MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 422

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004061	TGTTAT	2	12	30	41	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21672295
2	NC_004061	ATATTA	2	12	2465	2476	50 %	50 %	0 %	0 %	21672296
3	NC_004061	ATTTTA	2	12	2503	2514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672296
4	NC_004061	TTTTAT	2	12	2787	2798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672296
5	NC_004061	ATTGGT	2	12	2962	2973	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21672297
6	NC_004061	CTTCAG	2	12	4963	4974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21672300
7	NC_004061	AAACAA	2	12	5580	5591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	21672300
8	NC_004061	TTATTT	2	12	5839	5850	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004061	ATAAAA	2	12	8362	8373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672303
10	NC_004061	ATTTTC	2	12	9026	9037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21672304
11	NC_004061	TCATTT	2	12	9171	9182	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21672304
12	NC_004061	CGTTTT	2	12	9268	9279	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21672304
13	NC_004061	ATTTTT	2	12	9338	9349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672304
14	NC_004061	CATCAG	2	12	9637	9648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21672304
15	NC_004061	ATTTTT	2	12	12124	12135	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672305
16	NC_004061	TTATAT	2	12	13217	13228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672306
17	NC_004061	GTAGAA	2	12	15415	15426	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	21672310
18	NC_004061	TTGATT	2	12	17120	17131	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21672311
19	NC_004061	TAAAAA	2	12	17180	17191	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672311
20	NC_004061	AAATAT	2	12	17349	17360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672311
21	NC_004061	GATATA	2	12	23158	23169	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21672317
22	NC_004061	TTTTCT	2	12	23394	23405	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_004061	TATTGG	2	12	24980	24991	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21672318
24	NC_004061	ATAAAA	2	12	26207	26218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004061	TTTTAA	2	12	26585	26596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672320
26	NC_004061	CTGTAT	2	12	27676	27687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21672320
27	NC_004061	TTTCTT	2	12	29317	29328	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21672321
28	NC_004061	TTTTTA	2	12	29512	29523	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004061	AGAAAA	2	12	33292	33303	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21672324
30	NC_004061	CTTTTA	2	12	34205	34216	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21672325
31	NC_004061	CAAAAT	2	12	34382	34393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	21672325
32	NC_004061	AGTATT	2	12	35088	35099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21672325
33	NC_004061	ATTTTT	2	12	35651	35662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004061	TGTTTC	2	12	38558	38569	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21672327
35	NC_004061	CTCTTC	2	12	39762	39773	0 %	50 %	0 %	50 %	21672327
36	NC_004061	CATGTA	2	12	41106	41117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21672328
37	NC_004061	GTTTTT	2	12	49227	49238	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	21672335
38	NC_004061	ATTTTT	2	12	52440	52451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004061	ATGTTG	2	12	54379	54390	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21672340
40	NC_004061	AAAGAA	2	12	56890	56901	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21672341
41	NC_004061	TTTTGC	2	12	59771	59782	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21672345
42	NC_004061	TATTTT	2	12	60172	60183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672345
43	NC_004061	TCATCT	2	12	60264	60275	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21672345
44	NC_004061	TCTGTA	2	12	60678	60689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21672345
45	NC_004061	TTATTT	2	12	63856	63867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672348
46	NC_004061	ATTTTT	2	12	66229	66240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004061	ATTTTT	2	12	71445	71456	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672356
48	NC_004061	GTTTCC	2	12	72246	72257	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21672356
49	NC_004061	ATTTTT	2	12	72350	72361	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004061	AATAGA	2	12	77141	77152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21672358
51	NC_004061	TTTAAA	2	12	78090	78101	50 %	50 %	0 %	0 %	21672359
52	NC_004061	ATAAAA	2	12	79043	79054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672359
53	NC_004061	AGAAAA	2	12	79982	79993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21672360
54	NC_004061	TTTTAT	2	12	82485	82496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672363
55	NC_004061	TTAATT	2	12	85441	85452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672367
56	NC_004061	TTATTT	2	12	85765	85776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672367
57	NC_004061	ATGTCT	2	12	87481	87492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21672369
58	NC_004061	AAATTT	2	12	87601	87612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004061	ATTTTT	2	12	87826	87837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672370
60	NC_004061	ATATTA	3	18	88262	88279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004061	ATTTTT	2	12	88332	88343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672372
62	NC_004061	TATAAA	2	12	88973	88984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672372
63	NC_004061	TAAAAA	2	12	89083	89094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672372
64	NC_004061	TAAAAA	2	12	89584	89595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672372
65	NC_004061	TTTTTC	2	12	91290	91301	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21672373
66	NC_004061	TTAGTA	2	12	93179	93190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21672374
67	NC_004061	TCTTTT	2	12	93744	93755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21672375
68	NC_004061	GTTTTG	2	12	95889	95900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672376
69	NC_004061	TAACTT	2	12	98770	98781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	21672378
70	NC_004061	TATTTT	2	12	101801	101812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004061	AATTAA	2	12	104671	104682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672384
72	NC_004061	AAAAGT	2	12	106933	106944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21672386
