_004252	GAA	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23307858
68	NC_004252	AAG	2	6	5150	5155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23307858
69	NC_004252	GAG	2	6	5303	5308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307858
70	NC_004252	CGG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307858
71	NC_004252	CTG	2	6	5551	5556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004252	GCT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004252	GTT	2	6	5739	5744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23307859
74	NC_004252	TGG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307859
75	NC_004252	GCA	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307859
76	NC_004252	GGC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307859
77	NC_004252	GAT	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23307859
78	NC_004252	GGC	2	6	6085	6090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307859
79	NC_004252	CTC	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307859
80	NC_004252	CTC	2	6	6113	6118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307859
81	NC_004252	CAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307859
82	NC_004252	GGC	2	6	6210	6215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307859
83	NC_004252	GGC	2	6	6298	6303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_004252	CAG	2	6	6358	6363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004252	TGC	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004252	TGG	2	6	6456	6461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004252	TCT	2	6	6641	6646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004252	GCT	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307860
89	NC_004252	GCC	2	6	6732	6737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307860
90	NC_004252	CGA	2	6	6763	6768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307860
91	NC_004252	TTG	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23307860
92	NC_004252	CTC	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307860
93	NC_004252	CCA	2	6	6910	6915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307860
94	NC_004252	TCT	2	6	6919	6924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307860
95	NC_004252	CGG	2	6	6979	6984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307860
96	NC_004252	GCA	2	6	7015	7020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307860
97	NC_004252	GCA	2	6	7033	7038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307860
98	NC_004252	CGC	2	6	7069	7074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307860
99	NC_004252	GCG	2	6	7212	7217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004252	GCG	2	6	7227	7232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004252	GCG	2	6	7260	7265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004252	GAT	2	6	7437	7442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004252	GCC	2	6	7621	7626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307861
104	NC_004252	CGA	2	6	7641	7646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307861
105	NC_004252	TGG	2	6	7691	7696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307861
106	NC_004252	ACC	2	6	7753	7758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307861
107	NC_004252	GAC	2	6	7888	7893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307861
108	NC_004252	ATT	2	6	8225	8230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004252	CAA	2	6	8313	8318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23307862
110	NC_004252	GAA	2	6	8328	8333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23307862
111	NC_004252	GAG	2	6	8419	8424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
112	NC_004252	GAA	2	6	8448	8453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23307862
113	NC_004252	CAA	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23307862
114	NC_004252	CTG	2	6	8503	8508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307862
115	NC_004252	ATC	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307862
116	NC_004252	AGG	2	6	8585	8590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
117	NC_004252	GAG	2	6	8614	8619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
118	NC_004252	CGA	2	6	8763	8768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307862
119	NC_004252	CAA	2	6	8823	8828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23307862
120	NC_004252	GAG	2	6	8851	8856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
121	NC_004252	GGA	2	6	8985	8990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
122	NC_004252	CAT	2	6	9139	9144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307862
123	NC_004252	CGG	2	6	9200	9205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004252	GGC	2	6	9207	9212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_004252	TGA	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004252	TTC	2	6	9270	9275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004252	GGA	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004252	GAG	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307863
129	NC_004252	AGC	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
130	NC_004252	GCG	2	6	9480	9485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307863
131	NC_004252	ATC	2	6	9496	9501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307863
132	NC_004252	GGC	2	6	9508	9513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307863
133	NC_004252	ACG	2	6	9542	9547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
134	NC_004252	ACG	2	6	9560	9565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
135	NC_004252	GCT	2	6	9582	9587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307863
136	NC_004252	GCC	2	6	9607	9612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307863
137	NC_004252	CGG	2	6	9665	9670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307863
138	NC_004252	TGC	2	6	9674	9679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307863
139	NC_004252	AGC	2	6	9722	9727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
140	NC_004252	GCA	3	9	9771	9779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
141	NC_004252	TCT	2	6	9800	9805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_004252	ATT	2	6	9936	9941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.