73	NC_004061	AAATCA	2	12	107761	107772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	21672386
74	NC_004061	ATTTTA	2	12	111682	111693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004061	ATTTCA	2	12	111779	111790	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_004061	TAAAAA	2	12	115159	115170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672394
77	NC_004061	TAATAT	2	12	123377	123388	50 %	50 %	0 %	0 %	21672401
78	NC_004061	TTACCT	2	12	124064	124075	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21672403
79	NC_004061	AATTTA	2	12	124208	124219	50 %	50 %	0 %	0 %	21672403
80	NC_004061	ATTTTA	2	12	124751	124762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672403
81	NC_004061	TTTTCT	2	12	127841	127852	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21672405
82	NC_004061	TTATTT	2	12	128154	128165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004061	TTGATA	2	12	131482	131493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21672408
84	NC_004061	ATAAAA	2	12	131575	131586	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672408
85	NC_004061	AATATA	2	12	131806	131817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672408
86	NC_004061	GTCAAA	2	12	133937	133948	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21672410
87	NC_004061	GAAAAA	2	12	134501	134512	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21672411
88	NC_004061	ATGATT	2	12	134826	134837	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21672411
89	NC_004061	AAAATT	2	12	137317	137328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672412
90	NC_004061	AAAATT	2	12	137681	137692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672413
91	NC_004061	AAATAA	2	12	141805	141816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	30410816
92	NC_004061	TAAAAA	2	12	143775	143786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004061	AAAAGA	2	12	143909	143920	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21672419
94	NC_004061	TTTAGG	2	12	145318	145329	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21672420
95	NC_004061	AATACT	2	12	147225	147236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21672423
96	NC_004061	TTAAAT	2	12	149574	149585	50 %	50 %	0 %	0 %	21672425
97	NC_004061	TTAATT	2	12	151673	151684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672427
98	NC_004061	ATTTAA	2	12	154201	154212	50 %	50 %	0 %	0 %	21672428
99	NC_004061	ATATTT	2	12	155008	155019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004061	TAATTT	2	12	155165	155176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672429
101	NC_004061	AATATC	2	12	155403	155414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21672429
102	NC_004061	TATTTT	2	12	155777	155788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672429
103	NC_004061	TATTTT	2	12	157679	157690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672432
104	NC_004061	TAGAAA	2	12	158249	158260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21672432
105	NC_004061	ATTTTA	2	12	160655	160666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672433
106	NC_004061	TATTAA	2	12	166330	166341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004061	TTAGAT	2	12	167665	167676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21672439
108	NC_004061	GTTTTC	2	12	172293	172304	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21672442
109	NC_004061	AAAGAT	2	12	182221	182232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21672451
110	NC_004061	ATAATT	2	12	182710	182721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004061	CTAAAA	2	12	185916	185927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	21672454
112	NC_004061	TAAAGC	2	12	186085	186096	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21672454
113	NC_004061	ATAGAA	2	12	186201	186212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21672454
114	NC_004061	GCTTTA	2	12	186739	186750	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21672455
115	NC_004061	TTAAAA	2	12	187530	187541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672456
116	NC_004061	TAAATA	2	12	190361	190372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004061	TTTAAT	2	12	191406	191417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672459
118	NC_004061	TAAAAA	2	12	191804	191815	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672459
119	NC_004061	ATTTTT	2	12	192327	192338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672459
120	NC_004061	CTTTCC	2	12	198116	198127	0 %	50 %	0 %	50 %	21672462
121	NC_004061	GTATTG	2	12	202067	202078	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21672466
122	NC_004061	TTTTAA	2	12	204533	204544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672469
123	NC_004061	AAATAT	2	12	206345	206356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30410817
124	NC_004061	ATGAAA	2	12	207205	207216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21672472
125	NC_004061	TGAAAA	2	12	208842	208853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21672473
126	NC_004061	AGTAAT	2	12	209647	209658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21672474
127	NC_004061	TCCAAC	2	12	209976	209987	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	21672474
128	NC_004061	ATTTTT	2	12	212755	212766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004061	TTAATA	2	12	213665	213676	50 %	50 %	0 %	0 %	21672476
130	NC_004061	ATCTTT	2	12	215687	215698	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21672479
131	NC_004061	ATTAAA	2	12	218318	218329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004061	ATTTTT	2	12	219534	219545	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004061	AGTTGA	2	12	220419	220430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672481
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245	NC_004061	TAAATT	2	12	416293	416304	50 %	50 %	0 %	0 %	21672640
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247	NC_004061	CTTTTG	2	12	418520	418531	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21672640
248	NC_004061	ATTTTT	2	12	418584	418595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21672640
249	NC_004061	AAAGAA	2	12	420979	420990	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21672642
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251	NC_004061	CATTTG	2	12	424292	424303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21672643
252	NC_004061	CTTGAT	2	12	424531	424542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21672643
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256	NC_004061	TAAGCA	2	12	428965	428976	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21672650
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280	NC_004061	TATCAT	2	12	464535	464546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.